Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
VEAFCATWKLTNSQNFDEYMKALGVGFATRQVGNVTKPTVIISQEGDKVVIRTLSTFKNTEISFQLGEEFDETTADDRNC
KSVVSLDGDKLVHIQKWDGKETNFVREIKDGKMVMTLTFGDVVAVRHYEKA

The query sequence (length=131) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 7e25:A 139 131 1.0000 0.9424 1.0000 2.54e-95 1fdq:A, 1fdq:B, 1fe3:A, 8ivf:B, 8ivf:A, 8ivl:A, 5ura:A, 5ura:B, 5ura:C, 5ura:D
2 5hz9:A 135 130 0.6641 0.6444 0.6692 9.90e-63 5ce4:A, 7ego:A, 7euv:A, 7euw:A, 7fbf:A, 7fbm:A, 7fc4:A, 7fcg:A, 7fcx:A, 7fd7:A, 7fdt:A, 7fdu:A, 7fdx:A, 7fek:A, 7feu:A, 7fez:A, 7ff6:A, 7ffx:A, 7fg1:A, 8gew:A, 1hmr:A, 5hz9:G, 5hz9:B, 5hz9:C, 5hz9:D, 5hz9:E, 5hz9:F, 5hz9:H, 4tkj:A, 7v5u:A, 7vb1:A, 3wbg:A, 3wbg:B, 3wbg:C, 3wbg:D, 4wbk:A, 7wci:A, 7wd6:A, 7wdj:A, 7wj1:A, 7wkb:A, 7wkg:A, 7wom:A, 7wpg:A, 7wpu:A, 7wpw:A, 7wq7:A, 7x48:A, 7x4j:A, 7x50:A, 7xbc:A, 7xhm:A, 7xhu:A
3 4bvm:A 133 127 0.5878 0.5789 0.6063 1.16e-52 5n4m:A, 5n4p:A, 5n4q:A, 7nrw:A, 7nsr:A, 1pmp:A, 1pmp:B, 1pmp:C, 6s2m:A, 6s2s:A
4 1yiv:A 131 127 0.5878 0.5878 0.6063 1.22e-52
5 3p6d:A 139 130 0.5649 0.5324 0.5692 6.15e-50 1adl:A, 2ans:A, 2ans:B, 6ayl:A, 5d45:A, 5d47:A, 5d48:A, 5d4a:A, 5edb:A, 5edc:A, 3fr2:A, 3fr4:A, 3fr5:A, 7fvu:A, 7fvv:A, 7fvw:A, 7fvx:A, 7fvy:A, 7fvz:A, 7fw0:A, 7fw1:A, 7fw2:A, 7fw3:A, 7fw6:A, 7fw7:A, 7fw8:A, 7fw9:A, 7fwa:A, 7fwb:A, 7fwc:A, 7fwd:A, 7fwe:A, 7fwf:A, 7fwg:A, 7fwh:A, 7fwj:A, 7fwk:A, 7fwl:A, 7fwm:A, 7fwn:A, 7fwo:A, 7fwp:A, 7fwq:A, 7fwr:A, 7fws:A, 7fwu:A, 7fwv:A, 7fww:A, 7fwx:A, 7fwy:A, 7fwz:A, 7fx0:A, 7fx1:A, 7fx2:A, 7fx4:A, 7fx5:A, 7fx6:A, 7fx7:A, 7fx8:A, 7fx9:A, 7fxa:A, 7fxb:A, 7fxc:A, 7fxe:A, 7fxf:A, 7fxg:A, 7fxh:A, 7fxi:A, 7fxj:A, 7fxk:A, 7fxm:A, 7fxn:A, 7fxp:A, 7fxq:A, 7fxr:A, 7fxs:A, 7fxt:A, 7fxu:A, 7fxv:A, 7fxw:A, 7fxx:A, 7fxy:A, 7fxz:A, 7fy2:A, 7fy4:A, 7fy5:A, 7fy6:A, 7fy7:A, 7fy9:A, 7fyb:A, 7fyc:A, 7fye:A, 7fyf:A, 7fyg:A, 7fyh:A, 7fyi:A, 7fyj:A, 7fyj:B, 7fyk:A, 7fyl:A, 7fym:A, 7fyo:A, 7fyp:A, 7fyq:A, 7fyr:A, 7fys:A, 7fyt:A, 7fyu:A, 7fyv:A, 7fyx:A, 7fyy:A, 7fyz:A, 7fz0:A, 7fz1:A, 7fz2:A, 7fz3:A, 7fz4:A, 7fz5:A, 7fz6:A, 7fz7:A, 7fz8:A, 7fz9:A, 7fzb:A, 7fzc:A, 7fzd:A, 7fzf:A, 7fzh:A, 7fzi:A, 7fzj:A, 7fzl:A, 7fzm:A, 7fzn:A, 7fzo:A, 7fzp:A, 7fzr:A, 7fzs:A, 7fzt:A, 7fzu:A, 7fzv:A, 7fzv:B, 7fzw:A, 7fzx:A, 7fzy:A, 7fzz:A, 7g02:A, 7g03:A, 7g05:A, 7g06:A, 7g07:A, 7g08:A, 7g09:A, 7g0a:A, 7g0c:A, 7g0f:A, 7g0g:A, 7g0h:A, 7g0i:A, 7g0j:A, 7g0k:A, 7g0l:A, 7g0m:A, 7g0o:A, 7g0p:A, 7g0q:A, 7g0r:A, 7g0s:A, 7g0t:A, 7g0u:A, 7g0v:A, 7g0x:A, 7g0y:A, 7g0z:A, 7g10:A, 7g11:A, 7g12:A, 7g13:A, 7g14:A, 7g15:A, 7g16:A, 7g17:A, 7g18:A, 7g19:A, 7g1a:A, 7g1b:A, 7g1c:A, 7g1d:A, 7g1e:A, 7g1f:A, 7g1g:A, 7g1h:A, 7g1i:A, 7g1j:A, 7g1k:A, 7g1l:A, 7g1m:A, 7g1n:A, 7g1o:A, 7g1p:A, 7g1r:A, 7g1s:A, 7g1t:A, 7g1u:A, 7g1v:A, 7g1w:A, 7g1y:A, 7g1z:A, 7g20:A, 7g21:A, 1g74:A, 3hk1:A, 5hz6:A, 5hz8:A, 3jsq:A, 1lic:A, 1lid:A, 1lif:A, 6ljs:A, 6ljt:A, 6lju:A, 6ljv:A, 6ljw:A, 6ljx:A, 2nnq:A, 4nnt:A, 3p6e:A, 3p6f:A, 3p6g:A, 3p6h:A, 2q9s:A, 2qm9:B, 8s1k:A, 1tou:A, 1tow:A, 7wc3:A, 8wdx:A, 8we3:A, 5y0f:A, 5y0g:A, 5y0x:A, 5y12:A, 5y13:A
6 2qm9:A 139 130 0.5649 0.5324 0.5692 4.22e-49
7 5bvs:A 132 130 0.5573 0.5530 0.5615 2.28e-48 5bvs:B
8 4i3b:A 139 136 0.5725 0.5396 0.5515 3.26e-46 4i3b:B, 4i3b:C, 4i3b:D, 4i3b:E, 4i3b:F, 4i3c:A, 4i3c:B, 4i3d:A, 4i3d:B, 4i3d:C, 4i3d:D
9 5ur9:F 138 123 0.4427 0.4203 0.4715 7.36e-37 4azm:A, 4azm:B, 4azr:A, 4azr:B, 7fwi:A, 7fwi:C, 7fxd:A, 7fy0:A, 7fyd:A, 7g01:A, 7g04:B, 7g0b:A, 7g0e:A, 7g1q:A, 5hz5:A, 4lkt:A, 4lkt:B, 4lkt:C, 4lkt:D, 5ur9:A, 5ur9:B, 5ur9:G, 5ur9:C, 5ur9:E, 5ur9:D, 5ur9:H
10 1vyf:A 135 131 0.4656 0.4519 0.4656 5.84e-35 1vyg:A
11 4azq:A 136 123 0.4122 0.3971 0.4390 1.13e-34 4azp:A
12 3ppt:A 133 127 0.4351 0.4286 0.4488 9.09e-34 3pp6:A, 3pp6:B, 3pp6:C
13 7ry5:BBB 143 132 0.4351 0.3986 0.4318 5.14e-29 7aa0:BBB, 7aa0:AAA, 7aa1:AAA, 1cbq:A, 1cbs:A, 2cbs:A, 3cbs:A, 3cr6:A, 3cwk:A, 3f8a:A, 3f9d:A, 3f9d:B, 3fa6:A, 3fa6:B, 3fep:A, 2fr3:A, 2g78:A, 2g79:A, 2g7b:A, 6hkr:A, 5hzq:A, 5hzq:B, 4i9r:A, 4i9s:A, 4m6s:A, 4m7m:A, 6mop:A, 6moq:A, 6mor:A, 6mov:A, 6mox:A, 6mpk:A, 6mqi:A, 6mqj:A, 6mqw:A, 6mqx:A, 6mqy:A, 6mqz:A, 6mr0:A, 6nnx:A, 6nny:A, 6noe:A, 5ogb:A, 4qgv:A, 4qgw:A, 4qgx:A, 7ry5:AAA, 4ybp:A, 4ybu:A, 4yce:A, 4ych:A, 4yda:A, 4ydb:A, 4yfp:A, 4yfq:A, 4yfr:A, 4ygg:A, 4ygh:A, 4ygz:A, 4yh0:A, 4ykm:A, 4ykm:B, 4yko:A, 4yko:B, 6z2z:A, 6zsw:A, 6zsx:A
14 7a9y:AAA 137 131 0.3893 0.3723 0.3893 2.43e-28 7a9z:AAA, 1cbr:A, 1cbr:B, 2cbr:A
15 1o8v:A 133 131 0.4046 0.3985 0.4046 1.64e-27
16 6e5l:A 140 130 0.3893 0.3643 0.3923 3.98e-27 1crb:A, 6e5t:A, 6e6m:A, 6e6m:B, 6e6m:C, 8gd2:B, 8gdm:A, 8gem:B, 8geu:A, 8gev:B, 8gey:B, 5h8t:A, 5ha1:A, 5hbs:A, 1kgl:A, 5ljb:A, 5ljc:A, 5ljd:A, 5lje:A, 1mx8:A
17 6e6k:A 134 128 0.3740 0.3657 0.3828 2.44e-25
18 1kqw:A 134 95 0.3588 0.3507 0.4947 5.28e-25
19 2rct:A 141 127 0.3664 0.3404 0.3780 7.28e-24 6bth:A, 6bth:B, 6bti:A, 6bti:B, 6c7z:A, 6c7z:B, 8d6h:A, 8d6l:A, 8d6n:A, 8db2:A, 8dn1:A, 6e5s:A, 6e5s:C, 6e5s:G, 6e5s:I, 6e5s:F, 6e5s:H, 6e5s:B, 6e5s:J, 6e5s:D, 6e5s:K, 6e5s:E, 6e5s:L, 6e6l:A, 6e7m:B, 6e7m:D, 4ede:A, 4ede:B, 4eej:A, 4eej:B, 4efg:A, 4efg:B, 4exz:A, 4exz:B, 5f58:A, 5f58:B, 5f6b:A, 5f6b:B, 5f7g:A, 5f7g:B, 5faz:A, 5faz:B, 5fen:A, 5fen:B, 5ffh:A, 5ffh:B, 4gkc:A, 4gkc:B, 7jvy:A, 7jvy:B, 7jwd:A, 7jwd:B, 7jwr:A, 7jwr:B, 7jx2:A, 7jz5:A, 7jz5:B, 7k3i:A, 7lhj:A, 7lhj:B, 7lhm:A, 7lhm:B, 7lhn:A, 7lhn:B, 7lho:A, 7lho:B, 7lsq:A, 7lsq:B, 7lsq:C, 6mcu:F, 6mcu:G, 6mcu:E, 6mcu:H, 6mcu:J, 6mcu:K, 7mfx:A, 7mfx:B, 7mfx:C, 7mfx:D, 7mfy:A, 7mfz:A, 7mfz:B, 7mfz:C, 6mkv:B, 6mkv:D, 6mkv:A, 6mkv:C, 6mlb:A, 6mlb:C, 6mlb:B, 6mlb:D, 6on5:A, 1opb:A, 1opb:B, 1opb:C, 1opb:D, 4qyn:A, 4qyn:B, 4qyp:A, 4qyp:B, 4qyp:C, 4qzt:A, 4qzt:C, 4qzu:A, 4qzu:C, 4qzu:B, 4ruu:A, 5u6g:A, 5u6g:F, 5u6g:B, 5u6g:E, 5u6g:C, 5u6g:G, 5u6g:D, 5u6g:H, 5u6g:I, 5u6g:K, 5u6g:J, 5u6g:L, 8vzx:C, 8vzx:D, 8vzy:A, 8vzz:A, 8vzz:B, 8w00:A, 8w00:B, 8w02:B, 4zj0:A, 4zj0:B
20 1eii:A 134 127 0.3664 0.3582 0.3780 3.99e-23
21 3akm:A 131 130 0.3511 0.3511 0.3538 5.86e-21 3akm:B, 3akm:C, 3akm:D, 2mji:A
22 3akn:A 130 130 0.3206 0.3231 0.3231 4.21e-19
23 9bcb:A 137 126 0.2672 0.2555 0.2778 3.06e-17 6e5w:A, 6e5w:B, 6e5w:C, 6e5w:D
24 7o0k:B 126 128 0.3282 0.3413 0.3359 3.43e-16 2jn3:A, 2k62:A, 2lfo:A, 7o0k:A, 1tw4:A, 1tw4:B
25 6i8x:A 149 138 0.3435 0.3020 0.3261 1.05e-09 6i8x:B
26 1mdc:A 131 124 0.2672 0.2672 0.2823 1.53e-09
27 1lfo:A 127 123 0.2748 0.2835 0.2927 2.21e-07
28 6mp4:E 137 125 0.2901 0.2774 0.3040 1.45e-06 6drg:A, 7fy8:A, 7fy8:B, 7fy8:C, 7fy8:D, 7fy8:E, 7fy8:F, 7fy8:G, 7fy8:H, 7g00:A, 7g00:B, 7g00:C, 7g00:D, 7g00:E, 7g00:F, 7g00:G, 7g00:H, 7g00:I, 7g00:J, 7g00:K, 7g00:L, 7g00:M, 7g00:N, 7g00:O, 7g00:P, 2lkk:A, 6mp4:A, 6mp4:H, 3stk:A, 3stm:X
29 2lba:A 127 129 0.2519 0.2598 0.2558 1.28e-04
30 1eio:A 127 125 0.2366 0.2441 0.2480 0.003
31 2mm3:A 127 91 0.1756 0.1811 0.2527 0.012 5l8n:A, 5l8n:C, 1o1v:A
32 3elz:B 135 136 0.2824 0.2741 0.2721 0.031 3elz:A, 3elz:C, 3em0:A, 3em0:B
33 6ck7:A 172 75 0.1832 0.1395 0.3200 2.4 6ck7:B, 6ck7:C, 6ck7:D
34 8h69:A 716 89 0.1679 0.0307 0.2472 2.4 4avg:A, 4avg:B, 4avg:C, 4avg:D, 4avl:A, 4avl:B, 4avl:C, 4avl:D, 4avq:A, 4avq:B, 4avq:C, 4avq:D, 4awf:A, 4awf:B, 4awf:C, 4awf:D, 4awg:A, 4awg:B, 4awg:C, 4awh:A, 4awh:B, 4awh:C, 4awh:D, 4awm:A, 8bek:A, 5ccy:A, 5cgv:A, 5cl0:A, 3cm8:A, 5cxr:A, 5czn:A, 5d2o:A, 5d42:A, 5d4g:A, 5d8u:A, 5d9j:A, 5dbs:A, 6dcz:A, 5deb:A, 5des:A, 8dip:A, 8dpj:A, 8dqs:A, 8dtw:A, 8dvo:A, 8e1q:A, 8e21:A, 8e4s:A, 4e5e:A, 4e5e:B, 4e5e:C, 4e5e:D, 4e5f:A, 4e5f:B, 4e5f:C, 4e5f:D, 4e5g:A, 4e5g:B, 4e5g:C, 4e5g:D, 4e5h:A, 4e5h:B, 4e5h:C, 4e5h:D, 4e5i:A, 4e5i:B, 4e5i:C, 4e5i:D, 4e5j:A, 4e5j:B, 4e5j:C, 4e5j:D, 4e5l:A, 4e5l:B, 4e5l:C, 4e5l:D, 8edz:A, 5ega:A, 7k0w:A, 7k77:A, 7k87:A, 7kaf:A, 7kbc:A, 4kil:A, 7kl3:A, 7knr:A, 7kny:A, 7kop:A, 7lm4:A, 4ln7:A, 7lp7:A, 7lp8:A, 7lw6:A, 7m0n:A, 7m0n:B, 7m0n:C, 7m0n:D, 4m4q:A, 4m5o:A, 4m5q:A, 4m5r:A, 4m5u:A, 4m5v:A, 4mk1:A, 4mk2:A, 4mk5:A, 7ml8:A, 7mpf:A, 7mty:A, 7mx0:A, 7my5:A, 7n47:A, 7n55:A, 7n68:A, 7n8f:A, 6nel:A, 6nem:A, 7nha:A, 7nhc:A, 7nhx:A, 7ni0:A, 7nik:A, 7nil:A, 7nir:A, 7nis:A, 7nj3:A, 7nj4:A, 7nj5:A, 7nj7:A, 7nk1:A, 7nk2:A, 7nk4:A, 7nk6:A, 7nk8:A, 7nka:A, 7nkc:A, 7nki:A, 7nkr:A, 7nug:A, 7nuh:A, 8pm0:A, 8pnp:A, 8pnq:A, 8poh:A, 8poh:E, 7qtl:A, 6qx3:A, 6qx8:A, 6qx8:E, 6qxe:A, 6qxe:E, 7r0e:A, 8r3k:A, 8r3l:A, 8r60:A, 8r65:A, 7rkp:A, 6rr7:A, 7umr:A, 7uuh:A, 6v53:A, 6v56:A, 6vbr:A, 6vg9:A, 6viv:A, 6vjh:A, 6vl3:A, 6vll:A, 5vp8:A, 5vpt:A, 5vpx:A, 5vqn:A, 5vrj:A, 5w44:A, 2w69:A, 2w69:B, 2w69:D, 5w73:A, 6w7a:A, 4w9s:A, 5wa7:A, 5wap:A, 5wb3:A, 5wcs:A, 5wct:A, 5wdn:A, 5wdw:A, 5we7:A, 5we9:A, 5web:A, 5wef:A, 5wei:A, 5wf3:A, 5wfm:A, 5wfw:A, 5wfz:A, 5wg9:A, 6whm:A, 6wij:A, 6wj4:A, 6ws3:A, 6ya5:A, 6yem:A, 7z4o:DDD, 7z4o:AAA, 7zpl:A, 7zpl:D
35 3ajy:A 133 58 0.1145 0.1128 0.2586 2.9 3ajy:C
36 8u5o:A 449 60 0.1603 0.0468 0.3500 3.8 2bf6:A, 5tsp:A, 5tsp:B, 8u2a:A, 2vk5:A, 2vk6:A, 2vk7:A, 2vk7:B
37 3jd8:A 1133 54 0.1069 0.0124 0.2593 7.4
38 6uox:A 1161 54 0.1069 0.0121 0.2593 7.4
39 6w5r:A 1194 54 0.1069 0.0117 0.2593 7.4 3gki:A, 3gkj:A, 6w5s:A, 6w5t:A, 6w5u:A, 6w5v:A
40 2qn0:A 429 64 0.1603 0.0490 0.3281 9.5

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218