BioLiP

>protein
VKKQRPVNLDLQTIRFPITAIASILHRVSGVITFVAVGILLWLLGTSLSSPEGFEQASAIMGSFFVKFIMWGILTALAYH
VVVGIRHMMMDFGYLEETFEAGKRSAKISFVITVVLSLLAGVLVW

The query sequence (length=125) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	2acz:C	129	125	1.0000	0.9690	1.0000	4.01e-87	7jz2:C, 7jz2:G, 7jz2:K, 1nek:C, 1nen:C, 2wdq:C, 2wdq:G, 2wdq:K, 2wdr:C, 2wdr:G, 2wdr:K, 2wdv:C, 2wdv:G, 2wdv:K, 2wp9:C, 2wp9:G, 2wp9:K, 2ws3:C, 2ws3:G, 2ws3:K, 2wu2:C, 2wu2:G, 2wu2:K, 2wu5:C, 2wu5:G, 2wu5:K, 6wu6:C, 6wu6:G, 6wu6:K
2	3sfe:C	139	96	0.2240	0.2014	0.2917	2.00e-04	3abv:C, 3ae1:C, 3ae2:C, 3ae3:C, 3ae4:C, 3ae5:C, 3ae6:C, 3ae7:C, 3ae8:C, 3ae9:C, 3aea:C, 3aeb:C, 3aec:C, 3aed:C, 3aee:C, 3aef:C, 3aeg:C, 8gs8:C, 3sfd:C, 4ytp:C, 4yxd:C, 1zoy:C, 1zp0:C
3	2wqy:C	140	101	0.2240	0.2000	0.2772	0.003	2fbw:C, 2fbw:P, 2h88:C, 2h88:P, 2h89:C, 6myo:C, 6myp:C, 6myq:C, 6myr:C, 6mys:C, 6myt:C, 6myu:C, 2wqy:P, 1yq3:C, 1yq4:C
4	6lum:G	123	71	0.1520	0.1545	0.2676	0.17	6lum:C, 6lum:M
5	3e3b:X	334	35	0.1040	0.0389	0.3714	1.1	7a1b:A, 7a1z:A, 7a22:A, 7a2h:A, 7at9:A, 7atv:A, 6hmb:A, 6hmc:A, 6hmd:A, 6hmq:A, 6l20:A, 6l20:D, 6l20:G, 6l20:J, 5m4u:A, 5m56:A, 5m56:B, 3ofm:A, 5ooi:A, 5ooi:B, 8q77:A, 8q9s:A, 8qbu:A, 8qcd:A, 8qcg:A, 8qcg:B, 8qf1:A, 8qf1:B, 6qy8:A, 6qy8:B, 6qy8:C, 6qy8:D, 6qy9:A, 6te2:A, 6tew:A, 6tgu:A, 7xyh:A, 7xyh:B, 5y9m:X, 5y9m:A, 5yf9:X, 5yf9:B, 5ywm:X
6	6yzh:A	344	35	0.0960	0.0349	0.3429	3.0	6a1c:A, 7a49:A, 7a49:B, 7a4b:A, 7a4b:B, 7a4c:A, 7a4c:B, 7a4q:A, 8ae7:A, 8aec:A, 8aek:A, 8aem:A, 3amy:A, 3at3:A, 3at4:A, 7at5:A, 7at5:B, 3axw:A, 7ay9:A, 7ay9:B, 7aya:A, 7aya:B, 5b0x:A, 7b8h:A, 7b8i:A, 7b8i:B, 8bgc:A, 8bgc:B, 3bqc:A, 7bu4:A, 3c13:A, 8c5q:A, 8c5q:B, 8c6l:A, 8c6m:A, 8c6n:A, 5clp:A, 5clp:B, 5cqu:A, 5cqw:A, 5cqw:B, 5cs6:A, 5csh:A, 5csh:B, 5csp:A, 5csv:A, 5ct0:A, 5ct0:B, 5ctp:A, 5ctp:B, 5cu0:A, 5cu0:B, 5cu2:A, 5cu2:B, 5cu3:A, 5cu3:B, 5cu4:A, 5cu6:A, 5cvf:A, 5cvh:A, 5cvh:B, 5cx9:A, 5cx9:B, 6ehk:A, 6ehu:A, 6ehu:B, 6eii:A, 6eii:B, 9epv:A, 9epv:B, 9epw:B, 9epx:A, 9epx:B, 9epy:A, 9epy:B, 9epz:A, 9epz:B, 9eq0:A, 9eq0:B, 9eq1:A, 9eq1:B, 9ezg:A, 9ezg:B, 4fbx:A, 6fvf:A, 6fvg:A, 9fyf:B, 9fyf:A, 6gih:A, 6gmd:A, 6gmd:B, 4grb:A, 4gub:A, 3h30:A, 3h30:B, 5h8b:A, 5h8b:B, 5h8e:A, 5h8e:B, 5h8g:A, 6hbn:A, 6hbn:B, 6hme:A, 6hme:B, 6hnw:A, 6hny:A, 6hop:A, 6hoq:A, 6hor:A, 6hot:A, 6hou:A, 4ib5:A, 4ib5:B, 4ib5:C, 3juh:A, 3juh:B, 1jwh:A, 6jwa:A, 5ku8:A, 5ku8:B, 4kwp:A, 5kwh:A, 5kwh:B, 6l1z:A, 7l1x:A, 6l21:A, 6l22:A, 6l23:A, 6l24:A, 5m44:A, 5m4c:A, 5m4f:A, 5m4i:A, 3mb6:A, 3mb7:A, 5mmf:A, 5mmr:A, 5mmr:B, 5mo5:A, 5mo6:A, 5mo7:A, 5mo8:A, 5mo8:B, 5mod:A, 5moe:A, 5moe:B, 5moh:A, 5mot:A, 5mow:A, 5mp8:A, 5mp8:B, 5mpj:A, 5n1v:A, 5n1v:B, 5n9k:A, 5n9l:A, 5n9n:A, 3nga:A, 3nga:B, 4nh1:A, 4nh1:B, 5nqc:A, 3nsz:A, 5omy:A, 5oni:A, 5oni:B, 5oqu:B, 5oqu:A, 5orh:A, 5orh:B, 5orj:B, 5orj:A, 5ork:B, 5ork:A, 5os7:B, 5os7:A, 5os8:A, 5osl:A, 5osp:A, 5osr:A, 5osu:A, 5osz:A, 5ot5:A, 5ot5:B, 5ot6:A, 5otd:B, 5otd:A, 5oth:A, 5oth:B, 5oti:A, 5otl:A, 5otl:B, 5oto:B, 5oto:A, 5otp:A, 5otq:A, 5otr:A, 5ots:A, 5oty:A, 5otz:A, 5oue:A, 5oue:B, 5oul:A, 5oum:A, 5ouu:A, 5ouu:B, 3owj:A, 3owk:A, 3owl:A, 5owh:A, 5owl:A, 5owl:B, 5oyf:A, 8p05:A, 8p05:B, 8p06:A, 8p06:B, 8p07:A, 8p07:B, 3pe1:A, 3pe2:A, 1pjk:A, 2pvr:A, 8pvo:A, 8pvo:B, 8pvp:A, 8pvp:B, 6q38:A, 6q4q:A, 6q4q:B, 3q9w:A, 3q9x:A, 3q9x:B, 3q9y:A, 3q9z:A, 3q9z:B, 7qgb:A, 7qgc:A, 7qgd:A, 7qge:A, 7qux:A, 8qwy:A, 8qwy:B, 8qwz:A, 8qwz:B, 6qy7:A, 6qy7:B, 3r0t:A, 6rb1:A, 6rcb:A, 6rcm:A, 6rfe:A, 6rff:A, 4rll:A, 3rps:A, 6spw:A, 6spx:A, 5t1h:A, 5t1h:B, 6tei:A, 6tei:B, 6tll:A, 6tlo:A, 6tlp:A, 6tlr:A, 6tls:A, 6tlu:AAA, 6tlv:A, 6tlw:A, 3u4u:A, 3u87:A, 3u87:B, 3u9c:A, 3u9c:B, 4ub7:A, 4uba:A, 4uba:B, 3w8l:A, 3w8l:B, 3war:A, 3wik:A, 3wil:A, 3wow:A, 7x4h:A, 6ypg:A, 6yph:A, 6yph:B, 6ypj:A, 6ypk:A, 6ypn:B, 6yul:AAA, 6yul:GGG, 6yum:AAA, 6yum:GGG, 6z19:B, 7z39:A, 6z83:AAA, 6z83:BBB, 6z84:AAA, 6z84:BBB, 2zjw:A, 7zwe:A, 7zwg:A, 7zy0:A, 7zy2:A, 7zy5:A, 7zy5:B, 7zy8:B, 7zyd:A, 7zyk:A, 7zyo:A, 7zyr:A
7	4obv:C	471	26	0.0960	0.0255	0.4615	3.0	4obu:E, 4obu:A, 4obu:U, 4obu:G, 4obu:H, 4obu:F, 4obu:B, 4obu:C, 4obv:D, 4obv:B, 4obv:A
8	2ks9:A	363	83	0.1760	0.0606	0.2651	5.2	2ksa:A, 2ksb:A, 7p00:R, 7p02:R, 7rmg:R, 7rmh:R, 7rmi:R, 8u26:R
9	3cjp:A	262	54	0.1200	0.0573	0.2778	7.5	3cjp:B

[Back]