BioLiP

>protein
VMDVMNRLILAMDLMNRDDALRVTGEVREYIDTVKIGYPLVLSEGMDIIAEFRKRFGCRIIADFKVADIPETNEKICRAT
FKAGADAIIVHGAPGADSVRACLNVAEEMGREVFLLTEMSHPGAEMFIQGAADEIARMGVDLGVKNYVGPSTRPERLSRL
REIIGQDSFLISPGVGAQGGDPGETLRFADAIIVGRSIYLADNPAAAAAGIIESIKDLL

The query sequence (length=219) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1dvj:A	239	218	0.9909	0.9079	0.9954	1.76e-157	1dvj:B, 1dvj:C, 1dvj:D, 2e6y:A, 2e6y:B, 4fx6:M, 4fx6:N, 4fx8:A, 4fx8:B, 4fxr:A, 4fxr:B, 3g1a:A, 3g1a:B, 3g1d:A, 3g1d:B, 3g1f:A, 3g1f:B, 3g1f:C, 3g1f:D, 3g1f:E, 3g1f:F, 3g1f:G, 3g1f:H, 3g1f:I, 3g1f:J, 3g1f:K, 3g1f:L, 3g1f:M, 3g1h:A, 3g1h:B, 3g1h:C, 3g1h:D, 3g1h:E, 3g1h:F, 3g1h:G, 3g1h:H, 3g1h:I, 3g1h:J, 3g1h:K, 3g1h:L, 3g1h:M, 3g1v:A, 3g1v:B, 3g1x:A, 3g1x:B, 3g22:A, 3g22:B, 3g24:A, 3g24:B, 4gc4:A, 4gc4:B, 1kly:A, 1klz:A, 1km0:A, 1km0:B, 1km0:C, 1km0:D, 1km1:A, 1km1:B, 1km2:A, 1km3:A, 1km4:A, 1km5:A, 1km6:A, 4lc6:A, 4lc6:B, 4lc8:A, 4lc8:B, 3lht:A, 3lht:B, 3lhu:A, 3lhu:B, 3lhv:A, 3lhv:B, 3lhv:C, 3lhv:D, 3lhw:A, 3lhw:B, 3lhy:A, 3lhy:B, 3lhz:A, 3lhz:B, 3li0:A, 3li0:B, 3li1:A, 3li1:B, 3lld:A, 3lld:B, 3llf:A, 3llf:B, 1lol:A, 1lol:B, 1loq:A, 1lor:A, 1los:A, 1los:B, 1los:C, 1los:D, 1lp6:A, 1lp6:B, 3ltp:A, 3ltp:B, 3lts:A, 3lts:B, 3lty:A, 3lty:B, 3lv5:A, 3lv5:B, 3lv6:A, 3lv6:B, 4lw7:A, 4lw7:B, 3m1z:A, 3m1z:B, 3nq6:A, 3nq6:B, 3nq7:A, 3nq7:B, 3nqa:A, 3nqa:B, 3nqc:A, 3nqc:B, 3nqd:A, 3nqd:B, 3nqe:A, 3nqe:B, 3nqf:A, 3nqf:B, 3nqg:A, 3nqg:B, 3nqm:A, 3nqm:B, 4nt0:A, 4nt0:B, 4nuw:A, 4nuw:B, 4nx5:A, 4nx5:B, 4o11:A, 4o11:B, 4o8r:A, 4o8r:B, 4o8r:C, 4o8r:D, 4o8r:E, 4o8r:F, 4o8r:G, 4o8r:H, 4o8r:I, 4o8r:J, 4o8r:K, 4o8r:L, 4o8r:M, 3p5y:A, 3p5y:B, 3p5z:A, 3p5z:B, 3p60:A, 3p60:B, 3p61:A, 3p61:B, 3pbu:A, 3pbu:B, 3pbv:A, 3pbv:B, 3pbw:A, 3pbw:B, 3pby:A, 3pby:B, 3pc0:A, 3pc0:B, 3qez:A, 3qez:B, 3qf0:A, 3qf0:B, 3qmr:A, 3qmr:B, 3qms:A, 3qms:B, 3qmt:A, 3qmt:B, 3rlu:A, 3rlu:B, 3rlv:A, 3rlv:B, 3sec:A, 3sgu:A, 3siz:A, 3siz:B, 3sj3:A, 3sj3:B, 3ssj:A, 3sw6:A, 3sy5:A, 3sy5:B, 3thq:A, 3thq:B, 3v1p:A, 3v1p:B, 3w07:A, 3wjw:A, 3wjx:A, 3wjy:A, 3wjz:A, 3wk0:A, 3wk1:A, 3wk2:A, 3wk3:A, 1x1z:A, 1x1z:B, 2zz1:A, 2zz1:B, 2zz2:A, 2zz2:B, 2zz3:A, 2zz3:B, 2zz4:A, 2zz4:B, 2zz5:A, 2zz5:B, 2zz6:A, 2zz6:B, 2zz7:A
2	4luj:A	214	207	0.4703	0.4813	0.4976	9.83e-66	4luj:B
3	4muz:A	212	206	0.3973	0.4104	0.4223	1.94e-49	4muz:B
4	2cze:A	208	210	0.3881	0.4087	0.4048	3.08e-48	2cze:B, 2czf:A, 2czf:B
5	3ve7:A	206	216	0.3242	0.3447	0.3287	2.17e-22	3ve7:B
6	4df1:A	199	207	0.2922	0.3216	0.3092	8.11e-19	4df1:B
7	4dbe:A	213	216	0.3105	0.3192	0.3148	3.97e-16	4dbe:B
8	3ajx:A	207	110	0.1598	0.1691	0.3182	3.96e-12	3ajx:B, 3ajx:C, 3ajx:D
9	1eix:C	232	232	0.2420	0.2284	0.2284	1.87e-11	1eix:A, 1eix:B, 1eix:D, 1jjk:A, 1jjk:B, 1jjk:C, 1jjk:D, 1jjk:E, 1jjk:F, 1jjk:G, 1jjk:H, 1jjk:I, 1jjk:J, 1jjk:K, 1jjk:L, 1jjk:M, 1jjk:N, 1jjk:O, 1jjk:P
10	3uwq:B	224	212	0.2374	0.2321	0.2453	1.21e-10	3uwq:A
11	8cso:C	231	234	0.2329	0.2208	0.2179	1.88e-10	8cso:A, 8cso:B, 8cso:D, 8cso:E, 8cso:F, 8ek7:C, 8ek7:E
12	3jr2:C	214	150	0.1918	0.1963	0.2800	7.02e-09	3jr2:A, 3jr2:B, 3jr2:D
13	1dbt:A	237	228	0.2466	0.2278	0.2368	3.02e-08	1dbt:B, 1dbt:C
14	2ffc:A	318	229	0.2374	0.1635	0.2271	2.63e-06	2guu:A
15	1xbz:B	216	107	0.1324	0.1343	0.2710	1.36e-05	1kv8:A, 1kv8:B, 1kw1:A, 1kw1:B, 1q6l:A, 1q6l:B, 1q6o:A, 1q6o:B, 1q6q:A, 1q6q:B, 1q6r:A, 1q6r:B, 1so3:A, 1so3:B, 1so4:A, 1so4:B, 1so5:A, 1so5:B, 1so6:A, 1so6:B, 1xbv:A, 1xbv:B, 1xbx:A, 1xbx:B, 1xby:A, 1xby:B, 1xbz:A
16	2yyu:B	229	91	0.1370	0.1310	0.3297	4.01e-05	2yyu:A
17	3s9y:A	331	229	0.2146	0.1420	0.2052	1.70e-04	3bar:A, 3bar:B, 3bpw:A, 3bpw:B, 6dsr:A, 6dsr:B, 6dss:A, 6dss:B, 3mwa:A, 3mwa:B, 3n2m:A, 3n2m:B, 3n34:A, 3n34:B, 3n3m:A, 3n3m:B, 2q8z:A, 2q8z:B, 2qaf:A, 2qaf:B, 3s9y:B, 3s9y:C, 3s9y:D, 3vi2:A, 3vi2:B, 2za1:A, 2za1:B, 2za3:A, 2za3:B
18	3qw4:C	447	142	0.1872	0.0917	0.2887	0.006	3qw4:B
19	2v30:A	262	182	0.2329	0.1947	0.2802	0.013	7am9:A, 7asq:A, 3bgg:A, 3bgj:A, 3bgj:B, 3bk0:A, 3bk0:B, 3bvj:A, 3bvj:B, 3dbp:A, 3dbp:B, 3ewu:A, 3ewu:B, 3eww:A, 3eww:B, 3ewx:A, 3ewy:A, 3ewz:A, 3ewz:B, 3ewz:C, 3ewz:D, 3ex1:A, 3ex1:B, 3ex2:A, 3ex2:B, 3ex3:A, 3ex3:B, 3ex4:A, 3ex6:A, 3ex6:B, 3g3d:A, 3g3d:B, 3g3m:A, 4hib:A, 4hib:B, 4hkp:A, 4hkp:B, 3l0k:A, 3l0k:B, 3l0n:A, 3l0n:B, 3mi2:A, 3mi2:B, 3mo7:A, 3mw7:A, 3mw7:B, 7oqf:A, 7oqf:B, 7oqi:A, 7oqi:B, 7oqk:A, 7oqk:B, 7oqm:A, 7oqm:B, 7oqn:A, 7oqn:B, 7otu:A, 7ouz:A, 7ov0:A, 7q1h:A, 2qcd:A, 2qcd:B, 2qcf:A, 2qcg:A, 2qcg:B, 2qch:A, 2qch:B, 2qcl:A, 2qcl:B, 2qcm:A, 2qcn:A, 2qcn:B, 2v30:B, 6yvk:A, 6yvl:A, 6yvm:A, 6yvn:A, 6yvo:A, 6ywt:A, 6ywu:A, 6zwy:A, 6zx0:A, 6zx1:A, 6zx2:A, 6zx3:A
20	3exs:D	218	222	0.2374	0.2385	0.2342	0.019	3exs:A, 3ext:A
21	6rs6:A	221	72	0.0776	0.0769	0.2361	0.19	6rs9:A
22	7nii:C	565	67	0.0731	0.0283	0.2388	0.65	7nii:B, 7nii:G, 7nii:H
23	1cvm:A	353	37	0.0594	0.0368	0.3514	0.70	3amr:A, 3ams:A, 1h6l:A, 1poo:A, 2poo:A, 1qlg:A
24	4mo5:A	345	25	0.0594	0.0377	0.5200	0.79
25	2f6x:A	231	53	0.0731	0.0693	0.3019	0.79	2f6x:B
26	8c0u:A	363	25	0.0594	0.0358	0.5200	0.85	8c0u:B, 8cp9:A, 8cp9:B, 8cpb:A, 8cpb:B, 4mo4:A, 4mo4:B, 4mo4:C, 4mo4:D, 4mo5:B, 4mo5:C, 4mo5:D, 3qbw:A, 3qbw:B, 3qbx:A, 3qbx:B
27	3cg4:A	126	39	0.0639	0.1111	0.3590	1.0
28	3s20:A	344	50	0.0594	0.0378	0.2600	1.6	6b2u:A, 4ku2:B, 4ku3:B, 4ku5:B, 3s20:B, 3s21:A, 3s23:A, 5vxe:A, 5vxg:A, 5vxi:A
29	1g7u:A	284	71	0.1005	0.0775	0.3099	1.9	1g7v:A, 1gg0:A, 1phq:A, 1phw:A, 1pl9:A, 1q3n:A, 1x6u:A
30	4a37:B	376	86	0.1279	0.0745	0.3256	2.2	4a37:A, 4a38:A, 4a38:B, 4a39:A, 4a39:B
31	1yb5:A	324	60	0.0913	0.0617	0.3333	2.7	1yb5:B
32	3und:B	284	27	0.0548	0.0423	0.4444	7.9	3tmq:A, 3tmq:C, 3und:A, 3und:C, 3und:D
33	4tkm:B	241	37	0.0594	0.0539	0.3514	9.4
34	6elq:X	630	28	0.0685	0.0238	0.5357	9.4	6elq:A, 6elq:B

[Back]