Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
VEDEPLLRENPRRFVVFPIEYHDIWQMYKKAEASFWTAEEVDLSKDIQHWEALKPDERHFISHVLAFFAASDGIVNENLV
ERFSQEVQVTEARCFYGFQIAMENIHSEMYSLLIDTYIKDPKEREYLFNAIETMPCVKKKADWALRWIGDKEATYGERVV
AFAAVEGIFFSGSFASIFWLKKRGLMPGLTFSNELISRDEGLHCDFACLMFKHLVHKPAEQRVREIITNAVRIEQEFLTE
ALPVKLIGMNCTLMKQYIEFVADRLMLELGFNKIFRVENPF

The query sequence (length=281) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 1h0n:A 288 281 1.0000 0.9757 1.0000 0.0 1h0o:A, 2uw2:A, 3vpm:A, 3vpm:B, 3vpn:A, 3vpn:B, 3vpo:A, 3vpo:B, 1w68:A, 1w69:A, 1xsm:A
2 3hf1:B 286 279 0.8114 0.7972 0.8172 3.70e-177 3hf1:A, 2vux:A
3 2vux:B 255 279 0.7402 0.8157 0.7455 4.44e-151
4 1jk0:A 334 281 0.6904 0.5808 0.6904 2.72e-145
5 2o1z:A 288 279 0.5801 0.5660 0.5842 5.11e-113 2o1z:B, 2p1i:A, 2p1i:B, 2p1i:C, 2p1i:D, 2p1i:E, 2p1i:F, 2p1i:G, 2p1i:H
6 6y2n:A 306 287 0.2883 0.2647 0.2822 2.09e-31
7 4d8f:B 334 288 0.2740 0.2305 0.2674 2.41e-29 2ani:A, 4d8f:A, 4d8f:C, 4d8f:D, 4d8g:A, 4d8g:B, 4d8g:C, 4d8g:D, 4m1i:A, 4m1i:B, 4m1i:C, 4m1i:D, 1syy:A
8 6zjk:A 317 260 0.1993 0.1767 0.2154 1.34e-15 6zjk:C, 6zjk:D, 6zjk:B
9 6w4x:C 375 323 0.2633 0.1973 0.2291 1.38e-12 7ai8:A, 7ai9:A, 2alx:A, 1av8:A, 1av8:B, 2av8:A, 2av8:B, 7bet:A, 1biq:A, 1biq:B, 5ci0:A, 5ci1:A, 5ci2:A, 5ci3:A, 5ci4:A, 5cns:E, 5cns:F, 5cns:G, 5cns:H, 5cnt:E, 5cnt:F, 5cnt:G, 5cnt:H, 5cnu:E, 5cnu:F, 5cnu:G, 5cnu:H, 5cnv:E, 5cnv:F, 5cnv:G, 5cnv:H, 4erm:E, 4erm:F, 4erm:G, 4erm:H, 4erp:E, 4erp:F, 4erp:G, 4erp:H, 1jpr:A, 1jpr:B, 1jqc:A, 1jqc:B, 1mrr:A, 1mrr:B, 1mxr:A, 1mxr:B, 1pfr:A, 1pfr:B, 1pim:A, 1pim:B, 1piu:A, 1piu:B, 1piy:A, 1piy:B, 1piz:A, 1piz:B, 1pj0:A, 1pj0:B, 1pj1:A, 1pj1:B, 1pm2:A, 1pm2:B, 1r65:A, 1r65:B, 1rib:A, 1rib:B, 1rnr:A, 1rnr:B, 1rsr:A, 1rsr:B, 1rsv:A, 1rsv:B, 3uus:E, 3uus:F, 3uus:G, 3uus:H, 6w4x:D, 1xik:A, 1xik:B, 2xof:A, 2xof:B, 1yfd:A, 1yfd:B
10 2rcc:C 311 263 0.2028 0.1833 0.2167 7.95e-12 2rcc:B
11 4dr0:B 291 272 0.2313 0.2234 0.2390 1.28e-10 4dr0:A
12 7aik:A 321 299 0.2171 0.1900 0.2040 7.40e-10 7ail:A, 7q39:AAA, 7q3c:AAA
13 4bmq:A 300 271 0.2278 0.2133 0.2362 1.11e-09 4bmo:A, 4bmp:A, 4bmr:A, 4bmr:B, 4bmt:A, 4bmt:B, 4bmu:A, 4bmu:B, 6qo7:A, 6qo7:B, 6qo8:A, 6qo8:B, 6qo9:A, 6qo9:B, 6qob:A, 6qob:B, 6tqv:A, 6tqv:B, 6tqw:A, 6tqw:B, 6tqy:A, 6tqy:B, 6tqz:A, 6tqz:B, 7z3d:A, 7z3e:A
14 4n83:A 285 255 0.1993 0.1965 0.2196 2.67e-09 4n83:B, 4n83:C, 4n83:D, 4n83:E, 4n83:F, 4n83:G, 4n83:H
15 6qrz:A 274 216 0.1957 0.2007 0.2546 6.84e-09
16 7mdi:E 353 315 0.2456 0.1955 0.2190 8.58e-09 7mdi:G, 7mdi:F, 7mdi:H
17 2bq1:I 294 260 0.1993 0.1905 0.2154 1.02e-07 2bq1:J, 1r2f:A, 1r2f:B, 2r2f:A, 2r2f:B
18 1oqu:C 302 200 0.1530 0.1424 0.2150 5.13e-07 3dhz:A, 3dhz:B, 1kgn:A, 1kgn:B, 1kgn:C, 1kgn:D, 1kgo:A, 1kgo:B, 1kgo:C, 1kgo:D, 1kgp:A, 1kgp:B, 1kgp:C, 1kgp:D, 3mjo:A, 3mjo:B, 1oqu:A, 1oqu:B, 1oqu:D
19 7mms:D 320 247 0.1708 0.1500 0.1943 4.03e-06 6ebo:A, 6ebo:B, 6ebo:C, 6ebo:D, 6ebp:A, 6ebp:B, 6ebp:C, 6ebp:D, 6ebz:A, 6ebz:B, 6ebz:C, 6ebz:D, 7mmp:A, 7mmp:C, 7mmp:B, 7mmq:A, 7mmq:C, 7mmq:B, 7mmr:A, 7mmr:B, 7mmr:C, 7mmr:D, 7mms:A, 7mms:B, 7mms:C, 7mmw:A, 7mmw:B
20 6gp2:A 318 202 0.1459 0.1289 0.2030 1.68e-05 8bt4:A, 8bt4:B, 6gp2:B, 6gp3:A, 6gp3:B
21 7qbk:A 284 203 0.1673 0.1655 0.2315 3.20e-05
22 4ac8:A 311 234 0.2064 0.1865 0.2479 5.82e-05 4ac8:B, 4ac8:C, 4ac8:D, 3ee4:A
23 7qbp:A 291 217 0.1637 0.1581 0.2120 6.36e-05
24 3n37:A 284 257 0.1744 0.1725 0.1907 4.66e-04 3n38:A, 3n39:B, 3n39:A, 3n3a:B, 3n3a:A, 3n3b:B, 3n3b:A
25 6cwq:A 308 242 0.1779 0.1623 0.2066 0.007 6cwo:A, 6cwo:B, 6cwp:B, 6cwp:A, 6cwq:B, 8dq4:A, 8dq4:B, 8dq5:A
26 8any:5 394 114 0.0996 0.0711 0.2456 0.036 7a5f:53, 7a5g:53, 7a5h:5, 7a5i:53, 7a5j:5, 7a5k:53, 6i9r:5, 3j7y:5, 3j9m:5, 8k2a:Lk, 8k2b:Lk, 7l08:5, 7l20:5, 6nu2:5, 6nu3:5, 7o9k:5, 7o9m:5, 7odr:5, 7ods:5, 7odt:5, 7of0:5, 7of2:5, 7of3:5, 7of4:5, 7of5:5, 7of6:5, 7of7:5, 7og4:5, 7oi6:5, 7oi7:5, 7oi8:5, 7oi9:5, 7oia:5, 7oib:5, 7oic:5, 7oid:5, 7oie:5, 8oir:Bm, 8oit:Bm, 5ool:5, 5oom:5, 7pd3:5, 8pk0:5, 7po4:5, 7qh6:5, 7qh7:5, 7qi4:5, 7qi5:5, 7qi6:5, 8qsj:5, 8qu1:5, 8qu5:5, 6vlz:5, 6vmi:5, 8xt0:Lk, 8xt1:Lk, 8xt2:Lk, 8xt3:Lk, 6zm5:5, 6zm6:5, 6zs9:5, 6zsa:5, 6zsb:5, 6zsc:5, 6zsd:5, 6zse:5, 6zsg:5
27 5dcs:A 287 212 0.1601 0.1568 0.2123 0.054 5dco:A, 5dcr:A, 5ekb:A, 6f65:A, 6f6b:A, 6f6c:A, 6f6c:B, 6f6e:A, 6f6e:B, 6f6f:A, 6f6g:A, 6f6g:B, 6f6h:A, 6f6h:B, 6f6k:A, 6f6k:B, 6f6l:A, 6f6l:B, 6f6m:A, 6f6m:B, 4hr0:A, 4hr4:A, 6i90:A, 6i92:A, 6i93:A, 6i94:A, 6i95:A, 5omj:A, 5omk:A, 6qjv:A, 6qk0:A, 6qk0:B, 6qk1:A, 6qk2:A, 6qk2:B, 4xb9:A, 4xbv:A, 4xbv:B, 4xbw:A
28 3qcp:A 410 168 0.1530 0.1049 0.2560 0.063 3qd9:A, 3qd9:B, 3qd9:C, 3qd9:D
29 5olk:A 395 204 0.1388 0.0987 0.1912 0.082 5olk:B, 5olk:C, 5olk:D, 6sf5:A, 6sf5:B
30 8dq5:B 265 198 0.1530 0.1623 0.2172 0.18
31 8dq3:D 297 284 0.2242 0.2121 0.2218 0.48 8dq3:A, 8dq3:B, 8dq3:C
32 6ftl:A 482 37 0.0427 0.0249 0.3243 1.9 6ftl:C, 6ftl:E, 6ftl:G, 5mz2:A, 5mz2:B, 5mz2:C, 5mz2:D, 5mz2:H, 5mz2:G, 5mz2:F, 5mz2:E, 5n9z:A, 5n9z:B, 5n9z:H, 5n9z:G, 5n9z:F, 5n9z:E, 5n9z:D, 5n9z:C, 5oya:A, 5oya:B, 5oya:C, 5oya:D, 5oya:E, 5oya:F, 5oya:G, 5oya:H, 7yk5:G, 7yk5:F, 7yk5:E, 7yk5:D, 7yk5:C, 7yk5:B, 7yk5:A, 7yk5:H
33 8fkb:A 424 89 0.0819 0.0542 0.2584 4.7 6cvc:A, 8fjo:A, 8flo:A, 8gdi:A
34 6sy0:A 137 54 0.0605 0.1241 0.3148 8.3 6sy0:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218