BioLiP

>protein
VEVLLGGDDGSLAFLPGDFSVASGEEIVFKNNAGFPHNVVFDEDEIPSGVDAAKISMSEEDLLNAPGETYKVTLTEKGTY
KFYCSPHQGAGMVGKVTVN

The query sequence (length=99) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1ag6:A	99	99	1.0000	1.0000	1.0000	4.97e-69	1oow:A, 2pcf:A, 1tef:A, 1tef:B, 1teg:A, 1teg:B, 1ylb:B
2	9pcy:A	99	99	0.8283	0.8283	0.8283	2.39e-56
3	6yez:P	99	99	0.8081	0.8081	0.8081	7.82e-56	6zoo:P
4	1byo:A	99	98	0.7879	0.7879	0.7959	5.00e-55	1byo:B, 1byp:A
5	1jxg:A	100	99	0.7778	0.7700	0.7778	1.35e-54	4dp7:X, 4dp8:X, 4dp9:X, 4dpa:X, 4dpb:X, 4dpc:X, 1jxg:B, 3pcy:A, 4pcy:A, 5pcy:A, 6pcy:A, 1plc:A, 1pnc:A, 1pnd:A, 1tkw:A
6	4dp0:X	99	99	0.7778	0.7778	0.7778	1.67e-54	4dp1:X, 4dp2:X, 4dp4:X, 4dp5:X, 4dp6:X
7	1pla:A	97	99	0.7071	0.7216	0.7071	2.19e-46	1plb:A
8	2plt:A	98	97	0.6061	0.6122	0.6186	7.36e-39	7zqe:M
9	7pcy:A	98	97	0.5859	0.5918	0.5979	2.70e-35
10	1iuz:A	98	97	0.5859	0.5918	0.5979	1.54e-34
11	1j5c:A	98	98	0.4646	0.4694	0.4694	1.14e-24	1j5d:A, 1jxd:A, 1jxf:A, 1pcs:A
12	4r0o:A	106	99	0.4040	0.3774	0.4040	4.15e-24	1baw:A, 1baw:B, 1baw:C, 3bqv:A, 3cvb:A, 3cvb:B, 3cvc:A, 3cvd:A, 3cvd:B, 3cvd:C, 2q5b:A, 2q5b:B, 2q5b:C, 4r0o:B, 4r0o:C, 4r0o:D, 2w88:A, 2w88:B, 2w88:C, 2w8c:A, 2w8c:B
13	1bxu:A	91	99	0.4040	0.4396	0.4040	3.79e-23	1bxv:A
14	2gim:A	106	100	0.4646	0.4340	0.4600	5.76e-22	2cj3:A, 2cj3:B, 1fa4:A, 2gim:C, 1nin:A, 1tu2:A
15	1b3i:A	97	98	0.4242	0.4330	0.4286	8.61e-22	2b3i:A, 2jxm:A
16	2bz7:A	102	104	0.3838	0.3725	0.3654	1.10e-16	2bzc:A, 1kdi:A, 1kdj:A
17	6akn:A	124	99	0.3939	0.3145	0.3939	1.89e-12	6akn:B, 1bqk:A, 1bqr:A, 8hm9:A, 8hm9:B, 6ifp:A, 6ifp:C, 2jkw:A, 2jkw:B, 2ux6:A, 2ux7:A, 2uxf:A, 2uxg:A, 5wv4:A, 5wv4:B, 5xmo:A, 5y23:A, 5y23:B, 4yl4:A, 5ysg:A, 5ysg:B, 5ysg:C, 5ysg:D, 5yw3:A, 5yw3:B, 5yw3:C, 5yw3:D, 5z0x:A, 5z0x:B, 1zia:A, 1zib:A, 5ztd:A, 5ztd:B
18	1adw:A	123	98	0.3333	0.2683	0.3367	2.44e-08	1adw:B, 4bwt:A, 4bwt:B, 4bwu:A, 4bwu:B, 4bxv:A, 4bxv:B, 3erx:A, 3erx:B
19	3c75:A	106	88	0.2727	0.2547	0.3068	5.45e-08	3c75:B, 1id2:A, 1id2:B, 1id2:C
20	8k9n:A	125	102	0.2929	0.2320	0.2843	6.52e-07	8k9p:A, 3nyk:A, 2p80:D, 1paz:A, 3paz:A, 4paz:A, 5paz:A, 6paz:A, 7paz:A, 8paz:A, 1py0:A, 1pza:A, 1pzb:A, 4rh4:A, 5x31:A, 5x31:B
21	3tu6:A	127	100	0.3131	0.2441	0.3100	7.10e-07
22	1aac:A	105	91	0.2828	0.2667	0.3077	2.50e-06	1aan:A, 1bxa:A, 2gb2:A, 2gba:A, 2gc4:C, 2gc4:G, 2gc4:K, 2gc4:O, 2idq:A, 2ids:A, 2idt:A, 2idu:A, 3ie9:A, 3iea:A, 2j55:A, 2j55:B, 2j56:A, 2j56:B, 2j57:A, 2j57:B, 2j57:C, 2j57:D, 3l45:A, 1mda:A, 1mda:B, 1mg2:C, 1mg2:G, 1mg2:K, 1mg2:O, 1mg3:C, 1mg3:G, 1mg3:K, 1mg3:O, 2mta:A, 2ov0:A, 4p5r:A, 4p5s:A, 3ply:A, 3ply:B, 3ply:C, 3ply:D, 2qdv:A, 2qdw:A, 2rac:A, 3rym:A, 3rym:C, 3rym:B, 3rym:D, 1sf3:A, 1sf5:A, 1sfd:A, 1sfd:B, 1sfh:A, 1sfh:B, 1t5k:A, 1t5k:B, 1t5k:C, 1t5k:D
23	1pmy:A	123	99	0.3030	0.2439	0.3030	1.02e-04
24	5fc9:A	95	89	0.2525	0.2632	0.2809	7.23e-04	5fc9:B, 5fc9:C, 5fc9:D
25	5b1j:C	124	88	0.2828	0.2258	0.3182	7.83e-04	3ef4:A, 3ef4:B, 3ef4:C
26	6hbe:C	427	81	0.2424	0.0562	0.2963	0.23	6hbe:A, 6hbe:B
27	4usc:A	303	58	0.1515	0.0495	0.2586	1.1	4usc:B
28	2grj:A	179	55	0.1616	0.0894	0.2909	1.3	2grj:B, 2grj:C, 2grj:D, 2grj:E, 2grj:F, 2grj:G, 2grj:H
29	4hcf:B	96	40	0.1515	0.1562	0.3750	1.9	4hcf:A, 4hcg:A, 4hcg:B
30	2q9u:A	409	32	0.1010	0.0244	0.3125	4.0	2q9u:B
31	7kwo:A	1200	50	0.1616	0.0133	0.3200	5.7
32	7x5j:C	256	40	0.1515	0.0586	0.3750	7.6	7x5j:D, 7x5j:A, 7x5j:E, 7x5j:B, 7x5j:F
33	7syv:x	627	51	0.1919	0.0303	0.3725	8.9	8pj3:0, 8pj4:0, 8pj5:0, 7syw:x, 7syx:x, 7tql:1, 4ujc:AB, 4ujd:BB

[Back]