BioLiP

>protein
VIRGPAGNNDCRIYVGNLPPDIRTKDIEDVFSKYGAIRDIDLKNRRGGPPFAFVEFEDPRDAEDAVSGRDGYDYDGYRLR
VEFP

The query sequence (length=84) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6hpj:B	84	84	1.0000	1.0000	1.0000	1.08e-55
2	2n7c:A	89	73	0.4643	0.4382	0.5342	7.09e-24
3	2i2y:A	150	75	0.4286	0.2400	0.4800	1.70e-15	9asq:H, 5bmg:A, 5bmg:B, 5bmg:H, 5bmg:D, 5bmg:E, 5bmg:F, 5bmg:G, 5bmh:A, 3v3x:C, 3v3x:D
4	4a8x:A	88	73	0.2976	0.2841	0.3425	3.77e-10
5	2mb0:B	95	74	0.3452	0.3053	0.3919	5.52e-10
6	2rra:A	99	89	0.3810	0.3232	0.3596	2.40e-09	2kxn:B
7	8xxm:3G	84	78	0.3333	0.3333	0.3590	3.15e-09	5k0y:O, 8pj1:o, 8pj2:o, 8pj3:o, 8pj4:o, 8pj5:o, 8pj6:o
8	2mxy:A	105	76	0.2976	0.2381	0.3289	2.84e-08	2mz1:A
9	2l41:A	77	72	0.2738	0.2987	0.3194	5.31e-08	2xnr:A
10	2n82:B	104	71	0.2857	0.2308	0.3380	8.99e-08	2err:A, 7vrl:B
11	2fy1:A	108	73	0.2738	0.2130	0.3151	1.07e-07
12	5ith:A	80	79	0.2976	0.3125	0.3165	1.21e-07	5o3j:A
13	2mgz:A	94	73	0.2857	0.2553	0.3288	1.41e-07
14	2leb:A	101	77	0.3690	0.3069	0.4026	2.07e-07	2lec:A
15	3lqv:B	115	82	0.3452	0.2522	0.3537	2.67e-07	2f9j:B, 3lqv:A, 7q4o:F, 8qo9:B6, 8qxd:B6, 8qzs:B6, 8r08:B6, 8r09:B6, 8r0a:B6, 8r0b:B6, 8rm5:B6
16	5kw6:A	201	76	0.2976	0.1244	0.3289	2.79e-07	5kvy:A, 5kvy:B, 5kw1:A, 5kw1:B, 5kw6:B, 7q8a:B, 7q8a:A, 2qfj:A, 2qfj:B, 7z3x:A, 7z3x:B
17	5kw6:A	201	80	0.2738	0.1144	0.2875	3.75e-04	5kvy:A, 5kvy:B, 5kw1:A, 5kw1:B, 5kw6:B, 7q8a:B, 7q8a:A, 2qfj:A, 2qfj:B, 7z3x:A, 7z3x:B
18	5ifm:C	256	72	0.3095	0.1016	0.3611	3.97e-07	5ifm:A
19	7uj1:B	270	73	0.3095	0.0963	0.3562	6.60e-07	7pu5:B, 7pu5:D, 7pu5:H, 7pu5:J, 7pu5:L, 7sp0:B, 7uj1:A
20	2mkc:A	118	87	0.3333	0.2373	0.3218	7.25e-07	2my3:A
21	7dvq:Y	140	73	0.3095	0.1857	0.3562	1.39e-06	8i0p:Y, 8i0r:Y
22	2xb2:D	89	74	0.2738	0.2584	0.3108	1.98e-06	2xb2:Z
23	7dco:X	128	78	0.2976	0.1953	0.3205	2.63e-06	5gm6:V, 5zwm:X
24	8by6:B	152	59	0.2619	0.1447	0.3729	7.64e-06	7abg:A1, 6d0y:A, 1h2t:Z, 1h2u:X, 1h2u:Y, 1n52:B, 5oo6:B, 5oo6:E, 5oo6:H, 5oo6:K, 5oo6:N, 5oo6:Q, 5oo6:T, 5oo6:W, 5oob:D, 5oob:J, 5oob:B, 5oob:G, 8pmp:B, 8pnt:B, 8srr:B, 8suy:B
25	7ohx:o	112	72	0.2500	0.1875	0.2917	9.27e-06
26	8ch6:V	285	75	0.2857	0.0842	0.3200	1.05e-05	7qtt:V
27	8i0s:Y	320	74	0.2857	0.0750	0.3243	1.18e-05	8i0t:Y, 8i0u:Y, 8i0v:Y
28	6c0f:o	133	72	0.2500	0.1579	0.2917	1.34e-05	7btb:o, 6cb1:o, 8e5t:o, 6elz:o, 6em1:o, 6em3:o, 6em4:o, 6em5:o, 3jct:o, 6m62:o, 7nac:o, 7ohp:o, 7ohq:o, 7ohr:o, 7ohs:o, 7ohv:o, 7ohw:o, 7r6q:o, 7r7a:o, 7u0h:o, 7uoo:o, 7uqb:o, 7uqz:o, 7v08:o, 8v83:o, 8v84:o, 8v87:o, 6ylx:o, 6yly:o, 5z3g:E
29	4ed5:B	169	66	0.2500	0.1243	0.3182	1.66e-05	4ed5:A
30	7qde:B	169	73	0.2262	0.1124	0.2603	1.68e-05	7qdd:B
31	5m8i:A	114	83	0.2500	0.1842	0.2530	3.51e-05
32	6r5k:H	394	71	0.2738	0.0584	0.3239	6.90e-05	6r5k:D, 6r5k:F
33	6r5k:H	394	71	0.2381	0.0508	0.2817	0.007	6r5k:D, 6r5k:F
34	6r5k:H	394	65	0.2262	0.0482	0.2923	0.031	6r5k:D, 6r5k:F
35	2cjk:A	167	74	0.2857	0.1437	0.3243	9.66e-05	2km8:C
36	2cjk:A	167	69	0.2143	0.1078	0.2609	0.003	2km8:C
37	4qqb:A	169	62	0.2500	0.1243	0.3387	1.09e-04	1b7f:A, 1b7f:B, 4qqb:B
38	4qqb:A	169	78	0.2262	0.1124	0.2436	0.13	1b7f:A, 1b7f:B, 4qqb:B
39	5x8p:v	190	73	0.2143	0.0947	0.2466	1.40e-04	5mmj:v, 5mmm:v, 5x8r:v
40	5x8p:v	190	77	0.2143	0.0947	0.2338	0.024	5mmj:v, 5mmm:v, 5x8r:v
41	2rqc:A	115	83	0.2381	0.1739	0.2410	1.57e-04
42	1fnx:H	174	65	0.2619	0.1264	0.3385	1.76e-04	1fxl:A, 1g2e:A
43	1fnx:H	174	78	0.2024	0.0977	0.2179	0.055	1fxl:A, 1g2e:A
44	4pkd:B	240	73	0.2738	0.0958	0.3151	1.92e-04	1aud:A, 7b0y:c, 3bo2:A, 3bo3:A, 3bo4:A, 4c4w:A, 4c4w:E, 3cul:A, 3cul:B, 3cun:A, 3cun:B, 7d7v:C, 5ddo:G, 5ddo:C, 5ddp:D, 5ddp:C, 5ddq:D, 5ddq:C, 5ddr:D, 5ddr:C, 7dlz:A, 7dlz:B, 1drz:A, 7dwh:A, 7dwh:B, 1dz5:A, 1dz5:B, 3egz:A, 5fj4:A, 5fj4:E, 3g8s:A, 3g8s:B, 3g8s:C, 3g8s:D, 3g8t:A, 3g8t:B, 3g8t:C, 3g8t:D, 3g96:A, 3g96:B, 3g96:C, 3g96:D, 3g9c:A, 3g9c:B, 3g9c:C, 3g9c:D, 8gxb:C, 8gxb:D, 8gxb:F, 8gxc:C, 8gxc:D, 8gxc:F, 3hhn:B, 3hhn:D, 3iin:A, 3irw:P, 3iwn:C, 3iwn:D, 8jy0:A, 8jy0:C, 8jy0:E, 3k0j:A, 3k0j:B, 3l3c:A, 3l3c:B, 3l3c:C, 3l3c:D, 6las:E, 6las:D, 6las:C, 6lau:E, 6lau:D, 6lau:C, 6lax:D, 6lax:E, 6lax:C, 6laz:D, 6laz:E, 6laz:C, 1m5k:C, 1m5k:F, 1m5o:C, 1m5o:F, 1m5p:C, 1m5p:F, 1m5v:C, 1m5v:F, 3mum:P, 3mur:P, 3mut:P, 3muv:P, 3mxh:P, 2nz4:A, 2nz4:B, 2nz4:C, 2nz4:D, 2oih:A, 2oj3:A, 3p49:B, 4pr6:A, 4prf:A, 7qr3:A, 7qr3:B, 7qr4:A, 6qx9:1A, 3r1h:A, 3r1h:D, 3r1l:A, 3r1l:D, 1sj3:P, 1sj4:P, 1sjf:A, 6sqn:A, 6sqn:B, 6sqn:C, 6sqq:AAA, 6sqq:BBB, 6sqq:CCC, 1u6b:A, 3ucu:P, 3ucz:P, 3ud3:P, 3ud4:P, 1urn:A, 1urn:B, 1urn:C, 1vbx:A, 1vby:A, 1vbz:A, 1vc0:A, 1vc5:A, 1vc6:A, 7vpx:M, 4w90:B, 4w92:B, 1zzn:A
45	9gpj:A	184	73	0.2619	0.1196	0.3014	3.76e-04	6dcl:A, 6dcl:B, 9f4d:A, 9f4e:A, 9f4f:A, 9f4g:A, 9f4h:A, 9f4j:A, 9f4k:A, 9f4l:A, 9f4m:A, 9f4n:A, 9f4o:A, 9f4p:A, 9f4q:A, 9f4r:A, 9f4s:A, 9f4t:A, 9f4u:A, 9f4v:A, 9f4w:A, 9f4x:A, 9f4y:A, 9f4z:A, 9f50:A, 9f51:A, 9f52:A, 9f53:A, 9f54:A, 9f55:A, 9f5c:A, 9f5d:A, 9f5e:A, 9f5f:A, 9f5g:A, 9f5k:A, 9f7f:A, 9f7h:A, 5mpg:A, 5mpl:A, 1pgz:A, 1po6:A, 8rzv:A, 1u1k:A, 1u1l:A, 1u1m:A, 1u1n:A, 1u1o:A, 1u1p:A, 1u1q:A, 1u1r:A, 2up1:A, 4yoe:A
46	5mqf:o	223	78	0.2976	0.1121	0.3205	3.93e-04	6id1:y, 7w59:y, 7w5a:y, 7w5b:y
47	6xh2:A	93	74	0.2500	0.2258	0.2838	4.11e-04	6cmn:A, 3k0j:D, 3k0j:C, 6xh0:A, 6xh1:A, 6xh3:A
48	7zew:A	117	87	0.3095	0.2222	0.2989	4.24e-04	7zex:A
49	8i0v:4	161	75	0.2857	0.1491	0.3200	5.44e-04
50	6qx9:1K	201	72	0.2738	0.1144	0.3194	5.75e-04	7b0y:b, 4pjo:K, 4pjo:k, 4pjo:N, 4pjo:n, 8r08:1K, 7vpx:O
51	7zap:A	97	49	0.2024	0.1753	0.3469	0.001
52	4f02:A	175	58	0.2619	0.1257	0.3793	0.001	1cvj:A, 1cvj:B, 1cvj:C, 1cvj:D, 1cvj:E, 1cvj:F, 1cvj:G, 1cvj:H, 4f02:D
53	7q33:A	93	75	0.2500	0.2258	0.2800	0.002	6pai:D, 6q0r:D, 6q0v:D, 6q0w:D, 6sj7:C, 6ud7:C, 6ue5:C
54	7slp:B	321	65	0.2738	0.0717	0.3538	0.002	6d12:A, 6d12:B, 7slq:B, 4wkr:A, 4wkr:B
55	8ro0:O	342	60	0.2381	0.0585	0.3333	0.003	8ro1:O
56	2x1f:A	94	66	0.2262	0.2021	0.2879	0.004	2km8:B, 2x1a:A
57	7vsj:A	160	72	0.1429	0.0750	0.1667	0.004	6fqr:A, 6gx6:A, 7yew:A, 7yew:C, 7yex:A
58	8xxn:3B	536	74	0.3214	0.0504	0.3649	0.004	6zon:B, 6zp4:B, 6zvj:B
59	4lmz:A	176	59	0.2143	0.1023	0.3051	0.004	3nmr:A, 3nna:A, 3nnc:A, 3nnh:A, 3nnh:C, 3nnh:B, 3nnh:D
60	8esq:o	137	49	0.2024	0.1241	0.3469	0.005	8esr:o, 8etg:o, 8eth:o, 8eti:o, 8eup:o, 8euy:o, 8ev3:o
61	5tkz:A	89	78	0.2619	0.2472	0.2821	0.005	5tkz:B
62	7s7b:C	79	76	0.2143	0.2278	0.2368	0.006	7s7b:G, 7s7c:C
63	8pj1:1	588	74	0.3214	0.0459	0.3649	0.008	6fec:w, 2krb:A, 8oz0:I, 8pj2:1, 8pj3:1, 8pj5:1, 8pj6:1
64	3d2w:A	72	60	0.2143	0.2500	0.3000	0.008
65	8y6o:W	167	84	0.2619	0.1317	0.2619	0.021
66	1wtb:A	79	52	0.2024	0.2152	0.3269	0.021	1x0f:A
67	6xlv:A	203	74	0.1905	0.0788	0.2162	0.024	5ev1:A, 5ev2:A, 5ev3:A, 5ev4:A, 2g4b:A, 2hzc:A, 7s3a:A, 7s3b:A, 7s3c:A, 4tu7:A, 4tu7:B, 4tu8:A, 4tu8:B, 4tu9:A, 4tu9:B, 3vaf:A, 3vaf:B, 3vag:A, 3vag:B, 3vah:B, 3vah:A, 3vai:A, 3vai:B, 3vaj:A, 3vaj:B, 3vak:A, 3vak:B, 3val:I, 3val:A, 3val:D, 3val:B, 3vam:A, 3vam:B, 5w0g:A, 6xlw:A, 6xlx:A, 2yh1:A
68	6xlv:A	203	95	0.3214	0.1330	0.2842	0.037	5ev1:A, 5ev2:A, 5ev3:A, 5ev4:A, 2g4b:A, 2hzc:A, 7s3a:A, 7s3b:A, 7s3c:A, 4tu7:A, 4tu7:B, 4tu8:A, 4tu8:B, 4tu9:A, 4tu9:B, 3vaf:A, 3vaf:B, 3vag:A, 3vag:B, 3vah:B, 3vah:A, 3vai:A, 3vai:B, 3vaj:A, 3vaj:B, 3vak:A, 3vak:B, 3val:I, 3val:A, 3val:D, 3val:B, 3vam:A, 3vam:B, 5w0g:A, 6xlw:A, 6xlx:A, 2yh1:A
69	6m75:A	167	68	0.2500	0.1257	0.3088	0.024
70	6g90:B	193	56	0.2024	0.0881	0.3036	0.028
71	8wq5:A	99	66	0.2143	0.1818	0.2727	0.032	8wq5:B, 8wq5:C, 8wq5:D
72	6n7p:A	186	56	0.2024	0.0914	0.3036	0.034	6n7r:A, 6n7x:A, 7oqc:B, 7oqe:B, 8w2o:A, 5zwn:Q
73	2adb:A	127	74	0.2500	0.1654	0.2838	0.045	3zzy:A, 3zzy:B, 3zzz:A, 3zzz:B
74	2xs2:A	87	71	0.1786	0.1724	0.2113	0.057	2xs5:A, 2xs5:B, 2xs7:A
75	5vsu:A	387	73	0.2143	0.0465	0.2466	0.060	6aso:A, 2kh9:A, 4n0t:A, 5tf6:A, 5tf6:C
76	5en1:A	184	50	0.1905	0.0870	0.3200	0.098	8hni:A, 8hni:B, 8hni:G, 8hni:I, 8hni:H, 8hni:E, 8hni:K, 8hni:C, 8hni:D, 8hni:J, 8hni:F, 8hni:L, 5ho4:A, 7wm3:A, 7wm3:B, 7wm3:C, 7wm3:D, 5wwe:A, 5wwf:A, 5wwf:C, 5wwg:A
77	4bs2:A	174	60	0.2262	0.1092	0.3167	0.10	4iuf:A, 4y00:A, 4y00:B, 4y00:C, 4y00:D, 4y0f:A, 4y0f:B
78	7ase:J	173	59	0.2024	0.0983	0.2881	0.12	5opt:h
79	2mgz:B	105	58	0.2024	0.1619	0.2931	0.14	4ch1:A, 4cio:A, 2ru3:A
80	2yka:A	124	75	0.2262	0.1532	0.2533	0.15
81	1fje:B	175	64	0.2024	0.0971	0.2656	0.18	1rkj:A
82	2adc:A	208	75	0.1905	0.0769	0.2133	0.22
83	2mki:A	203	72	0.2619	0.1084	0.3056	0.22
84	2rs2:A	84	82	0.2500	0.2500	0.2561	0.25
85	7dco:4	174	58	0.1905	0.0920	0.2759	0.31	6g90:R, 5gm6:e, 5nrl:R, 7oqb:R, 7oqe:R, 5zwm:4
86	3smz:A	280	33	0.1667	0.0500	0.4242	0.56
87	7evo:D	200	25	0.1310	0.0550	0.4400	0.66	8hk1:D, 6n3e:A, 6n3f:C, 6nsx:A
88	7q4l:A	227	65	0.1905	0.0705	0.2462	1.3
89	6mcp:C	507	31	0.1548	0.0256	0.4194	2.1
90	7k9y:A	425	27	0.1429	0.0282	0.4444	6.3	6ar1:A, 6ar1:D, 6ar3:A, 6ar3:D, 7k9y:D
91	6eet:A	443	30	0.1190	0.0226	0.3333	8.5	6bxz:C, 6bxz:A, 6c10:A, 5kj4:A, 5kj4:B, 5kj4:C, 5kj4:D

[Back]