BioLiP

>protein
VEVLLGGDDGSEAFLPGDFSVASGEEIVFKNNAGFPHNVVFDEDEIPSGVDAAKISMSEEDLLNAPGETYKVTLTEKGTY
KFYCSPHQGAGMVGKVTVN

The query sequence (length=99) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1ag6:A	99	99	0.9899	0.9899	0.9899	7.24e-68	1oow:A, 2pcf:A, 1tef:A, 1tef:B, 1teg:A, 1teg:B, 1ylb:B
2	9pcy:A	99	99	0.8182	0.8182	0.8182	2.73e-55
3	6yez:P	99	99	0.7980	0.7980	0.7980	1.01e-54	6zoo:P
4	1byo:A	99	98	0.7778	0.7778	0.7857	6.66e-54	1byo:B, 1byp:A
5	1jxg:A	100	99	0.7677	0.7600	0.7677	1.65e-53	4dp7:X, 4dp8:X, 4dp9:X, 4dpa:X, 4dpb:X, 4dpc:X, 1jxg:B, 3pcy:A, 4pcy:A, 5pcy:A, 6pcy:A, 1plc:A, 1pnc:A, 1pnd:A, 1tkw:A
6	4dp0:X	99	99	0.7677	0.7677	0.7677	2.25e-53	4dp1:X, 4dp2:X, 4dp4:X, 4dp5:X, 4dp6:X
7	1pla:A	97	98	0.6970	0.7113	0.7041	4.27e-45	1plb:A
8	2plt:A	98	97	0.5960	0.6020	0.6082	9.47e-38	7zqe:M
9	7pcy:A	98	96	0.5758	0.5816	0.5938	3.28e-34
10	1iuz:A	98	97	0.5758	0.5816	0.5876	1.85e-33
11	1j5c:A	98	98	0.4545	0.4592	0.4592	1.61e-23	1j5d:A, 1jxd:A, 1jxf:A, 1pcs:A
12	4r0o:A	106	99	0.3939	0.3679	0.3939	5.17e-23	1baw:A, 1baw:B, 1baw:C, 3bqv:A, 3cvb:A, 3cvb:B, 3cvc:A, 3cvd:A, 3cvd:B, 3cvd:C, 2q5b:A, 2q5b:B, 2q5b:C, 4r0o:B, 4r0o:C, 4r0o:D, 2w88:A, 2w88:B, 2w88:C, 2w8c:A, 2w8c:B
13	1b3i:A	97	98	0.4242	0.4330	0.4286	3.59e-22	2b3i:A, 2jxm:A
14	1bxu:A	91	99	0.3939	0.4286	0.3939	6.22e-22	1bxv:A
15	2gim:A	106	100	0.4545	0.4245	0.4500	5.87e-21	2cj3:A, 2cj3:B, 1fa4:A, 2gim:C, 1nin:A, 1tu2:A
16	2bz7:A	102	104	0.3838	0.3725	0.3654	6.66e-16	2bzc:A, 1kdi:A, 1kdj:A
17	6akn:A	124	99	0.3838	0.3065	0.3838	2.33e-11	6akn:B, 1bqk:A, 1bqr:A, 8hm9:A, 8hm9:B, 6ifp:A, 6ifp:C, 2jkw:A, 2jkw:B, 2ux6:A, 2ux7:A, 2uxf:A, 2uxg:A, 5wv4:A, 5wv4:B, 5xmo:A, 5y23:A, 5y23:B, 4yl4:A, 5ysg:A, 5ysg:B, 5ysg:C, 5ysg:D, 5yw3:A, 5yw3:B, 5yw3:C, 5yw3:D, 5z0x:A, 5z0x:B, 1zia:A, 1zib:A, 5ztd:A, 5ztd:B
18	1adw:A	123	98	0.3333	0.2683	0.3367	1.16e-07	1adw:B, 4bwt:A, 4bwt:B, 4bwu:A, 4bwu:B, 4bxv:A, 4bxv:B, 3erx:A, 3erx:B
19	3c75:A	106	85	0.2727	0.2547	0.3176	1.31e-07	3c75:B, 1id2:A, 1id2:B, 1id2:C
20	8k9n:A	125	102	0.2929	0.2320	0.2843	2.79e-06	8k9p:A, 3nyk:A, 2p80:D, 1paz:A, 3paz:A, 4paz:A, 5paz:A, 6paz:A, 7paz:A, 8paz:A, 1py0:A, 1pza:A, 1pzb:A, 4rh4:A, 5x31:A, 5x31:B
21	3tu6:A	127	100	0.3131	0.2441	0.3100	3.66e-06
22	1aac:A	105	81	0.2727	0.2571	0.3333	5.43e-06	1aan:A, 1bxa:A, 2gb2:A, 2gba:A, 2gc4:C, 2gc4:G, 2gc4:K, 2gc4:O, 2idq:A, 2ids:A, 2idt:A, 2idu:A, 3ie9:A, 3iea:A, 2j55:A, 2j55:B, 2j56:A, 2j56:B, 2j57:A, 2j57:B, 2j57:C, 2j57:D, 3l45:A, 1mda:A, 1mda:B, 1mg2:C, 1mg2:G, 1mg2:K, 1mg2:O, 1mg3:C, 1mg3:G, 1mg3:K, 1mg3:O, 2mta:A, 2ov0:A, 4p5r:A, 4p5s:A, 3ply:A, 3ply:B, 3ply:C, 3ply:D, 2qdv:A, 2qdw:A, 2rac:A, 3rym:A, 3rym:C, 3rym:B, 3rym:D, 1sf3:A, 1sf5:A, 1sfd:A, 1sfd:B, 1sfh:A, 1sfh:B, 1t5k:A, 1t5k:B, 1t5k:C, 1t5k:D
23	1pmy:A	123	99	0.3030	0.2439	0.3030	3.67e-04
24	5fc9:A	95	89	0.2525	0.2632	0.2809	4.55e-04	5fc9:B, 5fc9:C, 5fc9:D
25	5b1j:C	124	85	0.2828	0.2258	0.3294	0.003	3ef4:A, 3ef4:B, 3ef4:C
26	6hbe:C	427	81	0.2424	0.0562	0.2963	0.28	6hbe:A, 6hbe:B
27	4usc:A	303	58	0.1515	0.0495	0.2586	1.0	4usc:B
28	2grj:A	179	55	0.1616	0.0894	0.2909	1.3	2grj:B, 2grj:C, 2grj:D, 2grj:E, 2grj:F, 2grj:G, 2grj:H
29	4hcf:B	96	40	0.1515	0.1562	0.3750	1.9	4hcf:A, 4hcg:A, 4hcg:B
30	8hku:AL2P	234	42	0.1212	0.0513	0.2857	3.1	8hkv:AL2P, 8hky:AL2P, 8hkz:AL2P, 8hl1:AL2P, 8hl2:AL2P, 8hl3:AL2P, 8hl4:AL2P, 8hl5:AL2P
31	2q9u:A	409	32	0.1010	0.0244	0.3125	4.1	2q9u:B
32	7kwo:A	1200	50	0.1616	0.0133	0.3200	5.7
33	5ngy:A	1265	63	0.1616	0.0126	0.2540	7.6	6htv:A, 5lfc:A, 5lfc:B, 5ngy:B, 5o8l:A
34	7x5j:C	256	40	0.1515	0.0586	0.3750	8.2	7x5j:D, 7x5j:A, 7x5j:E, 7x5j:B, 7x5j:F

[Back]