BioLiP

>protein
VLSAEEIHLIEASVEQFGAPLLLLDCDVIRQQYRALKNALPNVTLHYALKPLPHPVVVRTLLAEGASFDLATTGEVELVA
SEGVPADLTIHTHPIKRDADIRDALAYGCNVFVVDNLNELEKFKAYRDDVELLVRLSFSKKFGCSPEQALVIIETAKEWN
IRIKGLSFHVGSQTTNPNKYVEAIHTCRHVMEQVVERGLPALSTLDIGGGFPVNYTQQVMPIDQFCAPINEALSLLPETV
HVLAEPGRFICAPAVTSVASVMGQAEREGQIWYYLDDGIYGSFSGLMFDDARYPLTTIKGELIPSVLSGPTCDSVDVIAE
NILLPKLNNGDLVIGRTMGAYTSATATDFNFFKRAQTIALNEF

The query sequence (length=363) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	2plj:A	376	365	1.0000	0.9654	0.9945	0.0	2plj:B, 2plk:A, 2plk:B
2	5gjo:A	385	373	0.3554	0.3351	0.3458	2.66e-69	5gjn:A, 5gjo:B, 5gjp:A
3	2oo0:A	419	346	0.3416	0.2959	0.3584	2.71e-57	5bwa:A, 7odc:A, 2on3:A, 2on3:B, 2oo0:B, 7s3f:A, 7s3f:B, 7s3g:A, 7s3g:B, 7u6p:A, 7u6p:B, 7u6u:A, 7u6u:B, 4zgy:A
4	1f3t:B	381	348	0.3361	0.3202	0.3506	8.89e-57	1f3t:A, 1f3t:C, 1f3t:D, 1njj:A, 1njj:B, 1njj:C, 1njj:D, 1qu4:A, 1qu4:B, 1qu4:C, 1qu4:D, 1szr:C, 1szr:D, 1szr:A, 1szr:B, 2tod:A, 2tod:B, 2tod:C, 2tod:D
5	2nv9:B	372	329	0.2893	0.2823	0.3191	1.31e-47	2nv9:A, 2nv9:C, 2nv9:D, 2nv9:E, 2nv9:F, 2nv9:G, 2nv9:H, 2nva:A, 2nva:B, 2nva:C, 2nva:D, 2nva:E, 2nva:F, 2nva:G, 2nva:H
6	2yxx:A	385	373	0.2424	0.2286	0.2359	2.93e-24
7	1hkv:A	446	394	0.2590	0.2108	0.2386	1.93e-22	1hkv:B
8	7ru7:A	412	366	0.2176	0.1917	0.2158	1.58e-20	2j66:A
9	3c5q:A	394	367	0.2342	0.2157	0.2316	6.49e-18	2qgh:A
10	5x7m:A	443	386	0.2534	0.2077	0.2383	1.70e-17	5x7m:B, 5x7n:A, 5x7n:B
11	4xg1:B	418	388	0.2617	0.2273	0.2448	3.20e-17	4xg1:C, 4xg1:D
12	4xg1:A	393	376	0.2645	0.2443	0.2553	1.23e-16
13	6knh:C	384	354	0.2369	0.2240	0.2429	2.56e-16	6knh:A, 6knh:B, 6kni:A, 6kni:B, 6kni:C, 6knk:A, 6knk:B, 6knk:C
14	1tuf:A	434	382	0.2452	0.2051	0.2330	5.73e-15	1tuf:B, 1twi:A, 1twi:B, 1twi:C, 1twi:D
15	1knw:A	421	385	0.2617	0.2257	0.2468	8.19e-15	1ko0:A
16	7kh2:D	415	377	0.2011	0.1759	0.1936	3.66e-14	7kh2:A, 7kh2:B, 7kh2:C
17	8d4i:A	462	396	0.2534	0.1991	0.2323	8.06e-10	8d2y:A, 8d4i:C, 8d5d:A, 8d5d:B, 8d5r:A, 8d5r:B, 8d88:A, 8d88:B
18	6n2a:A	422	375	0.2314	0.1991	0.2240	1.94e-07	6n2a:B, 6n2f:B, 6n2f:A
19	3nzp:B	591	246	0.1598	0.0981	0.2358	3.52e-06	3nzp:A
20	3n29:A	371	286	0.1736	0.1698	0.2203	0.004	3n29:B
21	6hiv:CR	314	147	0.1047	0.1210	0.2585	0.010	6hiw:CR, 6hiy:CR, 6hiz:CR, 7pub:CR
22	3nzq:A	628	79	0.0606	0.0350	0.2785	0.039	3nzq:B
23	7aat:A	401	159	0.1047	0.0948	0.2390	2.9	7aat:B, 8aat:A, 8aat:B, 9aat:A, 9aat:B, 1aka:A, 1aka:B, 1akb:A, 1akc:A, 1ama:A, 1ivr:A, 1map:A, 1maq:A, 1oxo:A, 1oxo:B, 1oxp:A, 1tar:A, 1tar:B, 1tas:A, 1tas:B, 1tat:A, 1tat:B
24	4etp:A	379	46	0.0386	0.0369	0.3043	4.5	1f9t:A, 1f9u:A, 1f9v:A, 3kar:A
25	2yaj:C	871	61	0.0468	0.0195	0.2787	4.6	2y8n:A, 2yaj:A
26	5fsx:A	233	81	0.0661	0.1030	0.2963	5.0	5fsx:B, 5fsy:A
27	3vyr:B	371	40	0.0413	0.0404	0.3750	7.8	3vys:B, 3vyt:B, 3vyu:B, 2z1d:A, 2z1d:B

[Back]