BioLiP

>protein
VFAVESIRKKRVRKGKVEYLVKWKGWPPKYSTWEPEEHILDPRLVMAYEEKEE

The query sequence (length=53) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5ejw:A	80	53	1.0000	0.6625	1.0000	3.31e-33	5epj:A, 2kvm:A, 2l12:A, 2l1b:A, 4mn3:A, 8sii:A, 8sii:B, 6v2r:A, 4x3k:A, 4x3k:B, 4x3s:B, 4x3s:A, 4x3t:A, 4x3t:B, 4x3t:C, 4x3t:D, 4x3t:E, 4x3t:F, 4x3u:A, 4x3u:B
2	5epl:B	58	52	0.7358	0.6724	0.7500	7.77e-26	5epl:A
3	3gv6:A	56	52	0.7170	0.6786	0.7308	3.94e-24	3i90:A, 3i90:B
4	5eq0:A	55	52	0.6792	0.6545	0.6923	2.52e-23	3i91:A
5	5epk:A	54	52	0.6415	0.6296	0.6538	2.98e-22	3h91:A, 3h91:B
6	1pfb:A	55	50	0.5849	0.5636	0.6200	5.94e-17	1pdq:A
7	7vyw:A	47	38	0.4340	0.4894	0.6053	2.43e-13
8	6asz:A	53	48	0.4906	0.4906	0.5417	9.39e-13	6at0:A, 1kna:A, 1kne:A, 6mha:A, 1q3l:A
9	3tzd:A	58	47	0.4340	0.3966	0.4894	1.20e-11	3dm1:A, 3dm1:C, 3dm1:G, 3dm1:E, 2l11:A
10	2rvn:A	83	50	0.3962	0.2530	0.4200	4.39e-10
11	1guw:A	73	39	0.3962	0.2877	0.5385	8.95e-10	6d07:A, 6d07:B, 6d08:A, 6d08:B
12	8uxq:A	170	45	0.3962	0.1235	0.4667	1.09e-09	3fdt:A
13	6v41:AAA	61	41	0.3774	0.3279	0.4878	5.40e-09
14	7n27:A	57	42	0.3774	0.3509	0.4762	9.13e-09	7n27:D, 7n27:B, 7n27:C, 7n27:E, 7n27:F
15	3qo2:A	61	46	0.3962	0.3443	0.4565	7.48e-08	7m5u:A, 3qo2:D, 3qo2:B, 3qo2:C, 3r93:A, 3r93:D, 3r93:B, 3r93:C, 3svm:A, 6v2s:A, 6v2s:B
16	6v2d:G	64	41	0.3962	0.3281	0.5122	1.92e-07	5jjz:A, 7slw:A, 7slw:B, 7slw:C, 7slw:D, 7slw:E, 7slw:F, 8sp6:A, 8sp6:B, 8sp6:C, 8sp6:D, 8sp6:E, 8sp6:F, 6v2d:I, 6v2d:K, 6v2d:A, 6v2d:C, 6v2d:E, 6v2h:A, 6v2h:C, 6v2h:E, 6v2h:G, 6v2h:I, 6v2h:K, 6v3n:A, 6v3n:B, 6v8w:A, 6v8w:B, 6v8w:C, 6v8w:D, 6v8w:E, 6v8w:F, 6v8w:G, 6v8w:H, 6v8w:I, 6v8w:J, 6v8w:K, 6v8w:L, 6v8w:M, 6v8w:N, 6v8w:O, 6v8w:P, 6v8w:Q, 6v8w:R, 6v8w:S, 6v8w:T, 6v8w:U, 6v8w:V, 6v8w:W, 6v8w:X, 6v8w:Y, 6v8w:Z
17	4u68:A	64	49	0.3774	0.3125	0.4082	1.61e-06	4quf:A, 4quf:B, 4quf:C, 4quf:D, 4quf:E, 4quf:F, 4u68:B, 4u68:C
18	7vrf:A	61	51	0.3585	0.3115	0.3725	3.92e-06	7vrf:B
19	2rsn:A	75	41	0.3208	0.2267	0.4146	7.68e-05	3g7l:A
20	6s47:Bi	952	53	0.3396	0.0189	0.3396	3.09e-04
21	2b2w:A	177	29	0.2642	0.0791	0.4828	6.62e-04	5afw:A, 2b2t:A, 2b2u:A, 2b2v:A, 4nw2:A, 4nw2:C, 4o42:A
22	6ryr:W	708	25	0.2075	0.0155	0.4400	0.027	2l75:A, 1mm2:A, 6q3m:D, 6ryu:W, 6ryu:V
23	3oa6:A	84	23	0.1698	0.1071	0.3913	0.099	3oa6:B
24	7ubu:A	708	29	0.1887	0.0141	0.3448	0.11	4ft4:A, 4ft4:B
25	4fsx:A	680	29	0.1887	0.0147	0.3448	0.11	4fsx:B, 4ft2:B, 4ft2:A
26	6q3m:C	219	25	0.2075	0.0502	0.4400	0.12	6q3m:A, 6q3m:B
27	6guu:B	204	25	0.2264	0.0588	0.4800	0.12	6guu:A
28	7uci:A	686	37	0.2453	0.0190	0.3514	0.89	7uci:B
29	7ucl:A	616	37	0.2453	0.0211	0.3514	0.95	7ucl:B
30	5fm6:A	426	42	0.2830	0.0352	0.3571	2.6	5fm7:A, 4ww4:A
31	9gd1:W	849	39	0.2453	0.0153	0.3333	4.3
32	6g0l:M	855	41	0.2453	0.0152	0.3171	4.3	7nkx:W, 5o9g:W
33	6ftx:W	878	41	0.2453	0.0148	0.3171	4.4	6g0l:W, 5j70:A, 5j70:B, 3mwy:W, 3ted:A
34	7tn2:W	895	39	0.2453	0.0145	0.3333	4.6	9gd2:W, 9gd3:W
35	6jt5:A	409	19	0.1321	0.0171	0.3684	5.4	6jwf:A, 6jwf:B
36	3ui2:A	234	21	0.2075	0.0470	0.5238	6.1	3dep:A, 2hug:A
37	5e4w:C	105	21	0.2075	0.1048	0.5238	6.4	5e4w:D, 5e4x:A
38	8u5y:B	700	31	0.2264	0.0171	0.3871	6.9	8u5y:A, 8u5y:C, 8u61:B, 8u61:A, 8u61:C
39	1aom:B	559	52	0.2642	0.0250	0.2692	7.2	1aof:A, 1aof:B, 1aom:A, 1aoq:A, 1aoq:B, 1dy7:A, 1dy7:B, 1e2r:A, 1e2r:B, 1gq1:A, 1gq1:B, 1h9x:A, 1h9x:B, 1h9y:A, 1h9y:B, 1hcm:A, 1hcm:B, 1hj3:A, 1hj3:B, 1hj4:A, 1hj4:B, 1hj5:A, 1hj5:B, 1qks:A, 1qks:B
40	1ktg:A	137	32	0.2075	0.0803	0.3438	9.4	1ktg:B

[Back]