BioLiP

>protein
VKYYTLEEIQKHKDSKSTWVILHHKVYDLTKYLEEHPGGEEVLREQAGGDATENFEDVGHSTDARELSKTYIIGELHPDD
RSKIA

The query sequence (length=85) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1aw3:A	94	85	0.9882	0.8936	0.9882	3.41e-58	1axx:A, 2axx:A, 1b5a:A, 1b5b:A, 1bfx:A, 1blv:A, 1do9:A, 1mny:A
2	1hko:A	104	85	0.9176	0.7500	0.9176	3.13e-55	1aqa:A, 1cyo:A, 1ehb:A, 1es1:A, 1f03:A, 1f04:A, 1i5u:A, 1ib7:A, 1j0q:A, 1jex:A, 1lqx:A, 1lr6:A, 1m20:A, 1m2i:A, 1m2m:A, 1m59:A, 1nx7:A, 1sh4:A, 1u9m:A, 1u9m:B, 1u9m:C, 1u9m:D, 1u9m:E, 1u9m:F, 1u9u:A, 3x32:A, 3x33:A, 3x34:A, 3x35:A
3	2i96:A	108	84	0.8941	0.7037	0.9048	4.83e-54	4hin:A, 4hin:B, 4hin:C, 4hin:D, 2m33:A
4	3ozz:B	82	81	0.7529	0.7805	0.7901	6.01e-46
5	2i89:A	90	80	0.6706	0.6333	0.7125	2.49e-40	2i89:B, 2i89:C, 2i89:D, 1icc:A, 1icc:B, 1icc:D, 1lj0:A, 1lj0:B, 1lj0:C, 1lj0:D, 3mus:B
6	1awp:A	86	80	0.5647	0.5581	0.6000	3.77e-34	1awp:B, 1b5m:A, 1eue:A, 1eue:B, 4hil:A, 4hil:B, 1icc:C, 3mus:A
7	3ner:B	91	80	0.5765	0.5385	0.6125	1.83e-33	3ner:A
8	2ibj:A	86	83	0.5765	0.5698	0.5904	3.57e-32
9	4b8n:B	90	74	0.3529	0.3333	0.4054	1.32e-12	4b8n:A, 4b8n:C, 4b8n:D
10	1cxy:A	81	80	0.3294	0.3457	0.3500	1.51e-12
11	8tgb:A	108	76	0.2941	0.2315	0.3289	3.72e-12	8tgb:B
12	3lf5:A	87	72	0.2941	0.2874	0.3472	5.58e-12	3lf5:B
13	1kbi:A	504	51	0.2588	0.0437	0.4314	9.15e-11	1fcb:A, 1fcb:B, 1kbi:B, 1kbj:A, 1kbj:B, 3ks0:A, 3ks0:B, 1lco:A, 1lco:B, 1ldc:A, 1ltd:A, 1ltd:B, 2oz0:A, 2oz0:B, 1qcw:A, 1qcw:B, 1sze:A, 1sze:B, 1szf:A, 1szf:B, 1szg:A, 1szg:B
14	7bwh:A	88	79	0.3176	0.3068	0.3418	1.36e-10
15	1x3x:A	82	66	0.2824	0.2927	0.3636	5.90e-09	1x3x:B
16	1sox:A	463	81	0.3529	0.0648	0.3704	1.42e-07	2a9a:A, 2a9a:B, 2a9b:A, 2a9c:A, 2a9c:B, 2a9d:A, 2a9d:B, 3hbp:A, 3hbq:A, 1sox:B
17	1mj4:A	79	73	0.2941	0.3165	0.3425	1.41e-06
18	1k6m:A	432	48	0.1529	0.0301	0.2708	0.88	1c7z:A, 1c7z:B, 1c80:A, 1c80:B, 1c81:A, 1fbt:A, 1fbt:B, 1k6m:B, 1tip:A, 1tip:B
19	8dyu:A	2562	29	0.1294	0.0043	0.3793	2.4	8dyv:A
20	8fcy:A	2864	29	0.1294	0.0038	0.3793	2.5	8fd6:A, 8fdt:A
21	8pqw:A	2892	29	0.1294	0.0038	0.3793	2.6	8pqy:A, 8pqz:A, 8pqz:J
22	5nug:A	2920	29	0.1294	0.0038	0.3793	2.7	5nug:B
23	7z8g:A	3047	29	0.1294	0.0036	0.3793	2.9	8fdu:A, 7z8l:f
24	8ptk:f	4502	29	0.1294	0.0024	0.3793	3.6	8ptk:e
25	3t58:B	504	32	0.1412	0.0238	0.3750	3.6	4p2l:A, 4p2l:B, 3t58:A, 3t58:C, 3t58:D, 3t59:A, 3t59:B, 3t59:C, 3t59:D
26	7z8f:e	4579	29	0.1294	0.0024	0.3793	3.7	5owo:A, 8pr2:f, 8ptk:m, 8ptk:n, 7z8f:f, 7z8f:m, 7z8f:n, 7z8h:A
27	3ats:A	352	27	0.1294	0.0312	0.4074	5.1	3att:A
28	2axn:A	451	50	0.1529	0.0288	0.2600	6.4	5ajv:B, 5ajw:A, 5ajx:A, 5ajy:A, 5ajz:A, 5ak0:A, 4d4j:A, 4d4k:A, 4d4l:A, 4d4m:A, 2dwo:A, 2dwp:A, 6etj:A, 6hvh:A, 6hvi:A, 6hvj:A, 2i1v:B, 6ibx:A, 6iby:A, 6ibz:A, 6ic0:A, 4ma4:A, 3qpu:A, 3qpv:A, 3qpw:A
29	1kwm:A	402	50	0.2118	0.0448	0.3600	9.8	1kwm:B, 1zli:A

[Back]