BioLiP

>protein
VMYYGKGDVFAYRTYLKPLTGVRTIPESPFSGRDHILFGVNVKISVGGTKLLTSFTKGDNSLVVATDSMKNFIQKHLASY
TGTTIEGFLEYVATSFLKKYSHIEKISLIGEEIPFETTFAVKNGNRAASELVFKKSRNEYATAYLNMVRNEDNTLNITEQ
QSGLAGLQLIKVSGNSFVGFIRDEYTTLPEDSNRPLFVYLNIKWKYKNTEDSFGTNPENYVAAEQIRDIATSVFHETETL
SIQHLIYLIGRRILERFPQLQEVYFESQNHTWDKIEGKVYTEPRPPYGFQCFTVTQ

The query sequence (length=296) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1j2g:A	306	303	1.0000	0.9673	0.9769	0.0	5ayj:A, 5ayj:B, 5ayj:C, 5ayj:D, 7cmn:A, 7cmn:B, 7cmq:A, 7cmq:B, 7cuc:A, 7cuc:B, 7cuf:A, 7cuf:B, 7cug:A, 7cug:B, 1j2g:B, 1j2g:C, 1j2g:D, 3wlv:A, 3wlv:B, 3wlv:C, 3wlv:D, 4xfp:A, 4xfp:B, 4xfp:C, 4xfp:D, 5y2p:A, 5y2p:B, 5y52:A, 5y52:B, 5y52:C, 5y52:D, 5yj2:A, 5yj2:B, 5yj2:C, 5yj2:D, 5yja:A, 5yja:B, 5yja:C, 5yja:D, 5z27:A, 5z27:B, 5z2b:A, 5z2b:B
2	4cw0:A	301	271	0.2568	0.2525	0.2804	5.19e-20	7a0l:A, 3bjp:A, 3bk8:A, 3cks:A, 3cku:A, 4cw2:A, 4cw3:A, 4cw6:A, 4d12:A, 4d13:A, 4d17:A, 4d19:A, 3f2m:A, 5frc:A, 4fsk:A, 2fub:A, 2fxl:A, 3gko:A, 6i9x:A, 6i9z:A, 6ia1:A, 6ia3:A, 6ia9:aaa, 6ia9:aba, 2iba:A, 2ic0:A, 2icq:A, 6ic1:A, 3l8w:A, 3l9g:A, 3lbg:A, 3ld4:A, 4n3m:A, 4n9m:A, 4n9s:A, 4n9v:A, 3obp:A, 4op6:A, 4op9:A, 4oqc:A, 7p0c:A, 7p0d:A, 7p0g:A, 3p9f:A, 3p9o:A, 2pes:A, 3pjk:A, 3pk3:A, 3pk4:A, 3pk5:A, 3pk6:A, 3pk8:A, 3pkf:A, 3pkg:A, 3pkh:A, 3pkk:A, 3pkl:A, 3pks:A, 3pkt:A, 3pku:A, 3ple:A, 3plg:A, 3plh:A, 3pli:A, 3plj:A, 3plm:A, 4poe:A, 4pr8:A, 4puv:A, 7puf:A, 7puf:B, 7pwn:A, 7pwn:B, 7q09:A, 7q09:B, 7qar:AAA, 1r4s:A, 1r4u:A, 1r51:A, 6rgm:A, 6rgt:A, 1wrr:A, 1ws2:A, 1ws2:B, 1ws2:C, 1ws2:D, 1ws3:A, 1ws3:B, 1ws3:C, 1ws3:D, 1xt4:A, 1xxj:A, 1xxj:B, 1xxj:C, 1xxj:D, 1xy3:A, 1xy3:B, 1xy3:C, 1xy3:D, 1xy3:E, 1xy3:F, 1xy3:G, 1xy3:H, 2zka:A, 2zkb:A
3	1vay:A	287	229	0.2128	0.2195	0.2751	1.49e-18	1vay:D, 1vay:B, 1vay:C, 1vay:E, 1vay:H, 1vay:F, 1vay:G, 2yzb:A, 2yzb:D, 2yzb:B, 2yzb:C, 2yzb:E, 2yzb:H, 2yzb:F, 2yzb:G, 2yzc:A, 2yzc:D, 2yzc:B, 2yzc:C, 2yzc:E, 2yzc:H, 2yzc:F, 2yzc:G, 2yzd:A, 2yzd:D, 2yzd:B, 2yzd:C, 2yzd:E, 2yzd:H, 2yzd:F, 2yzd:G, 2yze:A, 2yze:D, 2yze:B, 2yze:C, 2yze:E, 2yze:H, 2yze:F, 2yze:G
4	7f2w:A	300	276	0.2297	0.2267	0.2464	2.98e-15	7f2w:B
5	8oh8:BBB	303	230	0.1858	0.1815	0.2391	2.38e-11	8ofk:AAA, 8ofk:BBB, 8ofk:CCC, 8ofk:DDD, 8oh8:AAA, 8oh8:CCC, 8oh8:DDD, 8oih:AAA, 8oih:BBB, 8oih:CCC, 8oih:DDD, 8oiw:AAA, 8oiw:DDD, 8oiw:BBB, 8oiw:CCC
6	8qby:G	666	144	0.1014	0.0450	0.2083	1.0
7	2wyh:A	905	81	0.0709	0.0232	0.2593	1.8	2wyh:B, 2wyi:A, 2wyi:B
8	1d4m:1	284	49	0.0507	0.0528	0.3061	5.2
9	1mqt:A	271	49	0.0574	0.0627	0.3469	8.0
10	4c20:B	605	67	0.0541	0.0264	0.2388	9.7	4c20:A, 4c21:A, 4c21:B, 4c22:A, 4c22:B

[Back]