Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
VYQEPTDPKFPQQWYLSGVTQRDLNVKAAWAQGYTGHGIVVSILDDGIEKNHPDLAGNYDPGASFDVNDQDPDPQPRYTQ
MNDNRHGTRCAGEVAAVANNGVCGVGVAYNARIGGVRMLDGEVTDAVEARSLGLNPNHIHIYSASWGPEDDGKTVDGPAR
LAEEAFFRGVSQGRGGLGSIFVWASGNGGREHDSCNCDGYTNSIYTLSISSATQFGNVPWYSEACSSTLATTYSSGNQNE
KQIVTTDLRQKCTESHTGTSASAPLAAGIIALTLEANKNLTWRDMQHLVVQTSKPAHLNANDWATNGVGRKVSHSYGYGL
LDAGAMVALAQNWTTVAPQRKCIIDILTEPKDIGKRLEVRKTVTACLGEPNHITRLEHAQARLTLSYNRRGDLAIHLVSP
MGTRSTLLAARPHDYSADGFNDWAFMTTHSWDEDPSGEWVLEIENTSEANNYGTLTKFTLVLYGTA

The query sequence (length=466) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 8b4x:A 473 466 1.0000 0.9852 1.0000 0.0 8b4v:A, 8b4w:A, 6eqv:A, 6eqw:A, 6eqx:A, 6hlb:A, 6hld:A, 6hle:A, 6hza:A, 6hzb:A, 6hzc:A, 6hzd:A, 5jmo:A, 5jmo:B, 5jxg:A, 5jxh:A, 5jxi:A, 5jxj:A, 7lcu:A, 5mim:A, 7o1u:A, 7o1w:A, 7o1y:A, 7o20:A, 7o22:A, 4omc:A, 4omc:B, 4omc:C, 4omc:D, 4omc:E, 4omc:F, 4omd:A, 4omd:B, 4omd:C, 4omd:D, 4omd:E, 4omd:F, 8oyh:A, 1p8j:A, 1p8j:D, 1p8j:B, 1p8j:C, 1p8j:E, 1p8j:F, 1p8j:G, 1p8j:H, 7qxy:A, 7qxz:A, 7qy0:A, 7qy1:A, 7qy2:A, 4ryd:A, 4ryd:B, 4ryd:C, 4ryd:D, 4ryd:E, 4ryd:F, 6yd2:A, 6yd3:A, 6yd4:A, 6yd7:A, 4z2a:A
2 1r64:A 481 468 0.4077 0.3950 0.4060 2.42e-116 2id4:A, 2id4:B, 1ot5:A, 1ot5:B, 1r64:B
3 3wqb:A 597 536 0.2704 0.2111 0.2351 1.72e-20 3hjr:A
4 3ti9:A 341 374 0.2167 0.2962 0.2701 2.75e-18 3ti7:A
5 8ehe:A 353 371 0.2210 0.2918 0.2776 9.77e-18
6 3lpa:A 340 366 0.2039 0.2794 0.2596 8.57e-17 3lpc:A, 3lpd:A
7 1tec:E 279 116 0.0987 0.1649 0.3966 2.18e-12 2tec:E, 3tec:E, 1thm:A
8 5yl7:A 339 323 0.1867 0.2566 0.2693 6.31e-12
9 3whi:A 355 110 0.0837 0.1099 0.3545 4.00e-10 4dww:A, 5gl8:B, 1mee:A, 6o44:A, 6o44:B, 6pak:A, 6pak:B, 1scj:A, 3vyv:A, 3vyv:B, 3whi:B
10 7w2a:A 354 380 0.2232 0.2938 0.2737 6.01e-10 7w2a:B
11 7y6m:C 290 282 0.1502 0.2414 0.2482 3.17e-09 7y6m:D
12 5aqe:A 269 268 0.1717 0.2974 0.2985 3.39e-09 5arb:A, 5arc:A, 5ard:A, 3bx1:A, 3bx1:B, 1c9j:A, 1c9m:A, 1c9n:A, 4cfy:A, 4cfz:A, 4cg0:A, 1gci:A, 1iav:A, 1jea:A, 1mpt:A, 1ndq:A, 1ndu:A, 1q5p:A, 1st3:A, 1svn:A, 1tk2:A, 1wsd:A, 6y5s:A, 6y5t:A
13 1dbi:A 271 105 0.0837 0.1439 0.3714 1.40e-08
14 2b6n:A 278 276 0.1459 0.2446 0.2464 3.27e-08
15 8pol:B 479 286 0.1309 0.1273 0.2133 7.72e-08 4lvn:A, 4lvo:A, 8pol:A
16 8h7o:A 281 103 0.0837 0.1388 0.3786 8.36e-08 1a2q:A, 1ak9:A, 7am6:C, 7am7:C, 7am8:A, 1aqn:A, 1au9:A, 3bgo:S, 3cnq:S, 1dui:A, 8h7p:A, 1lw6:E, 5ox2:A, 1s01:A, 1s02:A, 1sbh:A, 1sbi:A, 1sbn:E, 1sib:E, 2sic:E, 3sic:E, 5sic:E, 2sni:E, 1st2:A, 2st1:A, 1sua:A, 1sub:A, 1sud:A, 1sue:A, 1sup:A, 1tm1:E, 1tm3:E, 1tm4:E, 1tm5:E, 1tm7:E, 1tmg:E, 1to1:E, 1to2:E, 1ubn:A, 1v5i:A, 1y1k:E, 1y33:E, 1y34:E, 1y3b:E, 1y3c:E, 1y3d:E, 1y3f:E, 1y48:E, 1y4a:E, 1y4d:E, 1yja:A, 1yjb:A, 1yjc:A
17 6uai:S 266 82 0.0751 0.1316 0.4268 4.18e-06 6uao:S, 6ube:S
18 4tr2:B 474 289 0.1395 0.1371 0.2249 4.40e-06 8coy:A, 8coy:B, 8coz:A, 8coz:B, 8cp0:A, 8qke:A, 8qke:B, 8qkg:A, 8qkg:B, 8qkj:A, 8qkj:B, 4tr2:A
19 1af4:A 274 76 0.0687 0.1168 0.4211 5.85e-06 1be6:A, 1be8:A, 1bfk:A, 1bfu:A, 1c3l:A, 4c3u:A, 4c3v:A, 1cse:E, 6dwq:A, 4hx2:A, 4hx2:C, 1oyv:A, 1oyv:B, 1r0r:E, 1sbc:A, 1sca:A, 1scb:A, 1scd:A, 1scn:E, 1sel:A, 1sel:B, 2sec:E, 3unx:A, 2wuv:A, 2wuw:E, 1yu6:A, 1yu6:B
20 1s2n:A 281 183 0.1030 0.1708 0.2623 6.71e-06 1s2n:B, 1sh7:A, 1sh7:B
21 8e7f:A 614 116 0.0794 0.0603 0.3190 1.17e-05
22 1bh6:A 274 174 0.1073 0.1825 0.2874 1.64e-04
23 3f7o:A 284 118 0.0708 0.1162 0.2797 1.78e-04 3f7o:B
24 4dzt:A 276 113 0.0730 0.1232 0.3009 2.27e-04
25 3wiv:C 397 316 0.1717 0.2015 0.2532 3.15e-04 3a3n:A, 3a3n:B, 3a3o:A, 3a3o:B, 3a3p:A, 3a3p:B, 2e1p:A, 4jp8:A, 3vhq:A, 3vv2:A, 3vv2:B, 3wiu:A, 3wiu:B, 3wiu:C, 3wiv:A, 3wiv:B, 2z2x:A, 2z2y:A, 2z2y:B, 2z2y:C, 2z2y:D, 2z2z:A, 2z30:A, 2z30:B, 2z56:A, 2z56:B, 2z57:A, 2z57:B, 2z58:A, 2z58:B, 2zrq:A, 2zwo:A, 2zwo:B, 2zwo:C, 2zwp:A, 2zwp:B
26 3vv3:A 329 307 0.1631 0.2310 0.2476 3.82e-04 3vv3:B
27 8c4x:A 276 172 0.0987 0.1667 0.2674 5.40e-04
28 1v6c:B 436 101 0.0687 0.0734 0.3168 6.02e-04 1v6c:A, 1wvm:A, 1wvm:B, 1y9z:A, 1y9z:B
29 2xrm:A 301 96 0.0730 0.1130 0.3542 8.05e-04
30 7a9f:A 279 85 0.0579 0.0968 0.3176 0.001 7a9k:A, 7a9m:A, 3aj8:A, 3aj9:A, 5avj:A, 5b1d:A, 5b1e:A, 4b5l:A, 1bjr:E, 7c0p:A, 1cnm:A, 5cw1:A, 3d9q:X, 3ddz:X, 3de0:X, 3de1:X, 3de2:X, 3de5:X, 3de6:X, 3de7:X, 2dp4:E, 2dqk:A, 2duj:A, 3dvq:X, 3dvr:X, 3dvs:X, 3dw1:X, 3dw3:X, 3dwe:X, 3dyb:A, 8e52:AAA, 8e53:AAA, 1egq:A, 8f05:A, 8f06:A, 8f07:A, 6fjs:A, 4fon:A, 8fyo:A, 8fyp:A, 8fyq:A, 8fyr:A, 8fys:A, 2g4v:A, 3gt3:A, 3gt4:A, 2hd4:A, 2hpz:A, 1ht3:A, 3i2y:X, 3i30:X, 3i34:X, 3i37:X, 1ic6:A, 2id8:A, 6j43:A, 7jsy:A, 6k2p:A, 6k2r:A, 6k2s:A, 6k2t:A, 6k2v:A, 6k2w:A, 5k7s:A, 6k8m:E, 6kkf:A, 5kxu:A, 5kxv:A, 3l1k:A, 7ln7:A, 7lpt:A, 7lpu:A, 7lpv:A, 7lq8:A, 7lq9:A, 7lqa:A, 7lqb:A, 7lqc:A, 7ltd:A, 7lti:A, 7ltv:A, 7lu0:A, 7lu1:A, 7lu2:A, 7lu3:A, 6mh6:A, 5mjl:A, 6n4u:A, 7nuz:A, 3osz:A, 1oyo:A, 1p7v:A, 1p7w:A, 1pek:E, 1pfg:A, 1pj8:A, 2pq2:A, 6pq0:A, 6pq4:A, 2prk:A, 3prk:E, 1ptk:A, 3ptl:A, 6pu4:A, 6pu5:A, 2pwa:A, 2pwb:A, 2pyz:A, 3q40:A, 3q5g:A, 6qf1:A, 3qmp:A, 6qxv:A, 5rof:A, 5rol:A, 5ron:A, 5rop:A, 5roq:A, 5ror:A, 5row:A, 5rp6:A, 5rp7:A, 5rp9:A, 5rpa:A, 5rpc:A, 5rpd:A, 5rpg:A, 5rph:A, 5rpj:A, 5rpk:A, 5rpm:A, 6rug:A, 6ruh:A, 6ruk:A, 6run:A, 6ruw:A, 6rve:A, 6rvg:A, 6rzp:A, 7s4z:A, 8sdk:A, 7skx:C, 8sog:A, 8sou:A, 8sov:A, 8spl:A, 8sqv:A, 6txg:A, 5uvl:A, 2v8b:A, 6v8r:A, 5whw:A, 5wjg:A, 5wjh:A, 5wrc:A, 4zar:A, 6zet:AAA, 6zeu:AAA, 6zev:AAA
31 3t41:A 423 193 0.1009 0.1111 0.2435 0.002 3t41:B
32 1r6v:A 671 333 0.1717 0.1192 0.2402 0.005
33 5wsl:A 282 108 0.0730 0.1206 0.3148 0.008 5wsl:B, 5wsl:C
34 2gko:A 309 84 0.0601 0.0906 0.3333 0.011
35 8c4z:B 282 110 0.0665 0.1099 0.2818 0.038
36 3d43:B 310 90 0.0601 0.0903 0.3111 0.081 3d43:A, 1ea7:A, 2ixt:A, 2ixt:B
37 5ffn:A 311 85 0.0601 0.0900 0.3294 0.12
38 7edd:A 1394 32 0.0279 0.0093 0.4062 0.22 5xyr:A
39 5xya:A 1358 32 0.0279 0.0096 0.4062 0.23 5xxz:A
40 5xxz:B 1310 32 0.0279 0.0099 0.4062 0.23
41 3afg:B 507 316 0.1652 0.1519 0.2437 0.26 3afg:A
42 3w5m:A 1030 80 0.0558 0.0252 0.3250 1.0 3w5n:A
43 5fq6:M 948 70 0.0429 0.0211 0.2857 1.5 5fq6:D, 5fq6:I, 5fq6:B, 5fq7:D, 5fq7:B, 5fq8:B, 5fq8:D
44 8uw8:A 738 30 0.0236 0.0149 0.3667 1.7
45 7bj3:A 936 40 0.0365 0.0182 0.4250 2.3 8bty:A, 3eif:A, 1xf1:A, 1xf1:B, 7yzx:A
46 6vjb:A 1346 32 0.0258 0.0089 0.3750 2.3
47 5z6o:A 282 116 0.0687 0.1135 0.2759 4.1
48 4f35:B 414 31 0.0300 0.0338 0.4516 5.2
49 7t9g:A 445 31 0.0300 0.0315 0.4516 5.2 4f35:D, 4f35:A, 4f35:C, 6okz:C, 6okz:B, 7t9g:Y, 6wtx:C, 6wtx:D, 6wtx:A, 6wtx:B
50 7zoy:A 226 38 0.0300 0.0619 0.3684 7.9 7zou:A, 7zov:A
51 6bs3:A 330 54 0.0408 0.0576 0.3519 8.0 6bs4:A, 6bs5:A
52 3s2s:A 182 42 0.0258 0.0659 0.2857 8.2 3s2s:B, 3s2s:C, 3s2s:D

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218