BioLiP

>protein
VPRGSKTFIIGISGVTNSGKTTLAKNLQKHLPNCSVISQDDFFKPESEIETDKNGFLQYDVLEALNMEKMMSAISCWMES
ARHSVVSTEEIPILIIEGFLLFNYKPLDTIWNRSYFLTIPYEECKRRRSTRVYQPPDSPGYFDGHVWPMYLKYRQEMQDI
TWEVVYLDGTKSEEDLFLQVYEDLIQEL

The query sequence (length=188) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	2p0e:A	190	190	1.0000	0.9895	0.9895	3.76e-140	2qg6:A, 2ql6:A, 2ql6:E, 2ql6:B, 2ql6:C, 2ql6:F, 2ql6:D, 2ql6:G, 2ql6:H, 2ql6:I, 2ql6:M, 2ql6:J, 2ql6:K, 2ql6:L, 2ql6:N, 2ql6:O, 2ql6:P, 2qsy:A, 2qsz:A, 2qt0:A, 2qt1:A
2	3asz:B	208	143	0.2021	0.1827	0.2657	2.67e-07	3asz:A, 3w34:A, 3w34:B, 3w8r:A, 3w8r:B
3	2ges:A	308	75	0.1117	0.0682	0.2800	7.93e-04	3aez:A, 3af0:A, 3af1:A, 3af2:A, 3af3:A, 3avo:A, 3avq:A, 4bfs:A, 4bft:A, 4bft:B, 4bfu:A, 4bfu:B, 4bfv:A, 4bfv:B, 4bfw:A, 4bfw:B, 4bfx:A, 4bfx:B, 4bfy:A, 4bfy:B, 4bfz:A, 4bfz:B, 2get:A, 2geu:A, 2gev:A, 2zs7:A, 2zs8:A, 2zs9:A, 2zsa:A, 2zsb:A, 2zsd:A, 2zse:A, 2zsf:A
4	3tqc:B	305	97	0.1489	0.0918	0.2887	0.023	3tqc:A
5	8hf4:A	563	25	0.0904	0.0302	0.6800	0.052	8hf4:B, 8hf5:A, 8hf5:B, 8hf6:A, 8hf6:B, 8hf7:B, 8k4b:A, 8k4b:B, 8k7a:A, 8k7a:B
6	2uvq:A	211	151	0.1809	0.1611	0.2252	0.084
7	7tsq:B	208	51	0.0957	0.0865	0.3529	0.13
8	6n55:E	214	149	0.1596	0.1402	0.2013	0.18	6n53:A, 6n53:B, 6n54:A, 6n54:B, 6n55:D, 6n55:F, 6pwz:D, 6pwz:E, 6pwz:H, 7sql:A, 7sql:C, 7sql:B, 7sql:D, 1udw:A, 1udw:B, 1uei:A, 1uei:B, 1uej:A, 1uej:B, 1uj2:A, 1uj2:B, 1xrj:A, 1xrj:B
9	3wnb:A	361	29	0.0798	0.0416	0.5172	0.19	3wnc:A
10	7to3:A	568	51	0.0957	0.0317	0.3529	0.33	7to3:B, 7tqd:A, 7tsq:A, 7tsx:B, 7tsx:A
11	7yq0:A	173	27	0.0745	0.0809	0.5185	0.54	7yq0:B, 7yq1:A, 7yq1:B, 7yq1:C, 7yq1:D, 7yq1:E, 7yq1:F
12	7owj:F	197	121	0.1489	0.1421	0.2314	0.59	7owe:E, 7owe:F, 7owe:D, 7owe:A, 7owe:B, 7owe:C, 7owj:A, 7owj:B, 7owj:C, 7owj:D, 7owj:E, 7owk:B, 7owk:A, 7owk:C, 7owk:D, 7owk:E, 7owk:F, 7owl:A, 7owl:B, 7owl:C, 7owl:D, 7owl:E, 7owl:F
13	4hi0:E	196	42	0.0798	0.0765	0.3571	0.69	4hi0:F
14	1m8p:A	573	27	0.0638	0.0209	0.4444	0.99	1i2d:A, 1i2d:B, 1i2d:C, 1m8p:B, 1m8p:C
15	7z67:A	393	35	0.0426	0.0204	0.2286	1.5
16	7zhf:A	250	27	0.0691	0.0520	0.4815	1.6	7zhk:A, 7zhk:B, 7zhk:C
17	8t3k:C	541	23	0.0638	0.0222	0.5217	1.7
18	8fhk:C	574	23	0.0638	0.0209	0.5217	1.8	8fmv:C, 8fpf:C, 7m33:C, 8szc:C, 8t1p:C
19	3vx4:D	240	25	0.0745	0.0583	0.5600	2.2	3vx4:A
20	7t55:A	715	46	0.0957	0.0252	0.3913	3.3	4s0f:A, 4s0f:B, 7s5j:A, 7t54:A, 7t54:B, 7t55:B, 7t56:A, 7t56:B, 7t57:A, 7t57:B, 6v9z:A, 6v9z:B
21	6c6b:B	199	28	0.0585	0.0553	0.3929	4.4	6c6b:A, 6c6b:C, 6c6b:D, 6c6b:E, 6c6b:F
22	1jjv:A	194	18	0.0532	0.0515	0.5556	4.4
23	2f6r:A	230	24	0.0426	0.0348	0.3333	5.1
24	3kxi:A	326	23	0.0691	0.0399	0.5652	8.9	2qth:A
25	2www:D	314	56	0.0851	0.0510	0.2857	9.2	2www:A, 2www:B, 2www:C

[Back]