BioLiP

>protein
VFTTVDNINLHTQVMTYGQQFGPTYLDGADVTKIKPHNSHEGKTFYVLPNDDTLRVEAFEYYHTTDPSFLGRYMSALNHT
KKWKYPQVNGLTSIKWADNNCYLATALLTLQQIELKFNPPALQDAYYRARAGEAANFCALILAYCNKTVGELGDVRETMS
YLFQHANLDSCKRVLNVVCKTCGQQQTTLKGVEAVMYMGTLSYEQFKKGVQIPCTCGKQATKYLVQQESPFVMMSAPPAQ
YELKHGTFTCASEYTGNYQCGHYKHITSKETLYCIDGALLTKSSEYKGPITDVFYKENSYTTTIK

The query sequence (length=305) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6wuu:B	321	309	1.0000	0.9502	0.9871	0.0	9brv:A, 9brv:B, 9brw:A, 9brw:B, 9brw:C, 9brw:D, 9brx:AA, 7cjd:D, 7cjd:A, 7cjd:B, 7cjd:C, 7cjm:B, 7cmd:A, 7cmd:B, 7cmd:C, 7cmd:D, 8cx9:B, 8cx9:A, 8cx9:C, 8cx9:D, 7d47:A, 7d47:B, 7d6h:A, 7d7k:A, 7d7k:B, 7d7l:A, 7d7l:B, 7e35:B, 7e35:A, 8eua:A, 8fwn:A, 8fwo:A, 8g62:A, 8g62:B, 8g62:C, 8iho:A, 8iho:C, 7jir:A, 7jit:A, 7jiv:A, 7jiw:A, 7jn2:A, 7jrn:A, 7jrn:J, 8jux:A, 8jux:B, 7koj:A, 7kok:A, 7kol:A, 7krx:A, 7lbr:A, 7lbr:B, 7lbs:A, 7lbs:B, 7llf:A, 7llf:B, 7llz:A, 7llz:B, 7los:A, 7los:B, 7m1y:A, 7m1y:B, 7nfv:AAA, 7nt4:A, 7nt4:B, 7ofs:A, 7oft:A, 7ofu:AAA, 7qcg:A, 7qch:A, 7qci:A, 7qcj:A, 7qck:A, 7qcm:A, 7rbr:A, 7rbs:A, 7rbs:C, 7rbs:E, 7rbs:G, 7rbs:I, 7rzc:A, 7rzc:B, 7rzc:C, 7sdr:A, 7sdr:B, 7sdr:C, 7sgu:A, 7sgv:A, 7sgw:A, 7sqe:A, 7sqe:B, 7sqe:C, 7tzj:A, 7tzj:B, 8uob:A, 8uuf:A, 8uug:A, 8uuh:A, 8uuu:A, 8uuv:A, 8uuw:A, 8uuy:A, 7uv5:A, 8uvm:A, 8uvm:B, 8uvm:C, 8uvm:D, 8vec:A, 6w9c:A, 6w9c:C, 6wrh:A, 6wuu:A, 6wuu:C, 6wuu:D, 6wx4:D, 6wzu:A, 6xa9:A, 6xa9:C, 6xa9:E, 6xaa:A, 6xg3:A, 7ybg:A
2	3e9s:A	317	308	0.8230	0.7918	0.8149	0.0	2fe8:A, 2fe8:B, 2fe8:C, 7lfu:D, 7lfv:A, 7lfv:B, 4m0w:A, 3mj5:A, 3mj5:B, 4mm3:B, 4ovz:A, 4ovz:B, 4ow0:A, 4ow0:B, 7skq:A, 7skq:B, 7skr:A, 5tl6:B, 5tl6:D, 5tl7:B, 5tl7:D, 5y3e:A, 5y3q:A
3	5v69:A	322	314	0.3115	0.2950	0.3025	2.25e-45	6bi8:A, 6bi8:B, 5ko3:A, 4p16:A, 4pt5:A, 4r3d:B, 4r3d:A, 4rez:A, 4rf0:A, 4rf1:A, 4rna:A, 5v6a:A, 5w8t:A, 5w8t:C, 5w8u:A, 5w8u:C, 4wur:A
4	4ypt:A	378	302	0.3115	0.2513	0.3146	3.62e-37	5wfi:A, 5wfi:B
5	7wfc:A	309	303	0.2984	0.2945	0.3003	2.27e-30
6	4x2z:A	301	242	0.1869	0.1894	0.2355	2.38e-13	5bz0:A
7	6ln0:A	425	110	0.1148	0.0824	0.3182	1.45e-07
8	3mp2:A	211	206	0.1672	0.2417	0.2476	2.22e-06
9	6noz:A	248	229	0.1770	0.2177	0.2358	3.11e-04	7f0u:A, 7f0u:B, 7mc9:A, 7mc9:C, 7mc9:E, 7mc9:G, 7mc9:I, 7mc9:K, 7mc9:M, 7mc9:O
10	6l5t:A	234	123	0.1016	0.1325	0.2520	3.67e-04
11	1g0d:A	666	61	0.0525	0.0240	0.2623	1.7
12	8a0e:A	356	65	0.0623	0.0534	0.2923	5.1	8a0e:B, 8a0e:C, 8a0e:D, 8a0f:A, 8a0f:B, 8a0g:A, 8a0g:B, 7a6t:A, 7a6t:B, 1dhs:A, 6p4v:A, 6p4v:B, 6pgr:A, 6pgr:B, 1rlz:A, 1roz:A, 1roz:B, 1rqd:A, 1rqd:B, 6xxi:A, 6xxi:B, 6xxj:A, 6xxj:B, 6xxk:A, 6xxk:B, 6xxl:A, 6xxl:B, 6xxm:A, 6xxm:B
13	4hcd:A	384	50	0.0525	0.0417	0.3200	9.4	4hch:A, 4hch:B, 4hcl:A, 4hcl:B, 4mmw:A, 4mmw:B, 1rvk:A

[Back]