Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
WKEATTTLFCASDAKAYDTEVHNVWATHACVPTDPNPQEVKLENVTENFNMWKNNMVEQMHEDIISLWDQSLKPCVKLTG
GSVITQACPKVSFEPIPIHYCAPAGFAILKCNDKKFNGTGPCTNVSTVQCTHGIRPVVSTQLLLNGSLAEEEIVIRSENF
TNNAKTIIVQLNESVVINCTRPNNDIRQAHCNLSKTQWENTLEQIAIKLKEQFGNNKTIIFNPSSGGDPEIVTHSFNCGG
EFFYCNSTQLFTWNDTNTGRNITLPCRIKQIINMWQEVGKAMYAPPIRGQIRCSSNITGLLLTRDGGKDTNGTEIFRPGG
GDMRDNWRSELYKYKVVKIE

The query sequence (length=340) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 4laj:A 343 345 0.9912 0.9825 0.9768 0.0 4dvr:G, 2i5y:G, 2i5y:P, 2i60:G, 2i60:P, 4jzw:G, 4jzw:A, 4jzz:A, 4k0a:A, 4ka2:A, 4laj:J, 4laj:F, 4laj:B, 4r4f:A, 1yyl:G, 1yyl:P, 1yym:G, 1yym:P
2 6opp:A 389 364 0.8912 0.7789 0.8324 0.0 6opo:A, 6opo:D, 6opo:J, 6opp:D, 6opp:J, 6opq:A, 6opq:D, 6opq:E, 5vn3:G, 5vn3:I, 5vn3:J
3 6meo:G 398 384 0.8588 0.7337 0.7604 0.0 6met:G
4 6x5b:A 353 347 0.8471 0.8159 0.8300 0.0 6opn:A, 6opn:D, 6opn:G, 6x5b:D, 6x5b:J, 6x5c:A, 6x5c:D, 6x5c:E
5 4r4n:B 342 343 0.8000 0.7953 0.7930 0.0 4r4n:A, 4r4n:E, 4r4n:I, 4r4n:M, 4r4n:P, 4r4n:S, 4r4n:V
6 6edu:D 401 389 0.8618 0.7307 0.7532 0.0 6edu:E, 6edu:F
7 4xmp:G 337 342 0.8029 0.8101 0.7982 0.0
8 3tgs:A 345 349 0.7971 0.7855 0.7765 0.0 5f4l:A, 5f4l:B, 5f4p:D, 5f4p:A, 5f4r:A, 5f4r:C, 5f4u:A, 5f4u:B, 8fly:A, 8fly:B, 8fly:C, 8fly:D, 8flz:A, 8flz:D, 8flz:B, 8flz:C, 8fm0:B, 8fm0:A, 8fm0:C, 8fm0:D, 8fm2:D, 8fm2:B, 8fm2:A, 8fm2:C, 8fm3:A, 8fm3:C, 8fm3:D, 8fm3:B, 8fm4:B, 8fm4:D, 8fm4:A, 8fm4:C, 8fm5:D, 8fm5:A, 8fm5:C, 8fm5:B, 8fm7:A, 8fm7:B, 8fm7:C, 8fm7:D, 8fm8:C, 8fm8:D, 8fm8:A, 8fm8:B, 4i53:A, 4i53:B, 7rsx:C, 7rsx:B, 7rsx:A, 7rsx:D, 7rsy:A, 7rsy:B, 7rsy:C, 7rsy:D, 7rsz:B, 7rsz:A, 7rsz:C, 7rsz:D, 3tgs:B, 7tjo:D, 7tjo:A, 7tjo:C, 7tjo:B, 7tjp:A, 7tjp:B, 7tjp:D, 7tjp:C
9 4j6r:G 343 348 0.7941 0.7872 0.7759 0.0
10 5w4l:G 357 344 0.7765 0.7395 0.7674 0.0 6bf4:G, 8dcq:A, 4dko:A, 4dko:C, 4dkp:A, 4dkp:C, 4dkq:A, 4dkr:A, 4dkr:C, 4dku:A, 4dku:B, 4dkv:A, 4dkv:B, 4dvs:A, 4dvs:B, 4dvt:A, 4dvt:B, 4dvv:A, 4dvv:B, 4dvw:A, 4dvw:B, 4dvx:A, 4dvx:B, 8f9z:A, 8fa0:A, 8gcz:A, 8gd0:A, 8gd1:A, 8gd3:A, 8gd5:A, 8gdj:A, 8gdk:A, 8gjt:A, 4i54:A, 4i54:B, 5kjr:G, 4lsq:G, 6mfp:G, 6mfp:A, 6mg7:G, 7n8q:G, 3ngb:G, 3ngb:A, 3ngb:D, 3ngb:I, 6one:A, 6onf:A, 6onh:A, 6onv:A, 6ooo:A, 6p9n:A, 4rfn:G, 4rfn:A, 4rfo:G, 4rz8:A, 4rz8:B, 4rz8:C, 4rz8:D, 3se9:G, 5u6e:A, 5u6e:B, 5uem:G, 6usw:A, 6ut1:A, 5w4l:A, 6w4m:G
11 6cm3:D 372 354 0.7941 0.7258 0.7627 0.0 6cm3:E, 6cm3:F, 7lo6:C, 7lo6:A, 7lo6:E, 7lok:A, 7lok:C, 7lok:E, 6u0l:B, 6u0l:C, 6u0n:A, 6u0n:C
12 7txd:A 397 374 0.8000 0.6851 0.7273 0.0 7txd:E
13 5fa2:A 336 339 0.7529 0.7619 0.7552 0.0
14 5te4:G 341 346 0.7529 0.7507 0.7399 0.0
15 1gc1:G 297 306 0.7412 0.8485 0.8235 0.0
16 8czz:A 440 421 0.7735 0.5977 0.6247 3.78e-178 8czz:E, 8czz:I
17 8d53:G 446 420 0.7794 0.5942 0.6310 6.20e-178
18 8tgw:A 387 407 0.7794 0.6848 0.6511 1.49e-173
19 7n6u:B 595 284 0.6735 0.3849 0.8063 5.46e-160 5fuu:A, 5fuu:D, 5fuu:E, 5fuu:F, 6j5e:K, 7n6u:C, 7n6u:A, 7n6w:A, 7n6w:B, 7n6w:C, 6olp:C, 7ska:B, 7ska:O, 7ska:Z, 6vpx:C, 5y14:C, 5y14:A, 5y14:B, 5yc0:B, 5yc0:C, 5yc0:F
20 7n6u:B 595 79 0.2235 0.1277 0.9620 6.70e-46 5fuu:A, 5fuu:D, 5fuu:E, 5fuu:F, 6j5e:K, 7n6u:C, 7n6u:A, 7n6w:A, 7n6w:B, 7n6w:C, 6olp:C, 7ska:B, 7ska:O, 7ska:Z, 6vpx:C, 5y14:C, 5y14:A, 5y14:B, 5yc0:B, 5yc0:C, 5yc0:F
21 8fae:A 468 295 0.6647 0.4829 0.7661 5.41e-156 8fad:C, 8fad:E, 8fad:A, 8fae:C, 8fae:E
22 8fae:A 468 79 0.2265 0.1645 0.9747 1.11e-47 8fad:C, 8fad:E, 8fad:A, 8fae:C, 8fae:E
23 6ch9:G 448 283 0.6647 0.5045 0.7986 2.17e-155 6mug:G
24 6ch9:G 448 79 0.2235 0.1696 0.9620 3.02e-47 6mug:G
25 8d0y:G 455 283 0.5912 0.4418 0.7102 5.04e-140 5cez:G, 6ch8:G, 6de7:G, 5i8h:A, 5i8h:C, 7l7u:A, 7l7u:C, 7l7u:E, 6mtj:G, 6mtn:G, 6mu6:G, 6mu7:G, 6mu8:G, 7pc2:A, 7rai:A, 7rai:C, 7rai:E, 8s2e:E, 5t3z:G, 8tjr:B, 8tjr:C, 8tjs:G, 8tjs:N, 8tjs:O, 8ttw:E, 8ttw:I, 8ttw:A, 4tvp:G, 5u7m:G, 5u7o:G, 7ucf:G, 5utf:G, 5v7j:G, 4zmj:G
26 8d0y:G 455 86 0.2118 0.1582 0.8372 1.67e-43 5cez:G, 6ch8:G, 6de7:G, 5i8h:A, 5i8h:C, 7l7u:A, 7l7u:C, 7l7u:E, 6mtj:G, 6mtn:G, 6mu6:G, 6mu7:G, 6mu8:G, 7pc2:A, 7rai:A, 7rai:C, 7rai:E, 8s2e:E, 5t3z:G, 8tjr:B, 8tjr:C, 8tjs:G, 8tjs:N, 8tjs:O, 8ttw:E, 8ttw:I, 8ttw:A, 4tvp:G, 5u7m:G, 5u7o:G, 7ucf:G, 5utf:G, 5v7j:G, 4zmj:G
27 7lu9:e 461 312 0.5971 0.4403 0.6506 4.16e-135 7lu9:f
28 7lu9:e 461 79 0.2059 0.1518 0.8861 3.80e-44 7lu9:f
29 6pwu:A 615 288 0.5824 0.3220 0.6875 1.77e-134 6j5e:I, 6ulc:C, 6ulc:A, 3vtp:C, 5yb2:E, 5yb2:F, 5yb2:D, 5yb2:A, 5yb2:B, 5yb2:C, 5yb2:M, 5yb3:E, 5yb3:F, 5yb3:D, 5yc0:A, 5yc0:D, 5yc0:E, 5z0w:E, 5zcx:A, 5zpw:A, 5zpw:E, 5zpw:C
30 6pwu:A 615 79 0.2088 0.1154 0.8987 5.73e-44 6j5e:I, 6ulc:C, 6ulc:A, 3vtp:C, 5yb2:E, 5yb2:F, 5yb2:D, 5yb2:A, 5yb2:B, 5yb2:C, 5yb2:M, 5yb3:E, 5yb3:F, 5yb3:D, 5yc0:A, 5yc0:D, 5yc0:E, 5z0w:E, 5zcx:A, 5zpw:A, 5zpw:E, 5zpw:C
31 5fyj:G 479 289 0.5706 0.4050 0.6713 1.14e-129
32 5fyj:G 479 79 0.2059 0.1461 0.8861 9.82e-44
33 7mxd:A 472 290 0.5647 0.4068 0.6621 1.64e-128 7mxd:F, 7mxd:G, 7n28:A
34 7mxd:A 472 93 0.2147 0.1547 0.7849 1.43e-43 7mxd:F, 7mxd:G, 7n28:A
35 6tyb:G 345 361 0.3824 0.3768 0.3601 1.89e-59 3fus:A
36 7t4g:A 493 299 0.2794 0.1927 0.3177 1.23e-33 7t4g:C, 7t4g:E
37 7t4g:A 493 90 0.1088 0.0751 0.4111 5.67e-11 7t4g:C, 7t4g:E
38 6j6o:A 192 63 0.0529 0.0938 0.2857 0.18 6j6p:A
39 4z67:A 309 41 0.0382 0.0421 0.3171 1.9 6e13:A, 3jxp:A, 1xto:A, 4z5y:A, 4z5z:A, 4z60:A, 4z6x:A
40 6lu0:A 937 61 0.0471 0.0171 0.2623 3.1
41 6ltr:A 1037 61 0.0471 0.0154 0.2623 3.7 6ltu:A
42 6ltp:G 923 61 0.0471 0.0173 0.2623 3.7 6ltp:A
43 8qjp:A 250 88 0.0676 0.0920 0.2614 4.3 8qjl:A, 8qjm:A, 8qjm:B, 8qjn:A, 8qjn:B, 8qjo:A, 8qjo:B, 8qjp:B, 8qjq:A, 8qjq:B
44 8hud:A 767 50 0.0324 0.0143 0.2200 4.4
45 5xg3:B 374 27 0.0265 0.0241 0.3333 4.9 5h67:A, 5xg3:A
46 2bty:A 282 46 0.0412 0.0496 0.3043 5.9 2bty:B, 2bty:C
47 2q04:A 211 31 0.0353 0.0569 0.3871 6.3 2q04:B, 2q04:C, 2q04:F
48 5w2i:A 239 38 0.0382 0.0544 0.3421 7.8 6m88:A, 6m89:A, 6m8a:A, 6m8b:A, 6m8c:A, 6m8d:A, 6m8e:A, 5w2h:A
49 3atp:A 151 34 0.0235 0.0530 0.2353 8.3 3atp:B

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218