Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
WEDADTTLFCASDAKAYSTEKHNVWATHACVPTDPDPQEIPLENVTENFNMWKNNMVEQMHEDIISLWDESLKPCVMLTG
GSTIKQACPKVTFEPIPIHYCAPAGFAILKCRDEDFNGTGPCKNVSTVQCTHGIKPVVSTQLLLNGSLAKGDIVIRSENL
TNNAKVIIVQLNEPVQIVCIRPDIRQAHCNVTRGKWVNITKNVKEQLWKIFNKTTNITFNNTIFNSPAGGDLEITTHSFN
CGGEFFYCNTSDLFNETNNENITLQCRIKQIVRMWQRVGQAMYAPPIAGNITCISNITGLLLTRDGVNDTHDKENETFRP
TGGDMRDNWRSELYKYKVIKL

The query sequence (length=341) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 5te4:G 341 341 1.0000 1.0000 1.0000 0.0
2 4xmp:G 337 345 0.7742 0.7834 0.7652 0.0
3 4r4n:B 342 349 0.7625 0.7602 0.7450 0.0 4r4n:A, 4r4n:E, 4r4n:I, 4r4n:M, 4r4n:P, 4r4n:S, 4r4n:V
4 4j6r:G 343 350 0.7713 0.7668 0.7514 0.0
5 3tgs:A 345 354 0.7507 0.7420 0.7232 0.0 5f4l:A, 5f4l:B, 5f4p:D, 5f4p:A, 5f4r:A, 5f4r:C, 5f4u:A, 5f4u:B, 8fly:A, 8fly:B, 8fly:C, 8fly:D, 8flz:A, 8flz:D, 8flz:B, 8flz:C, 8fm0:B, 8fm0:A, 8fm0:C, 8fm0:D, 8fm2:D, 8fm2:B, 8fm2:A, 8fm2:C, 8fm3:A, 8fm3:C, 8fm3:D, 8fm3:B, 8fm4:B, 8fm4:D, 8fm4:A, 8fm4:C, 8fm5:D, 8fm5:A, 8fm5:C, 8fm5:B, 8fm7:A, 8fm7:B, 8fm7:C, 8fm7:D, 8fm8:C, 8fm8:D, 8fm8:A, 8fm8:B, 4i53:A, 4i53:B, 7rsx:C, 7rsx:B, 7rsx:A, 7rsx:D, 7rsy:A, 7rsy:B, 7rsy:C, 7rsy:D, 7rsz:B, 7rsz:A, 7rsz:C, 7rsz:D, 3tgs:B, 7tjo:D, 7tjo:A, 7tjo:C, 7tjo:B, 7tjp:A, 7tjp:B, 7tjp:D, 7tjp:C
6 4laj:A 343 351 0.7478 0.7434 0.7265 0.0 4dvr:G, 2i5y:G, 2i5y:P, 2i60:G, 2i60:P, 4jzw:G, 4jzw:A, 4jzz:A, 4k0a:A, 4ka2:A, 4laj:J, 4laj:F, 4laj:B, 4r4f:A, 1yyl:G, 1yyl:P, 1yym:G, 1yym:P
7 6cm3:D 372 358 0.7478 0.6855 0.7123 0.0 6cm3:E, 6cm3:F, 7lo6:C, 7lo6:A, 7lo6:E, 7lok:A, 7lok:C, 7lok:E, 6u0l:B, 6u0l:C, 6u0n:A, 6u0n:C
8 7txd:A 397 379 0.7507 0.6448 0.6755 0.0 7txd:E
9 5w4l:G 357 350 0.7185 0.6863 0.7000 1.14e-180 6bf4:G, 8dcq:A, 4dko:A, 4dko:C, 4dkp:A, 4dkp:C, 4dkq:A, 4dkr:A, 4dkr:C, 4dku:A, 4dku:B, 4dkv:A, 4dkv:B, 4dvs:A, 4dvs:B, 4dvt:A, 4dvt:B, 4dvv:A, 4dvv:B, 4dvw:A, 4dvw:B, 4dvx:A, 4dvx:B, 8f9z:A, 8fa0:A, 8gcz:A, 8gd0:A, 8gd1:A, 8gd3:A, 8gd5:A, 8gdj:A, 8gdk:A, 8gjt:A, 4i54:A, 4i54:B, 5kjr:G, 4lsq:G, 6mfp:G, 6mfp:A, 6mg7:G, 7n8q:G, 3ngb:G, 3ngb:A, 3ngb:D, 3ngb:I, 6one:A, 6onf:A, 6onh:A, 6onv:A, 6ooo:A, 6p9n:A, 4rfn:G, 4rfn:A, 4rfo:G, 4rz8:A, 4rz8:B, 4rz8:C, 4rz8:D, 3se9:G, 5u6e:A, 5u6e:B, 5uem:G, 6usw:A, 6ut1:A, 5w4l:A, 6w4m:G
10 6x5b:A 353 350 0.7273 0.7025 0.7086 1.03e-175 6opn:A, 6opn:D, 6opn:G, 6x5b:D, 6x5b:J, 6x5c:A, 6x5c:D, 6x5c:E
11 6opp:A 389 371 0.7390 0.6478 0.6792 2.31e-175 6opo:A, 6opo:D, 6opo:J, 6opp:D, 6opp:J, 6opq:A, 6opq:D, 6opq:E, 5vn3:G, 5vn3:I, 5vn3:J
12 5fa2:A 336 343 0.6950 0.7054 0.6910 1.29e-172
13 6meo:G 398 389 0.7507 0.6432 0.6581 2.43e-172 6met:G
14 8d53:G 446 425 0.7243 0.5538 0.5812 9.56e-165
15 6edu:D 401 396 0.7185 0.6110 0.6187 3.11e-163 6edu:E, 6edu:F
16 1gc1:G 297 307 0.5982 0.6869 0.6645 4.30e-143
17 8tgw:A 387 410 0.6393 0.5633 0.5317 4.43e-136
18 5fyj:G 479 293 0.5660 0.4029 0.6587 3.02e-131
19 5fyj:G 479 79 0.2199 0.1566 0.9494 3.65e-47
20 8d0y:G 455 433 0.6481 0.4857 0.5104 2.19e-130 5cez:G, 6ch8:G, 6de7:G, 5i8h:A, 5i8h:C, 7l7u:A, 7l7u:C, 7l7u:E, 6mtj:G, 6mtn:G, 6mu6:G, 6mu7:G, 6mu8:G, 7pc2:A, 7rai:A, 7rai:C, 7rai:E, 8s2e:E, 5t3z:G, 8tjr:B, 8tjr:C, 8tjs:G, 8tjs:N, 8tjs:O, 8ttw:E, 8ttw:I, 8ttw:A, 4tvp:G, 5u7m:G, 5u7o:G, 7ucf:G, 5utf:G, 5v7j:G, 4zmj:G
21 8fae:A 468 300 0.5308 0.3868 0.6033 1.47e-120 8fad:C, 8fad:E, 8fad:A, 8fae:C, 8fae:E
22 8fae:A 468 79 0.2053 0.1496 0.8861 8.22e-43 8fad:C, 8fad:E, 8fad:A, 8fae:C, 8fae:E
23 7lu9:e 461 318 0.5396 0.3991 0.5786 9.60e-120 7lu9:f
24 7lu9:e 461 79 0.1877 0.1388 0.8101 5.17e-40 7lu9:f
25 6ch9:G 448 289 0.5367 0.4085 0.6332 2.09e-119 6mug:G
26 6ch9:G 448 79 0.2023 0.1540 0.8734 7.28e-42 6mug:G
27 7n6u:B 595 290 0.5249 0.3008 0.6172 5.73e-118 5fuu:A, 5fuu:D, 5fuu:E, 5fuu:F, 6j5e:K, 7n6u:C, 7n6u:A, 7n6w:A, 7n6w:B, 7n6w:C, 6olp:C, 7ska:B, 7ska:O, 7ska:Z, 6vpx:C, 5y14:C, 5y14:A, 5y14:B, 5yc0:B, 5yc0:C, 5yc0:F
28 7n6u:B 595 79 0.1965 0.1126 0.8481 3.45e-40 5fuu:A, 5fuu:D, 5fuu:E, 5fuu:F, 6j5e:K, 7n6u:C, 7n6u:A, 7n6w:A, 7n6w:B, 7n6w:C, 6olp:C, 7ska:B, 7ska:O, 7ska:Z, 6vpx:C, 5y14:C, 5y14:A, 5y14:B, 5yc0:B, 5yc0:C, 5yc0:F
29 6pwu:A 615 294 0.5308 0.2943 0.6156 2.79e-116 6j5e:I, 6ulc:C, 6ulc:A, 3vtp:C, 5yb2:E, 5yb2:F, 5yb2:D, 5yb2:A, 5yb2:B, 5yb2:C, 5yb2:M, 5yb3:E, 5yb3:F, 5yb3:D, 5yc0:A, 5yc0:D, 5yc0:E, 5z0w:E, 5zcx:A, 5zpw:A, 5zpw:E, 5zpw:C
30 6pwu:A 615 79 0.1994 0.1106 0.8608 2.53e-41 6j5e:I, 6ulc:C, 6ulc:A, 3vtp:C, 5yb2:E, 5yb2:F, 5yb2:D, 5yb2:A, 5yb2:B, 5yb2:C, 5yb2:M, 5yb3:E, 5yb3:F, 5yb3:D, 5yc0:A, 5yc0:D, 5yc0:E, 5z0w:E, 5zcx:A, 5zpw:A, 5zpw:E, 5zpw:C
31 8czz:A 440 289 0.5132 0.3977 0.6055 9.28e-116 8czz:E, 8czz:I
32 8czz:A 440 79 0.2053 0.1591 0.8861 2.95e-43 8czz:E, 8czz:I
33 7mxd:A 472 295 0.5015 0.3623 0.5797 4.63e-112 7mxd:F, 7mxd:G, 7n28:A
34 7mxd:A 472 79 0.1994 0.1441 0.8608 4.81e-42 7mxd:F, 7mxd:G, 7n28:A
35 6tyb:G 345 360 0.3460 0.3420 0.3278 1.03e-54 3fus:A
36 7t4g:A 493 298 0.2463 0.1704 0.2819 6.91e-29 7t4g:C, 7t4g:E
37 7t4g:A 493 79 0.0938 0.0649 0.4051 2.09e-10 7t4g:C, 7t4g:E
38 6rmw:C 386 51 0.0469 0.0415 0.3137 0.033 6rmd:D, 6rme:A, 6rme:B, 6rme:C, 6rme:D, 6rme:E, 6rme:F, 6rme:G, 6rme:H, 6rmw:A, 6rmw:B, 6rmw:D, 6rmw:E, 6rmw:F, 6rmw:G, 6rmw:H
39 5nxb:A 644 120 0.0909 0.0481 0.2583 0.050 4ccc:A, 4ccd:A, 4cce:A, 5nxb:B, 4ufh:A, 4ufi:A, 4ufj:A, 4ufk:A, 4ufl:A, 4ufm:A, 6y6s:A, 6y6t:A, 3zr5:A, 3zr6:A
40 3v0s:A 287 54 0.0528 0.0627 0.3333 0.30 3v0t:A
41 4z67:A 309 41 0.0381 0.0421 0.3171 2.0 6e13:A, 3jxp:A, 1xto:A, 4z5y:A, 4z5z:A, 4z60:A, 4z6x:A
42 6sf6:H 216 72 0.0616 0.0972 0.2917 2.1 6sf6:A
43 6j6o:A 192 63 0.0469 0.0833 0.2540 4.9 6j6p:A
44 6k0w:B 499 117 0.0762 0.0521 0.2222 5.2
45 7aor:f 233 86 0.0674 0.0987 0.2674 5.3
46 2bty:A 282 46 0.0411 0.0496 0.3043 6.3 2bty:B, 2bty:C

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218