BioLiP

>protein
WPLSSQSGSYELRIEVQPKPHHRAHYETEGSRGAVKAPTGGHPVVQLHGYMENKPLGLQIFIGTADERILKPHAFYQVHR
ITGKTVTTTSYEKIVGNTKVLEIPLEPKNNMRATIDCAGILKLRNADIELRKGETDIGRKNTRVRLVFRVHIPESSGRIV
SLQTASNPIECSQRSAHELPMVERQDTDSCLVYGGQQMILTGQNFTSESKVVFTEKTTDGQQIWEMEATVDKDKSQPNML
FVEIPEYRNKHIRTPVKVNFYVINGKRKRSQPQHFTYHPV

The query sequence (length=280) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	8ow4:B	296	280	1.0000	0.9459	1.0000	0.0	1a02:N, 2as5:N, 2as5:M, 2o93:L, 2o93:M, 2o93:O, 1owr:M, 1owr:N, 1owr:P, 1owr:Q, 1p7h:L, 1p7h:M, 1p7h:N, 1p7h:O, 1pzu:L, 1pzu:M, 1pzu:H, 1pzu:I, 1pzu:B, 1pzu:D, 3qrf:N, 8r3f:A, 8r3f:B, 1s9k:C
2	8ow4:A	225	273	0.7857	0.9778	0.8059	6.21e-146
3	1a66:A	178	175	0.5107	0.8034	0.8171	3.36e-106
4	1imh:C	281	280	0.4321	0.4306	0.4321	2.94e-70	1imh:D
5	6c49:A	338	79	0.0857	0.0710	0.3038	0.087
6	3t37:A	509	69	0.0679	0.0373	0.2754	0.81	4ha6:A
7	7uy2:A	175	29	0.0464	0.0743	0.4483	1.8	5ljn:A, 5ljn:B, 4oyk:A, 4oyk:B, 4p0a:A, 4p0a:C, 4p0b:A, 4p0b:C, 7uy2:B, 7uyj:A, 7uyj:B
8	7dco:L	435	111	0.1107	0.0713	0.2793	1.8
9	3t6q:A	601	115	0.1036	0.0483	0.2522	2.2	3t6q:B
10	6j6g:c	436	88	0.0857	0.0550	0.2727	4.5	6j6h:c, 6j6n:c, 6j6q:c, 5y88:J, 5ylz:J
11	6a4y:A	595	46	0.0679	0.0319	0.4130	4.7	5b72:A, 3bxi:A, 7c73:A, 7c74:A, 7c75:A, 7d52:A, 7dao:A, 7de5:A, 7dlq:A, 7dmr:A, 7dn6:A, 7dn7:A, 2e9e:A, 2e9e:B, 2efb:A, 2efb:B, 2eha:A, 2eha:B, 3erh:A, 3eri:A, 3faq:A, 5ff1:A, 5ff1:B, 3fnl:A, 3gc1:A, 3gcj:A, 3gck:A, 3gcl:A, 5gh0:A, 2gjm:A, 5gls:A, 4gm7:A, 5hpw:A, 5hpw:B, 5hpw:C, 5hpw:D, 3i6n:A, 2ikc:A, 2ikc:B, 8ing:A, 2ips:A, 9it8:A, 8k5m:A, 6kmk:A, 3krq:A, 4ksz:A, 6ky7:A, 6l2j:A, 6l32:A, 6l5g:A, 6l9t:A, 6lco:A, 6lf7:A, 6lqw:A, 6lqw:B, 6m7e:A, 4msf:A, 3n8f:A, 3n8f:B, 3nak:A, 3nak:B, 3niu:A, 3niu:B, 4njb:A, 2nqx:A, 2o86:A, 4oek:A, 2ojv:A, 4pnx:A, 2pt3:A, 2pum:A, 3py4:A, 3qf1:A, 4qjq:A, 2qpk:A, 2qqt:A, 2qrb:A, 3r4x:A, 2r5l:A, 3r55:A, 3r5o:A, 3rke:A, 3sxv:A, 3tgy:A, 3uba:A, 3v6q:A, 7ve3:A, 5wv3:A, 7wyj:A, 7y3u:A, 7y3u:B, 4y55:A, 8y9x:A, 2z5z:A, 5zgs:A
12	1vix:A	411	40	0.0500	0.0341	0.3500	5.7	1fno:A, 1vix:B
13	3ah7:A	109	85	0.0821	0.2110	0.2706	9.7

[Back]