Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
VKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHEAGYSEEECKQYKAVVYSNTIQSIIAIIRAMGRLKIDFGDSARADDARQLFVLAMT
AELAGVIKRLWKDSGVQACFNRSREYQLNDSAAYYLNDLDRIAQPNYIPTQQDVLRTRVKTTGIVETHFTFKDLHFKMFD
VGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSDYDLVMNRMHESMKLFDSICNNKWFTDTSIILFLNKKDLFEEKIKKSPLTIC
YPEYAGSNTYEEAAAYIQCQFEDLNKRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVII

The query sequence (length=298) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 1agr:A 350 311 0.9966 0.8486 0.9550 0.0 1agr:D, 1as0:A, 1as2:A, 1as3:A, 1bh2:A, 1cip:A, 6crk:A, 3d7m:A, 3ffa:A, 4g5o:A, 4g5o:C, 4g5o:B, 4g5o:D, 4g5q:A, 4g5q:C, 4g5q:B, 4g5q:D, 4g5r:A, 4g5r:B, 4g5r:C, 4g5r:D, 4g5s:A, 4g5s:C, 4g5s:D, 4g5s:B, 2g83:A, 2g83:B, 1gfi:A, 1gg2:A, 1gia:A, 1gil:A, 1git:A, 1gp2:A, 2gtp:A, 2gtp:B, 8gvx:F, 8gvx:E, 8gvx:G, 8gvx:H, 2ihb:A, 2ik8:A, 2ik8:C, 5kdl:A, 5kdl:B, 5kdo:A, 1kjy:A, 1kjy:C, 6m8h:A, 6mhe:A, 6mhf:A, 4n0d:A, 4n0e:A, 2ode:A, 2ode:C, 2om2:A, 2om2:C, 3onw:A, 3onw:B, 8oy1:A, 4pam:A, 4pao:A, 4paq:A, 3qe0:B, 3qe0:A, 3qe0:C, 3qi2:A, 3qi2:B, 7rky:A, 1svk:A, 1svs:A, 5tdh:A, 5tdh:H, 3umr:A, 3ums:A, 2v4z:A, 7x6i:E, 7x6i:F, 7x6i:G, 7x6i:H, 2xns:A, 2xns:B, 1y3a:A, 1y3a:B, 1y3a:C, 1y3a:D, 2zjy:A, 2zjz:A, 2zjz:B
2 3ffb:A 327 305 0.9362 0.8532 0.9148 0.0 1bof:A, 1gdd:A, 4pan:A
3 3v00:C 353 311 0.7785 0.6572 0.7460 1.15e-177 1fqj:A, 1fqj:D, 1fqk:A, 1fqk:C, 1got:A, 7jsn:E, 7jsn:F, 1tad:A, 1tad:B, 1tad:C, 1tag:A, 1tnd:A, 1tnd:B, 1tnd:C, 3v00:B, 3v00:A
4 3c7k:C 311 311 0.7450 0.7138 0.7138 7.07e-162 3c7k:A
5 1shz:D 327 318 0.7081 0.6453 0.6635 2.17e-155 1shz:A
6 8pjk:A 222 163 0.5168 0.6937 0.9448 2.22e-112 7e2x:A, 7e2z:A
7 8pjk:A 222 29 0.0705 0.0946 0.7241 1.05e-04 7e2x:A, 7e2z:A
8 7rkf:A 350 311 0.5604 0.4771 0.5370 6.05e-108
9 8iys:A 355 300 0.5403 0.4535 0.5367 1.26e-105 3ah8:A, 2bcj:Q, 5do9:A, 5do9:C, 5do9:E, 4ekc:A, 4ekc:C, 4ekd:A, 4gnk:A, 4gnk:C, 8jpb:Q, 8jpc:Q, 8jpe:Q, 4qj3:A, 4qj4:A, 4qj5:A, 2rgn:A, 2rgn:D, 7sq2:A, 8uqn:A, 8uqo:A
10 8fn0:B 212 157 0.4161 0.5849 0.7898 1.62e-85
11 8fn0:B 212 23 0.0705 0.0991 0.9130 1.55e-04
12 1zca:A 318 319 0.4430 0.4151 0.4138 2.26e-83 1zca:B
13 3ab3:A 322 319 0.4295 0.3975 0.4013 2.19e-81 3ab3:C, 3cx6:A, 3cx7:A, 3cx8:A, 1zcb:A
14 8htg:B 334 327 0.4698 0.4192 0.4281 2.74e-80 8htg:A, 8htg:C, 8htg:D
15 6eg8:I 372 328 0.4631 0.3710 0.4207 2.59e-77 6au6:A, 1azs:C, 1azt:A, 1azt:B, 7bph:A, 8buz:B, 8bv5:B, 3c14:C, 3c15:C, 3c16:C, 1cjk:C, 1cjt:C, 1cju:C, 1cjv:C, 1cs4:C, 1cul:C, 7e5e:A, 7e5e:B, 7e5e:C, 7e5e:D, 6eg8:J, 6eg8:K, 6eg8:L, 3g82:C, 8gge:A, 8ggf:A, 2gvd:C, 2gvz:C, 3maa:C, 7pde:B, 7pdf:B, 6r3q:B, 6r4o:B, 6r4p:B, 1tl7:C, 1u0h:C, 8uo3:A
16 4fid:A 318 310 0.3993 0.3742 0.3839 4.18e-72 4fid:B
17 2xtz:A 343 327 0.4228 0.3673 0.3853 6.19e-69
18 2xtz:B 291 275 0.3758 0.3849 0.4073 1.29e-63
19 8uo1:A 334 327 0.4295 0.3832 0.3914 1.30e-61 8gga:A
20 8ggb:A 310 318 0.4228 0.4065 0.3962 1.11e-60 8gg9:A, 8ggc:A
21 2xtz:C 270 275 0.3490 0.3852 0.3782 1.25e-54
22 8uo4:A 292 317 0.3758 0.3836 0.3533 2.32e-45 8uo2:A
23 8xql:A 240 174 0.2718 0.3375 0.4655 4.09e-42
24 8xql:A 240 28 0.0638 0.0792 0.6786 3.01e-04
25 8unx:A 244 178 0.2550 0.3115 0.4270 6.82e-39 7f1o:A, 7f1z:A, 7f23:A, 7f24:A, 5g53:C, 8gfv:A, 8gfw:A, 8gfx:A, 8gfy:A, 8gfz:A, 8gg0:A, 8gg1:A, 8gg2:A, 8gg3:A, 8gg4:A, 8gg5:A, 8gg6:A, 8gg7:A, 8gg8:A, 8gw8:A, 8jr9:A, 8unl:A, 8unm:A, 8unn:A, 8uno:A, 8unp:A, 8unq:A, 8unr:A, 8uns:A, 8unt:A, 8unu:A, 8unv:A, 8unw:A, 8uny:A, 8unz:A, 8uo0:A, 7vui:A, 7vuj:A
26 8unx:A 244 21 0.0638 0.0779 0.9048 1.11e-04 7f1o:A, 7f1z:A, 7f23:A, 7f24:A, 5g53:C, 8gfv:A, 8gfw:A, 8gfx:A, 8gfy:A, 8gfz:A, 8gg0:A, 8gg1:A, 8gg2:A, 8gg3:A, 8gg4:A, 8gg5:A, 8gg6:A, 8gg7:A, 8gg8:A, 8gw8:A, 8jr9:A, 8unl:A, 8unm:A, 8unn:A, 8uno:A, 8unp:A, 8unq:A, 8unr:A, 8uns:A, 8unt:A, 8unu:A, 8unv:A, 8unw:A, 8uny:A, 8unz:A, 8uo0:A, 7vui:A, 7vuj:A
27 3lvq:E 420 91 0.1040 0.0738 0.3407 1.03e-09 2b0o:E, 2b0o:F, 2b0o:G, 2b0o:H, 3lvr:E
28 6bbp:A 520 91 0.1007 0.0577 0.3297 1.91e-08 2a5d:A, 2a5f:A, 2a5g:A, 6bbq:A, 1e0s:A, 1fgy:A, 1fhw:A, 1fhw:B, 1fhx:A, 1fhx:B, 4fme:C, 4fme:F, 2j5x:A, 2j5x:B, 4kax:A, 4kax:B, 3n5c:A, 3n5c:B, 3pcr:B, 2r09:A, 2r09:B, 2r0d:A, 2r0d:B, 3vhx:A, 3vhx:C, 3vhx:E, 3vhx:G, 2w83:A, 2w83:B, 2w83:E, 7xrd:A, 7xrd:B, 7xrd:C, 7xrd:D
29 6a8d:A 181 104 0.1040 0.1713 0.2981 1.64e-07
30 7rll:B 177 89 0.0973 0.1638 0.3258 5.75e-07 7rll:A
31 2k5u:A 181 93 0.0872 0.1436 0.2796 3.04e-06 2ksq:A, 1mr3:F, 4q66:F, 4q66:L, 3tjz:A, 3tjz:D
32 8d4c:C 180 91 0.0906 0.1500 0.2967 3.21e-06 8d4c:H, 8d4c:D, 8d4c:F, 8d4d:C, 8d4d:H, 8d4d:D, 8d4d:F, 8d4e:C, 8d4e:H, 8d4e:Z, 8d4f:C, 8d4f:H, 8d4f:Z, 8d4f:D, 8d4f:F, 8d4f:Q, 8d4g:C, 8d4g:H, 8d4g:Z, 8d4g:D, 8d4g:F, 8d4g:Q, 8d9r:C, 8d9r:H, 8d9r:Z, 8d9r:J, 8d9r:X, 8d9r:3, 8d9r:K, 8d9r:a, 8d9r:4, 8d9r:O, 8d9r:b, 8d9r:5, 8d9r:P, 8d9r:c, 8d9r:6, 8d9r:Q, 8d9r:d, 8d9r:7, 8d9s:C, 8d9s:H, 8d9s:Z, 8d9s:J, 8d9s:X, 8d9s:3, 8d9s:K, 8d9s:a, 8d9s:4, 8d9s:O, 8d9s:b, 8d9s:5, 8d9s:P, 8d9s:c, 8d9s:6, 8d9s:Q, 8d9s:d, 8d9s:7, 8d9t:C, 8d9t:H, 8d9t:J, 8d9t:X, 8d9t:K, 8d9t:Z, 8d9t:O, 8d9t:a, 8d9t:P, 8d9t:b, 8d9t:Q, 8d9t:c, 8d9u:C, 8d9u:H, 8d9u:J, 8d9u:X, 8d9u:K, 8d9u:Z, 8d9u:O, 8d9u:a, 8d9u:P, 8d9u:b, 8d9u:Q, 8d9u:c, 8d9v:C, 8d9v:H, 8d9v:D, 8d9v:F, 8d9w:F, 8d9w:I, 1hur:A, 1hur:B, 7ux3:C, 7ux3:H
33 3lrp:A 181 91 0.0872 0.1436 0.2857 3.63e-06
34 1z6x:A 175 93 0.0973 0.1657 0.3118 1.26e-05 1z6x:B
35 8e0c:A 185 108 0.0906 0.1459 0.2500 2.02e-05 8e0a:B, 8e0b:B, 8e0d:A, 1f6b:A, 1f6b:B, 2fa9:A, 2fa9:B, 2fmx:A, 2fmx:B
36 2h57:B 167 139 0.1242 0.2216 0.2662 4.47e-05 2h57:A, 2h57:C, 6vbv:3
37 5di3:B 204 97 0.0940 0.1373 0.2887 4.70e-05 4m9q:A, 4m9q:B, 4m9q:C
38 6pta:A 165 91 0.0872 0.1576 0.2857 7.14e-05 6pta:B, 6pta:C, 6pta:D, 5uf8:A, 5uf8:B, 5uf8:C
39 5uf8:D 160 91 0.0872 0.1625 0.2857 2.32e-04
40 5de3:A 166 73 0.0705 0.1265 0.2877 2.40e-04 5di3:A
41 2x77:A 181 79 0.0805 0.1326 0.3038 2.84e-04 2x77:B
42 4y0v:A 165 91 0.0906 0.1636 0.2967 2.87e-04 4y0v:B, 4ylg:A, 4ylg:B
43 3doe:A 189 80 0.0805 0.1270 0.3000 2.89e-04 3dof:A, 4gok:B, 4gok:A, 1ksg:A, 1ksh:A, 1ksj:A
44 6zga:C 168 109 0.0973 0.1726 0.2661 4.32e-04 8bsh:B, 4bzi:B, 4bzi:J, 4bzi:K, 6gni:B, 1m2o:B, 1m2o:D, 2qtv:B, 6zga:G
45 8oun:A 181 187 0.1208 0.1989 0.1925 0.002 8oum:A, 8oum:B, 8oum:C, 8oum:D, 8oum:E, 8oun:B
46 3o47:A 289 93 0.0872 0.0900 0.2796 0.003 4c0a:C, 4c0a:D, 4c0a:G, 4c0a:H, 6cm9:C, 6cm9:H, 6cri:C, 6cri:H, 6cri:K, 6cri:U, 6cri:L, 6cri:V, 6d83:C, 6d83:H, 6d84:C, 6d84:H, 6d84:I, 6d84:N, 6dff:C, 6dff:H, 7dn8:D, 7dn8:B, 7dn8:F, 7dn8:H, 7dn9:B, 7dn9:D, 7dn9:F, 7dn9:H, 3dwd:A, 3dwd:B, 4hmy:C, 6ii6:C, 6ii6:D, 1j2j:A, 2j59:A, 2j59:B, 2j59:C, 2j59:D, 2j59:E, 2j59:F, 7mge:E, 1o3y:A, 1o3y:B, 3o47:B, 8p50:B, 7r4h:C, 7r4h:H, 1r8q:A, 1r8q:B, 1r8s:A, 1re0:A, 1rrf:A, 1rrg:A, 1rrg:B, 1s9d:A, 8sdw:A, 1u81:A, 7wqy:A, 7wqy:B
47 4ile:A 176 89 0.0772 0.1307 0.2584 0.003 2al7:A, 2h18:A, 8jc5:A, 8jc5:B, 8jca:A, 1zd9:A
48 2b6h:A 171 91 0.0805 0.1404 0.2637 0.003
49 1upt:G 170 91 0.0805 0.1412 0.2637 0.004 4dcn:A, 4dcn:B, 5ee5:B, 5j5c:A, 1r4a:A, 1r4a:B, 1r4a:C, 1r4a:D, 1upt:A, 1upt:C, 1upt:E
50 3aq4:A 170 91 0.0839 0.1471 0.2747 0.005 3aq4:B
51 8oul:A 185 94 0.0872 0.1405 0.2766 0.012 8ouk:A, 8oul:B, 8oul:C
52 1yzg:A 168 84 0.0738 0.1310 0.2619 0.031
53 4zi2:A 185 73 0.0604 0.0973 0.2466 0.21 3bh6:A, 3bh7:A, 1fzq:A, 4goj:A, 4goj:B, 7ok7:A, 7ok7:B, 7ok7:C, 7ok7:D, 7ok7:E, 7ok7:F, 4zi2:B, 4zi3:A, 4zi3:B
54 4q66:C 134 88 0.0805 0.1791 0.2727 0.51
55 4bas:A 172 35 0.0436 0.0756 0.3714 0.65
56 4v0l:A 168 87 0.0738 0.1310 0.2529 1.5 4v0k:A, 4v0k:B, 4v0l:B, 4v0m:A, 4v0m:C, 4v0m:E, 4v0m:G, 4v0n:A, 4v0n:C, 4v0n:E, 4v0n:G, 4v0o:A, 4v0o:C, 4v0o:E, 4v0o:G
57 3p27:B 444 121 0.1107 0.0743 0.2727 1.6 3p27:A
58 8dr5:A 646 38 0.0503 0.0232 0.3947 2.7 8dqx:A, 8dqz:A, 8dr0:A, 8dr1:A, 8dr3:A, 8dr4:A, 8dr6:A, 8dr7:A, 1sxj:A, 7tfh:A, 7tfi:A, 7tfj:A, 7thj:A, 7thv:A, 7ti8:A, 7tib:A, 7tic:A, 7tid:A, 7tku:A, 7u19:A, 7u1a:A, 7u1p:A
59 7tfk:A 360 38 0.0503 0.0417 0.3947 2.9 7tfl:A
60 6vs4:A 223 81 0.0570 0.0762 0.2099 4.5 6vs4:B
61 7d63:RZ 839 62 0.0604 0.0215 0.2903 7.0 7d4i:RZ, 7d5t:RZ, 7mqj:A
62 6rm8:A 655 74 0.0872 0.0397 0.3514 7.6 6fa5:A, 6faa:A, 6fac:A, 6rm9:A, 6rma:A, 6rmb:A, 6rmc:A, 6rmc:B, 6zm2:A
63 6h57:A 795 62 0.0604 0.0226 0.2903 8.2
64 5ebe:A 418 51 0.0436 0.0311 0.2549 8.4 5ebb:A, 5ebb:B, 5ebb:C, 5ebe:B, 5ebe:C
65 4wnr:A 323 20 0.0336 0.0310 0.5000 9.0
66 7edb:A 350 31 0.0336 0.0286 0.3226 9.1 7edb:B
67 6zqg:JD 829 62 0.0604 0.0217 0.2903 9.6
68 7aju:JD 811 62 0.0604 0.0222 0.2903 9.7 6zqd:JD, 6zqe:JD, 6zqf:JD

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218