Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
VRKPRTIYSSFQLAALQRRFQKTQYLALPERAELAASLGLTQTQVKIWFQNKRSKIKKIMKN

The query sequence (length=62) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 4rdu:D 62 62 1.0000 1.0000 1.0000 7.02e-40 4rdu:A, 4xrs:I, 4xrs:G
2 1ig7:A 58 58 0.5484 0.5862 0.5862 1.50e-20
3 3rkq:A 58 56 0.5161 0.5517 0.5714 5.05e-17 3rkq:B
4 8pna:A 67 57 0.4677 0.4328 0.5088 3.76e-16 8pm5:A, 8pm5:D, 8pm5:G, 8pm5:M, 8pm5:J, 8pm7:A, 8pm7:C, 8pm7:E, 8pm7:G, 8pmc:A, 8pmc:C, 8pmc:E, 8pmc:G, 8pmf:A, 8pmn:A, 8pmv:A, 8pmv:D, 8pmv:G, 8pmv:J, 8pn4:A, 8pn4:D, 8pn4:G, 8pn4:M, 8pn4:J, 8pnc:A, 8pnc:K, 8pnc:E, 8pnc:H
5 6es3:K 72 59 0.4516 0.3889 0.4746 2.43e-15 6es2:K, 6es2:L, 6es3:M, 5lty:K, 5lty:M, 5lux:K, 5lux:L, 7q3o:K, 7q3o:C, 7q3o:E, 7q3o:G, 7q4n:K, 7q4n:C
6 3a01:A 78 57 0.4677 0.3718 0.5088 4.72e-15 3a01:E
7 6m3d:C 108 56 0.4677 0.2685 0.5179 1.25e-14 1du0:A, 1du0:B, 1hdd:C, 1hdd:D, 2hdd:A, 2hdd:B, 3hdd:A, 3hdd:B, 2hos:A, 2hos:B, 2hot:A, 2hot:B
8 6m3d:C 108 48 0.3871 0.2222 0.5000 6.72e-11 1du0:A, 1du0:B, 1hdd:C, 1hdd:D, 2hdd:A, 2hdd:B, 3hdd:A, 3hdd:B, 2hos:A, 2hos:B, 2hot:A, 2hot:B
9 2me6:A 71 58 0.4516 0.3944 0.4828 2.08e-14
10 1nk2:P 77 57 0.4677 0.3766 0.5088 1.10e-13 1nk3:P
11 3a01:F 61 57 0.4032 0.4098 0.4386 1.56e-13 3a01:B, 3lnq:A
12 5flv:M 229 53 0.4516 0.1223 0.5283 1.02e-12 5flv:A, 5flv:E, 5flv:I, 4s0h:A, 4s0h:B, 4s0h:E, 4s0h:F, 6wc2:N, 6wc2:M, 6wc2:O, 6wc5:I, 6wc5:N, 2x6u:A, 2x6v:A, 2x6v:B
13 1fjl:A 65 57 0.3871 0.3692 0.4211 1.03e-12 1fjl:B, 1fjl:C
14 1b72:A 68 54 0.4355 0.3971 0.5000 1.24e-12
15 2h1k:B 60 57 0.4194 0.4333 0.4561 2.33e-12 2h1k:A
16 1jgg:A 57 54 0.3871 0.4211 0.4444 3.45e-12 1jgg:B
17 1puf:A 77 62 0.4677 0.3766 0.4677 6.23e-12 2lp0:A
18 8eml:A 58 56 0.4355 0.4655 0.4821 6.44e-12 8eml:B
19 4uus:A 67 54 0.3871 0.3582 0.4444 7.05e-12 4uus:E
20 8osb:E 62 56 0.3871 0.3871 0.4286 1.28e-11
21 4rbo:A 55 53 0.4194 0.4727 0.4906 1.43e-11 4rbo:D
22 4cyc:A 66 54 0.3871 0.3636 0.4444 1.55e-11 1b8i:A
23 1zq3:P 68 56 0.4032 0.3676 0.4464 2.28e-11
24 5zjr:A 64 58 0.4677 0.4531 0.5000 2.79e-11 5zjq:A, 5zjs:A, 5zjt:A, 5zjt:E
25 2r5z:A 75 57 0.4194 0.3467 0.4561 3.23e-11 9ant:A, 9ant:B, 5jlw:A, 5jlw:D, 5jlx:A, 5jlx:D, 2r5y:A, 4xic:A, 4xic:D, 4xid:A, 4xid:D
26 1ahd:P 68 57 0.3871 0.3529 0.4211 1.21e-10
27 3cmy:A 60 57 0.3548 0.3667 0.3860 5.95e-10
28 2ld5:A 67 59 0.3548 0.3284 0.3729 9.59e-10
29 2lkx:A 68 57 0.3548 0.3235 0.3860 1.25e-09
30 4qtr:C 57 54 0.4355 0.4737 0.5000 1.52e-09 4qtr:A, 4qtr:B, 4qtr:D
31 5eea:G 63 59 0.3548 0.3492 0.3729 2.27e-09 8byx:B, 8byx:J, 8byx:A, 8byx:K, 8byx:G, 8byx:L, 5edn:A, 5edn:B, 5edn:G, 5edn:J, 5eea:B, 5eea:A, 5eea:J, 5ef6:A, 5ef6:J, 5ef6:B, 5ef6:G, 5eg0:B, 5ego:B, 5no6:A, 5no6:B, 7psx:A, 7psx:B, 7psx:G, 7psx:J
32 6e8c:A 135 54 0.3387 0.1556 0.3889 7.29e-08 6a8r:A, 6a8r:B, 6dfy:C, 6dfy:D, 7dw5:A, 7dw5:B, 6u81:A, 6u82:A, 6u82:D, 5z2t:C, 5z2t:D, 5z6z:A, 5zfw:A, 5zfy:A, 5zfz:A
33 6e8c:A 135 49 0.2742 0.1259 0.3469 1.84e-06 6a8r:A, 6a8r:B, 6dfy:C, 6dfy:D, 7dw5:A, 7dw5:B, 6u81:A, 6u82:A, 6u82:D, 5z2t:C, 5z2t:D, 5z6z:A, 5zfw:A, 5zfy:A, 5zfz:A
34 8ik5:C 67 60 0.3548 0.3284 0.3667 3.65e-07 8ike:C, 8ilw:C
35 8ejo:A 56 54 0.2742 0.3036 0.3148 9.38e-07 8ejo:B, 8ejp:A, 8ejp:B
36 9b8u:B 66 50 0.3065 0.2879 0.3800 1.16e-06 9b8u:A, 9b8u:C, 9b8u:D
37 5hod:A 61 59 0.3065 0.3115 0.3220 2.03e-06 5hod:D
38 1le8:A 53 44 0.2903 0.3396 0.4091 3.78e-05 1akh:A, 1yrn:A
39 4egc:A 539 50 0.3226 0.0371 0.4000 7.36e-05
40 3d1n:I 150 56 0.2903 0.1200 0.3214 0.007 3d1n:K, 3d1n:J, 3d1n:L, 3d1n:M, 3d1n:N, 3d1n:O, 3d1n:P
41 7xrc:C 134 46 0.2742 0.1269 0.3696 0.021 2xsd:C
42 1lfu:P 82 34 0.2419 0.1829 0.4412 0.021 1b72:B, 1b8i:B, 4cyc:B, 1puf:B, 2r5y:B, 2r5z:B, 4uus:B, 4uus:F, 5zjq:B, 5zjr:B, 5zjs:B, 5zjt:B
43 5wc9:A 136 57 0.2903 0.1324 0.3158 0.024 1au7:A, 1au7:B, 5wc9:B, 5wc9:E, 5wc9:F
44 3l1p:A 147 44 0.2419 0.1020 0.3409 0.051 8bx2:A, 6ht5:E, 3l1p:B, 8sps:L, 8spu:L, 6t90:K, 7u0g:M, 7u0g:L, 7u0i:L, 7u0i:M
45 1gt0:C 137 57 0.2742 0.1241 0.2982 0.055 1cqt:A, 1cqt:B, 1e3o:C, 1hf0:A, 1hf0:B, 1o4x:A, 1oct:C
46 8bx1:A 127 43 0.2419 0.1181 0.3488 0.059
47 8g8e:X 140 27 0.1774 0.0786 0.4074 0.29 8g87:X, 8g88:X, 8g8b:X, 8g8g:X, 8sps:M, 7u0g:K
48 4xrm:B 64 42 0.2742 0.2656 0.4048 0.34 5bng:B, 5bng:A, 5eg0:A, 5ego:A, 8vts:B, 8vts:D, 8vtt:D, 4xrm:A, 4xrs:A, 4xrs:B
49 4l16:A 292 16 0.1774 0.0377 0.6875 0.61
50 8r3g:A 335 33 0.2258 0.0418 0.4242 0.63 3bxf:A, 3bxg:A, 3bxg:B, 3bxh:A, 3bxh:B, 2okg:B, 7oyk:BBB, 7oyk:AAA, 7oyk:CCC, 7oyk:DDD, 8r3g:B, 8r3g:D, 8r3g:C
51 2zan:A 312 36 0.2419 0.0481 0.4167 0.95 7l9x:A, 2zao:A
52 4j19:A 77 61 0.2581 0.2078 0.2623 1.1 4j19:B
53 1dv2:A 450 31 0.1774 0.0244 0.3548 2.0 1dv1:A, 1dv2:B, 3g8c:A, 3g8c:B, 3g8d:B, 2j9g:A, 2j9g:B, 3jzf:B, 3jzi:A, 3jzi:B, 6oi9:A, 6oi9:B, 3rup:A, 3rup:B, 3rv3:A, 3rv3:B, 3rv4:A, 2v58:A, 2v58:B, 2v59:A, 2v59:B, 2v5a:A, 2vr1:A, 2w6m:A, 2w6m:B, 2w6n:A, 2w6n:B, 2w6o:A, 2w6o:C, 2w6p:A, 2w6q:A, 2w6q:B, 2w6z:A, 2w70:A, 2w70:B, 2w71:A, 2w71:C
54 4d82:B 274 30 0.1935 0.0438 0.4000 2.8 4d81:A, 4d82:A, 4d82:C
55 1kc7:A 872 42 0.2581 0.0183 0.3810 3.4
56 6qfb:C 1011 55 0.2258 0.0138 0.2545 3.5
57 8g1e:A 1037 55 0.2258 0.0135 0.2545 3.5 8g1e:B, 8g1e:D, 8g1e:C, 8g1f:A, 8g1f:C, 8g1f:B, 8g1f:D, 8g5c:A, 8g5c:B, 8g5c:C, 8g5c:D, 8g5d:A, 8g5d:B, 8g5d:C, 8g5d:D, 6hxh:A, 6hxh:B, 6hxh:C, 6hxh:D, 6hxh:E, 6hxh:F, 6hxh:G, 6hxh:H, 6hxk:A, 6hxk:B, 6hxk:C, 6hxk:D, 6hxl:A, 6hxl:B, 6hxl:C, 6hxl:D, 6hxl:E, 6hxl:F, 6hxl:G, 6hxl:H, 6hxm:A, 6hxm:B, 7liw:B, 7liw:D, 7lj9:A, 7lj9:B, 7lj9:C, 7lj9:D, 7lla:A, 7lla:C, 7lla:B, 7lla:D, 3mwe:A, 6o0h:A, 6o0h:B, 6o0h:C, 6o0h:D, 3pff:A, 6poe:B, 6poe:D, 6poe:A, 6poe:C, 6qfb:A, 6qfb:B, 6qfb:D, 7rig:A, 7rig:C, 7rig:B, 7rig:D, 7rkz:A, 7rkz:C, 7rkz:B, 7rkz:D, 7rmp:A, 7rmp:C, 7rmp:B, 7rmp:D, 5tde:A, 5tde:B, 5tdf:A, 5tdm:A, 5tdm:B, 5tdz:A, 5te1:A, 5te1:B, 5teq:A, 5teq:B, 5tes:A, 5tet:A, 6ui9:A, 6ui9:C, 6ui9:B, 6ui9:D, 6uia:C, 6uia:A, 6uia:D, 6uia:B, 6uuw:A, 6uuw:C, 6uuw:B, 6uuw:D, 6uuz:A, 6uuz:C, 6uuz:B, 6uuz:D, 6uv5:A, 6uv5:C, 6uv5:B, 6uv5:D, 6z2h:A, 6z2h:C, 6z2h:D

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218