Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
VPGKVTLQKDAQNLIGISIGGGAYCPCLYIVQVFDNTPAALDGTVAAGDEITGVNGRSIKGKTKVEVAKMIQEVKGEVTI
HYNKL

The query sequence (length=85) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 6ar4:B 87 86 1.0000 0.9770 0.9884 5.19e-56 6ar4:A, 6bjo:A, 6bjo:B, 2pku:A
2 2exg:A 101 84 0.3412 0.2871 0.3452 8.62e-07 2ain:A, 7qcr:B, 7qcr:A
3 6nid:B 88 76 0.2471 0.2386 0.2763 3.43e-06 6nid:A, 6nid:C
4 1zub:A 109 78 0.2824 0.2202 0.3077 1.11e-04
5 2r4h:C 98 69 0.2471 0.2143 0.3043 1.84e-04
6 2kpl:A 129 68 0.2588 0.1705 0.3235 3.53e-04
7 5n7d:A 423 68 0.2588 0.0520 0.3235 3.55e-04 2i04:A, 2i04:B, 5n7d:B, 5n7f:A, 5n7f:B, 5n7g:A, 7p71:A, 7p71:B, 6twq:B, 6twq:A, 6twu:B, 6twu:A, 6twx:B, 6twx:A, 6twy:B, 6twy:A
8 3jxt:A 96 79 0.2824 0.2500 0.3038 4.79e-04 3jxt:B
9 4xhv:A 94 74 0.2471 0.2234 0.2838 5.16e-04
10 4e34:A 87 76 0.2706 0.2644 0.3026 6.66e-04 4e34:B, 4e35:A, 4e35:B, 5ic3:A, 5ic3:B, 4joe:A, 4joe:B, 4jof:A, 4jof:B, 4jog:A, 4jog:B, 4joh:A, 4joh:B, 4joj:A, 4joj:B, 4jok:A, 4jok:B, 4jop:A, 4jop:B, 4jor:A, 4jor:B, 7jzo:A, 7jzo:B, 7jzp:A, 7jzp:B, 7jzq:A, 7jzr:A, 7jzr:B, 5k4f:A, 5k4f:B, 4k6y:A, 4k6y:B, 4k72:A, 4k72:B, 4k75:A, 4k76:A, 4k76:B, 4k76:C, 4k76:D, 4k78:A, 2lob:A, 4nmo:A, 4nmo:B, 4nmp:A, 4nmp:B, 4nmq:A, 4nmq:B, 4nmr:A, 4nmr:B, 4nms:A, 4nms:B, 4nmt:A, 4nmt:B, 4nmv:A, 4nmv:B, 6ov7:A, 6ov7:B, 4q6h:A, 4q6s:A, 4q6s:B, 6v84:A, 6v84:B, 6xnj:A
11 8bp4:A 93 77 0.2588 0.2366 0.2857 0.002 8bp4:C, 8bp4:B
12 1u38:A 89 82 0.2471 0.2360 0.2561 0.003
13 7qct:A 90 65 0.2000 0.1889 0.2615 0.003 7qct:B
14 1ihj:B 95 84 0.2588 0.2316 0.2619 0.003 1ihj:A
15 3cyy:B 81 79 0.2353 0.2469 0.2532 0.003 3cyy:A
16 7p73:A 420 33 0.1647 0.0333 0.4242 0.004 8ael:A, 7p74:A, 7pc9:A, 7pc9:B, 7r2m:A, 7r2m:D, 7r2t:A
17 2qt5:A 194 82 0.2941 0.1289 0.3049 0.005 2qt5:B
18 5heb:A 119 79 0.2471 0.1765 0.2658 0.006 1be9:A, 5d13:B, 5d13:A, 5d13:C, 5d13:D, 5hed:A, 5hey:A, 5hf1:A, 5hfb:A, 5hfc:A, 5hfe:A, 5hff:A, 1tp3:A, 1tp5:A
19 6gbe:A 119 68 0.2471 0.1765 0.3088 0.016
20 6kz1:A 97 76 0.3294 0.2887 0.3684 0.018 6y38:A, 6y38:B, 6y9n:A, 6y9o:A, 6y9p:A, 6y9p:B, 6y9p:I, 6y9p:E, 6y9p:G, 6y9p:K, 6y9q:B
21 7d6f:A 87 49 0.1765 0.1724 0.3061 0.024
22 4xh7:A 110 52 0.1765 0.1364 0.2885 0.025
23 7qqn:C 414 77 0.2588 0.0531 0.2857 0.041 7pc7:A, 7pc7:B, 7pc8:A, 7pc8:B, 7qql:C, 7qql:B, 7qqn:A
24 2i0i:A 81 54 0.2235 0.2346 0.3519 0.048 2i0i:B, 2i0i:C
25 8bq8:C 93 82 0.2588 0.2366 0.2683 0.051 8bq8:A, 8bq8:B
26 2pdz:A 86 80 0.2824 0.2791 0.3000 0.053
27 2egn:A 83 68 0.2235 0.2289 0.2794 0.086
28 6zbq:A 89 70 0.2235 0.2135 0.2714 0.087 6zc4:A
29 4wsi:A 372 50 0.1765 0.0403 0.3000 0.092 7m4r:A, 7ntj:B, 7ntj:A, 7ntk:A, 7ntk:D, 7ntk:B, 7ntk:F, 7qcs:A, 7qcs:B, 4uu5:A, 4wsi:B
30 2m0z:A 97 64 0.2471 0.2165 0.3281 0.10 1d5g:A, 3lny:A, 2m10:A, 1vj6:A, 7xty:A, 7xty:B
31 5zys:A 90 55 0.1882 0.1778 0.2909 0.13
32 2os6:A 89 69 0.2706 0.2584 0.3333 0.36
33 2kqf:A 96 57 0.2235 0.1979 0.3333 0.37 2kyl:A
34 2kaw:A 90 73 0.2118 0.2000 0.2466 0.44 6lcb:A, 2mx6:A
35 8blu:B 195 77 0.2824 0.1231 0.3117 0.45 5a2p:A, 5a2p:B, 5a2p:D, 5a2p:C, 8aai:A, 8aai:B, 8aai:C, 8aai:D, 8aak:A, 8aak:B, 8aao:A, 8aao:B, 8aap:A, 8aap:B, 6ak2:A, 6ak2:B, 8blu:C, 8blu:D, 8blv:A, 8blv:B, 7fsg:B, 7fsg:C, 7fsg:D, 7fsh:B, 7fsh:C, 7fsh:D, 7fsi:B, 7fsi:C, 7fsi:D, 7fsj:A, 7fsj:B, 7fsj:C, 7fsj:D, 7fsk:B, 7fsk:C, 7fsk:D, 7fsl:A, 7fsl:B, 7fsl:C, 7fsl:D, 7fsm:A, 7fsm:B, 7fsm:C, 7fsm:D, 7fsn:A, 7fsn:B, 7fsn:C, 7fsn:D, 7fso:B, 7fso:C, 7fso:D, 7fsp:B, 7fsp:C, 7fsp:D, 7fsq:B, 7fsq:A, 7fsq:C, 7fsq:D, 7fsr:B, 7fsr:C, 7fsr:D, 7fss:A, 7fss:B, 7fss:C, 7fss:D, 7fst:B, 7fst:C, 7fst:D, 7fsu:B, 7fsu:C, 7fsu:D, 7fsv:A, 7fsv:B, 7fsv:C, 7fsv:D, 7fsw:A, 7fsw:B, 7fsw:C, 7fsw:D, 7fsx:B, 7fsx:C, 7fsx:D, 7fsy:A, 7fsy:B, 7fsy:C, 7fsy:D, 7fsz:B, 7fsz:C, 7fsz:D, 7ft0:B, 7ft0:C, 7ft0:D, 7ft1:B, 7ft1:C, 7ft1:D, 7ft2:B, 7ft2:C, 7ft2:D, 7ft3:B, 7ft3:A, 7ft3:C, 7ft3:D, 7ft4:A, 7ft4:B, 7ft4:C, 7ft4:D, 7ft5:A, 7ft5:B, 7ft5:C, 7ft5:D, 7ft6:B, 7ft6:C, 7ft6:D, 7ft7:A, 7ft7:B, 7ft7:C, 7ft7:D, 7ft8:B, 7ft8:C, 7ft8:D, 7ft9:B, 7ft9:C, 7ft9:D, 7fta:B, 7fta:C, 7fta:D, 7ftb:B, 7ftb:C, 7ftb:D, 7ftc:B, 7ftc:C, 7ftc:D, 7ftd:A, 7ftd:C, 7ftd:B, 7ftd:D, 5g1d:B, 5g1d:A, 8hck:A, 8hu2:A, 1obx:A, 1oby:A, 1oby:B, 1obz:A, 6r9h:A, 6r9h:C, 6rlc:A, 6rlc:B, 6rlc:C, 6rlc:D, 1v1t:B, 1v1t:A, 1w9e:A, 1w9e:B, 1w9o:B, 1w9o:A, 1w9q:B, 1ybo:A, 1ybo:B, 4z33:A, 4z33:B
36 1l6o:A 95 73 0.2118 0.1895 0.2466 0.46 2f0a:B, 2f0a:D, 1l6o:B, 1l6o:C, 6zbq:B, 6zbz:A, 6zbz:B, 6zbz:C, 6zbz:D, 6zc3:A, 6zc3:B, 6zc4:B, 6zc6:A, 6zc7:A, 6zc7:B, 6zc8:A, 6zc8:B
37 1n7f:A 86 46 0.1765 0.1744 0.3261 0.47 1n7f:B
38 2ejy:A 85 39 0.1294 0.1294 0.2821 0.50
39 1bpw:A 503 47 0.1647 0.0278 0.2979 0.53 1bpw:B, 1bpw:C, 1bpw:D
40 7p70:A 407 68 0.2471 0.0516 0.3088 0.57 7pc4:A, 7qql:A
41 2koh:A 111 46 0.1294 0.0991 0.2391 0.61 9imp:A, 9imp:B, 9imp:C, 9imp:D, 9imp:E, 9imp:F, 6jue:L, 2k20:A
42 1rzx:A 98 46 0.1765 0.1531 0.3261 0.66 5i7z:A, 1x8s:A
43 5gmj:B 224 48 0.2000 0.0759 0.3542 1.4 5gmi:A, 5gmi:B, 5gmj:A, 5h3j:A
44 3cs0:A 392 31 0.1647 0.0357 0.4516 2.0 8f0a:A, 8f0a:B, 8f0a:C, 8f0u:A, 8f1t:A, 8f1t:B, 8f1t:C, 8f1u:A, 8f1u:B, 8f1u:C, 8f21:A, 8f21:B, 8f21:C, 8f26:A, 6jjk:A, 6jjk:B, 6jjk:C, 6jjk:D, 6jjk:E, 6jjk:F, 6jjl:A, 6jjl:B, 6jjl:C, 6jjl:D, 6jjl:E, 6jjl:F, 6jjo:A, 6jjo:B, 6jjo:C, 6jjo:D, 6jjo:E, 6jjo:F, 3mh5:A, 3mh5:B, 3mh6:A, 3mh7:A, 3otp:A, 3otp:B, 3otp:C, 3otp:D, 3otp:E, 3otp:F, 3ou0:A
45 3vqg:A 85 66 0.1647 0.1647 0.2121 2.2
46 6lqs:B1 806 40 0.1647 0.0174 0.3500 2.8 7aju:UA, 7d4i:B1, 7d5t:B1, 7d63:B1, 6lqr:B1, 6lqt:B1, 6lqv:B1, 6zqd:UA, 6zqe:UA, 6zqf:UA
47 7ajt:UA 834 40 0.1647 0.0168 0.3500 2.8 7d5s:B1, 6ke6:B1, 6lqp:B1, 6lqq:B1, 6lqu:B1, 6nd4:O, 7suk:LO, 5wlc:LO, 6zqa:UA, 6zqb:UA, 6zqc:UA
48 4c2c:A 433 33 0.1647 0.0323 0.4242 3.0 4c2d:A, 4c2d:B, 4c2d:C, 4c2f:A, 4c2g:A
49 3nol:A 234 26 0.1294 0.0470 0.4231 3.6 3nom:A, 3nom:B
50 2m0u:A 117 44 0.1765 0.1282 0.3409 4.0
51 2ka9:A 189 47 0.1765 0.0794 0.3191 4.1 8cn1:B, 8cn1:A, 8cn1:E, 8cn1:D, 2mho:A, 1rgr:A, 3rl7:A, 3rl7:F, 3rl7:D, 3rl7:C, 3rl7:E, 6spv:A, 6spz:A
52 4asm:B 357 60 0.2353 0.0560 0.3333 5.3
53 7pc3:A 405 48 0.1647 0.0346 0.2917 5.3 2awu:B, 2aww:A, 2awx:B, 8cn3:A, 8cn3:B, 2g2l:A, 2g2l:B, 4g69:A, 2i0l:A, 2i0l:B, 2m3m:A, 4oaj:A, 2oqs:A, 3rl8:B
54 5ez0:D 95 70 0.2353 0.2105 0.2857 6.2 5eyz:A, 5eyz:B, 5eyz:C, 5eyz:D, 5ez0:A, 5ez0:C, 5ez0:B, 3nfk:A, 3nfk:B, 3nfl:A, 3nfl:B, 3nfl:C, 3nfl:D, 7vze:A, 7vze:B, 7vze:C, 7vze:D
55 8u2r:A 664 56 0.1882 0.0241 0.2857 7.5 8sf3:A, 8u2s:A, 8u2s:B, 8u2t:A, 8u2u:A
56 3ppt:A 133 28 0.1647 0.1053 0.5000 8.7 3pp6:A, 3pp6:B, 3pp6:C
57 7po7:H 311 47 0.1765 0.0482 0.3191 8.9 7poe:A, 7poe:B

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218