BioLiP

>protein
VLNPMPACFYTVSRKEATEMLQKNPSLGNMILRPGSDSRNYSITIRQEIDIPRIKHYKVMSVGQNYTIELEKPVTLPNLF
SVIDYFVKETRGNLRPFIA

The query sequence (length=99) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3maz:A	99	99	1.0000	1.0000	1.0000	1.05e-70
2	8t7c:A	1001	85	0.2222	0.0220	0.2588	4.85e-04
3	5xxb:J	166	74	0.2222	0.1325	0.2973	0.010
4	8dgo:B	218	63	0.1717	0.0780	0.2698	0.053	2aoa:A, 2aoa:B, 2aob:A, 2aob:B, 2aob:C, 2aob:D, 1aze:A, 1bm2:A, 1bmb:A, 3c7i:A, 5cdw:B, 5cdw:K, 5cdw:O, 5cdw:Y, 5cdw:d, 5cdw:Z, 5cdw:V, 5cdw:P, 5cdw:L, 5cdw:H, 5cdw:C, 5cdw:E, 5cdw:U, 5cdw:c, 5cdw:A, 5cdw:G, 1cj1:A, 1cj1:B, 1cj1:C, 1cj1:D, 1cj1:E, 1cj1:F, 1cj1:G, 1cj1:H, 1cj1:I, 1cj1:J, 1cj1:K, 1cj1:L, 1fyr:A, 1fyr:B, 1fyr:C, 1fyr:D, 1gbq:A, 2gbq:A, 3gbq:A, 4gbq:A, 2h5k:A, 2huw:A, 2huw:B, 3imd:A, 3imd:B, 3imj:A, 3imj:B, 3in7:A, 3in7:C, 3in8:A, 1io6:A, 1jyq:A, 1jyq:B, 1jyr:A, 3kfj:A, 7mph:A, 7mph:B, 7mph:C, 7mph:D, 7mph:E, 7mph:F, 3mxc:A, 3mxy:A, 3n7y:A, 3n7y:B, 3n7y:C, 3n84:A, 3n84:B, 3n84:C, 3n84:D, 3n84:E, 3n84:F, 3n8m:A, 3ov1:A, 3ove:A, 4p9v:A, 4p9z:A, 1qg1:E, 3s8l:A, 3s8n:A, 3s8o:A, 1tze:E, 2vwf:A, 2w0z:A, 3wa4:A, 6wm1:A, 6wm1:C, 6wo2:A, 6wo2:B, 1x0n:A, 1zfp:E
5	8t2v:B	718	80	0.2222	0.0306	0.2750	0.15	4cak:B, 3fcs:B, 3fcs:D, 3fcu:B, 3fcu:D, 3fcu:F, 4g1e:B, 4g1m:B, 8gcd:B, 8gce:B, 5hdb:B, 5hdb:D, 3ije:B, 7l8p:B, 7l8p:D, 7la4:B, 6mk0:B, 4mmx:B, 4mmy:B, 4mmz:B, 6msl:B, 6msu:B, 6naj:B, 3nid:B, 3nid:D, 3nif:B, 3nif:D, 3nig:B, 3nig:D, 4o02:B, 8t2u:B, 3t3m:B, 3t3m:D, 3t3p:B, 3t3p:D, 7tct:B, 7tct:D, 7td8:B, 7td8:D, 7tho:B, 7tho:D, 7tmz:B, 7tmz:D, 7tpd:B, 7tpd:D, 1tye:B, 1tye:D, 1tye:F, 7u60:B, 7u60:D, 7u9f:B, 7u9f:D, 7u9v:B, 7u9v:D, 7ubr:B, 7ubr:D, 7ucy:B, 7ucy:D, 7udg:B, 7udg:D, 7udh:B, 7udh:D, 7ue0:B, 7ue0:D, 7ufh:B, 7ufh:D, 7uh8:B, 7uh8:D, 7uje:B, 7uje:D, 7ujk:B, 7ujk:D, 7uk9:B, 7uk9:D, 7uko:B, 7uko:D, 7ukp:B, 7ukp:D, 7ukt:B, 7ukt:D, 6v4p:B, 2vc2:B, 2vdk:B, 2vdl:B, 2vdm:B, 2vdn:B, 2vdo:B, 2vdp:B, 2vdq:B, 2vdr:B, 4z7n:B, 4z7n:D, 4z7o:B, 4z7o:D, 4z7q:B, 4z7q:D, 3zdx:B, 3zdx:D, 3zdy:B, 3zdy:D, 3zdz:B, 3zdz:D, 3ze0:B, 3ze0:D, 3ze1:B, 3ze1:D, 3ze2:B, 3ze2:D
6	1u8c:B	599	80	0.2222	0.0367	0.2750	0.17	1jv2:B, 1l5g:B, 1m1x:B
7	6bxj:A	619	35	0.1313	0.0210	0.3714	1.5	3bn3:A, 3bqm:B, 3bqm:C, 3bqn:B, 3bqn:C, 6bxb:A, 6bxb:B, 6bxf:A, 6bxf:B, 6ckb:A, 6ckb:B, 1cqp:A, 1cqp:B, 3e2m:A, 3e2m:B, 3eob:I, 3eob:J, 3f74:C, 3f78:A, 3f78:B, 3f78:C, 3hi6:A, 3hi6:B, 2ica:A, 4ixd:A, 7kc3:C, 7kc5:A, 7kc5:C, 7kc6:C, 7kc6:A, 1lfa:A, 1lfa:B, 3m6f:A, 1mjn:A, 1mq8:B, 1mq8:D, 1mq9:A, 2o7n:A, 1rd4:A, 1rd4:B, 1rd4:C, 1rd4:D, 1t0p:A, 3tcx:B, 3tcx:D, 3tcx:F, 3tcx:H, 3tcx:J, 3tcx:L, 3tcx:N, 3tcx:P, 3tcx:R, 3tcx:T, 3tcx:V, 3tcx:X, 3tcx:Z, 3tcx:b, 1xdd:A, 1xdd:B, 1xdg:A, 1xdg:B, 1xuo:A, 1xuo:B, 1zoo:A, 1zoo:B, 1zop:A, 1zop:B
8	1sbz:D	185	52	0.1313	0.0703	0.2500	2.4	1sbz:A, 1sbz:B, 1sbz:C
9	2h59:A	246	80	0.2121	0.0854	0.2625	3.3	4buz:A, 4bv2:A, 4bv2:B, 3d4b:A, 3d81:A, 2h2d:A, 2h2f:A, 2h2g:A, 2h2h:A, 2h2i:A, 2h4f:A, 2h4h:A, 2h4j:A, 2h59:B, 3jr3:A, 3pdh:A, 1yc5:A
10	7pj3:AAA	273	81	0.2121	0.0769	0.2593	3.3	7pj4:AAA, 7pj5:AAA, 7pj6:AAA, 7pl3:A, 7pod:A
11	6ei1:A	335	37	0.1212	0.0358	0.3243	3.7
12	6sg9:F4	541	40	0.1111	0.0203	0.2750	4.2	6sgb:F4
13	3iar:A	360	25	0.0909	0.0250	0.3600	4.8	2bgn:E, 2bgn:F, 2bgn:G, 2bgn:H, 2e1w:A, 1krm:A, 1ndv:A, 1ndw:A, 1ndy:A, 1ndz:A, 1o5r:A, 1qxl:A, 7rtg:A, 7rtg:B, 1uml:A, 1v79:A, 1v7a:A, 1vfl:A, 1w1i:E, 1w1i:F, 1w1i:G, 1w1i:H, 1wxy:A, 1wxz:A, 2z7g:A
14	3pe7:A	376	23	0.1212	0.0319	0.5217	5.5
15	1bp3:B	197	17	0.0909	0.0457	0.5294	5.8	3d48:R
16	6a9t:A	417	37	0.1313	0.0312	0.3514	9.1	6a9u:A, 6a9v:A

[Back]