Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
VEAKSRIAVVGGGGSGSVAAWLLARRHDVTLFEADEYLGGHAYSHPVETDQGTLHVDMGVEHFNEKLSPNLFRLLTDFGI
GTYVAPSSVHVDFPGEQQSWNNLDFLGELREELHEEFDRFHQEMNQLPTSKQMSIGEYLDKHGYSKSFKYKAMNPILSIY
SGCHAPSLDYNLMYVALSFSMNLLSFFSAGYWRKAQGGIHSYLARIESDLGERVRLNTPVEAVVPTQSGVTVLAGGQEHH
FDQVVFATHADVTLRLLRTSDQQYRDLLGDFAYVPVESVLHQDESWLSPAGGGAYCQFRMPEGFELARAEEQMGSLTRNC
NVLHPYRKVSSPILITFDPQEDVDPERVIVRREWKLPQLRPVDVRRKKRLHEIQGLNGLWFCGTDTSVTGHEGAIVSGMV
IADRLGVPHPFPDDAPAAAQFRGIKEFMGV

The query sequence (length=430) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 6f32:A 434 431 1.0000 0.9908 0.9977 0.0 6f32:B, 6f7l:A, 6f7l:B, 6f7v:A, 6f7v:B, 6fjh:A, 6fjh:B
2 2z5x:A 513 260 0.1581 0.1326 0.2615 6.46e-07 2bxr:A, 2bxr:B, 2bxs:A, 2bxs:B, 2z5y:A
3 1o5w:C 512 271 0.1558 0.1309 0.2472 1.02e-06 1o5w:A, 1o5w:B, 1o5w:D
4 2yg3:B 450 258 0.1605 0.1533 0.2674 5.20e-06 2yg3:A, 2yg4:A, 2yg4:B, 2yg5:A, 2yg6:A, 2yg6:B, 2yg7:A, 2yg7:B
5 6fvz:A 500 264 0.1628 0.1400 0.2652 2.48e-05 4a79:A, 4a79:B, 4a7a:A, 4a7a:B, 7b0v:A, 7b0v:B, 7b0z:A, 7b0z:B, 2bk3:A, 2bk3:B, 2bk4:A, 2bk4:B, 2bk5:A, 2bk5:B, 2byb:A, 2byb:B, 2c64:A, 2c64:B, 2c65:A, 2c65:B, 2c66:A, 2c66:B, 2c67:A, 2c67:B, 2c70:A, 2c70:B, 2c72:A, 2c72:B, 2c73:A, 2c73:B, 2c75:A, 2c75:B, 2c76:A, 2c76:B, 4crt:A, 4crt:B, 6fvz:B, 6fw0:A, 6fw0:B, 6fwc:A, 6fwc:B, 1gos:A, 1gos:B, 5mrl:A, 5mrl:B, 1oj9:A, 1oj9:B, 1oja:A, 1oja:B, 1ojc:A, 1ojc:B, 1ojd:A, 1ojd:B, 1ojd:C, 1ojd:D, 1ojd:E, 1ojd:F, 1ojd:G, 1ojd:H, 1ojd:I, 1ojd:L, 7p4f:A, 7p4f:B, 7p4h:A, 7p4h:B, 3po7:A, 3po7:B, 6rkb:A, 6rkb:B, 6rkp:A, 6rkp:B, 6rle:A, 6rle:B, 1s2q:A, 1s2q:B, 1s2y:A, 1s2y:B, 1s3b:A, 1s3b:B, 1s3e:A, 1s3e:B, 2v5z:A, 2v5z:B, 2v60:A, 2v60:B, 2v61:A, 2v61:B, 2vrl:A, 2vrl:B, 2vrm:A, 2vrm:B, 2vz2:A, 2vz2:B, 2xcg:A, 2xcg:B, 2xfn:A, 2xfn:B, 2xfo:A, 2xfo:B, 2xfp:A, 2xfp:B, 2xfq:A, 2xfq:B, 2xfu:A, 2xfu:B, 6yt2:A, 6yt2:B, 7zw3:AAA, 7zw3:BBB, 3zyx:A, 3zyx:B
6 6cr0:A 430 250 0.1535 0.1535 0.2640 6.90e-05
7 4iv9:A 552 125 0.0884 0.0688 0.3040 1.07e-04 4iv9:B
8 8i6i:A 448 305 0.1721 0.1652 0.2426 1.72e-04 8i6i:C
9 7u6l:D 436 357 0.1977 0.1950 0.2381 0.003 7e7h:A, 7e7h:B, 7u6l:A, 7u6l:B, 7u6l:C
10 6lqc:A 450 307 0.1721 0.1644 0.2410 0.014 6lql:A
11 3ng7:X 427 98 0.0837 0.0843 0.3673 0.015 3k7m:X, 3k7q:X, 3k7t:A, 3k7t:B, 3ngc:X, 3nh3:X, 3nho:X, 3nk0:X, 3nk1:X, 3nk2:X, 3nn0:X, 3nn6:X
12 7rt0:A 385 97 0.0581 0.0649 0.2577 0.023
13 4oi6:B 81 56 0.0442 0.2346 0.3393 0.039
14 5z2g:A 477 54 0.0512 0.0461 0.4074 0.041 5z2g:B
15 8jhe:A 508 44 0.0419 0.0354 0.4091 0.076 8jhe:B, 8jhe:C, 8jhe:D
16 5ts5:A 483 46 0.0442 0.0393 0.4130 0.078 4e0v:A, 4e0v:B, 5ts5:B, 5ts5:C, 5ts5:D
17 2ive:A 451 381 0.2047 0.1951 0.2310 0.079 2ivd:A, 2ivd:B, 2ive:B
18 3kve:A 484 40 0.0442 0.0393 0.4750 0.17 3kve:B, 3kve:C, 3kve:D
19 1gth:A 1019 43 0.0395 0.0167 0.3953 0.27 8f5w:A, 8f5w:B, 8f5w:C, 8f5w:D, 8f61:A, 8f61:B, 8f61:C, 8f61:D, 8f6n:A, 8f6n:B, 8f6n:C, 8f6n:D, 1gt8:A, 1gt8:B, 1gt8:C, 1gt8:D, 1gte:A, 1gte:B, 1gte:C, 1gte:D, 1gth:B, 1gth:C, 1gth:D, 1h7w:A, 1h7w:B, 1h7w:C, 1h7w:D, 1h7x:A, 1h7x:B, 1h7x:C, 1h7x:D, 7ljs:A, 7ljs:B, 7ljs:C, 7ljs:D, 7ljt:A, 7ljt:B, 7ljt:C, 7ljt:D, 7lju:A, 7lju:C, 7lju:D, 7lju:B, 7m31:A, 7m31:B, 7m31:C, 7m31:D, 7m32:A, 7m32:B, 7m32:C, 7m32:D
20 7rk0:B 262 79 0.0558 0.0916 0.3038 0.30 7rk0:A, 7rk0:C, 7rk0:D
21 7d9f:A 591 102 0.0698 0.0508 0.2941 0.31 7d9f:B, 7d9g:A, 7d9g:B, 7d9h:A, 7d9h:B, 7d9i:A, 7d9i:B, 7d9j:A, 7d9j:B
22 2i0z:A 416 56 0.0465 0.0481 0.3571 0.42
23 3i3l:A 550 32 0.0349 0.0273 0.4688 0.46
24 6qkg:B 664 39 0.0419 0.0271 0.4615 0.54 6qkg:A, 6qkr:A, 6qkr:B, 6qkx:A
25 8oh5:C 1172 36 0.0395 0.0145 0.4722 0.56 8oh5:F, 8oh5:I, 8oh5:L, 8oh9:C, 8oh9:F, 8oh9:I, 8oh9:L
26 3rha:A 459 255 0.1279 0.1198 0.2157 0.68 3rha:B
27 7og2:A 622 49 0.0395 0.0273 0.3469 0.74 7og2:B
28 1reo:A 484 61 0.0488 0.0434 0.3443 0.80 1tdk:A, 1tdn:A, 1tdo:A
29 5x68:B 354 34 0.0326 0.0395 0.4118 0.84 5x68:A
30 8t8a:A 583 42 0.0349 0.0257 0.3571 0.88 8jt7:A, 8t8a:B, 8t8a:C, 8t8a:D
31 5nrl:A 2216 31 0.0302 0.0059 0.4194 1.3 6bk8:A, 6exn:A, 7fju:A, 7fjv:A, 7fjw:A, 7fjy:A, 7fjz:A, 7fk1:A, 7fk2:A, 7fk3:A, 7fk4:A, 7fk6:A, 7fka:A, 7fkh:A, 7fkj:A, 7fkk:A, 7fkl:A, 7fkn:A, 7fko:A, 7fkp:A, 7fkr:A, 7fkt:A, 7fkv:A, 7fkw:A, 7fkx:A, 7fl1:A, 7fl3:A, 7fl6:A, 7fl9:A, 7fla:A, 7fld:A, 7fle:A, 7flf:A, 7flg:A, 7fli:A, 7flk:A, 7fll:A, 7flm:A, 7flp:A, 7flr:A, 7flu:A, 7flx:A, 7fly:A, 7fm7:A, 7fmb:A, 7fmf:A, 7fmg:A, 7fmi:A, 7fmk:A, 7fml:A, 7fmo:A, 7fmq:A, 7fms:A, 7fmx:A, 7fmy:A, 7fn1:A, 7fn2:A, 7fn4:A, 7fne:A, 7fno:A, 7fnq:A, 7fns:A, 7fnu:A, 7fny:A, 7fo3:A, 7fo4:A, 7fo6:A, 7fo8:A, 7fok:A, 7fol:A, 7fon:A, 7foo:A, 7foq:A, 7for:A, 7foy:A, 7fp0:A, 7fp1:A, 7fp2:A, 7fp3:A, 7fp8:A, 7fpb:A, 7fpd:A, 7fpj:A, 5gap:A, 5lj3:A, 5qy4:A, 5qy6:A, 5qy8:A, 5qy9:A, 5qya:A, 5qyb:A, 5qyc:A, 5qyd:A, 5qye:A, 5qyg:A, 5qyh:A, 5r0b:A, 5r0d:A, 5r0e:A, 5r0f:A, 5r0g:A, 5r0h:A, 5r0i:A, 5r0j:A, 5r0l:A, 5r0m:A, 5st1:A, 5st3:A, 5st9:A, 5stb:A, 5stc:A, 5stn:A, 5stq:A, 5str:A, 5stu:A, 5stz:A, 5su4:A, 5su6:A, 5su8:A, 5sub:A, 5suc:A, 5sue:A, 5sug:A, 5wsg:A, 5ylz:A
32 6j6g:A 1913 31 0.0302 0.0068 0.4194 1.3 5gmk:A, 6j6h:A, 6j6n:A, 6j6q:A, 5y88:A
33 7dco:A 2205 31 0.0302 0.0059 0.4194 1.4 7b9v:A, 5gm6:A, 3jcm:A, 5lj5:A, 5zwm:A, 5zwo:A
34 1ps9:A 671 39 0.0419 0.0268 0.4615 1.7
35 7c4k:A 614 51 0.0395 0.0277 0.3333 1.7 7c4l:A, 7c4m:A, 7c4n:A
36 6c71:B 440 259 0.1465 0.1432 0.2432 2.1 7c49:A, 7c49:B, 7c4a:A, 7c4a:B, 6c71:A, 6c71:C, 6c71:D, 8dq7:A, 8dq7:B, 8dq8:A, 8dq8:B, 8dsv:A, 8dsv:B, 7khn:A, 7kho:A, 7kho:B, 7kho:C, 5ttj:A, 5ttj:B, 5ttk:A, 5ttk:B, 5ttk:C, 5ttk:D
37 7eih:A 588 44 0.0349 0.0255 0.3409 2.2 7eih:B, 7eii:A, 7eii:B, 7eij:A, 7eij:B
38 3k30:A 684 41 0.0465 0.0292 0.4878 2.8 3k30:B
39 1sez:A 465 41 0.0442 0.0409 0.4634 3.4 1sez:B
40 2bi7:A 383 40 0.0326 0.0366 0.3500 3.5 2bi8:A, 3gf4:A, 3gf4:B, 3inr:A, 3inr:B, 3int:A, 3int:B, 3kyb:A, 3kyb:B, 1wam:A
41 1f8r:A 483 61 0.0442 0.0393 0.3115 4.1 1f8r:B, 1f8r:C, 1f8r:D, 1f8s:A, 1f8s:B, 1f8s:C, 1f8s:D, 1f8s:E, 1f8s:F, 1f8s:G, 1f8s:H, 2iid:A, 2iid:B, 2iid:C, 2iid:D
42 7kho:D 405 61 0.0395 0.0420 0.2787 4.3
43 8eeg:B 440 95 0.0674 0.0659 0.3053 4.5 8eef:A, 8eef:B, 8eeg:A, 8eeh:A, 8eeh:B, 8eei:A, 8eei:B, 8eej:B, 8eej:A, 8eek:A, 8eek:B, 8eel:A, 8eel:B, 8eem:A, 8eem:B, 8een:B, 8een:A, 8eeo:A, 8eeo:B
44 8syd:B 371 92 0.0558 0.0647 0.2609 4.8 8sxy:A, 8sxy:B, 8sy0:A, 8sy0:B, 8sy9:A, 8sy9:B, 8sya:A, 8sya:B, 8syb:A, 8syb:B, 8syd:A, 8sye:A, 8sye:B, 8syh:A, 8syh:B
45 8gu0:B 450 38 0.0395 0.0378 0.4474 5.2 8gu0:A
46 3gp8:A 551 35 0.0326 0.0254 0.4000 7.1 3gpl:A, 3gpl:B
47 7btb:X 141 36 0.0279 0.0851 0.3333 8.8 8aaf:K, 8agt:K, 8agu:K, 8agv:K, 8agw:K, 8agx:K, 8agz:K, 5apn:X, 5apo:X, 7azy:I, 7b7d:LT, 8bip:LX, 8bjq:LX, 8bn3:N5, 8bqd:AH, 8bqx:AH, 7bt6:X, 6cb1:X, 8ccs:J, 8cdl:J, 8cdr:J, 8ceh:J, 8cf5:J, 8cg8:J, 8cgn:J, 8civ:J, 8cku:J, 8cmj:J, 5dat:N5, 5dat:n5, 5dc3:N5, 5dc3:n5, 5dge:N5, 5dge:n5, 5dgf:N5, 5dgf:n5, 5dgv:N5, 5dgv:n5, 6elz:X, 6em5:X, 8eub:AX, 8evp:AX, 8evq:AX, 8evr:AX, 8evs:AX, 8evt:AX, 8ewb:AX, 8ewc:AX, 5fci:N5, 5fci:n5, 5fcj:N5, 5fcj:n5, 6ft6:X, 5gak:Z, 6gq1:X, 6gqb:X, 6gqv:X, 5h4p:X, 6hd7:Z, 8hfr:Xc, 6hhq:8, 6hhq:CZ, 5i4l:N5, 5i4l:n5, 6i7o:AH, 6i7o:XH, 5it7:XX, 3j6x:65, 3j6y:65, 3j77:75, 3j78:75, 3jct:X, 5jcs:X, 5juo:CA, 5jup:CA, 5jus:CA, 5jut:CA, 5juu:CA, 8k2d:LX, 8k82:LX, 5lyb:N5, 5lyb:n5, 5m1j:X5, 6m62:X, 5mc6:AH, 5mei:8, 5mei:CZ, 7mpi:AX, 7mpj:AX, 6n8j:X, 6n8k:X, 6n8l:X, 6n8m:k, 6n8n:k, 6n8o:k, 7n8b:AX, 7nac:X, 5ndg:N5, 5ndg:n5, 5ndv:N5, 5ndv:n5, 5ndw:N5, 5ndw:n5, 7nrc:LZ, 7nrd:LZ, 5obm:N5, 5obm:n5, 7of1:X, 7oh3:X, 7ohq:X, 7ohr:X, 7ohv:X, 6oig:X, 5on6:8, 5on6:CZ, 7osa:uL23, 7osm:uL23, 8p8m:QX, 8p8n:QX, 8p8u:QX, 8pfr:QX, 6q8y:AH, 6qik:W, 6qt0:W, 6qtz:W, 7r7a:X, 6r84:Z, 6r86:Z, 6r87:Z, 6ri5:W, 7rr5:LX, 6rzz:W, 6s05:W, 6s47:AZ, 6snt:as, 6sv4:AH, 6sv4:XH, 6sv4:zH, 6t4q:LX, 5t62:k, 5t6r:k, 6t7i:LX, 6t7t:LX, 6t83:Xy, 6t83:I, 5tbw:8, 5tbw:CZ, 6tb3:AH, 5tga:N5, 5tga:n5, 5tgm:N5, 5tgm:n5, 6tnu:AH, 7too:AL25, 7top:AL25, 7u0h:X, 4u3m:N5, 4u3m:n5, 4u3n:N5, 4u3n:n5, 4u3u:N5, 4u3u:n5, 4u4n:N5, 4u4n:n5, 4u4o:N5, 4u4o:n5, 4u4q:N5, 4u4q:n5, 4u4r:N5, 4u4r:n5, 4u4u:N5, 4u4u:n5, 4u4y:N5, 4u4y:n5, 4u4z:N5, 4u4z:n5, 4u50:N5, 4u50:n5, 4u51:N5, 4u51:n5, 4u52:N5, 4u52:n5, 4u53:N5, 4u53:n5, 4u55:N5, 4u55:n5, 4u56:N5, 4u56:n5, 4u6f:N5, 4u6f:n5, 7ug6:X, 7uoo:X, 7uqb:X, 7uqz:X, 6uz7:AX, 7v08:X, 4v4b:BT, 4v6i:BX, 4v7f:W, 4v7h:BT, 4v7r:BW, 4v7r:DW, 4v88:BX, 4v88:DX, 4v8t:X, 4v8y:BX, 4v8z:BX, 8v87:X, 4v91:X, 6woo:X, 2ww9:K, 2wwa:K, 2wwb:K, 6xiq:X, 6xir:X, 8y0u:LX, 6ylg:X, 6ylh:X, 6ylx:X, 6yly:X, 7z34:X, 6z6j:LX, 6z6k:LX, 7zpq:BW, 7zrs:BW, 7zs5:BY, 7zuw:BW, 7zux:EW, 7zw0:La
48 5buk:A 434 37 0.0349 0.0346 0.4054 9.7 5buk:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218