BioLiP

>protein
VTIKDIEVLNCEYGKNTIKFLRLHREGKKHFVKEVEVCTHLRLTSAHEYLDGNNSFVIPTDTIKNIVLVLAKKNGISSIE
QFAIDICKHFMTTFCQVAYVKTYIQEVPWQRQYQNGVPHIHSFILVPDGIRFCEAEQCRNGPLVVCAGIKDLKLMKTTQS
GFEGFYRNEHTTLPERNDRILCGEFFCKWSYGECRDFDFDCIWSKVRECILEAFSGPPDCGEYSPSYQRTVNCIQMCVLS
RVPQVQVIEVILNNNFYNVVDMKALGCTNDKEVLVPVETPYGSCACTLGRKKYLEAQS

The query sequence (length=298) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	8oh8:BBB	303	297	0.9966	0.9802	1.0000	0.0	8ofk:AAA, 8ofk:BBB, 8ofk:CCC, 8ofk:DDD, 8oh8:AAA, 8oh8:CCC, 8oh8:DDD, 8oih:AAA, 8oih:BBB, 8oih:CCC, 8oih:DDD, 8oiw:AAA, 8oiw:DDD, 8oiw:BBB, 8oiw:CCC
2	7f2w:A	300	288	0.3154	0.3133	0.3264	1.75e-47	7f2w:B
3	1vay:A	287	280	0.2752	0.2857	0.2929	2.46e-39	1vay:D, 1vay:B, 1vay:C, 1vay:E, 1vay:H, 1vay:F, 1vay:G, 2yzb:A, 2yzb:D, 2yzb:B, 2yzb:C, 2yzb:E, 2yzb:H, 2yzb:F, 2yzb:G, 2yzc:A, 2yzc:D, 2yzc:B, 2yzc:C, 2yzc:E, 2yzc:H, 2yzc:F, 2yzc:G, 2yzd:A, 2yzd:D, 2yzd:B, 2yzd:C, 2yzd:E, 2yzd:H, 2yzd:F, 2yzd:G, 2yze:A, 2yze:D, 2yze:B, 2yze:C, 2yze:E, 2yze:H, 2yze:F, 2yze:G
4	4cw0:A	301	297	0.2919	0.2890	0.2929	2.07e-35	7a0l:A, 3bjp:A, 3bk8:A, 3cks:A, 3cku:A, 4cw2:A, 4cw3:A, 4cw6:A, 4d12:A, 4d13:A, 4d17:A, 4d19:A, 3f2m:A, 5frc:A, 4fsk:A, 2fub:A, 2fxl:A, 3gko:A, 6i9x:A, 6i9z:A, 6ia1:A, 6ia3:A, 6ia9:aaa, 6ia9:aba, 2iba:A, 2ic0:A, 2icq:A, 6ic1:A, 3l8w:A, 3l9g:A, 3lbg:A, 3ld4:A, 4n3m:A, 4n9m:A, 4n9s:A, 4n9v:A, 3obp:A, 4op6:A, 4op9:A, 4oqc:A, 7p0c:A, 7p0d:A, 7p0g:A, 3p9f:A, 3p9o:A, 2pes:A, 3pjk:A, 3pk3:A, 3pk4:A, 3pk5:A, 3pk6:A, 3pk8:A, 3pkf:A, 3pkg:A, 3pkh:A, 3pkk:A, 3pkl:A, 3pks:A, 3pkt:A, 3pku:A, 3ple:A, 3plg:A, 3plh:A, 3pli:A, 3plj:A, 3plm:A, 4poe:A, 4pr8:A, 4puv:A, 7puf:A, 7puf:B, 7pwn:A, 7pwn:B, 7q09:A, 7q09:B, 7qar:AAA, 1r4s:A, 1r4u:A, 1r51:A, 6rgm:A, 6rgt:A, 1wrr:A, 1ws2:A, 1ws2:B, 1ws2:C, 1ws2:D, 1ws3:A, 1ws3:B, 1ws3:C, 1ws3:D, 1xt4:A, 1xxj:A, 1xxj:B, 1xxj:C, 1xxj:D, 1xy3:A, 1xy3:B, 1xy3:C, 1xy3:D, 1xy3:E, 1xy3:F, 1xy3:G, 1xy3:H, 2zka:A, 2zkb:A
5	1j2g:A	306	215	0.1779	0.1732	0.2465	3.88e-11	5ayj:A, 5ayj:B, 5ayj:C, 5ayj:D, 7cmn:A, 7cmn:B, 7cmq:A, 7cmq:B, 7cuc:A, 7cuc:B, 7cuf:A, 7cuf:B, 7cug:A, 7cug:B, 1j2g:B, 1j2g:C, 1j2g:D, 3wlv:A, 3wlv:B, 3wlv:C, 3wlv:D, 4xfp:A, 4xfp:B, 4xfp:C, 4xfp:D, 5y2p:A, 5y2p:B, 5y52:A, 5y52:B, 5y52:C, 5y52:D, 5yj2:A, 5yj2:B, 5yj2:C, 5yj2:D, 5yja:A, 5yja:B, 5yja:C, 5yja:D, 5z27:A, 5z27:B, 5z2b:A, 5z2b:B
6	4wri:A	187	88	0.0671	0.1070	0.2273	0.40
7	1irx:B	508	52	0.0604	0.0354	0.3462	0.90	1irx:A
8	8e4t:A	268	22	0.0369	0.0410	0.5000	2.8
9	5xj2:A	454	167	0.1309	0.0859	0.2335	4.2	5xj2:B, 5xj2:C, 5xj2:D, 5zq0:A, 5zq1:A, 5zq8:B, 5zq8:A, 5zth:A
10	5lpe:A	204	66	0.0705	0.1029	0.3182	4.4	5lpe:B
11	6n61:D	1239	65	0.0638	0.0153	0.2923	6.2	6n60:D, 6n62:D, 4xsx:J, 4xsy:J, 4xsz:J
12	3jd5:o	461	34	0.0403	0.0260	0.3529	6.6
13	8txo:J	1162	65	0.0638	0.0164	0.2923	6.9
14	8im8:A	557	59	0.0537	0.0287	0.2712	7.1	8im8:B, 8im8:C, 8im8:D
15	5aj3:o	476	34	0.0369	0.0231	0.3235	7.4	5aj3:e, 5aj4:Ae, 5aj4:Bz, 5aj4:Ao, 5apn:z, 5apo:z, 4ce4:x, 4ce4:z, 5flc:C, 5flc:G, 6hiv:UD, 6hix:UD, 6sg9:Ui, 6sgb:UO, 6sgb:Ui, 7z34:oC

[Back]