BioLiP

>protein
VRILGYDPLASPALLQVQIPATPTSLETAKRGRREAIDIITGKDDRVLVIVGPCSIHDLEAAQEYALRLKKLSDELKGDL
SIIMRAYLEKPRTTVGWKGLINDPDVNNTFNINKGLQSARQLFVNLTNIGLPIGSEMLDTISPQYLADLVSFGAIGARTT
ESQLHRELASGLSFPVGFKNGTDGTLNVAVDACQAAAHSHHFMGVTKHGVAAITTTKGNEHCFVILRGGKKGTNYDAKSV
AEAKAQLPAGSNGLMIDYSHGNSNKDFRNQPKVNDVVCEQIANGENAITGVMIESNINEGNQGIPKAGLKYGVSITDACI
GWETTEDVLRKLAAAVRQRREVNK

The query sequence (length=344) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1of6:A	350	346	0.9942	0.9771	0.9884	0.0	1hfb:A, 1hfb:B, 1hfb:C, 1hfb:D, 1hfb:E, 1hfb:F, 1hfb:G, 1hfb:H, 1oab:A, 1oab:B, 1of6:B, 1of6:C, 1of6:D, 1of6:E, 1of6:F, 1of6:G, 1of6:H, 1of8:A, 1of8:B, 1ofa:B, 1ofa:A, 1ofb:A, 1ofb:B, 1ofo:A, 1ofo:B, 1ofq:A, 1ofq:B, 1ofq:C, 1ofq:D, 1ofr:A, 1ofr:H, 1ofr:C, 1ofr:D, 1ofr:E, 1ofr:F, 1ofr:G, 1ofr:B, 1og0:A, 1og0:B, 1og0:C, 1og0:D, 1og0:E, 1og0:F, 1og0:G, 1og0:H
2	7reu:B	358	351	0.6890	0.6620	0.6752	2.30e-172	7reu:A
3	1kfl:A	350	346	0.5756	0.5657	0.5723	3.10e-132	5cks:A, 5cks:B, 5cks:C, 5cks:D, 8e0s:A, 8e0s:B, 8e0s:C, 8e0s:D, 8e0t:B, 8e0t:C, 8e0v:A, 8e0v:B, 8e0v:C, 8e0v:D, 8e0x:A, 8e0x:B, 8e0x:C, 8e0x:D, 8e0y:C, 1gg1:A, 1gg1:B, 1gg1:C, 1gg1:D, 1kfl:B, 1kfl:C, 1kfl:D, 1kfl:E, 1kfl:F, 1kfl:G, 1kfl:H, 1n8f:A, 1n8f:B, 1n8f:C, 1n8f:D, 1qr7:A, 1qr7:B, 1qr7:C, 1qr7:D, 7rud:B, 7rud:C, 7rud:D, 7rue:A, 7rue:B, 7rue:C, 7rue:D
4	5dcb:C	348	341	0.5349	0.5287	0.5396	7.63e-124	5cz0:A, 5cz0:B, 5cz0:C, 5cz0:D, 5czs:A, 5czs:B, 5czs:C, 5czs:D, 5czt:A, 5czt:B, 5czt:C, 5czt:D, 5d02:A, 5d02:B, 5d02:C, 5d02:D, 5d03:A, 5d03:B, 5d03:C, 5d03:D, 5d04:C, 5d04:D, 5d05:A, 5d05:B, 5d05:C, 5d05:D, 5d09:A, 5d09:B, 5d09:C, 5d09:D, 5dcb:A, 5dcb:B, 5dcb:D, 5dcd:A, 5dcd:B, 5dcd:C, 5dcd:D, 5dce:A, 5dce:B, 5dce:C, 5dce:D, 4hsn:A, 4hsn:B, 4hsn:C, 4hsn:D, 4hso:A, 4hso:B, 4hso:C, 4hso:D, 4ixx:A, 4ixx:B, 4ixx:C, 4ixx:D, 4uc5:A, 4uc5:B, 4uc5:C, 4uc5:D, 4ucg:A, 4ucg:B, 4ucg:C, 4ucg:D, 4uma:A, 4uma:B, 4uma:C, 4uma:D, 4umb:A, 4umb:B, 4umb:C, 4umb:D, 4umc:A, 4umc:B, 4umc:C, 4umc:D
5	3tqk:A	341	332	0.5233	0.5279	0.5422	5.39e-122
6	6agm:A	334	334	0.4797	0.4940	0.4940	4.92e-110	6agm:B, 6agm:C, 6agm:D
7	2bgs:A	308	81	0.0640	0.0714	0.2716	0.27	2vdg:A
8	5i7i:B	320	88	0.0669	0.0719	0.2614	0.50	5i7i:A, 5izz:A
9	3nvt:A	345	228	0.1366	0.1362	0.2061	1.6	3nvt:B, 3tfc:A, 3tfc:B
10	2a21:A	263	46	0.0378	0.0494	0.2826	2.1	2a21:B, 2a2i:A, 2a2i:B, 3e0i:A, 3e0i:B, 3e12:A, 3e12:B, 2ef9:A, 2ef9:B, 1fwn:A, 1fwn:B, 1fws:A, 1fws:B, 1fwt:A, 1fwt:B, 1fww:A, 1fww:B, 1fx6:A, 1fx6:B, 1fxp:A, 1fxp:B, 1fxq:A, 1fxq:B, 1fy6:A, 1fy6:B, 1jcx:A, 1jcx:B, 1jcy:A, 1jcy:B, 1lrn:A, 1lrn:B, 1lro:A, 1lro:B, 1lrq:A, 1lrq:B, 2nwr:A, 2nwr:B, 2nws:A, 2nws:B, 2nx1:A, 2nx1:B, 2nx3:A, 2nx3:B, 2nx3:C, 2nx3:D, 2nx3:E, 2nx3:F, 2nx3:G, 2nx3:H, 2nx3:I, 2nx3:J, 2nx3:K, 2nx3:L, 2nxg:A, 2nxg:B, 2nxh:A, 2nxh:B, 2nxh:C, 2nxh:D, 2nxh:E, 2nxh:F, 2nxh:G, 2nxh:H, 2nxh:I, 2nxh:J, 2nxh:K, 2nxh:L, 2nxi:A, 2nxi:B, 2nxi:C, 2nxi:D, 2nxi:E, 2nxi:F, 2nxi:G, 2nxi:H, 2nxi:I, 2nxi:J, 2nxi:K, 2nxi:L, 1pck:A, 1pck:B, 1pcw:A, 1pcw:B, 1pe1:A, 1pe1:B, 1t8x:A, 1t8x:B, 1t96:A, 1t96:B, 1zha:A, 1zha:B, 1zji:A, 1zji:B
11	3h0g:M	1476	93	0.0610	0.0142	0.2258	2.2
12	7q86:A	612	72	0.0610	0.0343	0.2917	3.1	7q86:B
13	5jgw:A	314	81	0.0610	0.0669	0.2593	3.2	5jgw:B, 5jgw:C, 5jgw:D, 5jgy:A, 5jgy:B
14	7ena:PA	1475	108	0.0814	0.0190	0.2593	3.6	7b0y:A, 8b3d:A, 8b3f:A, 7enc:PA, 6gmh:A, 6gml:A, 8gxq:PA, 8gxs:PA, 7lbm:A, 5oik:A, 7oo3:A, 7oob:A, 7oop:A, 7opc:A, 7opd:A, 8p4a:A, 8p4b:A, 8p4c:A, 8p4d:A, 8p4e:A, 8p4f:A, 8s51:A, 8s52:A, 8s54:A, 8s55:A, 8uha:A, 8uhd:A, 8uis:A, 8w8e:A, 8w8f:A, 7ycx:1
15	7qvd:AAA	380	107	0.0785	0.0711	0.2523	3.7
16	6o9l:A	1476	108	0.0814	0.0190	0.2593	4.1	8a40:A, 8bvw:A, 8byq:A, 8bz1:A, 7edx:o, 7eg7:o, 7eg8:o, 7eg9:o, 7ega:o, 7egb:o, 7egc:o, 6exv:A, 5flm:A, 5iy6:A, 5iy7:A, 5iy8:A, 5iy9:A, 5iya:A, 5iyb:A, 5iyc:A, 5iyd:A, 7nvr:A, 7nvs:A, 7nvt:A, 7nvu:A, 7nvy:A, 7nvz:A, 7nw0:A, 8s5n:A, 8wak:o, 8wal:o, 8wan:o, 8wao:o, 8wap:o, 8waq:o, 8war:o, 8was:o, 8wat:o, 8wau:o, 8wav:o, 8waw:o, 8wax:o, 8way:o, 8waz:o, 8wb0:o, 6xre:A, 7zwd:A, 7zx7:A, 7zx8:A
17	8a3y:A	1426	108	0.0814	0.0196	0.2593	4.2	8oeu:A, 8oev:A, 8oew:A, 8of0:A, 7okx:A, 7oky:A, 7ol0:A, 7pks:A, 8rbx:A, 6ted:A, 8uhg:A, 8ui0:A, 7unc:A, 7und:A
18	1vs1:D	271	147	0.1047	0.1328	0.2449	4.7	1vs1:A, 1vs1:B, 1vs1:C
19	3pg9:A	338	244	0.1483	0.1509	0.2090	5.2	3pg9:F, 3pg9:B, 3pg9:G, 3pg9:C, 3pg9:E, 3pg9:D, 3pg9:H, 1rzm:A, 1rzm:B
20	6rm3:LT0	159	46	0.0349	0.0755	0.2609	5.6
21	6xyw:Bj	123	48	0.0465	0.1301	0.3333	6.9
22	4ciu:A	657	74	0.0552	0.0289	0.2568	7.0
23	6tir:A	285	59	0.0523	0.0632	0.3051	9.6
24	4z5q:A	363	94	0.0727	0.0689	0.2660	10.0

[Back]