BioLiP

>protein
WMGRAKEIGNGGWDQFQFLFFDPNGYLYAVSNDKLYKASPPQSDTDNWIARATEIGSGGWSGFKFLFFHPNGYLYAVRGQ
RFYKALPP

The query sequence (length=88) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3kif:I	94	88	1.0000	0.9362	1.0000	3.54e-62	3kif:A, 3kif:B, 3kif:C, 3kif:D, 3kif:E, 3kif:F, 3kif:G, 3kif:J
2	3kif:I	94	45	0.3409	0.3191	0.6667	9.31e-17	3kif:A, 3kif:B, 3kif:C, 3kif:D, 3kif:E, 3kif:F, 3kif:G, 3kif:J
3	3kif:I	94	43	0.3182	0.2979	0.6512	5.50e-14	3kif:A, 3kif:B, 3kif:C, 3kif:D, 3kif:E, 3kif:F, 3kif:G, 3kif:J
4	3kih:B	95	59	0.6023	0.5579	0.8983	2.92e-34	3kih:A, 3kih:C, 3kih:D
5	3kih:B	95	77	0.5341	0.4947	0.6104	8.23e-31	3kih:A, 3kih:C, 3kih:D
6	8r3b:A	47	45	0.3636	0.6809	0.7111	1.03e-18	8r3c:A, 8r3c:B, 8r3c:E
7	8r3b:A	47	28	0.1932	0.3617	0.6071	4.33e-06	8r3c:A, 8r3c:B, 8r3c:E
8	8r3b:A	47	13	0.1023	0.1915	0.6923	3.3	8r3c:A, 8r3c:B, 8r3c:E
9	8cff:A	823	80	0.2386	0.0255	0.2625	2.5	8cff:C, 8cff:E, 8cff:G, 8cgs:A, 8cgs:C, 8cgs:E, 8cgs:G, 8ch9:A, 8ch9:C, 8ch9:E, 8ch9:G, 1g8j:A, 1g8j:C, 1g8k:A, 1g8k:C, 1g8k:E, 1g8k:G
10	7t4g:A	493	65	0.1932	0.0345	0.2615	2.8	7t4g:C, 7t4g:E
11	7vef:A	828	52	0.2045	0.0217	0.3462	3.0	8in9:A
12	4jay:A	338	49	0.1818	0.0473	0.3265	4.4	4jay:B, 4jay:C, 4jay:D, 4jb1:A, 7or2:A, 7orz:A, 7osq:A
13	6tyb:G	345	65	0.1932	0.0493	0.2615	5.4	3fus:A
14	2bo0:A	336	38	0.1364	0.0357	0.3158	7.8	5b1j:A, 5b1j:B, 5b1k:A, 2bp0:A, 2bp0:B, 2bp8:A, 2bp8:B, 1bq5:A, 4csp:A, 4csp:F, 4csz:A, 1gs6:X, 1gs7:A, 1gs8:A, 1hau:A, 1haw:A, 2jfc:A, 2jfc:B, 2jfc:C, 2jfc:D, 2jfc:E, 2jfc:F, 1ndt:A, 1oe1:A, 1oe2:A, 1oe3:A, 5onx:A, 5ony:A, 2vm3:A, 2vm4:A, 2vmj:A, 2vn3:A, 2vw4:A, 2vw4:B, 2vw6:A, 2vw6:B, 2vw7:A, 2vw7:B, 1wa0:X, 1wa1:X, 1wa2:X, 1wae:A, 2xwz:A, 2xwz:E, 2xwz:D, 2xwz:B, 2xwz:F, 2xwz:C, 2xx0:A, 2xx0:B, 2xx1:A, 2xx1:D, 2xx1:B, 2xx1:C, 2xx1:E, 2xx1:F, 2xxf:A, 2xxf:B, 2xxg:A, 2xxg:C, 2zon:A, 2zon:B, 2zon:C
15	8tv5:C	294	38	0.1477	0.0442	0.3421	7.8	6b9l:A, 6b9l:B, 6b9l:C, 6b9l:D, 6njz:A, 6njz:B, 6nk0:A, 6nk0:B, 6nk1:A, 6nk1:B, 6nk2:A, 6nk2:B, 6nkp:A, 6nkp:B, 6rw2:A
16	2ynp:A	601	65	0.1932	0.0283	0.2615	9.2	8ens:A, 8enw:A, 8enw:B, 8enx:A, 8hqt:A, 8hqv:A, 8hqx:A, 4j73:A, 4j77:A, 4j77:B, 4j78:A, 4j79:A, 4j81:B, 4j81:A, 4j82:A, 4j82:B, 4j84:A, 4j84:B, 4j86:A, 4j86:B, 2ynn:A

[Back]