BioLiP

>protein
VIYLHKGPRINGLRRDPESYLRNPSGVLFTEVNAKECQDKVRSILQLPKYGINLSNELILQCLTHKSFAHGSKPYNEKLN
LLGAQFLKLQTCIHSLKNLQFSNLGTKFAKELTSKNTACTFVKLHNLDPFIFWKMRDPIKDGHINGETTIFASVLNAFIG
AILSTNGSEKAAKFIQGSLLDKEDLHSLVNIANENVASAKAK

The query sequence (length=202) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5mrc:9	202	202	1.0000	1.0000	1.0000	3.14e-150	3j6b:9, 5mre:9, 5mrf:9
2	6ywe:9	206	156	0.2079	0.2039	0.2692	6.53e-06	6yws:9, 6ywv:9, 6ywx:9, 6ywy:9
3	2a11:A	154	145	0.2030	0.2662	0.2828	7.26e-05
4	8d33:A	974	55	0.0941	0.0195	0.3455	0.055	8d37:A, 8d3r:A, 8d42:A, 8udl:A, 8v54:A
5	8udk:A	1012	52	0.0891	0.0178	0.3462	0.58	5c51:A, 5c52:A, 5c53:A, 4ztu:A, 4ztz:A
6	2ffl:A	732	106	0.1337	0.0369	0.2547	1.0	2ffl:B, 2ffl:C, 2ffl:D, 2qvw:A, 2qvw:B, 2qvw:C, 2qvw:D
7	5aj4:Bh	289	129	0.1634	0.1142	0.2558	1.3	4ce4:h, 6gaw:Bh, 6gb2:Bh, 7nqh:Bh, 7nql:Bh, 7nsh:Bh, 7nsi:Bh, 7nsj:Bh, 8oin:Bt, 8oiq:Bt, 7qh7:c, 6ydp:Bh, 6ydw:Bh
8	6y9t:A	536	95	0.1287	0.0485	0.2737	1.7	6y9t:B
9	4g68:A	392	42	0.0693	0.0357	0.3333	1.9	4g68:B
10	8a0c:A	1116	54	0.0891	0.0161	0.3333	3.2	8a0c:B, 8a0m:A, 8a0m:C
11	8a0m:D	975	54	0.0891	0.0185	0.3333	3.6
12	8a0m:B	964	54	0.0891	0.0187	0.3333	3.7
13	7ezi:A	323	61	0.0891	0.0557	0.2951	4.0	7ezl:A
14	4ttq:A	201	25	0.0743	0.0746	0.6000	5.0	4ttr:A
15	2hk6:A	309	127	0.1436	0.0939	0.2283	5.5	1c1h:A, 1c9e:A, 1ld3:A, 3m4z:A, 2q2n:A, 2q2o:A, 2q3j:A
16	7l08:c	289	129	0.1535	0.1073	0.2403	6.5	7a5f:c3, 7a5g:c3, 7a5h:c, 7a5i:c3, 7a5j:c, 7a5k:c3, 8any:c, 6i9r:c, 3j7y:c, 3j9m:c, 8k2a:Lr, 8k2b:Lr, 7l20:c, 6nu2:c, 6nu3:c, 7o9k:c, 7o9m:c, 7odr:c, 7ods:c, 7odt:c, 7of0:c, 7of2:c, 7of3:c, 7of4:c, 7of5:c, 7of6:c, 7of7:c, 7og4:c, 7oi6:c, 7oi7:c, 7oi8:c, 7oi9:c, 7oia:c, 7oib:c, 7oic:c, 7oid:c, 7oie:c, 8oir:Bt, 8oit:Bt, 5ool:c, 5oom:c, 7pd3:c, 8pk0:c, 7po4:c, 7qh6:c, 7qi4:c, 7qi5:c, 7qi6:c, 8qsj:c, 8qu5:c, 6vlz:c, 6vmi:c, 8xt0:Lr, 8xt1:Lr, 8xt2:Lr, 8xt3:Lr, 6zm5:c, 6zm6:c, 6zs9:c, 6zsa:c, 6zsb:c, 6zsc:c, 6zsd:c, 6zse:c, 6zsg:c
17	5uqe:D	507	39	0.0594	0.0237	0.3077	7.4	8bsk:A, 8bsl:A, 8bsl:B, 8bsl:C, 8bsl:D, 8bsm:A, 8bsn:A, 3czd:A, 8ec6:A, 8ec6:B, 8ec6:C, 8ec6:D, 8ec6:E, 8ec6:F, 8ec6:G, 8ec6:H, 5fi2:A, 5fi2:D, 5fi6:A, 5fi6:B, 5fi6:C, 5fi6:D, 5fi7:A, 5fi7:C, 8gwr:B, 5hl1:A, 5hl1:D, 5hl1:B, 5hl1:C, 5i94:A, 5i94:D, 5i94:B, 5i94:C, 4jkt:B, 4jkt:C, 4jkt:A, 4jkt:D, 8jub:A, 8jub:B, 8jub:C, 8jub:D, 8jue:A, 8jue:B, 8jue:C, 8jue:D, 5jyo:D, 5jyo:E, 5jyo:B, 5jyo:C, 5jyo:F, 5jyp:A, 6lox:A, 6lox:D, 6lox:B, 6lox:C, 4o7d:A, 7ren:A, 7ren:B, 7ren:C, 7ren:D, 7rgg:A, 7rgg:B, 7rgg:C, 7rgg:D, 7sbm:A, 7sbm:B, 7sbm:C, 7sbm:D, 7sbn:A, 7sbn:B, 7sbn:C, 7sbn:D, 3ss4:A, 3ss4:B, 3ss4:C, 3ss4:D, 3ss5:A, 3ss5:B, 3ss5:C, 3ss5:D, 8szj:A, 8szj:B, 8szj:C, 8szj:D, 8szj:E, 8szj:G, 8szj:I, 8szj:K, 8szj:F, 8szj:H, 8szj:J, 8szj:L, 6ujg:C, 6ujg:H, 6ujg:D, 6ujg:G, 6ujg:B, 6ujg:E, 6ujg:A, 6ujg:F, 6ujm:A, 6ujm:B, 6ujm:C, 6ujm:D, 6uk6:A, 6uk6:B, 6uk6:C, 6uk6:D, 6ukb:A, 6ukb:B, 6ul9:B, 6ul9:D, 6ula:A, 6ula:B, 6ula:C, 6ula:D, 6ula:F, 6ula:H, 6ula:E, 6ula:G, 6ulj:A, 6ulj:B, 6ulj:C, 6ulj:D, 6umc:C, 6umc:B, 6umd:B, 6umd:D, 6ume:A, 6ume:D, 6umf:A, 6umf:B, 6umf:C, 6umf:D, 3unw:A, 3unw:B, 3unw:C, 3unw:D, 3uo9:A, 3uo9:B, 3uo9:C, 3uo9:D, 5uqe:A, 5uqe:B, 5uqe:C, 5uqe:F, 3voz:A, 3vp0:A, 3vp1:A, 3vp2:A, 3vp3:A, 3vp4:A, 5w2j:B, 5wj6:A, 5wj6:C
18	5f9h:G	653	78	0.1089	0.0337	0.2821	9.0	5e3h:A, 5f98:A, 5f98:C, 5f98:E, 5f98:G, 5f98:I, 5f98:K, 5f9h:A, 5f9h:C, 5f9h:E, 5f9h:I, 5f9h:K, 6gpg:A, 7jl3:A, 7jl3:C, 7jl3:E
19	8hku:L15P	94	33	0.0446	0.0957	0.2727	9.4	8hkv:L15P, 8hky:L15P, 8hkz:L15P, 8hl1:L15P, 8hl2:L15P, 8hl3:L15P, 8hl4:L15P, 8hl5:L15P
20	6ktv:A	431	34	0.0495	0.0232	0.2941	10.0	6h98:A, 6h99:A, 6h9a:A, 6ktw:A, 6ktx:A, 6ktz:A, 6ku1:A, 6ku1:B, 6ku2:A, 6ku2:E, 6kvw:A, 6kvw:B, 6kvy:A, 6kvz:A, 6kw0:A, 6kw0:B

[Back]