BioLiP

>protein
VEGAVKTEPVDLFHPGFLNSSNYRIPALFKTKEGTLIASIDARRHGGADAPNNDIDTAVRRSEDGGKTWDEGQIIMDYPD
KSSVIDTTLIQDDETGRIFLLVTHFPSKYGFWNAGLGSGFKNIDGKEYLCLYDSSGKEFTVRENVVYDKDSNKTEYTTNA
LGDLFKNGTKIDNINSSTAPLKAKGTSYINLVYSDDDGKTWSEPQNINFQVKKDWMKFLGIAPGRGIQIKNGEHKGRIVV
PVYYTNEKGKQSSAVIYSDDSGKNWTIGESPNDNRKLENGKIINSKTLSDDAPQLTECQVVEMPNGQLKLFMRNLSGYLN
IATSFDGGATWDETVEKDTNVLEPYCQLSVINYSQKVDGKDAVIFSNPNARSRSNGTVRIGLINQVGTYENGEPKYEFDW
KYNKLVKPGYYAYSCLTELSNGNIGLLYEGTPSEEMSYIEMNLKYLES

The query sequence (length=448) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	8u5o:A	449	448	0.9955	0.9933	0.9955	0.0	2bf6:A, 5tsp:A, 5tsp:B, 8u2a:A, 2vk5:A, 2vk6:A, 2vk7:A, 2vk7:B
2	9c20:A	451	449	0.5938	0.5898	0.5924	0.0	8url:A, 8uvv:A
3	6qzh:A	744	470	0.4375	0.2634	0.4170	3.03e-97	7a54:A, 7a54:B, 7a5x:A, 7a5x:B, 3h72:A, 3h72:B, 3h73:A, 3h73:B, 5kky:A, 5kky:B, 2vvz:A, 2vvz:B, 2ya5:A, 2ya5:B, 2ya6:A, 2ya6:B, 2ya7:A, 2ya7:B, 2ya7:C, 2ya7:D, 2ya8:A, 2ya8:B
4	4x47:A	489	483	0.4152	0.3804	0.3851	3.92e-86	4x49:A, 4x4a:A, 4x6k:A
5	1sli:A	679	481	0.3862	0.2548	0.3597	4.38e-73	2sli:A, 3sli:A, 4sli:A
6	2jkb:A	661	483	0.3326	0.2254	0.3085	3.91e-45	4fow:A, 4foy:A, 4fp2:A, 4fp3:A, 4fpc:A, 4fpe:A, 4fpf:A, 4fpg:A, 4fph:A, 4fpj:A, 4fpk:A, 4fpl:A, 4fpo:B, 4fpy:A, 4fq4:A, 2vw1:A, 2vw2:A, 4xe9:A, 4xhb:A, 4xhx:A, 4xil:A, 4xj9:A, 4xja:A, 4xju:A, 4xjw:A, 4xma:A, 4xog:A, 4xyx:A
7	5f9t:A	659	479	0.3371	0.2291	0.3152	2.63e-42	5f9t:B, 4yw1:A, 4yw1:B, 4yw2:A, 4yw2:B, 4yw3:A, 4yw3:B, 4yw5:A, 4yw5:B, 4yz2:A, 4yz2:B, 4yz3:A, 4yz3:B, 4yz4:A, 4yz4:B, 4yz5:A, 4yz5:B
8	7qxo:A	519	456	0.2522	0.2177	0.2478	1.64e-30	7qxo:B, 7qy8:A, 7qy8:B, 7qy9:A, 7qy9:B
9	6myv:C	526	263	0.1875	0.1597	0.3194	5.64e-25	6mrv:B, 6mrv:A, 6myv:A, 6myv:B, 6myv:D
10	6myv:C	526	360	0.1853	0.1578	0.2306	2.72e-07	6mrv:B, 6mrv:A, 6myv:A, 6myv:B, 6myv:D
11	2ber:A	601	268	0.1741	0.1298	0.2910	1.23e-20	2bzd:A, 2bzd:B, 2bzd:C, 1eus:A, 1euu:A, 1w8n:A, 1w8o:A, 1wcq:A, 1wcq:B, 1wcq:C
12	2ber:A	601	187	0.1161	0.0865	0.2781	1.63e-09	2bzd:A, 2bzd:B, 2bzd:C, 1eus:A, 1euu:A, 1w8n:A, 1w8o:A, 1wcq:A, 1wcq:B, 1wcq:C
13	7lbv:A	380	263	0.1540	0.1816	0.2624	6.09e-14
14	7lbv:A	380	207	0.1228	0.1447	0.2657	4.91e-07
15	8t26:A	504	204	0.1295	0.1151	0.2843	5.72e-13	8t1y:A, 8t1z:A, 8t24:A, 8t27:A
16	8t26:A	504	273	0.1607	0.1429	0.2637	3.13e-08	8t1y:A, 8t1z:A, 8t24:A, 8t27:A
17	2f25:A	373	275	0.1496	0.1796	0.2436	3.74e-12	2f0z:A, 2f10:A, 2f11:A, 2f12:A, 2f13:A, 2f25:B, 2f27:A, 2f27:B, 2f29:A, 2f29:B, 4nc5:A, 4ncs:A, 1vcu:A, 1vcu:B
18	7p1o:X	386	423	0.2254	0.2617	0.2388	8.46e-11	7p1d:A, 7p1e:A, 7p1f:B, 7p1f:A, 7p1o:A
19	2xzj:A	386	423	0.2076	0.2409	0.2199	1.80e-09	4m4v:A, 2xzi:A, 2xzi:B, 2xzj:B, 2xzk:A, 2xzk:B
20	7p1v:A	384	417	0.2232	0.2604	0.2398	1.81e-08	7p1q:A, 7p1r:A, 7p1r:B, 7p1r:C, 7p1r:D, 7p1s:A, 7p1s:B, 7p1s:C, 7p1s:D, 7p1u:A, 7p1u:B, 7p1v:B, 7p1v:C, 7p1v:D
21	1dil:A	381	96	0.0848	0.0997	0.3958	3.88e-08	7aey:AAA, 1dim:A, 2sim:A, 6tvi:AAA
22	3b69:A	626	258	0.1518	0.1086	0.2636	1.51e-06	2ah2:A, 1ms0:A, 1ms0:B, 1ms1:A, 1ms1:B, 1ms8:A, 1ms8:B, 1ms9:A, 1ms9:B, 3pjq:A, 1s0i:A, 1s0j:A
23	1kit:A	757	247	0.1406	0.0832	0.2551	3.29e-06	6eks:A, 6eku:A, 1w0o:A, 1w0p:A, 2w68:A, 2w68:B, 2w68:C
24	1kit:A	757	50	0.0402	0.0238	0.3600	3.1	6eks:A, 6eku:A, 1w0o:A, 1w0p:A, 2w68:A, 2w68:B, 2w68:C
25	8ul7:A	363	150	0.0960	0.1185	0.2867	2.67e-05	8ule:A, 8um0:A
26	8ul7:A	363	215	0.1339	0.1653	0.2791	1.99e-04	8ule:A, 8um0:A
27	2ags:A	634	197	0.1138	0.0804	0.2589	0.007	2a75:A, 2fhr:A, 1mz6:A, 1n1t:A, 1n1v:A, 1n1y:A
28	7aor:w	175	47	0.0357	0.0914	0.3404	5.4
29	3tu6:A	127	29	0.0268	0.0945	0.4138	5.9
30	5dfa:A	685	127	0.0625	0.0409	0.2205	6.2	5dfa:B, 5dfa:C, 4oif:A, 4oif:B, 4oif:C
31	2ydp:A	361	73	0.0469	0.0582	0.2877	8.7	5m1z:A, 2w5o:A, 2ydp:B, 2ydp:C, 2ydt:A
32	8bd3:2	222	46	0.0357	0.0721	0.3478	9.8	8bd3:4, 8bd3:G, 8bd3:q, 8bd3:9, 8bd3:g
33	3fby:A	535	92	0.0513	0.0430	0.2500	10.0	3fby:B, 3fby:C

[Back]