Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
WQENKSWNAHFTEHKSQGVVVLWNENKQQGFTNNLKRANQAFLPASTFAIPNSLIALDLGVVKDEHQVFKWDGQTRDIAT
WNRDHNLITAMKYSVVPVYQEFARQIGEARMSKMLHAFDYGNEDISGNVDSFWLDGGIRISATEQISFLRKLYHNKLHVS
ERSQRIVKQAMLTEANGDYIIRAKTGYDTKIGWWVGWVELDDNVWFFAMNMDMPTSDGLGLRQAITKEVLKQEKIIP

The query sequence (length=237) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 6psg:C 249 241 0.9916 0.9438 0.9751 9.93e-176 7ass:C, 7ass:D, 7aux:A, 7aux:B, 7aw5:A, 7aw5:B, 7dml:A, 7dml:B, 7dml:C, 7dml:D, 5dtk:A, 5dtk:B, 5dtk:C, 5dtk:D, 5dts:A, 5dts:B, 5dts:C, 5dts:D, 5dtt:C, 5dtt:D, 5dva:A, 5dva:B, 5dva:C, 5dva:D, 5faq:A, 5faq:B, 5fas:A, 5fas:B, 5fat:A, 5fat:B, 8faj:A, 8faj:B, 7jhq:A, 7jhq:B, 7jhq:C, 7jhq:D, 7k5v:A, 7k5v:B, 7kh9:B, 7kh9:A, 7khq:A, 7khq:B, 7khy:A, 7khz:A, 7l8o:A, 7l8o:B, 7l8o:C, 7l8o:D, 7nrj:AAA, 7nrj:BBB, 7nrj:CCC, 7nrj:DDD, 7o5n:AAA, 7o5n:BBB, 7o5n:CCC, 7o5n:DDD, 7o5q:BBB, 7o5q:CCC, 7o5q:DDD, 7o9n:AAA, 7o9n:DDD, 7o9n:BBB, 7o9n:CCC, 5odz:B, 6p96:A, 6p96:B, 6p97:A, 6p97:B, 6p98:A, 6p98:B, 6p99:A, 6p99:B, 6p9c:A, 6p9c:B, 7peh:AAA, 7peh:CCC, 7peh:DDD, 7pep:AAA, 7pep:BBB, 7pep:CCC, 7pep:DDD, 8pec:A, 8pec:C, 8pec:D, 7pfn:AAA, 7pfn:BBB, 7pgo:AAA, 6pk0:A, 6pk0:C, 6pk0:B, 6pk0:D, 6pqi:A, 6pqi:B, 6pqi:C, 6pqi:D, 6psg:A, 6psg:B, 6psg:D, 7pse:AAA, 7pse:BBB, 7psf:AAA, 7psf:BBB, 7psf:CCC, 6pt1:A, 6pt1:B, 6pt1:C, 6pt1:D, 6pt5:A, 6pt5:B, 6pt5:C, 6pt5:D, 6ptu:A, 6ptu:B, 6ptu:C, 6ptu:D, 6pxx:A, 6pxx:B, 7q14:AAA, 7q14:BBB, 7q14:CCC, 7q14:DDD, 7q14:EEE, 7q14:FFF, 7q14:GGG, 7q14:HHH, 6q5b:A, 6q5b:B, 6q5b:C, 6q5b:D, 6q5f:A, 6q5f:C, 5qa4:A, 5qa4:B, 5qa4:C, 5qa4:D, 5qa5:A, 5qa5:B, 5qa5:C, 5qa5:D, 5qa6:A, 5qa6:B, 5qa6:C, 5qa6:D, 5qa7:A, 5qa7:B, 5qa7:C, 5qa7:D, 5qa8:A, 5qa8:C, 5qa8:D, 5qa9:A, 5qa9:B, 5qa9:C, 5qaa:A, 5qaa:B, 5qaa:C, 5qaa:D, 5qab:A, 5qab:B, 5qab:D, 5qac:A, 5qac:B, 5qac:C, 5qac:D, 5qad:A, 5qad:B, 5qad:C, 5qad:D, 5qae:A, 5qae:B, 5qae:C, 5qae:D, 5qaf:A, 5qaf:B, 5qaf:D, 5qag:A, 5qag:B, 5qag:C, 5qag:D, 5qah:A, 5qah:B, 5qah:C, 5qah:D, 5qai:A, 5qai:C, 5qaj:A, 5qaj:B, 5qaj:C, 5qaj:D, 5qak:A, 5qak:B, 5qak:C, 5qak:D, 5qal:A, 5qal:B, 5qal:C, 5qal:D, 5qam:A, 5qam:B, 5qam:C, 5qam:D, 5qan:A, 5qan:B, 5qan:C, 5qan:D, 5qao:A, 5qao:B, 5qao:C, 5qao:D, 5qap:B, 5qap:C, 5qap:D, 5qaq:B, 5qaq:C, 5qaq:D, 5qar:A, 5qar:B, 5qar:C, 5qar:D, 5qas:A, 5qas:B, 5qas:C, 5qas:D, 5qat:A, 5qat:B, 5qat:C, 5qat:D, 5qau:C, 5qau:D, 5qav:C, 5qav:D, 5qaw:A, 5qaw:C, 5qaw:D, 5qax:A, 5qax:B, 5qax:C, 5qax:D, 5qay:A, 5qay:B, 5qay:C, 5qay:D, 5qaz:A, 5qaz:B, 5qaz:C, 5qaz:D, 5qb0:A, 5qb0:B, 5qb0:D, 5qb1:B, 5qb1:D, 5qb2:A, 5qb2:B, 5qb3:A, 5qb3:B, 5qb3:C, 5qb3:D, 5qb4:A, 5qb4:B, 5qb4:C, 5qb4:D, 8qnz:AAA, 8qnz:BBB, 8qnz:DDD, 7r6z:A, 7r6z:B, 6rj7:A, 4s2j:A, 4s2j:B, 4s2j:C, 4s2j:D, 4s2k:A, 4s2k:B, 4s2k:C, 4s2k:D, 4s2n:A, 4s2n:B, 4s2n:C, 4s2n:D, 8sqf:B, 8sqf:A, 8sqg:B, 8sqg:A, 6uvk:A, 6uvk:B, 6uvk:C, 6uvk:D, 6v1o:A, 6v1o:B, 6v1o:C, 6v1o:D, 4wmc:A, 4wmc:B, 4wmc:C, 4wmc:D, 4wmc:E, 4wmc:F, 4wmc:G, 4wmc:H, 6xqr:A, 6xqr:B, 6zrj:A, 6zrj:B, 6zrj:C, 6zrj:D, 6zrj:E, 6zrj:F, 6zrj:G, 6zrj:H, 6zrp:A, 6zrp:B, 6zrp:C, 6zrp:D, 6zxi:A, 6zxi:B
2 5fq9:B 247 241 0.4852 0.4656 0.4772 1.51e-83 1fof:A, 1fof:B, 5fq9:A, 1h5x:A, 1h5x:B, 1h8y:A, 1h8y:B, 2hp5:A, 2hp5:B, 2hp5:C, 2hp5:D, 1k54:A, 1k54:B, 1k6r:A, 1k6r:B, 1k6s:A, 1k6s:B, 7l5t:A, 7l5t:B, 3lce:A, 3lce:B, 5mmy:B, 5mnu:A, 5mnu:B, 5mox:A, 5mox:B, 5moz:A, 5moz:B, 6rtn:A, 6rtn:B, 4s2o:A, 4s2o:B, 6skp:A, 6skp:B, 6skq:A, 6skq:B, 6skq:C, 6skq:D, 6skr:A, 6skr:B, 2wgi:A, 2wgi:B, 2wgv:A, 2wgv:B, 2wkh:A, 2wkh:B, 4wz5:A, 4wz5:B, 6zrg:A, 6zrh:A, 6zrh:B, 6zrh:C, 6zrh:D, 6zri:A, 6zri:B, 6zri:C, 6zri:D, 6zw2:A
3 6xj3:A 241 238 0.4219 0.4149 0.4202 1.50e-64 6xj3:B, 6xj3:C, 6xj3:D
4 5e2f:A 237 224 0.3840 0.3840 0.4062 5.43e-52
5 4ied:C 247 240 0.3797 0.3644 0.3750 2.09e-51 4ied:B
6 8ep6:A 245 215 0.3586 0.3469 0.3953 5.95e-51
7 5ctn:A 233 217 0.3629 0.3691 0.3963 2.68e-50 5ctn:B
8 4k0x:A 243 238 0.3755 0.3663 0.3739 1.71e-49 4jf4:A, 4jf4:B, 4k0w:A, 6n6u:A, 6n6v:A, 6n6x:A, 6n6y:A, 7t7d:A, 7t7e:A, 7t7f:A, 7t7g:A, 5wi3:B, 5wi3:A, 5wi7:A, 5wi7:B, 5wib:A, 5wib:B, 4x55:A, 4x55:B
9 4y0u:A 243 232 0.3544 0.3457 0.3621 1.05e-45 7vvi:A, 7vx3:A, 7vx6:A, 4y0u:B, 4y0u:C, 4y0u:D
10 8sq7:A 241 231 0.3502 0.3444 0.3593 6.63e-43 5l2f:A, 5l2f:B, 5l2f:C, 5l2f:D, 8sq7:B, 8sq7:C, 8sq7:D, 8sq7:E, 8sq7:F, 8sq7:G, 8sq7:H, 8sq8:A, 8sq8:B, 8sq8:C, 8sq8:D
11 4f94:A 245 241 0.3586 0.3469 0.3527 9.56e-43 6b22:A, 8cul:A, 8cum:A, 8cuo:A, 3fv7:A, 3fyz:A, 3fzc:A, 3mbz:A, 6mpq:A, 3pae:A, 3pae:B, 3pag:A, 3pag:B, 7rp8:A, 7rp9:A, 7rpa:A, 7rpb:A, 7rpc:A, 7rpd:A, 7rpe:A, 7rpf:A, 7rpg:A, 5tg4:A, 5tg5:A, 5tg6:A, 5tg7:A, 5vfd:A, 4wm9:A, 4x53:A, 4x56:A, 3znt:A
12 2iwc:A 255 224 0.2827 0.2627 0.2991 3.42e-33 2iwb:A, 2iwd:A, 6o9s:A
13 4mll:B 251 198 0.2658 0.2510 0.3182 2.66e-23 3isg:A, 3isg:B, 4mll:A, 4mll:C, 4mll:D
14 8exs:A 556 224 0.2321 0.0989 0.2455 1.48e-21 8c0p:A, 8c0p:B, 8c0s:A, 8c0s:B, 8cf3:C, 8cf3:E, 8exp:A, 8exp:B, 8exq:B, 8exq:A, 8exr:B, 8exr:A, 8exs:B, 8ext:A, 8ext:B, 6o9w:B, 3q7z:A, 3q7z:B, 3q81:A, 3q81:B, 3q82:A, 3q82:B, 1xa1:A, 1xa1:B, 1xa1:C, 1xa1:D, 1xa7:A, 1xa7:B, 1xkz:A, 1xkz:B, 1xkz:C, 1xkz:D
15 6pqc:A 252 186 0.2194 0.2063 0.2796 1.40e-20 7kep:A, 7keq:A, 7ker:A, 7lnq:A, 7lnr:A, 7mea:A, 7meb:A, 7mec:A, 7med:A, 7mee:A, 7mef:A, 7meg:A, 7meh:A
16 6o9w:A 227 226 0.2194 0.2291 0.2301 6.09e-16
17 7rcz:A 511 89 0.1097 0.0509 0.2921 0.018 7rcz:B
18 6mkh:A 445 111 0.1181 0.0629 0.2523 2.7 6bsr:A, 6mki:A
19 6tix:BBB 533 105 0.1181 0.0525 0.2667 2.7 6tix:AAA
20 2f2h:A 773 76 0.0970 0.0298 0.3026 3.2 2f2h:B, 2f2h:C, 2f2h:D, 2f2h:E, 2f2h:F, 1xsk:A, 1xsk:B, 1xsk:C, 1xsk:E
21 5hug:A 388 62 0.0591 0.0361 0.2258 3.4 3b7e:A, 3b7e:B, 4b7j:A, 4b7m:A, 4b7m:B, 4b7n:A, 4b7q:A, 4b7q:B, 4b7q:C, 4b7q:D, 4b7r:A, 4b7r:B, 4b7r:C, 4b7r:D, 3beq:A, 3beq:B, 3ckz:A, 3cl0:A, 3cl2:A, 3cl2:B, 3cl2:C, 3cl2:D, 3cl2:E, 3cl2:F, 3cl2:G, 3cl2:H, 3cye:A, 3cye:B, 6d96:A, 6d96:B, 6d96:C, 6d96:D, 6d96:E, 6d96:F, 6d96:G, 6d96:H, 6g01:A, 6g01:B, 6g02:A, 6g02:B, 6hp0:C, 6hp0:A, 6hp0:B, 6hp0:D, 2hty:A, 2hty:B, 2hty:C, 2hty:D, 2hty:E, 2hty:F, 2hty:G, 2hty:H, 2hu0:B, 2hu4:A, 2hu4:B, 2hu4:C, 2hu4:D, 2hu4:E, 2hu4:F, 2hu4:G, 2hu4:H, 6lxi:A, 6lxi:B, 6lxk:A, 6lxk:B, 6lxk:C, 6lxk:D, 3nss:A, 3nss:B, 5nwe:A, 5nwe:B, 5nwe:C, 5nwe:D, 5nz4:A, 5nz4:B, 5nze:A, 5nze:B, 5nzf:A, 5nzf:B, 5nzf:C, 5nzf:D, 5nzn:A, 5nzn:B, 5nzn:C, 5nzn:D, 6q23:C, 6q23:B, 6q23:A, 6q23:D, 4qnp:A, 4qnp:B, 7s0i:A, 3ti3:A, 3ti3:B, 3ti4:A, 3ti4:B, 3ti5:A, 3ti5:B, 3ti6:A, 3ti6:B
22 7kis:A 458 106 0.1139 0.0590 0.2547 5.8 7kis:B
23 5epe:A 248 74 0.0844 0.0806 0.2703 6.9
24 7e38:A 313 32 0.0506 0.0383 0.3750 8.3 8ci9:C, 7e37:A, 7e37:B, 7e38:B
25 5tgf:D 332 91 0.1055 0.0753 0.2747 9.6

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218