BioLiP

>protein
VKVIVTDMDGTFLNDAKTYNQPRFMAQYQELKKRGIKFVVASGNQYYQLISFFPELKDEISFVAENGALVYEHGKQLFHG
ELTRHESRIVIGELLKDKQLNFVACGLQSAYVSENAPEAFVALMAKHYHRLKPVKDYQEIDDVLFKFSLNLPDEQIPLVI
DKLHVALDGIMKPVTSGFGFIDLIIPGLHKANGISRLLKRWDLSPQNVVAIGDSGNDAEMLKMARYSFAMGNAAENIKQI
ARYATDDNNHEGALNVIQAVLDNTYPFN

The query sequence (length=268) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1rlm:A	269	268	1.0000	0.9963	1.0000	0.0	1rlm:B, 1rlm:C, 1rlm:D, 1rlo:A, 1rlo:B, 1rlo:C, 1rlo:D, 1rlt:A, 1rlt:B, 1rlt:C, 1rlt:D
2	3l7y:A	266	260	0.3470	0.3496	0.3577	3.51e-52
3	4dwo:A	268	277	0.2836	0.2836	0.2744	2.51e-18	3niw:A
4	1nrw:A	285	288	0.2500	0.2351	0.2326	5.89e-13
5	4zev:A	290	280	0.2425	0.2241	0.2321	1.74e-11	4qjb:A, 4qjb:B, 4zev:B, 4zew:A, 4zew:B, 4zex:A, 4zex:B
6	3r4c:A	268	263	0.2575	0.2575	0.2624	1.91e-10
7	1rkq:A	271	272	0.2351	0.2325	0.2316	3.46e-10	1rkq:B
8	2b30:A	284	278	0.2687	0.2535	0.2590	4.35e-09	2b30:B, 2b30:C, 2b30:D
9	3pgv:A	259	242	0.2239	0.2317	0.2479	1.03e-08	3pgv:B, 3pgv:C, 3pgv:D
10	3gyg:B	230	108	0.0970	0.1130	0.2407	1.50e-07
11	1nf2:A	267	267	0.2463	0.2472	0.2472	4.89e-07	1nf2:B, 1nf2:C
12	2rar:A	261	74	0.0896	0.0920	0.3243	4.92e-07	2rav:A, 2rb5:A, 2rbk:A, 1ymq:A
13	3gyg:D	250	81	0.0821	0.0880	0.2716	2.02e-06
14	3gyg:A	285	81	0.0821	0.0772	0.2716	2.73e-06	3gyg:C
15	2b1q:A	244	262	0.1978	0.2172	0.2023	3.60e-05	2b1r:A, 2d2v:A, 1s2o:A, 1tj3:A, 1tj4:A, 1tj5:A, 1u2s:A, 1u2t:A
16	1kyt:A	225	71	0.0784	0.0933	0.2958	0.005	1kyt:B, 1l6r:A, 1l6r:B
17	6zhh:A	883	71	0.0933	0.0283	0.3521	0.075	6zhf:A, 6zhg:A, 6zhh:B, 6zhh:C, 6zhh:D, 6zhh:E, 6zhh:F, 6zhh:G, 6zhh:H
18	2fue:A	246	105	0.1119	0.1220	0.2857	0.11	6cfr:A, 6cfs:A, 6cft:A, 6cfu:A, 6cfv:A, 2fuc:A
19	3mmz:D	174	81	0.0784	0.1207	0.2593	0.12	3mmz:A, 3mmz:B, 3mmz:C
20	3m1y:C	208	54	0.0709	0.0913	0.3519	0.31	3m1y:A, 3m1y:B, 3m1y:D
21	4bnd:B	253	242	0.2239	0.2372	0.2479	0.54	4bnd:A
22	8q4s:A	295	41	0.0448	0.0407	0.2927	0.72	7qpl:A
23	7xs6:B	729	48	0.0522	0.0192	0.2917	1.1	8k3v:A, 8k3v:B, 7xs6:A, 7xs7:B, 7xs7:A
24	7dsu:B	420	185	0.1716	0.1095	0.2486	1.3	7dsu:A
25	8k3w:B	694	52	0.0522	0.0202	0.2692	1.4	8k3w:A, 8k3x:A, 8k3x:B
26	8k3p:A	660	52	0.0522	0.0212	0.2692	1.5	8k3p:B, 8k3t:A, 8k3t:B
27	8k3u:A	597	52	0.0522	0.0235	0.2692	2.0	8k3u:B
28	8a1z:A	396	58	0.0672	0.0455	0.3103	2.0	8a21:A, 5is2:A, 5it0:A, 5it4:A, 5jjb:A, 5jlp:A, 5jlr:A, 5jma:A, 3p96:A, 5t41:A
29	4ojz:A	706	141	0.1381	0.0524	0.2624	2.4	4nei:A, 4nei:B, 4ojz:B, 4ok2:A, 4ok2:B, 4ok4:A, 4ok4:B
30	1rhy:B	180	93	0.0896	0.1333	0.2581	2.6
31	4umv:A	605	48	0.0560	0.0248	0.3125	6.8	4umw:A
32	7pcs:B	247	42	0.0485	0.0526	0.3095	7.5	7pcs:D
33	4d9u:A	307	35	0.0485	0.0423	0.3714	8.6	4d9t:A, 4jg6:A, 4jg7:A, 4jg8:A, 4m8t:A, 4mao:A, 5o1s:A
34	3szv:A	364	50	0.0634	0.0467	0.3400	9.2	2y0k:A
35	4gqn:B	205	24	0.0410	0.0537	0.4583	9.3	4e0f:A, 4e0f:B, 4g6i:A, 4g6i:B, 4g6i:C, 4gqn:A, 4gqn:C
36	1wza:A	488	55	0.0746	0.0410	0.3636	9.4

[Back]