Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
VKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHEAGYSEEECKQYKAVVYSNTIQSIIAIIRAMGRLKIDFGDSARADDARQLFVLAGG
FMTAELAGVIKRLWKDSGVQACFNRSREYQLNDSAAYYLNDLDRIAQPNYIPTQQDVLRTRVKTTGIVETHFTFKDLHFK
MFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSDYDLVLAEDEEMNRMHESMKLFDSICNNKWFTDTSIILFLNKKDLFEEK
IKKSPLTICYPEYAGSNTYEEAAAYIQCQFEDLNKRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVII

The query sequence (length=307) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 1agr:A 350 311 0.9967 0.8743 0.9839 0.0 1agr:D, 1as0:A, 1as2:A, 1as3:A, 1bh2:A, 1cip:A, 6crk:A, 3d7m:A, 3ffa:A, 4g5o:A, 4g5o:C, 4g5o:B, 4g5o:D, 4g5q:A, 4g5q:C, 4g5q:B, 4g5q:D, 4g5r:A, 4g5r:B, 4g5r:C, 4g5r:D, 4g5s:A, 4g5s:C, 4g5s:D, 4g5s:B, 2g83:A, 2g83:B, 1gfi:A, 1gg2:A, 1gia:A, 1gil:A, 1git:A, 1gp2:A, 2gtp:A, 2gtp:B, 8gvx:F, 8gvx:E, 8gvx:G, 8gvx:H, 2ihb:A, 2ik8:A, 2ik8:C, 5kdl:A, 5kdl:B, 5kdo:A, 1kjy:A, 1kjy:C, 6m8h:A, 6mhe:A, 6mhf:A, 4n0d:A, 4n0e:A, 2ode:A, 2ode:C, 2om2:A, 2om2:C, 3onw:A, 3onw:B, 8oy1:A, 4pam:A, 4pao:A, 4paq:A, 3qe0:B, 3qe0:A, 3qe0:C, 3qi2:A, 3qi2:B, 7rky:A, 1svk:A, 1svs:A, 5tdh:A, 5tdh:H, 3umr:A, 3ums:A, 2v4z:A, 7x6i:E, 7x6i:F, 7x6i:G, 7x6i:H, 2xns:A, 2xns:B, 1y3a:A, 1y3a:B, 1y3a:C, 1y3a:D, 2zjy:A, 2zjz:A, 2zjz:B
2 3ffb:A 327 311 0.9186 0.8624 0.9068 0.0 1bof:A, 1gdd:A, 4pan:A
3 3v00:C 353 311 0.7785 0.6771 0.7685 0.0 1fqj:A, 1fqj:D, 1fqk:A, 1fqk:C, 1got:A, 7jsn:E, 7jsn:F, 1tad:A, 1tad:B, 1tad:C, 1tag:A, 1tnd:A, 1tnd:B, 1tnd:C, 3v00:B, 3v00:A
4 3c7k:C 311 311 0.7362 0.7267 0.7267 4.57e-166 3c7k:A
5 1shz:D 327 320 0.7068 0.6636 0.6781 4.20e-159 1shz:A
6 8pjk:A 222 165 0.5212 0.7207 0.9697 3.22e-119 7e2x:A, 7e2z:A
7 8pjk:A 222 29 0.0684 0.0946 0.7241 1.16e-04 7e2x:A, 7e2z:A
8 7rkf:A 350 311 0.5472 0.4800 0.5402 4.52e-111
9 8iys:A 355 300 0.5277 0.4563 0.5400 1.03e-108 3ah8:A, 2bcj:Q, 5do9:A, 5do9:C, 5do9:E, 4ekc:A, 4ekc:C, 4ekd:A, 4gnk:A, 4gnk:C, 8jpb:Q, 8jpc:Q, 8jpe:Q, 4qj3:A, 4qj4:A, 4qj5:A, 2rgn:A, 2rgn:D, 7sq2:A, 8uqn:A, 8uqo:A
10 1zca:A 318 318 0.4397 0.4245 0.4245 5.44e-87 1zca:B
11 3ab3:A 322 321 0.4365 0.4161 0.4174 4.91e-85 3ab3:C, 3cx6:A, 3cx7:A, 3cx8:A, 1zcb:A
12 8htg:B 334 327 0.4658 0.4281 0.4373 5.43e-85 8htg:A, 8htg:C, 8htg:D
13 8fn0:B 212 163 0.4039 0.5849 0.7607 2.01e-84
14 8fn0:B 212 23 0.0684 0.0991 0.9130 1.54e-04
15 6eg8:I 372 328 0.4560 0.3763 0.4268 4.52e-81 6au6:A, 1azs:C, 1azt:A, 1azt:B, 7bph:A, 8buz:B, 8bv5:B, 3c14:C, 3c15:C, 3c16:C, 1cjk:C, 1cjt:C, 1cju:C, 1cjv:C, 1cs4:C, 1cul:C, 7e5e:A, 7e5e:B, 7e5e:C, 7e5e:D, 6eg8:J, 6eg8:K, 6eg8:L, 3g82:C, 8gge:A, 8ggf:A, 2gvd:C, 2gvz:C, 3maa:C, 7pde:B, 7pdf:B, 6r3q:B, 6r4o:B, 6r4p:B, 1tl7:C, 1u0h:C, 8uo3:A
16 2xtz:A 343 327 0.4267 0.3819 0.4006 1.60e-73
17 4fid:A 318 313 0.3909 0.3774 0.3834 5.91e-70 4fid:B
18 2xtz:B 291 278 0.3779 0.3986 0.4173 1.33e-67
19 8uo1:A 334 322 0.4235 0.3892 0.4037 1.80e-66 8gga:A
20 8ggb:A 310 321 0.4169 0.4129 0.3988 3.37e-64 8gg9:A, 8ggc:A
21 2xtz:C 270 278 0.3518 0.4000 0.3885 2.14e-58
22 8uo4:A 292 320 0.3713 0.3904 0.3563 6.81e-49 8uo2:A
23 8unx:A 244 178 0.2573 0.3238 0.4438 7.59e-43 7f1o:A, 7f1z:A, 7f23:A, 7f24:A, 5g53:C, 8gfv:A, 8gfw:A, 8gfx:A, 8gfy:A, 8gfz:A, 8gg0:A, 8gg1:A, 8gg2:A, 8gg3:A, 8gg4:A, 8gg5:A, 8gg6:A, 8gg7:A, 8gg8:A, 8gw8:A, 8jr9:A, 8unl:A, 8unm:A, 8unn:A, 8uno:A, 8unp:A, 8unq:A, 8unr:A, 8uns:A, 8unt:A, 8unu:A, 8unv:A, 8unw:A, 8uny:A, 8unz:A, 8uo0:A, 7vui:A, 7vuj:A
24 8unx:A 244 21 0.0619 0.0779 0.9048 1.28e-04 7f1o:A, 7f1z:A, 7f23:A, 7f24:A, 5g53:C, 8gfv:A, 8gfw:A, 8gfx:A, 8gfy:A, 8gfz:A, 8gg0:A, 8gg1:A, 8gg2:A, 8gg3:A, 8gg4:A, 8gg5:A, 8gg6:A, 8gg7:A, 8gg8:A, 8gw8:A, 8jr9:A, 8unl:A, 8unm:A, 8unn:A, 8uno:A, 8unp:A, 8unq:A, 8unr:A, 8uns:A, 8unt:A, 8unu:A, 8unv:A, 8unw:A, 8uny:A, 8unz:A, 8uo0:A, 7vui:A, 7vuj:A
25 8xql:A 240 180 0.2638 0.3375 0.4500 4.70e-41
26 8xql:A 240 28 0.0619 0.0792 0.6786 3.50e-04
27 3lvq:E 420 97 0.1010 0.0738 0.3196 5.35e-09 2b0o:E, 2b0o:F, 2b0o:G, 2b0o:H, 3lvr:E
28 6bbp:A 520 97 0.0977 0.0577 0.3093 9.01e-08 2a5d:A, 2a5f:A, 2a5g:A, 6bbq:A, 1e0s:A, 1fgy:A, 1fhw:A, 1fhw:B, 1fhx:A, 1fhx:B, 4fme:C, 4fme:F, 2j5x:A, 2j5x:B, 4kax:A, 4kax:B, 3n5c:A, 3n5c:B, 3pcr:B, 2r09:A, 2r09:B, 2r0d:A, 2r0d:B, 3vhx:A, 3vhx:C, 3vhx:E, 3vhx:G, 2w83:A, 2w83:B, 2w83:E, 7xrd:A, 7xrd:B, 7xrd:C, 7xrd:D
29 8d4c:C 180 97 0.0977 0.1667 0.3093 2.45e-07 8d4c:H, 8d4c:D, 8d4c:F, 8d4d:C, 8d4d:H, 8d4d:D, 8d4d:F, 8d4e:C, 8d4e:H, 8d4e:Z, 8d4f:C, 8d4f:H, 8d4f:Z, 8d4f:D, 8d4f:F, 8d4f:Q, 8d4g:C, 8d4g:H, 8d4g:Z, 8d4g:D, 8d4g:F, 8d4g:Q, 8d9r:C, 8d9r:H, 8d9r:Z, 8d9r:J, 8d9r:X, 8d9r:3, 8d9r:K, 8d9r:a, 8d9r:4, 8d9r:O, 8d9r:b, 8d9r:5, 8d9r:P, 8d9r:c, 8d9r:6, 8d9r:Q, 8d9r:d, 8d9r:7, 8d9s:C, 8d9s:H, 8d9s:Z, 8d9s:J, 8d9s:X, 8d9s:3, 8d9s:K, 8d9s:a, 8d9s:4, 8d9s:O, 8d9s:b, 8d9s:5, 8d9s:P, 8d9s:c, 8d9s:6, 8d9s:Q, 8d9s:d, 8d9s:7, 8d9t:C, 8d9t:H, 8d9t:J, 8d9t:X, 8d9t:K, 8d9t:Z, 8d9t:O, 8d9t:a, 8d9t:P, 8d9t:b, 8d9t:Q, 8d9t:c, 8d9u:C, 8d9u:H, 8d9u:J, 8d9u:X, 8d9u:K, 8d9u:Z, 8d9u:O, 8d9u:a, 8d9u:P, 8d9u:b, 8d9u:Q, 8d9u:c, 8d9v:C, 8d9v:H, 8d9v:D, 8d9v:F, 8d9w:F, 8d9w:I, 1hur:A, 1hur:B, 7ux3:C, 7ux3:H
30 3lrp:A 181 97 0.0977 0.1657 0.3093 3.46e-07
31 6a8d:A 181 110 0.1010 0.1713 0.2818 1.13e-06
32 2k5u:A 181 99 0.0977 0.1657 0.3030 3.12e-06 2ksq:A, 1mr3:F, 4q66:F, 4q66:L, 3tjz:A, 3tjz:D
33 7rll:B 177 95 0.0945 0.1638 0.3053 3.43e-06 7rll:A
34 1z6x:A 175 97 0.0912 0.1600 0.2887 5.42e-06 1z6x:B
35 2h57:B 167 145 0.1205 0.2216 0.2552 1.50e-05 2h57:A, 2h57:C, 6vbv:3
36 8e0c:A 185 114 0.0879 0.1459 0.2368 8.56e-05 8e0a:B, 8e0b:B, 8e0d:A, 1f6b:A, 1f6b:B, 2fa9:A, 2fa9:B, 2fmx:A, 2fmx:B
37 1upt:G 170 97 0.0879 0.1588 0.2784 1.28e-04 4dcn:A, 4dcn:B, 5ee5:B, 5j5c:A, 1r4a:A, 1r4a:B, 1r4a:C, 1r4a:D, 1upt:A, 1upt:C, 1upt:E
38 1yzg:A 168 84 0.0814 0.1488 0.2976 1.61e-04
39 3aq4:A 170 97 0.0879 0.1588 0.2784 1.70e-04 3aq4:B
40 3o47:A 289 97 0.0912 0.0969 0.2887 2.25e-04 4c0a:C, 4c0a:D, 4c0a:G, 4c0a:H, 6cm9:C, 6cm9:H, 6cri:C, 6cri:H, 6cri:K, 6cri:U, 6cri:L, 6cri:V, 6d83:C, 6d83:H, 6d84:C, 6d84:H, 6d84:I, 6d84:N, 6dff:C, 6dff:H, 7dn8:D, 7dn8:B, 7dn8:F, 7dn8:H, 7dn9:B, 7dn9:D, 7dn9:F, 7dn9:H, 3dwd:A, 3dwd:B, 4hmy:C, 6ii6:C, 6ii6:D, 1j2j:A, 2j59:A, 2j59:B, 2j59:C, 2j59:D, 2j59:E, 2j59:F, 7mge:E, 1o3y:A, 1o3y:B, 3o47:B, 8p50:B, 7r4h:C, 7r4h:H, 1r8q:A, 1r8q:B, 1r8s:A, 1re0:A, 1rrf:A, 1rrg:A, 1rrg:B, 1s9d:A, 8sdw:A, 1u81:A, 7wqy:A, 7wqy:B
41 5uf8:D 160 97 0.0879 0.1688 0.2784 2.95e-04
42 5di3:B 204 103 0.0912 0.1373 0.2718 3.09e-04 4m9q:A, 4m9q:B, 4m9q:C
43 6pta:A 165 97 0.0847 0.1576 0.2680 4.98e-04 6pta:B, 6pta:C, 6pta:D, 5uf8:A, 5uf8:B, 5uf8:C
44 4y0v:A 165 97 0.0879 0.1636 0.2784 6.18e-04 4y0v:B, 4ylg:A, 4ylg:B
45 2b6h:A 171 97 0.0814 0.1462 0.2577 0.001
46 4ile:A 176 95 0.0749 0.1307 0.2421 0.001 2al7:A, 2h18:A, 8jc5:A, 8jc5:B, 8jca:A, 1zd9:A
47 5de3:A 166 79 0.0684 0.1265 0.2658 0.002 5di3:A
48 3doe:A 189 86 0.0782 0.1270 0.2791 0.002 3dof:A, 4gok:B, 4gok:A, 1ksg:A, 1ksh:A, 1ksj:A
49 6zga:C 168 115 0.0945 0.1726 0.2522 0.003 8bsh:B, 4bzi:B, 4bzi:J, 4bzi:K, 6gni:B, 1m2o:B, 1m2o:D, 2qtv:B, 6zga:G
50 2x77:A 181 85 0.0717 0.1215 0.2588 0.006 2x77:B
51 8oun:A 181 193 0.1173 0.1989 0.1865 0.012 8oum:A, 8oum:B, 8oum:C, 8oum:D, 8oum:E, 8oun:B
52 8oul:A 185 99 0.0912 0.1514 0.2828 0.034 8ouk:A, 8oul:B, 8oul:C
53 4v0l:A 168 95 0.0814 0.1488 0.2632 0.079 4v0k:A, 4v0k:B, 4v0l:B, 4v0m:A, 4v0m:C, 4v0m:E, 4v0m:G, 4v0n:A, 4v0n:C, 4v0n:E, 4v0n:G, 4v0o:A, 4v0o:C, 4v0o:E, 4v0o:G
54 6mao:A 137 56 0.0586 0.1314 0.3214 0.29
55 4bas:A 172 55 0.0554 0.0988 0.3091 0.29
56 4q66:C 134 69 0.0619 0.1418 0.2754 0.41
57 3p27:B 444 195 0.1564 0.1081 0.2462 0.56 3p27:A
58 1moz:A 178 88 0.0749 0.1292 0.2614 0.87 8ezj:C, 8ezj:D, 1moz:B
59 8e0a:A 168 97 0.0684 0.1250 0.2165 0.93 8e0b:A
60 5z3g:X 202 39 0.0358 0.0545 0.2821 1.2
61 4zi2:A 185 79 0.0586 0.0973 0.2278 1.3 3bh6:A, 3bh7:A, 1fzq:A, 4goj:A, 4goj:B, 7ok7:A, 7ok7:B, 7ok7:C, 7ok7:D, 7ok7:E, 7ok7:F, 4zi2:B, 4zi3:A, 4zi3:B
62 8e0h:A 179 106 0.0717 0.1229 0.2075 2.5 8dzm:A, 8dzm:B, 8dzn:A, 8dzn:B, 8dzo:A, 8dzo:B, 8dzt:A, 8dzt:B, 8e0h:B, 2gao:A, 2gao:B
63 8dr5:A 646 38 0.0489 0.0232 0.3947 2.7 8dqx:A, 8dqz:A, 8dr0:A, 8dr1:A, 8dr3:A, 8dr4:A, 8dr6:A, 8dr7:A, 1sxj:A, 7tfh:A, 7tfi:A, 7tfj:A, 7thj:A, 7thv:A, 7ti8:A, 7tib:A, 7tic:A, 7tid:A, 7tku:A, 7u19:A, 7u1a:A, 7u1p:A
64 7tfk:A 360 38 0.0489 0.0417 0.3947 2.9 7tfl:A
65 4xmp:G 337 115 0.0814 0.0742 0.2174 3.0
66 6pwu:A 615 129 0.0847 0.0423 0.2016 8.0 6j5e:I, 6ulc:C, 6ulc:A, 3vtp:C, 5yb2:E, 5yb2:F, 5yb2:D, 5yb2:A, 5yb2:B, 5yb2:C, 5yb2:M, 5yb3:E, 5yb3:F, 5yb3:D, 5yc0:A, 5yc0:D, 5yc0:E, 5z0w:E, 5zcx:A, 5zpw:A, 5zpw:E, 5zpw:C
67 6rm8:A 655 74 0.0847 0.0397 0.3514 9.2 6fa5:A, 6faa:A, 6fac:A, 6rm9:A, 6rma:A, 6rmb:A, 6rmc:A, 6rmc:B, 6zm2:A
68 5kdv:A 891 27 0.0423 0.0146 0.4815 9.5 7jtv:B, 7jtv:A, 5kdw:A, 5kdw:B, 5kdx:A, 5kdx:B
69 4wnr:A 323 20 0.0326 0.0310 0.5000 9.8

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218