BioLiP

>protein
VETFERNKTIFFPGDPAERVYFLLKGAVKLSRVYEAGEEITVALLRENSVFGVLSLLTGNKSDRFYHAVAFTPVELLSAP
IEQVEQALKENPELSMLMLRGLSSRILQTEMMIETLAHRDMGSRLVSFLLILCRDFGVPCADGITIDLKLSHQAIAEAIG
STRVTVTRLLGDLREKKMISIHKKKITVHKPVTLSRQ

The query sequence (length=197) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3la3:A	198	197	1.0000	0.9949	1.0000	1.19e-144	8h3v:X, 8h3v:Y, 8h40:X, 8h40:Y, 3la2:A, 3la2:B, 3la3:B
2	2xhk:B	217	197	0.8376	0.7604	0.8376	8.57e-121	2xgx:A, 2xgx:B, 2xhk:A, 2xko:A, 2xko:B, 2xkp:A, 2xkp:B, 2xkp:C, 2xkp:D, 2xkp:E, 2xkp:F
3	3i54:D	228	194	0.2640	0.2281	0.2680	5.48e-17	4a2u:A, 4a2u:B, 4a2u:C, 4a2u:D, 4a2u:E, 4a2u:F, 4a2u:G, 4a2u:H, 3h3u:B, 3i54:A, 3i54:B, 3i54:C, 3i59:A, 3i59:B, 3mzh:A, 3mzh:B
4	4cyd:B	225	194	0.2640	0.2311	0.2680	2.46e-15	4cyd:A, 4cyd:C, 4cyd:D, 3r6s:A, 3r6s:B, 3r6s:C, 3r6s:D, 3r6s:E, 3r6s:F
5	1hw5:A	208	190	0.2538	0.2404	0.2632	1.66e-14	6b6h:G, 6b6h:H, 1cgp:A, 1cgp:B, 2cgp:A, 5ciz:A, 6dt4:A, 6dt4:B, 4ft8:A, 4ft8:B, 3fwe:A, 1g6n:A, 1g6n:B, 2gzw:A, 2gzw:B, 2gzw:C, 2gzw:D, 1hw5:B, 4hzf:A, 4hzf:B, 4i01:A, 4i01:B, 4i02:A, 4i02:B, 4i02:C, 4i02:D, 4i02:E, 4i02:F, 4i09:A, 4i09:B, 4i0a:A, 4i0a:B, 4i0b:A, 4i0b:B, 1i5z:A, 1i5z:B, 1i6x:A, 1i6x:B, 3iyd:G, 3iyd:H, 1j59:A, 1j59:B, 3kcc:A, 3kcc:B, 1lb2:A, 3n4m:A, 4n9i:A, 4n9i:B, 4n9i:C, 4n9i:D, 1o3q:A, 1o3r:A, 1o3s:A, 1o3t:A, 1o3t:B, 6pb4:G, 6pb4:H, 6pb5:G, 6pb5:H, 6pb6:H, 6pb6:G, 3qop:A, 3qop:B, 4r8h:A, 4r8h:B, 3rdi:A, 3rdi:B, 3rou:A, 3rou:B, 3rpq:A, 3rpq:B, 1run:A, 1run:B, 1ruo:A, 1ruo:B, 3ryp:A, 3ryp:B, 3ryr:A, 3ryr:B, 1zrc:A, 1zrc:B, 1zrd:A, 1zrd:B, 1zre:A, 1zre:B, 1zrf:A, 1zrf:B
6	7ff0:A	206	186	0.2538	0.2427	0.2688	9.94e-13	7few:A, 7few:B, 7ff0:B, 7ff8:A, 7ff8:B, 7ff9:A, 7ff9:B, 7ff9:C, 7ff9:D, 7ff9:E, 7ff9:F, 7ff9:G, 7ff9:H, 2oz6:A
7	4ev0:D	214	191	0.2589	0.2383	0.2670	3.72e-12	4ev0:A
8	2h6b:A	239	190	0.2132	0.1757	0.2211	9.51e-11	3e5u:C, 3e5u:D, 3e5u:A, 3e5u:B, 3e5x:A, 3e5x:B, 3e5x:C, 3e5x:D, 3e6b:A, 3e6b:B, 3e6c:C, 2h6b:B
9	2fmy:A	218	169	0.2386	0.2156	0.2781	4.79e-10	2fmy:B, 2fmy:C, 2fmy:D, 2hkx:A, 2hkx:B
10	7pzb:A	227	177	0.2284	0.1982	0.2542	1.84e-08	7pza:A, 7pza:B, 7pzb:B
11	5i2d:G	195	194	0.2386	0.2410	0.2423	2.93e-08	5i2d:H, 5i2d:R, 5i2d:S
12	8qto:A	234	191	0.2284	0.1923	0.2356	4.74e-08	5cvr:A, 5e44:A
13	4i2o:A	198	178	0.2030	0.2020	0.2247	0.018	4i2o:B
14	6hq7:A	377	101	0.1371	0.0716	0.2673	0.032	6hq3:B, 6hq3:C, 6hq3:A, 6hq3:D, 6hq4:A, 6hq4:B, 6hq5:A, 6hq5:B, 6hq7:B
15	5kbf:A	282	86	0.1168	0.0816	0.2674	0.086	5k8s:A, 5k8s:B, 5kbf:B, 5t3n:A, 5t3n:B
16	2zfu:A	212	68	0.0964	0.0896	0.2794	0.23	2zfu:B
17	8hpd:C	221	54	0.0914	0.0814	0.3333	1.7
18	4x6r:B	290	55	0.0914	0.0621	0.3273	1.7	3fhi:B, 4jv4:A, 5kjx:A, 5kjy:A, 5kjz:A, 7lz4:A, 7lz4:B, 7lz4:C, 7lz4:D, 7lz4:E, 7lz4:F, 7lz4:G, 7lz4:H, 4mx3:A, 4mx3:B, 1ne4:A, 1ne6:A, 3plq:A, 3pna:A, 3pna:B, 1rgs:A, 1rl3:A, 1rl3:B
19	8e73:E	74	24	0.0609	0.1622	0.5000	4.6	8e73:Q
20	5fmp:A	184	70	0.1015	0.1087	0.2857	4.8	5aqc:A, 5aqc:B, 5cw8:A, 5cw8:B, 5cxi:A, 5cxi:B, 5fmp:B, 5ua1:B, 5ua1:A, 5ua2:A
21	3of1:A	246	55	0.0812	0.0650	0.2909	5.2
22	8r7y:C	312	31	0.0711	0.0449	0.4516	6.3	7bhy:A, 7bhy:B, 7bhy:C, 4oqp:A, 8r7y:D, 8r7y:A, 8r7y:B
23	8dqj:A	251	77	0.0964	0.0757	0.2468	8.3
24	8pw0:A	137	38	0.0711	0.1022	0.3684	9.1

[Back]