Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
WLPHQRKVFDFYASQGVQYFTAFLIVSNFIFNCAEKEWDPYTDQLYQGLWRWGEFAFNTMFLIELLINFYGIAFCFWRYN
WAWNTFDLVVVAIGTLTMAEAIGGNFMPPSMALIRNLRAFRIFRLFKRIKSLNKIIVSLGKAIPGVANAFVIMVIIMCIY
AILGVEFYHMTGSDGTYVTYNDNVKRGLCTGDEVELGQCSLNQTVSSETARGYTYGEEYYGTFFRALYTLFQVLTGESWS
EAVARPAVFESHYDSFGPVLFYVSFIIICQIVLINVVVAVLLDKMVEED

The query sequence (length=289) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 8j7h:B 290 289 1.0000 0.9966 1.0000 0.0 8j7f:A, 8j7f:B, 8j7f:C, 8j7f:D, 8j7h:C, 8j7h:D, 7x5v:A, 7x5v:B, 7x5v:C
2 8j7m:A 257 288 0.8616 0.9689 0.8646 2.25e-178 8j7m:C, 8j7m:D, 8j7m:B
3 5ek0:A 250 269 0.2491 0.2880 0.2677 1.12e-20 5ek0:B, 5ek0:C, 5ek0:D
4 6n4i:C 226 266 0.2353 0.3009 0.2556 5.03e-19 6n4i:A, 6n4i:D, 6n4i:B
5 6sxc:A 271 284 0.2318 0.2472 0.2359 9.91e-18 5bzb:B, 5bzb:C, 5bzb:D, 4cbc:A, 4cbc:B, 4cbc:C, 4cbc:D, 4oxs:A, 4oxs:B, 4oxs:C, 4oxs:D, 4p2z:B, 4p30:A, 4p30:B, 4p30:C, 4p30:D, 4p9o:A, 4p9o:B, 4p9o:C, 4p9o:D, 4p9p:B, 4p9p:D, 4pa3:A, 4pa3:B, 4pa3:C, 4pa3:D, 4pa4:A, 4pa4:B, 4pa4:C, 4pa4:D, 4pa6:A, 4pa6:B, 4pa6:C, 4pa6:D, 4pa7:A, 4pa7:B, 4pa7:C, 4pa7:D, 4pa9:A, 4pa9:B, 4pa9:C, 4pa9:D, 8s6j:A, 6sx5:A, 6sx7:A, 6sxe:A, 6sxf:A, 6sxf:B, 6sxg:A, 4x88:A, 4x88:B, 4x88:C, 4x88:D, 4x89:B, 4x8a:B, 4x8a:C, 4x8a:D, 6yz0:A, 6yz2:A, 6z8c:A, 3zjz:A, 3zjz:B, 3zjz:C, 3zjz:D
6 7wli:A 1135 291 0.2595 0.0661 0.2577 3.07e-16 7wlj:A, 7wlk:A, 7wll:A
7 7wli:A 1135 173 0.1349 0.0344 0.2254 1.48e-04 7wlj:A, 7wlk:A, 7wll:A
8 5klb:A 267 227 0.1972 0.2135 0.2511 5.73e-15 6c1e:A, 6c1e:B, 6c1k:A, 6c1k:B, 6c1m:A, 6c1m:B, 8h9w:A, 6juh:C, 6ke5:A, 6ke5:B, 6ke5:C, 6ke5:D, 6keb:C, 6keb:D, 5klb:B, 5klb:C, 5klb:D, 5klg:D, 5klg:C, 5kls:C, 5kmf:A, 5kmh:A
9 4dxw:A 210 280 0.2561 0.3524 0.2643 8.75e-13
10 6j8e:A 1139 300 0.2630 0.0667 0.2533 3.44e-12 7dtd:A, 7w77:D, 7w7f:D
11 6j8e:A 1139 268 0.2249 0.0571 0.2425 1.94e-08 7dtd:A, 7w77:D, 7w7f:D
12 6j8e:A 1139 250 0.1661 0.0421 0.1920 2.49e-08 7dtd:A, 7w77:D, 7w7f:D
13 6j8e:A 1139 158 0.1246 0.0316 0.2278 2.72e-07 7dtd:A, 7w77:D, 7w7f:D
14 6kzp:A 1014 252 0.2249 0.0641 0.2579 3.75e-12
15 6kzp:A 1014 249 0.1696 0.0483 0.1968 0.001
16 6kzp:A 1014 240 0.1592 0.0454 0.1917 6.7
17 9ayh:A 1056 281 0.2388 0.0653 0.2456 5.02e-12 9ayg:A, 9ayj:A, 9ayk:A, 9ayl:A
18 9ayh:A 1056 247 0.1696 0.0464 0.1984 1.39e-04 9ayg:A, 9ayj:A, 9ayk:A, 9ayl:A
19 7w9l:A 1420 302 0.2561 0.0521 0.2450 1.73e-11 8g1a:A, 7w9k:A, 7w9m:A, 7w9p:A, 7w9t:A, 8xmo:A
20 7w9l:A 1420 262 0.1938 0.0394 0.2137 2.46e-08 8g1a:A, 7w9k:A, 7w9m:A, 7w9p:A, 7w9t:A, 8xmo:A
21 7w9l:A 1420 245 0.1869 0.0380 0.2204 8.61e-08 8g1a:A, 7w9k:A, 7w9m:A, 7w9p:A, 7w9t:A, 8xmo:A
22 7w9l:A 1420 146 0.1349 0.0275 0.2671 2.31e-07 8g1a:A, 7w9k:A, 7w9m:A, 7w9p:A, 7w9t:A, 8xmo:A
23 7xm9:A 1230 302 0.2561 0.0602 0.2450 2.10e-11 6j8g:A, 6j8h:A, 6j8i:A, 6j8j:A, 7xmf:A, 7xmg:A, 8xmm:A
24 7xm9:A 1230 262 0.1938 0.0455 0.2137 2.57e-08 6j8g:A, 6j8h:A, 6j8i:A, 6j8j:A, 7xmf:A, 7xmg:A, 8xmm:A
25 7xm9:A 1230 245 0.1869 0.0439 0.2204 2.37e-07 6j8g:A, 6j8h:A, 6j8i:A, 6j8j:A, 7xmf:A, 7xmg:A, 8xmm:A
26 7xm9:A 1230 146 0.1349 0.0317 0.2671 3.39e-07 6j8g:A, 6j8h:A, 6j8i:A, 6j8j:A, 7xmf:A, 7xmg:A, 8xmm:A
27 8xmn:A 1277 302 0.2561 0.0579 0.2450 2.13e-11 8i5b:A, 8i5g:A, 8i5x:A, 8i5y:A, 8j4f:A, 8s9b:A, 8s9c:A, 8thg:A, 8thh:A, 7xve:A, 7xvf:A
28 8xmn:A 1277 262 0.1938 0.0439 0.2137 1.90e-07 8i5b:A, 8i5g:A, 8i5x:A, 8i5y:A, 8j4f:A, 8s9b:A, 8s9c:A, 8thg:A, 8thh:A, 7xve:A, 7xvf:A
29 8xmn:A 1277 146 0.1349 0.0305 0.2671 3.29e-07 8i5b:A, 8i5g:A, 8i5x:A, 8i5y:A, 8j4f:A, 8s9b:A, 8s9c:A, 8thg:A, 8thh:A, 7xve:A, 7xvf:A
30 8xmn:A 1277 245 0.1869 0.0423 0.2204 6.26e-07 8i5b:A, 8i5g:A, 8i5x:A, 8i5y:A, 8j4f:A, 8s9b:A, 8s9c:A, 8thg:A, 8thh:A, 7xve:A, 7xvf:A
31 7vfs:A 1266 282 0.2318 0.0529 0.2376 2.93e-11 7vfu:A, 7vfv:A, 7vfw:A
32 7vfs:A 1266 295 0.2630 0.0600 0.2576 4.12e-10 7vfu:A, 7vfv:A, 7vfw:A
33 7vfs:A 1266 255 0.2076 0.0474 0.2353 2.10e-08 7vfu:A, 7vfv:A, 7vfw:A
34 7vfs:A 1266 242 0.1834 0.0419 0.2190 1.79e-05 7vfu:A, 7vfv:A, 7vfw:A
35 7mix:A 1326 279 0.2318 0.0505 0.2401 4.58e-11 7miy:A
36 7mix:A 1326 304 0.2664 0.0581 0.2533 1.87e-10 7miy:A
37 7mix:A 1326 252 0.2076 0.0452 0.2381 2.72e-08 7miy:A
38 7mix:A 1326 242 0.1834 0.0400 0.2190 1.69e-05 7miy:A
39 7we4:A 1122 285 0.2249 0.0579 0.2281 7.42e-11 7wel:A, 7wfr:A, 7wfw:A
40 7we4:A 1122 261 0.1903 0.0490 0.2107 2.67e-08 7wel:A, 7wfr:A, 7wfw:A
41 7we4:A 1122 135 0.1349 0.0348 0.2889 1.83e-07 7wel:A, 7wfr:A, 7wfw:A
42 7we4:A 1122 183 0.1557 0.0401 0.2459 6.15e-06 7wel:A, 7wfr:A, 7wfw:A
43 6jp5:A 1274 252 0.2076 0.0471 0.2381 7.52e-11 6jp8:A, 6jpa:A, 6jpb:A
44 6jp5:A 1274 234 0.2042 0.0463 0.2521 2.24e-08 6jp8:A, 6jpa:A, 6jpb:A
45 6jp5:A 1274 249 0.1765 0.0400 0.2048 3.54e-08 6jp8:A, 6jpa:A, 6jpb:A
46 6jp5:A 1274 245 0.1834 0.0416 0.2163 7.03e-07 6jp8:A, 6jpa:A, 6jpb:A
47 7jpx:A 1116 252 0.2076 0.0538 0.2381 8.05e-11 8e56:A, 8e57:A, 8e58:A, 7jpk:A, 7jpl:A, 7jpv:A, 7jpw:A
48 7jpx:A 1116 234 0.2042 0.0529 0.2521 4.04e-08 8e56:A, 8e57:A, 8e58:A, 7jpk:A, 7jpl:A, 7jpv:A, 7jpw:A
49 7jpx:A 1116 249 0.1799 0.0466 0.2088 6.00e-08 8e56:A, 8e57:A, 8e58:A, 7jpk:A, 7jpl:A, 7jpv:A, 7jpw:A
50 7jpx:A 1116 245 0.1834 0.0475 0.2163 1.14e-06 8e56:A, 8e57:A, 8e58:A, 7jpk:A, 7jpl:A, 7jpv:A, 7jpw:A
51 8x90:A 1377 280 0.2284 0.0479 0.2357 1.35e-10 8x91:A, 8x93:A
52 8x90:A 1377 217 0.1972 0.0414 0.2627 8.56e-10 8x91:A, 8x93:A
53 8x90:A 1377 255 0.2111 0.0443 0.2392 8.05e-08 8x91:A, 8x93:A
54 8x90:A 1377 257 0.2111 0.0443 0.2374 1.19e-06 8x91:A, 8x93:A
55 8fhd:A 1294 301 0.2388 0.0533 0.2292 1.38e-10
56 8fhd:A 1294 221 0.1765 0.0394 0.2308 1.28e-08
57 8fhd:A 1294 291 0.2180 0.0487 0.2165 2.48e-08
58 8fhd:A 1294 264 0.1765 0.0394 0.1932 2.12e-06
59 8gz2:B 1174 301 0.2388 0.0588 0.2292 1.61e-10 8gz1:B
60 8gz2:B 1174 221 0.1765 0.0434 0.2308 1.83e-08 8gz1:B
61 8gz2:B 1174 291 0.2180 0.0537 0.2165 2.25e-08 8gz1:B
62 8gz2:B 1174 264 0.1765 0.0434 0.1932 3.32e-06 8gz1:B
63 8eoi:K 1116 249 0.2180 0.0565 0.2530 1.88e-10
64 8eoi:K 1116 244 0.1869 0.0484 0.2213 4.73e-07
65 8eoi:K 1116 237 0.1834 0.0475 0.2236 6.78e-04
66 7xlq:A 1319 213 0.1903 0.0417 0.2582 2.73e-10 8epl:A, 7yg5:A
67 7xlq:A 1319 284 0.2318 0.0508 0.2359 4.67e-09 8epl:A, 7yg5:A
68 7xlq:A 1319 303 0.2422 0.0531 0.2310 4.77e-07 8epl:A, 7yg5:A
69 7xlq:A 1319 226 0.1730 0.0379 0.2212 1.27e-04 8epl:A, 7yg5:A
70 8wea:A 1206 224 0.1972 0.0473 0.2545 5.04e-10
71 8wea:A 1206 238 0.1903 0.0456 0.2311 4.50e-07
72 8wea:A 1206 239 0.1869 0.0448 0.2259 0.004
73 7xsu:A 1085 305 0.2249 0.0599 0.2131 8.77e-10
74 7xsu:A 1085 261 0.2249 0.0599 0.2490 2.73e-08
75 7xsu:A 1085 302 0.2111 0.0562 0.2020 4.24e-06
76 7xsu:A 1085 123 0.0865 0.0230 0.2033 1.40e-05
77 8fhs:A 1282 221 0.1938 0.0437 0.2534 9.19e-10 8eog:K, 8fd7:K, 8hlp:A, 8hma:E, 8hmb:D, 8we6:A, 8we7:A, 8we8:A, 8we9:A
78 8fhs:A 1282 240 0.1869 0.0421 0.2250 1.01e-07 8eog:K, 8fd7:K, 8hlp:A, 8hma:E, 8hmb:D, 8we6:A, 8we7:A, 8we8:A, 8we9:A
79 8fhs:A 1282 251 0.1834 0.0413 0.2112 4.97e-06 8eog:K, 8fd7:K, 8hlp:A, 8hma:E, 8hmb:D, 8we6:A, 8we7:A, 8we8:A, 8we9:A
80 8fhs:A 1282 237 0.1834 0.0413 0.2236 6.37e-04 8eog:K, 8fd7:K, 8hlp:A, 8hma:E, 8hmb:D, 8we6:A, 8we7:A, 8we8:A, 8we9:A
81 6kzo:A 967 211 0.1903 0.0569 0.2607 1.22e-09
82 6kzo:A 967 170 0.1107 0.0331 0.1882 0.033
83 8e59:A 1230 219 0.1903 0.0447 0.2511 1.31e-09 8e5a:A, 8e5b:A, 7uhf:A, 7uhg:A
84 8e59:A 1230 215 0.1419 0.0333 0.1907 9.22e-06 8e5a:A, 8e5b:A, 7uhf:A, 7uhg:A
85 8e59:A 1230 235 0.1799 0.0423 0.2213 0.002 8e5a:A, 8e5b:A, 7uhf:A, 7uhg:A
86 8e59:A 1230 280 0.1903 0.0447 0.1964 0.003 8e5a:A, 8e5b:A, 7uhf:A, 7uhg:A
87 6a91:A 1323 170 0.1384 0.0302 0.2353 1.65e-09 6a95:A, 6nt3:A, 6nt4:A
88 6a91:A 1323 300 0.2388 0.0522 0.2300 6.96e-09 6a95:A, 6nt3:A, 6nt4:A
89 6a91:A 1323 245 0.1661 0.0363 0.1959 6.22e-08 6a95:A, 6nt3:A, 6nt4:A
90 6a91:A 1323 264 0.1834 0.0401 0.2008 5.60e-04 6a95:A, 6nt3:A, 6nt4:A
91 6uz3:A 1126 302 0.2249 0.0577 0.2152 8.12e-09 7fbs:A
92 6uz3:A 1126 261 0.2111 0.0542 0.2337 1.41e-07 7fbs:A
93 6uz3:A 1126 302 0.2111 0.0542 0.2020 4.05e-06 7fbs:A
94 6uz3:A 1126 129 0.0900 0.0231 0.2016 1.13e-05 7fbs:A
95 8f0p:A 1116 303 0.2699 0.0699 0.2574 1.51e-08 8f0q:A, 8f0r:A, 8f0s:A
96 8f0p:A 1116 245 0.1696 0.0439 0.2000 9.25e-08 8f0q:A, 8f0r:A, 8f0s:A
97 8f0p:A 1116 169 0.1349 0.0349 0.2308 1.17e-07 8f0q:A, 8f0r:A, 8f0s:A
98 8f0p:A 1116 264 0.1730 0.0448 0.1894 0.039 8f0q:A, 8f0r:A, 8f0s:A
99 8epm:A 991 209 0.1834 0.0535 0.2536 1.80e-08
100 8epm:A 991 203 0.1626 0.0474 0.2315 5.85e-07
101 8epm:A 991 263 0.2111 0.0616 0.2319 6.24e-06
102 8epm:A 991 207 0.1626 0.0474 0.2271 0.001
103 6agf:A 1138 263 0.2042 0.0518 0.2243 2.04e-08
104 6agf:A 1138 298 0.2249 0.0571 0.2181 6.89e-08
105 6agf:A 1138 169 0.1453 0.0369 0.2485 5.83e-07
106 6agf:A 1138 224 0.1592 0.0404 0.2054 7.04e-06
107 5hk7:A 139 68 0.0865 0.1799 0.3676 2.20e-08 5hk7:B, 5hk7:C, 7pgb:c, 7pgb:Z, 7pgb:d, 7pgb:o, 7pgb:l, 7pgb:h, 7pgb:e
108 8t6l:A 1237 261 0.2180 0.0509 0.2414 2.64e-08 7k18:A, 6lqa:B, 6uz0:A
109 8t6l:A 1237 311 0.2145 0.0501 0.1994 5.79e-08 7k18:A, 6lqa:B, 6uz0:A
110 8t6l:A 1237 129 0.0969 0.0226 0.2171 1.09e-07 7k18:A, 6lqa:B, 6uz0:A
111 8t6l:A 1237 301 0.2111 0.0493 0.2027 3.82e-06 7k18:A, 6lqa:B, 6uz0:A
112 8f6p:A 1091 311 0.2180 0.0577 0.2026 9.46e-08
113 8f6p:A 1091 261 0.2076 0.0550 0.2299 2.38e-06
114 8f6p:A 1091 123 0.0865 0.0229 0.2033 1.19e-05
115 8f6p:A 1091 301 0.2111 0.0559 0.2027 1.16e-04
116 6c9a:B 723 237 0.1869 0.0747 0.2278 2.77e-07 6c9a:A
117 7fhk:A 663 288 0.2353 0.1026 0.2361 7.53e-07 5dqq:A, 7fhk:C, 7fhl:A, 7fhl:C, 7fhn:A, 7fhn:C, 7fho:A, 7fho:C, 5tua:A
118 6e1p:A 646 286 0.2318 0.1037 0.2343 1.88e-06 6cx0:A, 5e1j:A, 6e1n:A, 6e1n:B, 6e1p:B
119 7pgg:A 147 76 0.0865 0.1701 0.3289 2.29e-06 7pgg:B, 7pgi:E
120 7tj9:A 1111 132 0.1142 0.0297 0.2500 3.44e-04
121 7tj9:A 1111 164 0.1557 0.0405 0.2744 0.037
122 7tj9:A 1111 163 0.1211 0.0315 0.2147 2.7
123 6xiw:A 1256 93 0.0830 0.0191 0.2581 0.010
124 6xiw:A 1256 148 0.1107 0.0255 0.2162 0.15
125 6xiw:A 1256 85 0.0692 0.0159 0.2353 3.2
126 7cu3:A 1277 93 0.0830 0.0188 0.2581 0.011
127 7cu3:A 1277 148 0.1107 0.0251 0.2162 0.14
128 7cu3:A 1277 85 0.0692 0.0157 0.2353 3.3
129 7sx3:A 1386 93 0.0830 0.0173 0.2581 0.012 7sx4:A
130 7sx3:A 1386 147 0.1107 0.0231 0.2177 0.16 7sx4:A
131 7sx3:A 1386 85 0.0692 0.0144 0.2353 3.4 7sx4:A
132 6v1q:A 538 119 0.1003 0.0539 0.2437 0.22 6v1q:B
133 2axn:A 451 99 0.0934 0.0599 0.2727 1.6 5ajv:B, 5ajw:A, 5ajx:A, 5ajy:A, 5ajz:A, 5ak0:A, 4d4j:A, 4d4k:A, 4d4l:A, 4d4m:A, 2dwo:A, 2dwp:A, 6etj:A, 6hvh:A, 6hvi:A, 6hvj:A, 2i1v:B, 6ibx:A, 6iby:A, 6ibz:A, 6ic0:A, 4ma4:A, 3qpu:A, 3qpv:A, 3qpw:A
134 7e8e:D 459 129 0.1176 0.0741 0.2636 2.9 7e87:B, 7e87:A, 7e87:C, 7e87:D, 7e8e:B, 1nn7:A, 7ukg:A, 7ukg:B, 7ukg:C, 7ukg:D
135 7u6j:B 248 33 0.0381 0.0444 0.3333 3.4 7u6i:A, 7u6j:A, 7u6j:C, 7u6j:D, 7u6j:E, 7u6j:F, 7u6j:G, 7u6j:H
136 7eeb:A 258 171 0.1176 0.1318 0.1988 3.9
137 6e1k:A 536 194 0.1419 0.0765 0.2113 7.9 6e1k:B, 6e1m:A, 6e1m:B
138 7ssy:A 346 106 0.0900 0.0751 0.2453 8.6 7ssy:B, 7ssy:C, 7ssy:D, 7wf3:B, 7wf3:D, 7wf3:F, 7wf3:H

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218