BioLiP

>protein
VKIVTVKTQAYQDQKPGTSGLRKRVKVFQSSANYAENFIQSIISTVEPAQRQEATLVVGGDGRFYMKEAIQLIARIAAAN
GIGRLVIGQNGILSTPAVSCIIRKIKAIGGIILTASHNPGGPNGDFGIKFNISNGGPAPEAITDKIFQISKTIEEYAVCP
DLKVDLGVLGKQQFDLENKFKPFTVEIVDSVEAYATMLRSIFDFSALKELLSGPNRLKIRIDAMHGVVGPYVKKILCEEL
GAPANSAVNCVPLEDFGGHHPYPNLTYAADLVETMKSGEHDFGAAFDGDGDRNMILGKHGFFVNPSDSVAVIAANIFSIP
YFQQTGVRGFARSMPTSGALDRVASATKIALYETPTGWKFFGNLMDASKLSLCGEESFGTGSDHIREKDGLWAVLAWLSI
LATRKQSVEDILKDHWQKYGRNFFTRYDYEEVEAEGANKMMKDLEALMFDRSFVGKQFSANDKVYTVEKADNFEYSDPVD
GSISRNQGLRLIFTDGSRIVFRLSGATIRLYIDSYEKDVAKINQDPQVMLAPLISIALKVSQLQERTGRTAPTVIT

The query sequence (length=556) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6sno:A	573	561	0.9245	0.8970	0.9162	0.0	1c47:A, 1c4g:A, 5epc:A, 5epc:B, 5f9c:A, 5jn5:A, 5jn5:B, 3pmg:A, 3pmg:B, 7s0w:A, 6snp:A, 6snq:A, 5tr2:A, 5tr2:B, 6uiq:B, 6uiq:A, 6uo6:A, 6uo6:B, 5vbi:A, 5vbi:B, 5vec:A, 5vec:B, 5vg7:A, 5vg7:B, 5vin:A, 5vin:B
2	7s0w:B	499	536	0.8903	0.9920	0.9235	0.0
3	6y8y:A	572	562	0.6763	0.6573	0.6690	0.0	6y8x:AA, 6y8z:A
4	7p5o:B	558	570	0.5324	0.5305	0.5193	0.0	7p5o:A
5	7pjc:B	553	566	0.5252	0.5280	0.5159	0.0	7pjc:A
6	1kfq:A	571	580	0.5180	0.5044	0.4966	0.0	1kfi:A, 1kfi:B, 1kfq:B
7	4qg5:A	565	575	0.4946	0.4867	0.4783	2.18e-175	4qg5:B, 4qg5:C, 4qg5:D
8	1wqa:A	455	480	0.2158	0.2637	0.2500	1.08e-17	1wqa:B, 1wqa:C, 1wqa:D
9	2fuv:A	545	403	0.1942	0.1982	0.2680	8.80e-15	2fuv:B, 3na5:A, 3na5:B, 3olp:A, 3olp:B
10	4il8:A	459	278	0.1331	0.1612	0.2662	1.78e-10	3bkq:X, 3c04:A, 2fkf:A, 2fkm:X, 2h4l:X, 2h5a:X, 1k2y:X, 1k35:A, 4mrq:A, 1p5d:X, 1p5g:X, 1pcj:X, 1pcm:X, 3rsm:A
11	3uw2:A	458	315	0.1439	0.1747	0.2540	4.97e-07
12	7ojr:A	445	386	0.1493	0.1865	0.2150	7.77e-06	7oml:A
13	3i3w:A	441	405	0.1673	0.2109	0.2296	6.08e-05	3i3w:B
14	5bmp:A	449	383	0.1673	0.2071	0.2428	4.12e-04	5bmn:A, 5kl0:A, 6mlf:A, 6mlh:A, 6mlw:A, 6mnv:A, 6n1e:A, 6nn1:A, 6nn2:A, 6nnn:A, 6nno:A, 6nnp:A, 6nns:A, 6nnt:A, 6nnu:A, 6nol:A, 6noq:A, 6np8:A, 6npx:A, 6nqe:A, 6nqf:A, 6nqg:A, 6nqh:A
15	4hjh:A	467	253	0.1079	0.1285	0.2372	0.003	4hjh:B
16	6bcu:A	2204	220	0.0935	0.0236	0.2364	0.54	6bcu:B, 6bcx:A, 6bcx:B, 4drh:B, 4drh:E, 4dri:B, 4drj:B, 8er6:B, 8er6:D, 8er6:F, 8er7:B, 8er7:D, 8er7:F, 8era:A, 9f44:A, 9f44:B, 9f45:A, 9f45:B, 1fap:B, 2fap:B, 3fap:B, 4fap:B, 5flc:B, 5flc:F, 5gpg:B, 4jsp:B, 4jsp:A, 4jsv:B, 4jsv:A, 4jsx:B, 4jsx:A, 4jt5:B, 4jt5:A, 4jt6:B, 4jt6:A, 6m4u:B, 6m4u:F, 6m4w:G, 6m4w:H, 6m4w:I, 1nsg:B, 7pe7:B, 7pe7:A, 7pe8:A, 7pe9:A, 7pea:B, 7pea:A, 7peb:A, 7pec:A, 8ppz:B, 7uxc:A, 7uxh:A, 7uxh:C, 5wbh:C, 5wbh:D, 5wbu:B, 5wbu:A, 6zwo:B
17	8rch:A	2036	126	0.0576	0.0157	0.2540	0.63	8rch:B, 8rck:B, 8rcn:B
18	7sqc:1C	1700	56	0.0360	0.0118	0.3571	0.85	7sqc:1D
19	2dkc:A	536	109	0.0540	0.0560	0.2752	1.1	2dkc:B, 2dkd:A, 2dkd:B
20	7kmq:B	754	80	0.0360	0.0265	0.2500	1.5	7kmq:A
21	2fsn:B	311	195	0.0935	0.1672	0.2667	3.9	2fsn:A
22	7sqc:1B	1660	56	0.0360	0.0120	0.3571	4.3
23	1clv:A	471	86	0.0378	0.0446	0.2442	5.7	1jae:A, 1tmq:A, 1viw:A
24	6nax:A	259	93	0.0378	0.0811	0.2258	9.6	6nax:B

[Back]