BioLiP

>protein
VVGTFKAKDLIVTPATILKEKPDPNNLVFGTVFTDHMLTVEWSSEFGWEKPHIKPLQNLSLHPGSSALHYAVELFEGLKA
FRGVDNKIRLFQPNLNMDRMYRSAVRATLPVFDKEELLECIQQLVKLDQEWVPYSTSASLYIRPAFIGTEPSLGVKKPTK
ALLFVLLSPVGPYFSSGTFNPVSLWANPKYVRAWKGGTGDCKMGGNYGSSLFAQCEDVDNGCQQVLWLYGRDHQITEVGT
MNLFLYWINEDGEEELATPPLDGIILPGVTRRCILDLAHQWGEFKVSERYLTMDDLTTALEGNRVREMFSSGTACVVCPV
SDILYKGETIHIPTMENGPKLASRILSKLTDIQYGREESDWTIVLS

The query sequence (length=366) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	2abj:A	366	366	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	2abj:D, 2abj:G, 2abj:J, 2cog:A, 2cog:B, 2coi:A, 2coi:B, 2coj:A, 2coj:B, 7ntr:A, 7ntr:B, 7nwa:A, 7nwa:B, 7nwb:A, 7nwb:B, 7nwb:C, 7nwb:D, 7nwc:A, 7nwc:B, 7nwc:C, 7nwc:D, 7nwe:A, 7nwe:B, 7nwm:A, 7nwm:B, 7nxn:A, 7nxn:B, 7nxo:A, 7nxo:B, 7ny2:A, 7ny2:B, 7ny9:A, 7ny9:B, 7nya:A, 7nya:B
2	1ekf:A	365	359	0.5765	0.5781	0.5877	9.93e-160	2a1h:A, 2a1h:B, 5bwr:A, 5bwr:B, 5bwt:A, 5bwt:B, 5bwu:A, 5bwu:B, 5bwv:A, 5bwv:B, 5bww:A, 5bww:B, 5bwx:A, 5bwx:B, 5cr5:A, 5cr5:B, 1ekf:B, 1ekp:A, 1ekp:B, 1ekv:A, 1ekv:B, 2hdk:A, 2hdk:B, 2hg8:A, 2hg8:B, 2hgw:A, 2hgw:B, 2hgx:A, 2hgx:B, 2hhf:A, 2hhf:B, 5hne:A, 5hne:B, 5i5s:A, 5i5s:B, 5i5t:A, 5i5t:B, 5i5u:A, 5i5u:B, 5i5v:A, 5i5v:B, 5i5w:A, 5i5w:B, 5i5x:A, 5i5x:B, 5i5y:A, 5i5y:B, 5i60:A, 5i60:B, 1kt8:A, 1kt8:B, 1kta:A, 1kta:B, 5mpr:A, 6prx:A, 6prx:B
3	3ht5:A	335	324	0.3388	0.3701	0.3827	7.11e-74	5u3f:A, 5u3f:B
4	3dtf:A	363	345	0.3579	0.3609	0.3797	1.46e-70	3dtf:B, 3dtg:A, 3dtg:B, 3jz6:A, 3jz6:B
5	3uyy:B	337	340	0.3033	0.3294	0.3265	1.48e-46	3uyy:A, 3uzb:A, 3uzb:B, 3uzb:C, 3uzb:D, 3uzo:A, 3uzo:B
6	6jif:B	334	316	0.2760	0.3024	0.3196	3.08e-42	6jif:A
7	1i1l:A	304	328	0.2459	0.2961	0.2744	1.71e-19	1a3g:A, 1a3g:B, 1a3g:C, 1i1k:A, 1i1k:B, 1i1k:C, 1i1l:B, 1i1l:C, 1i1m:A, 1i1m:B, 1i1m:C, 1iyd:A, 1iyd:B, 1iyd:C, 1iye:A, 1iye:B, 1iye:C
8	4whx:A	306	327	0.2350	0.2810	0.2630	8.46e-14	4whx:C, 4whx:D, 4whx:E
9	2ej0:B	305	281	0.2295	0.2754	0.2989	3.38e-13	2eiy:A, 2eiy:B, 2eiy:C, 2ej0:A, 2ej0:C, 2ej0:D, 2ej0:E, 2ej0:F, 2ej2:A, 2ej2:B, 2ej2:C, 2ej2:D, 2ej2:E, 2ej2:F, 2ej3:A, 2ej3:B, 2ej3:C, 1wrv:A, 1wrv:B, 1wrv:C
10	6thq:B	301	297	0.2022	0.2458	0.2492	2.40e-11	5ce8:A, 5ce8:B, 5ce8:C, 6thq:A, 6thq:C
11	6h65:C	308	323	0.1940	0.2305	0.2198	7.54e-10	6h65:A, 6h65:B, 6h65:D, 6h65:E, 6h65:F
12	3csw:C	275	110	0.1066	0.1418	0.3545	0.001	3csw:A
13	7nea:A	309	122	0.0902	0.1068	0.2705	0.11	6gkr:A, 6gkr:B, 6gkr:C, 7neb:A, 6q8e:A
14	7wao:A	502	97	0.0656	0.0478	0.2474	0.94	7waj:A, 7wak:A, 7wal:A
15	8ivp:B	322	244	0.1612	0.1832	0.2418	1.1	8ivp:A, 8ivp:C, 8ivp:D
16	8ahu:A	283	62	0.0574	0.0742	0.3387	1.6	7p7x:A, 8raf:A, 8rai:A, 8yrt:A, 8yru:A, 8yrv:A
17	2o5c:A	634	100	0.0738	0.0426	0.2700	3.2	1i7d:A, 2o19:A, 2o19:B, 2o54:A, 2o54:B, 2o59:A, 2o59:B, 2o5c:B, 2o5e:A, 2o5e:B
18	6xwb:A	319	119	0.0956	0.1097	0.2941	4.2	6xwb:B
19	7dbe:B	332	57	0.0574	0.0633	0.3684	9.7	7dbe:A, 7dbe:C, 7dbe:D, 7wud:B, 7wud:A, 7wud:C, 7wud:D

[Back]