BioLiP

>protein
VPSQKTYQGSYGFRLGFLHSGTAKSVTCTYSPALNKLFCQLAKTCPVQLWVDSTPPPGTRVRAMAIYKQSQHMTEVVRRC
PHHERCSDSDGLAPPQHLIRVEGNLRAEYLDDRNTFRHSVVVPCEPPEVGSDCTTIHYNYMCYSSCMGGMNRRPILTIIT
LEDSSGNLLGRDSFEVRVCACPGRDRRTEEENLR

The query sequence (length=194) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	8xp5:A	302	194	0.9742	0.6258	0.9742	9.20e-144
2	6lhd:B	332	193	0.9691	0.5663	0.9741	2.51e-142	4a1w:A, 4a1w:B, 4a1w:C, 4a1w:D, 8a31:A, 8a31:B, 8a32:A, 8a32:B, 5a7b:A, 5a7b:B, 8a92:A, 8a92:B, 5ab9:A, 5ab9:B, 5aba:A, 5aba:B, 2ac0:A, 2ac0:B, 2ac0:C, 2ac0:D, 2ady:A, 2ady:B, 4agl:A, 4agl:B, 4agm:A, 4agm:B, 4agn:A, 4agn:B, 4ago:A, 4ago:B, 4agp:A, 4agp:B, 4agq:A, 4agq:B, 2ahi:A, 2ahi:B, 2ahi:C, 2ahi:D, 5aoi:A, 5aoi:B, 5aoj:A, 5aoj:B, 5aok:A, 5aok:B, 5aol:A, 5aol:B, 5aom:A, 5aom:B, 2ata:A, 2ata:B, 2ata:C, 2ata:D, 5b1z:A, 5b1z:B, 7b46:B, 7b46:A, 7b46:C, 7b46:D, 7b47:A, 7b47:B, 7b47:C, 7b47:D, 7b48:A, 7b48:B, 7b48:C, 7b48:D, 7b49:A, 7b49:B, 7b4a:A, 7b4a:B, 7b4b:A, 7b4b:B, 7b4b:C, 7b4b:D, 7b4c:A, 7b4c:B, 7b4c:C, 7b4c:D, 7b4d:A, 7b4e:A, 7b4f:A, 7b4g:A, 7b4h:A, 7b4n:A, 2bim:A, 2bim:B, 2bin:A, 2bio:A, 2bip:A, 2biq:A, 4bpk:A, 4bpk:B, 5bua:A, 2bzw:A, 5c3g:A, 4c52:A, 4c52:B, 4c5d:A, 4c5d:B, 8cg7:A, 8cg7:B, 4cin:A, 4cin:B, 3d05:A, 3d06:A, 3d07:A, 3d07:B, 3d08:A, 3d09:A, 3d0a:A, 3d0a:B, 3d0a:C, 3d0a:D, 6dcn:A, 6dcn:B, 6dco:A, 6dco:B, 8dc4:B, 8dc4:A, 8dc4:C, 8dc4:D, 8dc6:A, 8dc6:B, 8dc6:C, 8dc6:D, 8dc7:A, 8dc8:A, 7dhy:A, 7dhy:B, 7dhy:C, 7dhy:D, 7dhz:A, 7dhz:B, 7dvd:B, 7dvd:A, 7dvd:C, 7dvd:D, 8e7a:A, 8e7b:A, 8e7b:B, 7eax:A, 7eax:B, 7eax:C, 7eax:D, 5ecg:A, 5ecg:B, 7eds:A, 7eeu:A, 7eeu:B, 7eeu:C, 7eeu:D, 7eeu:E, 7eeu:F, 7eeu:G, 7eeu:H, 4ehr:A, 3fdl:A, 3fdm:A, 3fdm:C, 3fdm:B, 2fej:A, 6ff9:A, 6ff9:B, 6ff9:C, 6ff9:D, 6fj5:A, 6fj5:B, 6fj5:C, 6fj5:D, 8fy0:D, 5g4m:A, 5g4m:B, 5g4n:A, 5g4n:B, 5g4o:A, 5g4o:B, 8gcr:B, 6gga:A, 6gga:B, 6ggb:A, 6ggb:B, 6ggc:A, 6ggc:B, 6ggd:A, 6ggd:B, 6gge:A, 6gge:B, 6ggf:A, 6ggf:B, 1gzh:A, 1gzh:C, 2h1l:M, 2h1l:N, 2h1l:O, 2h1l:P, 2h1l:Q, 2h1l:R, 2h1l:S, 2h1l:T, 2h1l:U, 2h1l:V, 2h1l:W, 2h1l:X, 4hje:A, 4hje:C, 4hje:D, 4hje:B, 8hll:A, 8hlm:A, 8hln:A, 4hnj:A, 4ibq:A, 4ibq:B, 4ibq:C, 4ibq:D, 4ibs:A, 4ibs:B, 4ibs:C, 4ibs:D, 4ibt:A, 4ibt:B, 4ibt:C, 4ibt:D, 4ibu:A, 4ibu:B, 4ibu:C, 4ibu:D, 4ibv:A, 4ibw:A, 4iby:A, 4iby:B, 4ibz:A, 4ibz:B, 4ibz:C, 4ibz:D, 3igk:A, 3igl:A, 4ijt:A, 3inq:A, 3inq:B, 3io8:A, 3io8:C, 8iqk:A, 8iqk:C, 8iqk:E, 8iqk:G, 2j1w:A, 2j1w:B, 2j1x:A, 2j1x:B, 2j1y:A, 2j1y:B, 2j1y:C, 2j1y:D, 2j1z:A, 2j1z:B, 2j20:A, 2j20:B, 2j21:A, 2j21:B, 8j8n:A, 8j8n:B, 8j8n:C, 8j8n:D, 7jgv:A, 7jgv:B, 7jgw:A, 3kmd:A, 3kmd:B, 3kmd:D, 3kmd:C, 4kvp:A, 4kvp:B, 4kvp:C, 4kvp:D, 1kzy:A, 1kzy:B, 3kz8:A, 3kz8:B, 5lap:A, 5lap:B, 5lgy:A, 5lgy:B, 5lgy:C, 5lgy:D, 6lhd:A, 7lh7:B, 4lo9:A, 4lo9:B, 4lo9:C, 4lo9:D, 4loe:A, 4loe:B, 4loe:C, 4loe:D, 4lof:A, 5mct:A, 5mct:B, 5mcu:A, 5mcu:B, 5mcv:A, 5mcv:B, 5mcw:A, 5mcw:B, 2mej:B, 5mf7:A, 5mf7:B, 5mg7:A, 5mg7:B, 4mzi:A, 5o1a:A, 5o1a:B, 5o1b:A, 5o1b:B, 5o1c:A, 5o1c:B, 5o1d:A, 5o1d:B, 5o1e:A, 5o1e:B, 5o1f:A, 5o1f:B, 5o1g:A, 5o1g:B, 5o1h:A, 5o1h:B, 5o1i:A, 5o1i:B, 2o2m:A, 2o2n:A, 2ocj:A, 2ocj:B, 2ocj:C, 2ocj:D, 2p1l:A, 2p1l:C, 2p1l:E, 2p1l:G, 2pcx:A, 3pl7:A, 3pl7:B, 3qkd:A, 3qkd:B, 4qnq:A, 4qnq:B, 4qnq:C, 4qnq:G, 4qnq:D, 4qnq:J, 4qnq:E, 4qnq:F, 4qnq:H, 4qnq:I, 4qnq:K, 4qnq:L, 4qo1:B, 4qve:A, 4qvf:A, 4qvx:A, 4qvx:B, 8qwk:A, 8qwl:A, 8qwm:A, 8qwm:B, 8qwn:A, 8qwo:A, 8qwo:B, 8qwp:A, 8qwp:B, 8r1f:C, 8r1g:C, 8r1g:F, 3r85:A, 3r85:B, 3r85:C, 3r85:D, 6rnu:B, 6rnu:A, 6rz3:A, 6shz:A, 6shz:B, 6si0:A, 6si0:B, 6si1:A, 6si1:B, 6si2:A, 6si2:B, 6si3:A, 6si3:B, 6si4:A, 6si4:B, 6sl6:A, 3sp7:A, 3spf:A, 1tsr:A, 1tsr:B, 1tsr:C, 1tup:A, 1tup:B, 1tup:C, 4tuh:A, 4tuh:B, 4tuh:C, 4tuh:D, 4tuh:E, 4tuh:F, 4tuh:G, 4tuh:H, 1uol:A, 1uol:B, 6uvc:A, 6uvc:B, 6uvd:A, 6uvd:B, 6uve:A, 6uve:B, 6uvf:A, 6uvf:B, 6uvf:C, 6uvf:D, 6uvf:K, 6uvf:E, 6uvf:F, 6uvf:I, 6uvf:G, 6uvf:H, 6uvf:J, 6uvf:L, 6uvg:A, 6uvg:B, 6uvg:C, 6uvg:K, 6uvg:D, 6uvg:E, 6uvg:F, 6uvg:G, 6uvg:H, 6uvg:I, 6uvg:J, 6uvg:L, 6uvh:A, 6uvh:B, 6uvh:C, 6uvh:D, 7v97:A, 7v97:B, 7v97:C, 7v97:D, 2vuk:A, 2vuk:B, 6vwc:A, 6vwc:B, 5vx3:A, 5vx3:C, 5vx3:E, 5vx3:G, 8wd2:A, 8wd2:B, 2wgx:B, 2wgx:A, 3wiz:A, 3wiz:B, 2x0u:A, 2x0u:B, 2x0v:A, 2x0v:B, 2x0w:A, 2x0w:B, 8xp5:B, 4xr8:C, 4xr8:D, 2xwr:A, 2xwr:B, 7xzx:K, 7xzx:L, 7xzx:M, 7xzx:N, 7xzz:K, 7xzz:L, 7xzz:M, 7xzz:N, 7y8d:A, 7y99:A, 7yaa:A, 2ybg:A, 2ybg:B, 2ybg:C, 2ybg:D, 1ycs:A, 7ygi:A, 7ygi:B, 2yj1:C, 4yj4:A, 4yk9:A, 4yk9:F, 6yli:C, 2yq6:A, 2yq7:A, 2yxj:A, 2yxj:B, 6zhc:DDD, 3zk6:A, 3zk6:B, 3zln:A, 3zlo:A, 3zlr:A, 3zme:A, 3zme:B, 6znc:A
3	4mzr:A	234	194	0.9175	0.7607	0.9175	2.34e-133	4mzr:B, 4mzr:C, 4mzr:D, 3q01:A, 3q01:B, 3q05:A, 3q05:C, 3q05:B, 3q05:D, 3q06:A, 3q06:C, 3q06:D, 3q06:B, 3ts8:A, 3ts8:B, 3ts8:C, 3ts8:D
4	3exj:A	194	190	0.8660	0.8660	0.8842	2.11e-126	3exj:B, 3exl:A, 2geq:A, 2geq:B, 1hu8:A, 1hu8:B, 1hu8:C, 2ioi:A, 2iom:A, 2ioo:A
5	7ezj:k	206	196	0.5928	0.5583	0.5867	4.00e-81	4a63:C, 4a63:E, 4a63:G, 4a63:I, 4a63:K, 7ezj:A, 7ezj:B, 7ezj:C, 7ezj:D, 7ezj:I, 7ezj:J, 7ezj:K, 7ezj:L, 7ezj:a, 7ezj:b, 7ezj:c, 7ezj:d, 7ezj:i, 7ezj:j, 7ezj:l, 4g82:A, 4g82:B, 4g83:B, 4g83:A, 4guo:A, 4guo:B, 4guo:C, 4guo:D, 4guo:J, 4guo:I, 4guo:K, 4guo:L, 4guq:A, 4guq:B, 5kbd:A, 5kbd:B, 3vd0:A, 3vd0:B, 3vd0:C, 3vd0:D, 3vd0:I, 3vd0:J, 3vd0:K, 3vd0:L, 3vd1:A, 3vd1:B, 3vd1:C, 3vd1:D, 3vd1:J, 3vd1:I, 3vd1:K, 3vd1:L, 3vd2:A, 3vd2:B, 3vd2:C, 3vd2:D, 3vd2:I, 3vd2:J, 2xwc:A
6	2rmn:A	233	196	0.5670	0.4721	0.5612	9.34e-80	3qym:A, 3qym:B, 3qym:C, 3qym:D, 3qym:E, 3qym:F, 3qym:G, 3qym:H, 3qyn:A, 3qyn:B, 3qyn:D, 3qyn:C, 3us0:A, 3us0:B, 3us0:D, 3us0:C, 3us1:A, 3us1:D, 3us2:A, 3us2:C, 3us2:B, 3us2:D, 3us2:G, 3us2:I, 3us2:H, 3us2:J, 7z71:A, 7z71:C, 7z7e:A
7	7pc6:A	193	192	0.4897	0.4922	0.4948	3.51e-60	7pc6:B, 7pc6:C, 7pc6:D, 7pc6:E, 7pc6:F, 7pc6:G, 7pc6:H
8	2jlm:F	180	35	0.0619	0.0667	0.3429	1.0
9	8jgj:A	684	54	0.0773	0.0219	0.2778	3.2	8jgj:B, 8jgk:A, 8jgk:B, 8jgl:A, 8jgl:B, 8jgv:A, 8jgv:B
10	1gka:A	180	114	0.1186	0.1278	0.2018	7.9
11	3pde:D	291	22	0.0515	0.0344	0.4545	8.8	3pde:A, 3pde:B, 3pde:C
12	6fd2:A	454	44	0.0979	0.0419	0.4318	9.3	6fd2:B

[Back]