Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
VSPPPPIADEPLTVNTGIYLIECYSLDDKAETFKVNAFLSLSWKDRRLAFDPVRSGVRVKTYEPEAIWIPEIRFVNVENA
RDADVVDISVSPDGTVQYLERFSARVLSPLDFRRYPFDSQTLHIYLIVRSVDTRNIVLAVDLEKVGKNDDVFLTGWDIES
FTAVVKPANFALEDRLESKLDYQLRISRQYFSYIPNIILPMLFILFISWTAFWSTSYEANVTLVVSTLIAQIAFNILVET
NLPKTPYMTYTGAIIFMIYLFYFVAVIEVTVQHYLKVESQPARAASITRASRIAFPVVFLLANIILAFLFF

The query sequence (length=311) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 4ire:B 313 311 0.9871 0.9808 0.9871 0.0 6emx:A, 6emx:B, 6emx:C, 6emx:D, 6emx:E, 4f8h:A, 4f8h:B, 4f8h:E, 4f8h:C, 4f8h:D, 4hfc:A, 4hfc:B, 4hfc:C, 4hfc:D, 4hfd:A, 4hfd:B, 4hfd:C, 4hfd:D, 4hfd:E, 4hfe:D, 4hfh:A, 4hfh:B, 4hfh:C, 4hfh:D, 4hfh:E, 4hfi:A, 4hfi:E, 6hj3:A, 6hj3:E, 6hj3:B, 6hj3:C, 6hj3:D, 6hja:A, 6hja:B, 6hja:C, 6hja:D, 6hja:E, 6hji:A, 6hji:C, 6hji:D, 6hji:E, 4il4:A, 4il4:D, 4il4:E, 4il9:A, 4il9:B, 4il9:C, 4il9:E, 4ilb:A, 4ilb:B, 4ilb:C, 4ilb:E, 4ilc:B, 4ilc:C, 4ilc:E, 4ire:A, 4ire:C, 4ire:D, 4ire:E, 5iux:A, 5iux:E, 5iux:C, 5iux:D, 5l47:C, 5l4h:C, 5l4h:D, 5l4h:E, 5mur:B, 5mur:E, 5mvm:A, 5mvm:E, 5mvm:B, 5mvm:C, 5mvm:D, 5mvn:B, 5mvn:C, 5mvn:D, 5mvn:E, 5mzq:A, 5mzq:B, 5mzq:C, 5mzq:D, 5mzq:E, 5mzr:A, 5mzr:C, 5mzr:D, 5mzr:E, 5mzt:A, 5mzt:E, 5mzt:B, 5mzt:C, 5mzt:D, 3p4w:A, 3p4w:B, 3p4w:C, 3p4w:D, 3p4w:E, 3p50:A, 3p50:B, 3p50:C, 3p50:D, 3p50:E, 4qh1:A, 4qh1:E, 4qh1:B, 4qh1:C, 4qh1:D
2 5osa:A 313 307 0.7428 0.7380 0.7524 1.57e-157 5osa:C, 5osa:E, 5osb:A, 5osb:E, 5osb:B, 5osb:C, 5osb:D, 5osc:A, 5osc:B, 5osc:C, 5osc:D, 5osc:E
3 8dd2:A 334 318 0.2797 0.2605 0.2736 1.03e-29 6a96:B, 4cof:B, 4cof:C, 4cof:D, 4cof:E, 6d6t:A, 6d6t:C, 6d6u:A, 6d6u:C, 8dd2:C, 8dd3:A, 8dd3:C, 6dw1:B, 6dw1:E, 7pbd:E, 7pbz:B, 7pbz:C, 7pbz:E, 7pc0:C, 8pvb:A, 6qfa:B, 6qfa:A, 6qfa:C, 6qfa:D, 6qfa:E, 8sgo:A, 8sgo:C, 8si9:A, 8si9:C, 8sid:A, 8sid:C, 7t0z:C, 8vqy:A, 8vqy:C, 8vrn:A, 8vrn:C, 6x3s:A, 6x3s:C, 6x3t:A, 6x3t:C, 6x3u:A, 6x3u:C, 6x3v:A, 6x3v:C, 6x3w:A, 6x3w:C, 6x3x:A, 6x3x:C, 6x3z:A, 6x3z:C, 6x40:A, 6x40:C
4 9ftg:A 559 310 0.2637 0.1467 0.2645 2.81e-26 9ftg:B, 9ftg:D, 9ftg:E, 9ftg:C
5 7q3g:A 517 310 0.2637 0.1586 0.2645 3.37e-26 7q3g:E, 7q3g:D, 7q3g:C, 7q3g:B
6 6v4s:E 591 310 0.2637 0.1387 0.2645 4.21e-26 6v4a:A, 6v4s:B, 6v4s:A, 6v4s:D, 6v4s:C
7 6fli:A 310 314 0.2669 0.2677 0.2643 1.01e-22 6fli:B, 6fli:C, 6fli:D, 6fli:E, 6fvs:D
8 5o8f:B 332 320 0.2701 0.2530 0.2625 1.56e-22 5o8f:C, 5o8f:D, 5o8f:E, 5o8f:A
9 9eqg:E 345 331 0.2637 0.2377 0.2477 2.16e-22 7a5v:A, 4cof:A, 9eqg:B, 8foi:B, 8foi:E, 8g4n:E, 8g4n:B, 8g4x:B, 8g4x:E, 8g5f:E, 8g5f:B, 8g5g:E, 8g5g:B, 8g5h:B, 8g5h:E, 6hug:E, 6huj:E, 6huj:B, 6huk:B, 6huk:E, 6huo:B, 6huo:E, 6hup:B, 6hup:E, 7pbd:B, 7qn7:B, 7qn7:C, 7qn7:D, 7qn8:A, 7qn8:B, 7qn8:C, 7qn8:D, 7qn9:B, 7qn9:C, 7qn9:D, 7qna:B, 7qnb:B, 7qnc:B, 7qnc:C, 7qnc:D, 7qnd:A, 7qnd:B, 7qnd:C, 7qnd:D
10 7t0z:E 334 317 0.2508 0.2335 0.2461 2.66e-22 6d6u:E, 8dd2:E, 8dd3:E, 6dw0:D, 9eqg:C, 8foi:D, 8g4n:D, 8g4o:D, 8g4x:D, 8g5g:D, 8g5h:D, 6hug:C, 6huj:C, 6huo:C, 6hup:C, 7qne:C, 8sgo:E, 8si9:E, 8sid:E, 7t0w:E, 8vqy:E, 8vrn:E, 6x3s:E, 6x3t:E, 6x3u:E, 6x3v:E, 6x3w:E, 6x3x:E, 6x3z:E, 6x40:E
11 8d68:A 311 318 0.2347 0.2347 0.2296 3.40e-22 4a97:A, 4a97:E, 4a97:B, 4a97:C, 4a97:D, 4a97:F, 4a97:J, 4a97:G, 4a97:H, 4a97:I, 4a98:A, 4a98:E, 4a98:B, 4a98:C, 4a98:D, 4a98:F, 4a98:J, 4a98:G, 4a98:H, 4a98:I, 8d63:A, 8d63:B, 8d63:C, 8d63:D, 8d63:E, 8d64:A, 8d64:B, 8d64:C, 8d64:D, 8d64:E, 8d65:A, 8d65:B, 8d65:C, 8d65:D, 8d65:E, 8d66:A, 8d66:E, 8d66:B, 8d66:C, 8d66:D, 8d67:A, 8d67:B, 8d67:C, 8d67:D, 8d67:E, 8d68:B, 8d68:C, 8d68:D, 8d68:E, 8f32:E, 8f32:D, 8f32:C, 8f32:B, 8f32:A, 8f33:E, 8f33:D, 8f33:C, 8f33:B, 8f33:A, 8f34:E, 8f34:D, 8f34:C, 8f34:B, 8f34:A, 7l6q:A, 7l6q:E, 7l6q:B, 7l6q:C, 7l6q:D, 5lg3:A, 5lg3:B, 5lg3:C, 5lg3:D, 5lg3:E, 5lg3:F, 5lg3:G, 5lg3:H, 5lg3:I, 5lg3:J, 5lid:A, 5lid:C, 5lid:E, 5lid:F, 5lid:H, 3rqw:A, 3rqw:B, 3rqw:C, 3rqw:D, 3rqw:E, 3rqw:F, 3rqw:G, 3rqw:H, 3rqw:I, 3rqw:J, 6ssi:A, 6ssi:B, 6ssi:C, 6ssi:D, 6ssi:E, 6ssp:F, 6ssp:H, 5sxu:A, 5sxu:B, 5sxu:C, 5sxu:D, 5sxu:E, 5sxu:F, 5sxu:G, 5sxu:H, 5sxu:I, 5sxu:J, 5sxv:A, 5sxv:B, 5sxv:C, 5sxv:D, 5sxv:E, 5sxv:F, 5sxv:G, 5sxv:H, 5sxv:I, 5sxv:J, 4twd:A, 4twd:B, 4twd:C, 4twd:D, 4twd:E, 4twd:F, 4twd:G, 4twd:H, 4twd:I, 4twf:A, 4twf:C, 4twf:B, 4twf:D, 4twf:E, 4twf:F, 4twf:G, 4twf:H, 4twf:I, 4twf:J, 8twv:A, 8twv:E, 8twv:B, 8twv:D, 8twv:C, 8twz:A, 8twz:B, 8twz:C, 8twz:D, 8twz:E, 6v03:A, 8vuw:A, 8vuw:E, 8vuw:B, 8vuw:C, 8vuw:D, 2yoe:B, 2yoe:C, 4z90:F, 4z91:A, 4z91:B, 4z91:C, 4z91:E, 4z91:H, 3zkr:A, 3zkr:B, 3zkr:C, 3zkr:E, 3zkr:F, 3zkr:G, 3zkr:H, 3zkr:I
12 8oq6:A 336 309 0.2444 0.2262 0.2460 3.40e-20 8op9:A, 8op9:B, 8op9:E, 8op9:C, 8op9:D, 8oq6:B, 8oq6:C, 8oq6:D, 8oq6:E, 8oq7:A, 8oq7:B, 8oq7:C, 8oq7:D, 8oq7:E, 8oq8:A, 8oq8:E, 8oqa:A, 8oqa:B, 8oqa:C, 8oqa:D, 8oqa:E, 8rh4:A, 8rh4:E, 8rh4:B, 8rh4:C, 8rh4:D, 8rh7:E, 8rh7:D, 8rh7:A, 8rh7:B, 8rh7:C, 8rh8:A, 8rh8:B, 8rh8:E, 8rh8:C, 8rh8:D, 8rh9:B, 8rhg:A, 8rhg:E, 8rhg:B, 8rhg:C, 8rhg:D
13 8bhg:B 334 317 0.2669 0.2485 0.2618 1.22e-19 6dw1:D
14 6cdu:A 314 318 0.2572 0.2548 0.2516 5.57e-19 6cdu:B, 6cdu:E, 6cdu:C, 6cdu:D, 6cdu:F, 6cdu:J, 6cdu:G, 6cdu:H, 6cdu:I
15 6dw0:E 319 297 0.2379 0.2320 0.2492 6.65e-19 6dw0:B
16 6vm0:A 362 329 0.2379 0.2044 0.2249 7.41e-19 5bkf:A, 5bkf:B, 5bkf:C, 5bkf:D, 5bkg:A, 5bkg:B, 5bkg:C, 5cfb:A, 5cfb:B, 5cfb:C, 5cfb:E, 8dn2:A, 8dn2:C, 8dn2:D, 8dn5:D, 8dn5:B, 8dn5:C, 8dn5:A, 8fe1:A, 8fe1:B, 8fe1:D, 8fe1:C, 3jad:A, 3jad:E, 3jad:B, 3jad:C, 3jad:D, 3jaf:A, 3jaf:B, 3jaf:C, 3jaf:D, 3jaf:E, 7m6n:A, 7m6n:B, 7m6n:D, 7m6n:E, 7m6n:C, 7m6o:A, 7m6o:E, 7m6o:B, 7m6o:C, 7m6o:D, 7m6p:A, 7m6p:E, 7m6p:B, 7m6p:C, 7m6p:D, 7m6q:A, 7m6q:B, 7m6q:E, 7m6q:C, 7m6q:D, 7m6r:A, 7m6r:E, 7m6r:B, 7m6r:C, 7m6r:D, 7m6s:A, 7m6s:B, 7m6s:C, 7m6s:D, 7m6s:E, 7mly:A, 7mly:B, 7mly:C, 7mly:D, 6plo:A, 6plo:B, 6plo:C, 6plo:D, 6plo:E, 6plp:A, 6plp:B, 6plp:C, 6plp:D, 6plp:E, 6plq:A, 6plq:B, 6plq:C, 6plq:D, 6plq:E, 6plu:A, 6plu:B, 6plu:E, 6plu:C, 6plu:D, 6plv:A, 6plv:B, 6plv:C, 6plv:D, 6plv:E, 6plw:A, 6plw:B, 6plw:C, 6plw:D, 6plw:E, 6plx:A, 6plx:E, 6plx:B, 6plx:C, 6plx:D, 6ply:A, 6ply:B, 6ply:E, 6ply:C, 6ply:D, 6plz:A, 6plz:B, 6plz:C, 6plz:D, 6plz:E, 6pm4:A, 6pm4:E, 6pm4:B, 6pm4:C, 6pm4:D, 6pm5:A, 6pm5:B, 6pm5:C, 6pm5:D, 6pm5:E, 6pm6:A, 6pm6:B, 6pm6:D, 6pm6:E, 6pm6:C, 5tin:A, 5tin:C, 5tin:E, 5tio:C, 5tio:A, 5tio:B, 5tio:E, 7tu9:A, 7tu9:D, 7tu9:C, 7tu9:B, 7tvi:A, 7tvi:D, 7tvi:C, 7tvi:B, 7u2m:A, 7u2m:B, 7u2m:C, 7u2m:D, 7u2m:E, 7u2n:A, 7u2n:B, 7u2n:D, 7u2n:E, 7u2n:C, 7u2o:A, 7u2o:B, 7u2o:C, 7u2o:D, 7u2o:E, 6ubt:A, 6ubt:E, 6ubt:B, 6ubt:C, 6ubt:D, 6ud3:A, 6ud3:E, 6ud3:C, 6ud3:B, 6ud3:D, 5vdh:A, 5vdh:B, 5vdh:C, 5vdh:E, 5vdi:A, 5vdi:C, 5vdi:D, 5vdi:E, 6vm0:E, 6vm0:B, 6vm0:D, 6vm0:C, 6vm2:A, 6vm2:E, 6vm2:B, 6vm2:D, 6vm2:C, 6vm3:A, 6vm3:E, 6vm3:B, 6vm3:C, 6vm3:D
17 8bha:A 336 319 0.2347 0.2173 0.2288 4.32e-18 8bgi:A, 8bgi:E, 8bgi:B, 8bgi:C, 8bgi:D, 8bha:E, 8bha:B, 8bha:C, 8bha:D, 8bhb:A, 8bhb:E, 8bhb:B, 8bhb:C, 8bhb:D, 8bhg:A, 8bhg:E, 8bhg:C, 8bhg:D, 8bhi:A, 8bhi:E, 8bhi:B, 8bhi:C, 8bhi:D, 8bhk:A, 8bhk:B, 8bhk:C, 8bhk:D, 8bhk:E, 8bhm:A, 8bhm:E, 8bhm:B, 8bhm:C, 8bhm:D, 8bho:A, 8bho:E, 8bho:B, 8bho:C, 8bho:D, 8bhq:A, 8bhq:E, 8bhq:B, 8bhq:C, 8bhq:D, 8bhr:A, 8bhr:E, 8bhr:B, 8bhr:C, 8bhr:D, 8bhs:A, 8bhs:E, 8bhs:B, 8bhs:C, 8bhs:D
18 7qnd:E 324 278 0.1961 0.1883 0.2194 1.00e-17 7qnc:E
19 5tin:B 343 326 0.2347 0.2128 0.2239 5.02e-17 5cfb:D, 7kuy:A, 7kuy:B, 7kuy:C, 7kuy:D, 7l31:A, 7l31:B, 7l31:C, 7l31:D, 5tin:D, 5tio:D, 5vdh:D, 5vdi:B
20 9eqg:D 353 333 0.2347 0.2068 0.2192 6.34e-16 6d6t:B, 6d6t:D, 6d6u:B, 6d6u:D, 8dd2:D, 8dd2:B, 8dd3:D, 8dd3:B, 6dw0:A, 6dw0:C, 6dw1:C, 6dw1:A, 9eqg:A, 8foi:A, 8foi:C, 8g4n:A, 8g4n:C, 8g4o:C, 8g4x:A, 8g5f:C, 8g5g:A, 8g5h:C, 6hug:A, 6hug:D, 6huj:A, 6huj:D, 6huk:A, 6huk:D, 6huo:A, 6huo:D, 6hup:A, 6hup:D, 6i53:A, 6i53:D, 7pbd:A, 7qne:A, 7qne:D, 8sgo:B, 8sgo:D, 8si9:B, 8si9:D, 8sid:B, 8sid:D, 7t0w:D, 7t0z:D, 7t0z:B, 8vqy:B, 8vqy:D, 8vrn:D, 8vrn:B, 6x3s:D, 6x3s:B, 6x3t:D, 6x3t:B, 6x3u:D, 6x3v:D, 6x3w:D, 6x3w:B, 6x3x:D, 6x3x:B, 6x3z:D, 6x3z:B, 6x40:D, 6x40:B
21 3rhw:A 340 321 0.2669 0.2441 0.2586 2.48e-15 3rhw:E, 3rhw:B, 3rhw:C, 3rhw:D, 3ri5:A, 3ri5:E, 3ri5:B, 3ri5:C, 3ri5:D, 3ria:A, 3ria:B, 3ria:C, 3ria:D, 3ria:E, 3rif:A, 3rif:B, 3rif:E, 3rif:C, 3rif:D
22 7ql6:C 427 256 0.2090 0.1522 0.2539 3.64e-14 8esk:B, 8f2s:B, 8f6y:B, 8f6z:B, 7ql5:C, 7smq:B, 7sms:B
23 7kuy:E 338 322 0.2412 0.2219 0.2329 7.27e-14 5bkf:E
24 9avu:B 413 251 0.2058 0.1550 0.2550 1.11e-12
25 8g4x:C 343 320 0.2186 0.1983 0.2125 4.94e-12 8g5f:A, 8g5g:C, 8g5h:A
26 9avv:D 429 289 0.2347 0.1702 0.2526 7.28e-12 9avu:D, 9awj:D, 9awk:D
27 8fe1:E 346 310 0.2219 0.1994 0.2226 1.43e-11 5bkg:E, 8dn5:E, 7l31:E, 7mly:E, 7tu9:E
28 7qn7:A 335 318 0.2283 0.2119 0.2233 4.52e-11 7qn9:A, 7qna:A, 7qnc:A
29 8f6y:C 409 262 0.2154 0.1638 0.2557 1.99e-10 8f6z:C, 7smm:C, 7smq:C, 7smr:C, 7sms:C, 7smt:C
30 9awj:B 408 255 0.1897 0.1446 0.2314 3.34e-10
31 8v8c:B 374 280 0.1994 0.1658 0.2214 9.43e-10 8v8c:A
32 7ekp:A 396 280 0.1961 0.1540 0.2179 1.16e-09 8cau:A, 8cau:B, 8cau:C, 8cau:D, 8cau:E, 8ci1:A, 8ci1:B, 8ci1:C, 8ci1:D, 8ci1:E, 7eki:A, 7eki:B, 7eki:C, 7eki:D, 7eki:E, 7ekp:B, 7ekp:C, 7ekp:D, 7ekp:E, 7ekt:A, 7ekt:E, 7ekt:B, 7ekt:C, 7ekt:D, 7koo:A, 7koo:B, 7koo:C, 7koo:D, 7koo:E, 7koq:A, 7koq:B, 7koq:C, 7koq:D, 7koq:E, 7kox:A, 7kox:B, 7kox:C, 7kox:D, 7kox:E, 8ut1:A, 8ut1:B, 8ut1:C, 8ut1:D, 8ut1:E, 8utb:A, 8utb:B, 8utb:C, 8utb:D, 8utb:E, 8uzj:A, 8uzj:B, 8uzj:E, 8uzj:C, 8uzj:D, 8v80:A, 8v80:B, 8v80:C, 8v80:D, 8v80:E, 8v82:A, 8v82:B, 8v82:E, 8v82:C, 8v82:D, 8v86:A, 8v86:E, 8v86:B, 8v86:C, 8v86:D, 8v88:A, 8v88:B, 8v88:C, 8v88:D, 8v88:E, 8v89:A, 8v89:B, 8v89:C, 8v89:D, 8v89:E, 8v8a:A, 8v8a:B, 8v8a:E, 8v8a:C, 8v8a:D, 8v8c:C, 8v8c:D, 8v8c:E, 8v8d:A, 8v8d:B, 8v8d:E, 8v8d:C, 8v8d:D
33 8f6y:E 412 262 0.2026 0.1529 0.2405 8.67e-09 8esk:E, 8f2s:E, 8f6z:E, 7ql5:E, 7smq:E, 7sms:E, 7smt:E
34 6pv7:A 387 250 0.1801 0.1447 0.2240 7.97e-08 6pv7:D, 6pv8:A, 6pv8:D
35 8zfk:D 412 292 0.1994 0.1505 0.2123 2.64e-07 8zfk:E, 8zfk:A, 8zfk:B, 8zfk:C
36 8ssz:B 384 230 0.1833 0.1484 0.2478 3.29e-07 6cnj:B, 6cnj:C, 6cnj:E, 6cnk:C, 6cnk:E, 5kxi:B, 5kxi:E, 8st0:B, 8st2:C, 8st2:E, 8st3:B, 8st3:E, 8st4:B, 8st4:E, 6ur8:B, 6usf:E
37 8c20:D 355 275 0.1768 0.1549 0.2000 1.44e-06 8c20:B
38 8frw:A 395 276 0.1833 0.1443 0.2065 1.74e-06 8aw2:A, 8aw2:E, 8aw2:B, 8aw2:C, 8aw2:D, 8c21:B, 8c21:C, 8cc6:A, 8cc6:B, 8cc6:C, 8cc6:D, 8cc6:E, 8cc7:A, 8cc7:B, 8cc7:C, 8cc7:D, 8cc7:E, 6dg7:A, 6dg7:B, 6dg7:C, 6dg7:D, 6dg7:E, 6dg8:A, 6dg8:E, 6dg8:B, 6dg8:C, 6dg8:D, 8frw:E, 8frw:B, 8frw:C, 8frw:D, 8frx:A, 8frx:E, 8frx:B, 8frx:C, 8frx:D, 8frz:A, 8frz:B, 8frz:C, 8frz:D, 8frz:E, 8fsb:E, 8fsb:A, 8fsb:B, 8fsb:C, 8fsb:D, 8fsp:A, 8fsp:B, 8fsp:C, 8fsp:D, 8fsp:E, 8fsz:A, 8fsz:E, 8fsz:B, 8fsz:C, 8fsz:D, 6hin:A, 6hin:B, 6hin:C, 6hin:D, 6hin:E, 6hio:A, 6hio:B, 6hio:E, 6hio:C, 6hio:D, 6hiq:A, 6hiq:E, 6hiq:B, 6hiq:C, 6hiq:D, 6his:A, 6his:E, 6his:B, 6his:C, 6his:D, 6np0:A, 6np0:E, 6np0:B, 6np0:C, 6np0:D, 6w1j:A, 6w1j:E, 6w1j:B, 6w1j:C, 6w1j:D, 6w1m:A, 6w1m:E, 6w1m:B, 6w1m:C, 6w1m:D, 6w1y:A, 6w1y:E, 6w1y:B, 6w1y:C, 6w1y:D, 6y1z:A, 6y1z:B, 6y1z:D, 6y1z:E, 6y1z:C, 6y5a:A, 6y5a:E, 6y5a:C, 6y5a:B, 6y5a:D
39 8byi:A 320 120 0.1061 0.1031 0.2750 1.54e-05 8byi:B, 8byi:C, 8byi:D, 8byi:E
40 8eiz:A 315 206 0.1543 0.1524 0.2330 2.28e-05 8eiz:B, 8eiz:C, 8eiz:D, 8eiz:E
41 7qko:A 396 245 0.1608 0.1263 0.2041 2.36e-05 8esk:A, 8esk:D, 8f2s:A, 8f2s:D, 8f6y:D, 8f6y:A, 8f6z:D, 8f6z:A, 7qko:D, 7ql5:A, 7ql5:D, 7ql6:A, 7ql6:D, 7smm:A, 7smm:D, 7smq:D, 7smq:A, 7smr:A, 7smr:D, 7sms:A, 7sms:D, 7smt:A, 7smt:D, 6uwz:A, 6uwz:D, 7z14:D, 7z14:A
42 5fjv:B 207 151 0.1158 0.1739 0.2384 4.32e-05 5fjv:A, 5fjv:E, 5fjv:C, 5fjv:D
43 8ssz:A 393 250 0.1768 0.1399 0.2200 4.50e-05 8ssz:D, 8st0:A, 8st0:D, 8st1:A, 8st1:B, 8st1:D, 8st2:A, 8st2:B, 8st2:D, 8st3:A, 8st3:D, 8st4:A, 8st4:D
44 6usf:A 464 304 0.2090 0.1401 0.2138 6.87e-05 6cnj:A, 6cnj:D, 6cnk:A, 6cnk:B, 6cnk:D, 5kxi:A, 5kxi:D, 6ur8:A, 6ur8:D, 6usf:D
45 8eis:A 292 117 0.1061 0.1130 0.2821 7.39e-05 8eis:E, 8eis:B, 8eis:C, 8eis:D
46 6d6t:E 302 260 0.1865 0.1921 0.2231 1.18e-04
47 8bla:A 211 176 0.1286 0.1896 0.2273 0.001 8bla:E, 8bla:B, 8bla:C, 8bla:D, 8blb:A, 8blb:E, 8blb:B, 8blb:C, 8blb:D
48 5afm:B 207 108 0.0932 0.1401 0.2685 0.005 5afh:A, 5afh:B, 5afh:C, 5afh:D, 5afh:E, 5afj:A, 5afj:B, 5afj:C, 5afj:D, 5afj:E, 5afk:A, 5afk:B, 5afk:C, 5afk:D, 5afk:E, 5afl:A, 5afl:B, 5afl:C, 5afl:D, 5afl:E, 5afm:A, 5afm:C, 5afm:D, 5afm:E, 5afn:A, 5afn:B, 5afn:C, 5afn:D, 5afn:E, 5oug:A, 5oug:E, 5oug:B, 5oug:C, 5oug:D, 5ouh:A, 5ouh:B, 5ouh:C, 5ouh:D, 5ouh:E, 5oui:A, 3sq6:A, 3sq6:B, 3sq6:C, 3sq6:D, 3sq6:E, 3sq6:F, 3sq6:G, 3sq6:H, 3sq6:I, 3sq6:J
49 3sio:C 221 104 0.0997 0.1403 0.2981 0.35 4aft:A, 4aft:B, 4aft:C, 4aft:D, 4aft:E, 4bfq:A, 4bfq:B, 4bfq:C, 4bfq:D, 4bfq:E, 4bqt:A, 4bqt:B, 4bqt:C, 4bqt:D, 4bqt:E, 2br8:A, 2br8:B, 2br8:C, 2br8:D, 2br8:E, 5brx:A, 5brx:C, 5brx:D, 5brx:F, 5brx:J, 5brx:H, 5brx:I, 5bw2:A, 5bw2:E, 5bw2:B, 5bw2:C, 5bw2:D, 2byp:A, 2byp:E, 2byp:B, 2byp:C, 2byp:D, 2byq:A, 2byq:B, 2byq:C, 2byq:D, 2byq:E, 2byr:A, 2byr:E, 2byr:B, 2byr:C, 2byr:D, 2byr:F, 2byr:J, 2byr:G, 2byr:H, 2byr:I, 2bys:A, 2bys:E, 2bys:B, 2bys:C, 2bys:D, 2bys:F, 2bys:J, 2bys:G, 2bys:H, 2bys:I, 3c79:A, 3c79:E, 3c79:B, 3c79:C, 3c79:D, 3c84:A, 3c84:E, 3c84:B, 3c84:C, 3c84:D, 2c9t:A, 2c9t:B, 2c9t:C, 2c9t:D, 2c9t:E, 2c9t:F, 2c9t:G, 2c9t:H, 2c9t:I, 2c9t:J, 5co5:A, 5co5:G, 5co5:B, 5co5:D, 5co5:I, 4dbm:A, 4dbm:E, 4dbm:B, 4dbm:C, 7egr:A, 7egr:B, 7egr:C, 7egr:D, 7egr:E, 7egr:F, 7egr:J, 7egr:G, 7egr:H, 7egr:I, 4ez1:B, 4ez1:C, 4ez1:A, 4ez1:E, 4ez1:D, 4frr:A, 4frr:E, 4frr:B, 4frr:C, 4frr:D, 4frr:F, 4frr:J, 4frr:G, 4frr:H, 4frr:I, 5jme:A, 5jme:B, 5jme:E, 5jme:C, 5jme:D, 5kzu:C, 5kzu:D, 5lxb:B, 5lxb:C, 5lxb:D, 5lxb:E, 5lxb:A, 5lxb:G, 5lxb:H, 5lxb:I, 5lxb:J, 6m4x:A, 6m4x:G, 6m4x:B, 6m4x:D, 6m4x:I, 6m4z:A, 6m4z:G, 6m4z:B, 6m4z:D, 6m4z:I, 5o87:A, 5o87:B, 5o87:C, 5o87:D, 5o87:E, 5o87:F, 5o87:G, 5o87:H, 5o87:I, 5o87:J, 5o8t:A, 5o8t:B, 5o8t:C, 5o8t:D, 5o8t:E, 3peo:A, 3peo:E, 3peo:B, 3peo:C, 3peo:D, 3peo:F, 3peo:G, 3peo:J, 3peo:H, 3peo:I, 2pgz:A, 2pgz:B, 2pgz:E, 2ph9:A, 2ph9:C, 2ph9:D, 2ph9:E, 3pmz:B, 3pmz:C, 3pmz:D, 3pmz:E, 8q1m:A, 8q1m:E, 8q1m:B, 8q1m:D, 6qkk:A, 6qkk:B, 6qkk:C, 6qkk:D, 6qkk:E, 6qkk:F, 6qkk:G, 6qkk:H, 6qkk:I, 6qkk:J, 6qqo:A, 6qqo:B, 6qqo:C, 6qqo:D, 6qqo:E, 6qqo:F, 6qqo:G, 6qqo:H, 6qqo:I, 6qqo:J, 6qqp:A, 6qqp:B, 6qqp:C, 6qqp:D, 6qqp:E, 6qqp:F, 6qqp:G, 6qqp:H, 6qqp:I, 6qqp:J, 8qtl:A, 8qtl:E, 8qtl:B, 8qtl:C, 8qx2:A, 8qx2:C, 8qx2:E, 6sgv:A, 6sgv:B, 6sgv:C, 6sgv:D, 6sgv:E, 6sgv:F, 6sgv:G, 6sgv:H, 6sgv:I, 6sgv:J, 3sh1:A, 3sh1:G, 3sh1:E, 3sh1:B, 3sh1:F, 3sh1:C, 3sh1:J, 3sh1:D, 3sh1:H, 3sh1:I, 6sh0:A, 6sh0:E, 6sh0:B, 6sh0:C, 6sh0:D, 6sh0:F, 6sh0:J, 6sh0:G, 6sh0:H, 6sh0:I, 3sio:A, 3sio:E, 3sio:B, 3sio:D, 3sio:F, 3sio:J, 3sio:G, 3sio:H, 3sio:I, 6t9r:AAA, 6t9r:DDD, 6t9r:BBB, 6t9r:EEE, 6t9r:FFF, 6t9r:HHH, 6t9r:GGG, 6t9r:III, 6t9r:JJJ, 5tsf:A, 5tsf:B, 5tsf:C, 5tsf:D, 5tvh:A, 5tvh:E, 5tvh:B, 5tvh:C, 2uz6:A, 2uz6:B, 2uz6:C, 2uz6:D, 2uz6:E, 2uz6:F, 2uz6:G, 2uz6:H, 2uz6:I, 2uz6:J, 2w8f:A, 2w8f:B, 2w8f:F, 2w8g:A, 2w8g:B, 2w8g:D, 2w8g:E, 2wn9:A, 2wn9:B, 2wn9:C, 2wn9:D, 2wnc:A, 2wnc:E, 2wnc:B, 2wnc:C, 2wnc:D, 2wnj:A, 2wnj:B, 2wnj:C, 2wnj:D, 2wnl:A, 2wnl:E, 2wnl:B, 2wnl:D, 2wnl:F, 2wnl:J, 2wnl:G, 2wnl:I, 4wv9:A, 4wv9:D, 4wv9:E, 2wzy:A, 2wzy:E, 2wzy:B, 2wzy:C, 2wzy:D, 2wzy:F, 2wzy:J, 2wzy:G, 2wzy:H, 2wzy:I, 2x00:A, 2x00:E, 2x00:B, 2x00:C, 2x00:D, 5xgl:A, 5xgl:G, 5xgl:B, 5xgl:D, 5xgl:I, 4xhe:A, 4xhe:E, 4xhe:C, 4xhe:D, 4xhe:F, 4xhe:J, 4xhe:G, 4xhe:H, 4xhe:I, 4xk9:A, 4xk9:E, 4xk9:B, 4xk9:C, 4xk9:D, 4xk9:F, 4xk9:J, 4xk9:G, 4xk9:H, 4xk9:I, 2xnt:A, 2xnt:B, 2xnt:C, 2xnt:D, 2xnt:F, 2xnt:G, 2xnt:H, 2xnt:I, 2xnt:J, 2xnu:C, 2xnv:A, 2xnv:B, 2xnv:C, 2xnv:D, 2xnv:E, 2xnv:F, 2xnv:G, 2xnv:H, 2xnv:I, 2xnv:J, 2xys:A, 2xys:B, 2xys:C, 2xys:D, 2xys:E, 2xyt:B, 2xyt:C, 2xyt:D, 2xyt:E, 2xyt:F, 2xyt:G, 2xyt:H, 2xyt:I, 2xz5:A, 2xz5:B, 2xz5:E, 2xz5:C, 2xz5:D, 2xz6:D, 2y54:A, 2y54:B, 2y54:C, 2y54:D, 2y54:E, 2y56:A, 2y56:B, 2y56:C, 2y56:D, 2y56:E, 2y57:A, 2y57:B, 2y57:C, 2y57:D, 2y57:E, 2y58:A, 2y58:B, 2y58:C, 2y58:D, 2y58:E, 2yme:A, 2yme:B, 2yme:C, 2yme:D, 2yme:E, 2yme:F, 2yme:G, 2yme:H, 2yme:I, 2yme:J
50 8qx2:B 217 71 0.0675 0.0968 0.2958 0.36 5ain:A, 5ain:B, 5ain:C, 5ain:D, 5ain:E, 4dbm:D, 5ke4:A, 5ke4:E, 5ke4:B, 5ke4:C, 5ke4:D, 5oa0:A, 5oa0:B, 5oa0:C, 5oa0:D, 5oa0:E, 5oaj:D, 5oaj:E, 5oaj:F, 5oaj:J, 5oal:A, 5oal:B, 5oal:C, 5oal:D, 5oal:E, 5oal:F, 5oal:G, 5oal:H, 5oal:I, 5oal:J, 5oal:K, 5oal:L, 5oal:O, 5oal:M, 5oal:N, 5oan:B, 5oan:C, 5oan:D, 5oan:E, 5obg:A, 5obg:B, 5obg:C, 5obg:D, 5obg:E, 5obh:A, 5obh:B, 5obh:C, 5obh:D, 5obh:E, 8q1m:C, 8qtl:D, 8qx2:D, 5syo:B, 5syo:C, 5syo:E, 6t9r:CCC, 5tsf:E, 5tvc:A, 5tvc:B, 5tvc:C, 5tvc:D, 5tvc:E, 5tvh:D, 2wn9:E, 2wnj:E, 4wv9:B, 4xhe:B, 2ymd:A, 2ymd:B, 2ymd:C, 2ymd:D, 2ymd:E, 2ymd:F, 2ymd:G, 2ymd:H, 2ymd:I, 2ymd:J, 4zk4:A, 4zk4:B, 4zk4:C, 4zk4:D, 4zk4:E
51 3fru:C 269 58 0.0547 0.0632 0.2931 5.8 1i1a:A
52 7rr9:A 560 43 0.0514 0.0286 0.3721 8.5 7rr9:B, 7vx8:B, 7vx8:A
53 7x0z:B 580 43 0.0514 0.0276 0.3721 8.8 7shm:A, 7shm:B, 7x0z:A
54 5b2o:A 1455 48 0.0386 0.0082 0.2500 9.4 5b2p:A, 5b2q:A
55 4afh:A 213 67 0.0707 0.1033 0.3284 9.9 4afg:A, 4afg:B, 4afg:E, 4afg:D, 4afg:C, 4afh:B, 4afh:C, 4afh:D, 4afh:E, 4b5d:A, 4b5d:B, 4b5d:C, 4b5d:D, 4b5d:E
56 1nb3:I 98 35 0.0386 0.1224 0.3429 9.9 1nb3:J, 1nb3:K, 1nb3:L, 1nb5:I, 1nb5:J, 1nb5:K, 1nb5:L
57 7x07:A 633 43 0.0514 0.0253 0.3721 9.9 7shn:A, 7shn:B, 7vzb:A, 7vzb:B, 7x0t:A, 7x0t:B, 7x1w:A, 7x1w:B, 7xec:A, 7yrq:A, 7yrq:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218