BioLiP

>protein
VTVRRFRPEDLNKLAKCNLDPFTETYELGFYLQYYAKWPSLFQVAEDQHGNIIGYIMGKLESSPDVYRFSPHYLPWHAHI
TAVTVAPEARRMGIGRLLTEQLEAAADAADAWFVDLFVRTTNHKAIAFYKSMGYSVYRVVKDYYGDHSADPSRSSEDAYD
MRKPMKRDVKREHIREDGEKHEVDPSVVWH

The query sequence (length=190) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6zmp:A	190	190	1.0000	1.0000	1.0000	6.01e-144	6zmp:B
2	8g0l:A	158	168	0.4368	0.5253	0.4940	7.36e-50	7stx:A, 6vp9:A
3	5k18:B	179	189	0.3947	0.4190	0.3968	1.75e-36	5k04:B, 5k18:D
4	6c95:B	160	169	0.2895	0.3438	0.3254	1.21e-26	6ppl:C, 6pw9:C
5	4kvm:E	153	163	0.2842	0.3529	0.3313	2.19e-22	4kvm:F, 4kvm:G, 4kvm:H, 4kvo:E, 4kvo:F, 4kvo:G, 4kvo:H, 4kvx:A, 4kvx:B
6	5nnp:B	179	189	0.3158	0.3352	0.3175	2.30e-19	5nnp:F
7	4hnx:B	213	182	0.2632	0.2347	0.2747	6.21e-15	4hnw:B, 6o07:B, 4xnh:B, 4xpd:B, 4y49:B, 4y49:H, 4y49:N
8	5c88:A	158	165	0.2526	0.3038	0.2909	7.98e-15	6ag4:A, 6ag5:A, 5c88:B, 4lx9:A, 4r3k:A, 4r3l:A, 2x7b:A
9	4pv6:G	154	147	0.2263	0.2792	0.2925	2.16e-14	4pv6:C, 4pv6:I, 4pv6:F, 4pv6:A, 4pv6:H, 4pv6:J, 4pv6:E
10	2cnm:A	151	89	0.1421	0.1788	0.3034	1.11e-05	2cnm:B, 2cnm:C, 2cns:A, 2cns:B, 2cns:C, 2cnt:A, 2cnt:B, 2cnt:C, 2cnt:D
11	5hgz:A	211	156	0.2105	0.1896	0.2564	3.35e-05	5hh0:A, 5hh1:A, 5icv:A, 5icv:B, 5icw:A, 5icw:B, 5icw:C, 5icw:D
12	2cy2:A	174	151	0.2053	0.2241	0.2583	5.67e-04
13	3ld2:B	162	74	0.1263	0.1481	0.3243	0.001	3ld2:A, 3ld2:C, 3ld2:D
14	6z00:A	156	70	0.1000	0.1218	0.2714	0.002	6yzz:A, 6z00:B
15	7mx2:A	152	113	0.1526	0.1908	0.2566	0.003	7rb3:A
16	2ob0:C	166	88	0.1368	0.1566	0.2955	0.005	2ob0:A, 2ob0:B, 6ppl:A, 2psw:A, 2psw:B, 2psw:C, 3tfy:A, 3tfy:B, 3tfy:C, 6wf3:A, 6wf3:B, 6wf3:C, 6wf3:D, 6wf3:E, 6wf3:F, 6wf5:A, 6wf5:B, 6wfg:A, 6wfg:C, 6wfg:E, 6wfk:A, 6wfk:B, 6wfk:C, 6wfn:A, 6wfo:A, 6wfo:B, 6wfo:C, 4x5k:A
17	2vi7:C	165	100	0.1684	0.1939	0.3200	0.007
18	7l1k:A	149	144	0.1789	0.2282	0.2361	0.008
19	4jxr:B	185	136	0.1632	0.1676	0.2279	0.009
20	6th0:A	176	157	0.1947	0.2102	0.2357	0.010	6tgx:A, 6tgx:B, 6th0:B
21	7dqg:A	161	61	0.0947	0.1118	0.2951	0.011
22	6yug:A	143	95	0.1316	0.1748	0.2632	0.062	6yug:B
23	3pp9:A	176	88	0.1158	0.1250	0.2500	0.067	3pp9:B, 3pp9:C
24	2c27:A	301	80	0.1211	0.0764	0.2875	0.096	1ozp:A, 1p0h:A
25	1i1d:D	161	70	0.0947	0.1118	0.2571	0.39	1i12:A, 1i12:B, 1i12:C, 1i12:D, 1i1d:A, 1i1d:B, 1i1d:C
26	4xpl:A	141	53	0.0789	0.1064	0.2830	0.45
27	6ygb:A	159	127	0.1579	0.1887	0.2362	0.74	6ygc:A, 6ygd:A
28	1tiq:A	173	70	0.1158	0.1272	0.3143	0.96	1tiq:B
29	2ge3:A	164	60	0.0947	0.1098	0.3000	1.1	2ge3:B, 2ge3:C
30	4kub:A	160	145	0.1737	0.2062	0.2276	1.2	4klv:A, 4klw:A, 4kor:A, 4kos:A, 4kot:A, 4kou:A, 4kov:A, 4kow:A, 4kox:A, 4koy:A, 4l89:A, 4l8a:A, 4m3s:A, 4oad:A, 4oae:A, 3pgp:A, 5vd6:A, 5vdb:A
31	7kd7:A	204	48	0.0789	0.0735	0.3125	1.3	7kd7:D, 7kpu:D, 7kpu:A, 4u9v:B, 4u9w:B, 4u9w:A, 4u9w:C, 4u9w:D
32	5jph:B	144	59	0.1053	0.1389	0.3390	1.7	5jph:A, 5jph:C
33	4miv:A	484	62	0.1000	0.0393	0.3065	1.8	4mhx:A, 4mhx:B, 4miv:B, 4miv:C, 4miv:D, 4miv:E, 4miv:F, 4miv:G, 4miv:H
34	3zj0:A	202	60	0.1158	0.1089	0.3667	2.6
35	7wx5:A	288	59	0.0789	0.0521	0.2542	2.7	7wx6:A, 7wx7:A
36	8a9n:A	150	143	0.1842	0.2333	0.2448	3.2	8a9n:B, 8a9o:A, 8a9o:B
37	2g88:A	331	67	0.1053	0.0604	0.2985	3.6	2odn:A, 2odw:A, 2oep:A, 1ube:A, 1ubf:A, 1ubg:A, 2zr9:A, 2zra:A, 2zrd:A, 2zre:A, 2zrf:A, 2zrg:A, 2zri:A, 2zrj:A, 2zrk:A, 2zrl:A, 2zrm:A, 2zro:A, 2zrp:A
38	5dwn:A	181	88	0.1158	0.1215	0.2500	4.3	5dwn:B, 5dwn:C, 5dwn:D
39	3owc:A	172	56	0.1053	0.1163	0.3571	4.7	3owc:B
40	1gyo:A	106	28	0.0526	0.0943	0.3571	6.3	1gyo:B
41	6bvc:A	154	55	0.0842	0.1039	0.2909	7.4	1bo4:A, 1bo4:B

[Back]