Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
VKKLINSQISLLIGKGLHEFDSLRDPEVNDFRTKMRQFCEEAAAHRQQLGWVEWLQYSFPLQLEPRALLVNVKFEGSEES
FTFQVSTKDMPLALMACALRKKATVFRQQPEEYALQVNGRHEYLYGNYPLCHFQYICSCLHSGLTPHLTMVHSSSILAMR
DEQSNLWSLEQPFSIELIEGRKVNMKLVVQAGLFHGNEMLCKTVSSSEVNVCSEPVWKQRLEFDISVCDLPRMARLCFAL
YAVVDCPIAWANLMLFDYKDQLKTGERCLYMWPSVLLNPAGTVRGNPNTESAAALVIYLPEVAPVYFPALEKILELGEQL
QLREILEYEHEKDLVWKMRHEVQEHFPEALARLLLVTKWNKHEDVAQMLYLLCSWPELPVLSALELLDFSFPDCYVGSFA
IKSLRKLTDDELFQYLLQLVQVLKYESYLDCELTKFLLGRALANRKIGHFLFWHLRSEMHVPSVALRFGLIMEAYCRGST
HHMKVLMKQGEALSKLKALNDFVKVSSQKTTKPQTKEMMHMCMRQETYMEALSHLQSPLDPSTLLEEVCVEQCTFMDSKM
KPLWIMYSSEEAGSAGNVGIIFKNGDDLRQDMLTLQMIQLMDVLWKQEGLDLRMTPYGCLPTGDRTGLIEVVLHSDTIAN
IQLNKSNMAATAAFNKDALLNWLKSKNPGEALDRAIEEFTLSCAGYCVATYVLGIGDRHSDNIMIRESGQLFHIDFGHFL
GNRVPFILTYDFVHVIQQGKTNNSEKFERFRGYCERAYTILRRHGLLFLHLFALMRAAGLPELSCSKDIQYLKDSLALGK
TEEEALKHFRVKFNEA

The query sequence (length=816) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 2wxl:A 823 822 0.9951 0.9866 0.9878 0.0 6gy0:A, 5i4u:A, 5i6u:A, 6mul:A, 6mul:B, 6mum:B, 5ngb:A, 7r26:A, 5t27:A, 5t28:A, 5t2b:A, 5t2d:A, 5t2g:A, 5t2i:A, 5t2m:A, 5t7f:A, 5t7f:B, 5t8i:A, 2wxf:A, 2wxh:A, 2wxi:A, 2wxj:A, 2wxm:A, 2wxn:A, 2wxo:A, 2wxp:A, 2wxq:A, 2x38:A, 4xe0:A
2 5o83:A 794 819 0.9620 0.9887 0.9585 0.0 4ajw:B, 6dgt:A, 5is5:A, 7r2b:A, 4v0i:B
3 4ajw:A 765 817 0.9289 0.9908 0.9278 0.0 4v0i:A
4 7lq1:A 950 854 0.9412 0.8084 0.8993 0.0 5ae8:A, 5ae9:A, 6eyz:A, 6ez6:A, 6g6w:A, 6hi1:A, 6hi2:A, 6hi9:A, 5l72:A, 7lm2:A, 6oco:A, 7pop:A, 7por:A, 7pos:A, 7pot:A, 6pyr:A, 6q6y:A, 6q73:A, 6q74:A, 6tnr:A, 6tns:A, 5vlr:A, 6zaa:A, 6zac:A, 6zad:A
5 6pyu:A 930 843 0.9301 0.8161 0.9004 0.0 8bcy:A, 5dxu:A, 6ftn:A, 7jis:A, 5m6u:A, 6mum:A, 5ncy:A, 5ncz:A, 6ocu:A, 7oi4:AAA, 7oij:AAA, 7oil:AAA, 7ois:AAA, 8s3r:A, 5t2l:A, 5t8f:A, 5ubt:A, 2wxg:A, 2wxk:A
6 2y3a:A 976 866 0.6054 0.5061 0.5704 0.0
7 4bfr:A 855 852 0.6017 0.5743 0.5763 0.0 4bfr:B
8 4ykn:A 1205 899 0.4424 0.2996 0.4016 0.0 4a55:A, 8am0:A, 8exl:A, 8exo:A, 8exu:A, 8exv:A, 5fi4:A, 8gub:A, 6gvf:A, 6gvg:A, 6gvi:A, 3hhm:A, 7jiu:A, 4jps:A, 4l23:A, 4l2y:A, 7mlk:A, 7myo:A, 4ovv:A, 8ow2:A, 7pg6:A, 6pys:A, 5sx9:A, 5sxj:A, 8tdu:A, 8tdu:C, 8tgd:A, 8tgd:C, 8ts9:A, 8tsa:A, 8tsb:A, 8tsc:A, 8tsd:A, 4tv3:A, 5uk8:A, 5ukj:A, 5ul1:A, 8v8h:A, 8v8h:C, 8v8i:A, 8v8i:C, 8v8j:A, 8v8j:C, 8v8v:A, 8v8v:C, 8w9a:A, 8w9b:A, 4waf:A, 5xgh:A, 5xgi:A, 3zim:A, 4zop:A
9 5ubr:A 887 895 0.4387 0.4036 0.4000 0.0 5dxt:A, 7k6n:A
10 5itd:A 995 891 0.4363 0.3578 0.3996 0.0 5dxh:A, 8ilr:A, 8ils:A, 8ilv:A, 7k6m:A, 7k6o:A, 7r9v:A, 7r9y:A, 8sbc:A, 8sbj:A, 8twy:A, 7tz7:A, 5xgj:A
11 5dxh:D 981 882 0.4387 0.3649 0.4059 0.0 8gua:A, 6oac:A
12 5swp:A 1060 923 0.4412 0.3396 0.3900 0.0 6gvh:A, 5swt:A, 8v8u:A, 8v8u:C
13 7k71:A 843 870 0.4338 0.4199 0.4069 0.0 8gud:A
14 1e7u:A 872 852 0.3701 0.3463 0.3545 2.04e-154 4anv:A, 3ibe:A
15 3zw3:A 831 752 0.3505 0.3442 0.3803 7.78e-153 2a4z:A, 4fhj:A, 4fhk:A, 6fh5:A, 6gq7:A, 4hvb:A, 5jha:A, 5jhb:A, 7jwe:A, 4kzc:A, 3lj3:A, 3mjw:A, 3nzu:A, 3p2b:A, 3qk0:A, 3sd5:A, 5t23:A, 6t3b:A, 6t3c:A, 4wwo:A, 4wwp:A, 6xrm:A, 6xrn:A, 3zvv:A
16 1e8w:A 851 841 0.3627 0.3478 0.3520 6.22e-149 2a5u:A, 4anu:A, 4anw:A, 4anx:A, 4aof:A, 3apc:A, 3apd:A, 3apf:A, 6aud:A, 6c1s:A, 2chw:A, 2chx:A, 2chz:A, 3csf:A, 3cst:A, 3dbs:A, 4dk5:A, 3dpd:A, 1e7v:A, 1e8x:A, 1e8z:A, 1e90:A, 5eds:A, 3ene:A, 4ezj:A, 4ezk:A, 4ezl:A, 4f1s:A, 4fa6:A, 4fad:A, 4fjy:A, 4fjz:A, 4flh:A, 4ful:A, 4g11:A, 5g2n:A, 5g55:A, 4gb9:A, 4hle:A, 4j6i:A, 7jwz:A, 5kae:A, 7kke:A, 4kz0:A, 3l08:A, 3l13:A, 3l16:A, 3l17:A, 3l54:A, 3ml8:A, 3ml9:A, 3nzs:A, 3oaw:A, 5oq4:A, 3pre:A, 3prz:A, 3ps6:A, 4ps3:A, 4ps7:A, 4ps8:A, 3qaq:A, 3qar:A, 3r7q:A, 3r7r:A, 3s2a:A, 8sc8:A, 3t8m:A, 3tjp:A, 3tl5:A, 4urk:A, 2v4l:A, 4wwn:A, 6xrl:A, 4xx5:A, 4xz4:A, 7z61:A
17 8sob:A 1005 885 0.3750 0.3045 0.3458 3.97e-148 8soa:A, 8soc:A
18 7jx0:A 801 761 0.3480 0.3546 0.3732 8.21e-141 3qjz:A
19 8sod:A 941 877 0.3615 0.3135 0.3364 6.96e-127 8soe:A
20 7bi6:A 829 740 0.3027 0.2979 0.3338 1.73e-103 8a9i:A, 7bi9:A, 7z74:A, 7z75:A
21 7bi2:A 1021 642 0.2782 0.2223 0.3536 3.13e-99
22 6ykg:AAA 559 529 0.1887 0.2755 0.2911 8.30e-68 5anl:A, 5enn:A, 5enn:B, 6i3u:A, 3ls8:A, 3ls8:B, 4oys:A, 4ph4:B, 7rsj:A, 7rsp:A, 7rsp:B, 7rsv:A, 7rsv:B, 8rxr:A, 8rxr:B, 4uwf:A, 4uwg:A, 4uwh:A, 4uwk:A, 4uwl:A
23 2x6k:A 550 520 0.1985 0.2945 0.3115 1.49e-61 2x6f:A, 2x6f:B, 2x6i:A, 2x6i:B, 2x6j:A, 2x6j:B, 2x6k:B
24 6bq1:E 1510 467 0.1397 0.0755 0.2441 1.04e-26 6bq1:A
25 4d0l:E 479 236 0.0821 0.1399 0.2839 3.38e-22 5c4g:E, 4d0l:A, 4d0l:C, 4d0m:A, 4d0m:C, 4d0m:G, 4d0m:I, 4d0m:M, 4d0m:O, 4d0m:Q, 4d0m:S, 4d0m:W, 4d0m:Y, 4d0m:c, 4d0m:g, 5euq:E, 5fbl:A, 5fbq:A, 5fbr:A, 5fbv:A, 5fbw:A, 6gl3:A, 8q6f:A, 8q6g:A, 8q6h:A, 8vof:A, 4wae:A, 4wag:A
26 7nfc:A 3562 244 0.0797 0.0182 0.2664 7.58e-14 8bh3:S, 8bh3:A, 8bhv:A, 8bhv:F, 8bhy:A, 8bhy:S, 8bot:F, 8bot:S, 7nfc:F
27 7nfe:A 3585 242 0.0784 0.0179 0.2645 2.25e-13
28 7su3:A 3802 251 0.0797 0.0171 0.2590 4.45e-13
29 7sud:A 3740 251 0.0797 0.0174 0.2590 4.60e-13
30 6zhe:A 3768 251 0.0797 0.0173 0.2590 4.68e-13
31 7k1k:A 3604 251 0.0797 0.0180 0.2590 4.86e-13 7k1b:A
32 7k1n:A 3634 251 0.0797 0.0179 0.2590 5.12e-13 7z88:A
33 8eza:L 3720 251 0.0797 0.0175 0.2590 5.13e-13 8eza:C, 7lt3:C, 7lt3:L
34 7z87:A 3689 251 0.0797 0.0176 0.2590 5.21e-13
35 7k17:B 3645 251 0.0797 0.0178 0.2590 5.25e-13 7k17:A
36 8ez9:L 3662 251 0.0797 0.0177 0.2590 5.30e-13 8ez9:C
37 7k1j:A 3584 251 0.0797 0.0181 0.2590 5.33e-13 7k19:A
38 7k0y:A 3669 251 0.0797 0.0177 0.2590 5.35e-13
39 6zhe:F 3731 251 0.0797 0.0174 0.2590 5.35e-13
40 6s8f:F 2571 221 0.0772 0.0245 0.2851 5.37e-13 7mq8:NR, 7mq9:NR, 7mqa:NR, 6s8f:H
41 8ezb:C 3724 251 0.0797 0.0175 0.2590 5.73e-13 8ezb:L
42 7otm:A 3656 251 0.0797 0.0178 0.2590 5.87e-13 7otp:A, 7otv:A, 7otw:A, 7oty:A
43 7sgl:A 3852 251 0.0797 0.0169 0.2590 6.04e-13
44 5y3r:C 3636 251 0.0797 0.0179 0.2590 6.07e-13
45 6zha:A 3707 251 0.0797 0.0175 0.2590 6.18e-13 6zh8:A
46 6zwm:B 2185 241 0.0809 0.0302 0.2739 2.56e-11 6zwm:A
47 8rch:A 2036 241 0.0809 0.0324 0.2739 2.78e-11 8rch:B, 8rck:B, 8rcn:B
48 3jbz:A 960 241 0.0809 0.0688 0.2739 2.84e-11
49 8bot:A 3528 242 0.0772 0.0179 0.2603 2.88e-11
50 6bcu:A 2204 241 0.0809 0.0299 0.2739 3.19e-11 6bcu:B, 6bcx:A, 6bcx:B, 4drh:B, 4drh:E, 4dri:B, 4drj:B, 8er6:B, 8er6:D, 8er6:F, 8er7:B, 8er7:D, 8er7:F, 8era:A, 9f44:A, 9f44:B, 9f45:A, 9f45:B, 1fap:B, 2fap:B, 3fap:B, 4fap:B, 5flc:B, 5flc:F, 5gpg:B, 4jsp:B, 4jsp:A, 4jsv:B, 4jsv:A, 4jsx:B, 4jsx:A, 4jt5:B, 4jt5:A, 4jt6:B, 4jt6:A, 6m4u:B, 6m4u:F, 6m4w:G, 6m4w:H, 6m4w:I, 1nsg:B, 7pe7:B, 7pe7:A, 7pe8:A, 7pe9:A, 7pea:B, 7pea:A, 7peb:A, 7pec:A, 8ppz:B, 7uxc:A, 7uxh:A, 7uxh:C, 5wbh:C, 5wbh:D, 5wbu:B, 5wbu:A, 6zwo:B
51 7sic:A 2773 230 0.0748 0.0220 0.2652 7.57e-08 8oxo:A, 8oxo:B, 8oxp:A, 8oxp:B, 7sic:B, 7sid:A, 7sid:C
52 7ni5:A 2791 230 0.0748 0.0219 0.2652 7.64e-08 7ni4:A, 7ni4:B, 7ni5:B, 7ni6:A, 7ni6:B, 8oxq:A, 8oxq:B
53 8oxm:A 2748 230 0.0748 0.0222 0.2652 8.45e-08 8oxm:B
54 6sl1:A 2652 349 0.1066 0.0328 0.2493 6.87e-07 6sky:A, 6sky:B
55 6skz:A 2638 349 0.1066 0.0330 0.2493 7.29e-07 6sl0:A, 6sl0:B
56 7pw9:A 1952 111 0.0392 0.0164 0.2883 1.16e-04 7pw4:A, 7pw5:A, 7pw6:A, 7pw7:A, 7pw8:A, 6z3r:A
57 6z2w:E 2325 187 0.0539 0.0189 0.2353 0.001 6z2w:F, 6z2x:E, 6z2x:F, 6z3a:F, 6z3a:E
58 6syt:A 1896 111 0.0380 0.0164 0.2793 0.001
59 7r5y:E 414 241 0.0662 0.1304 0.2241 1.5 7r5y:A, 7r5y:B, 7r5y:C, 7r5y:D, 7r5y:F
60 8ogi:B 465 66 0.0233 0.0409 0.2879 6.5
61 3tbo:A 54 19 0.0110 0.1667 0.4737 7.8

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218