BioLiP

>protein
VDMYIERAGDITWEKDAEVTGNSPRLDVALDESGDFSLVE

The query sequence (length=40) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5lc0:A	193	40	0.9750	0.2021	0.9750	8.02e-22	8a15:B, 8aqa:A, 8aqa:B, 8aqb:A, 8aqb:B, 8aqk:A, 8aqk:B, 7doc:A, 7doc:B, 7h1h:B, 7h1i:B, 7h1j:B, 7h1k:B, 7h1l:B, 7h1m:B, 7h1n:B, 7h1o:B, 7h1p:A, 7h1p:B, 7h1q:B, 7h1r:B, 7h1s:B, 7h1t:B, 7h1u:B, 7h1v:B, 7h1w:B, 7h1x:B, 7h1y:B, 7h1z:B, 7h20:B, 7h21:B, 7h22:A, 7h22:B, 7h23:B, 7h24:B, 7h25:B, 7h27:B, 7h28:B, 7h29:B, 7h2a:B, 7h2b:B, 7h2c:B, 7h2c:A, 7h2d:B, 7h2e:B, 7h2f:B, 7h2g:B, 7h2h:B, 7h2i:B, 7h2j:B, 7h2k:B, 7h2l:B, 7h2m:B, 7h2n:B, 7h2o:B, 7h2p:A, 7h2p:B, 7h2q:B, 7h2r:B, 7h2s:B, 5h4i:B, 5h6v:A, 5h6v:B, 6jpw:C, 6jpw:D, 6jpw:E, 6jpw:F, 6jpw:G, 6jpw:H, 6kk2:A, 6kk2:B, 6kk3:A, 6kk3:B, 6kk4:A, 6kk4:B, 6kk5:A, 6kk5:B, 6kk6:A, 6kk6:B, 6kpq:B, 6l4z:H, 6l50:H, 5lc0:B, 7o2m:A, 7o2m:B, 7o55:A, 7o55:B, 7obv:A, 7obv:B, 7oc2:A, 7oc2:B, 7pfq:A, 7pfq:B, 7pfy:A, 7pfy:B, 7pfz:A, 7pfz:B, 7pg1:A, 7pg1:B, 7pgc:A, 7pgc:B, 7vlg:A, 7vlg:B, 7vlh:A, 7vlh:B, 7vli:A, 7vli:B, 7vxx:D, 7vxy:C, 7vxy:D, 6y3b:A, 6y3b:B, 8y9v:C, 8y9v:D, 5yof:A, 5yof:B, 7zlc:A, 7zlc:B, 7zld:A, 7zld:B, 5zmq:C, 5zmq:D, 5zmq:G, 5zmq:H, 5zms:A, 5zms:B, 5zms:D, 5zms:E, 7zmi:A, 7zmi:B, 7zno:A, 7zno:B, 5zob:A, 5zob:B, 5zob:C, 5zob:D, 7zpd:A, 7zpd:B, 7zq1:B, 7zqf:B, 7ztm:B, 7zum:A, 7zum:B, 7zv4:A, 7zv4:B, 7zvv:B, 7zvv:A, 7zw5:A, 7zw5:B, 7zwk:A, 7zwk:B, 7zys:A, 7zys:B
2	3e90:A	47	38	0.5750	0.4894	0.6053	9.19e-12	3e90:C
3	2yol:A	212	39	0.6000	0.1132	0.6154	4.06e-11	3e90:B, 3e90:D, 2fp7:A, 2fp7:B, 5idk:A, 5idk:B, 5idk:C
4	7m1v:A	166	20	0.5000	0.1205	1.0000	9.47e-08
5	2m9p:A	240	38	0.4000	0.0667	0.4211	4.26e-06	2m9q:A
6	6mo0:A	164	23	0.2750	0.0671	0.4783	0.025	6mo0:B, 6mo1:A, 6mo1:B, 6mo2:A, 6mo2:B
7	7z6w:A	188	33	0.3500	0.0745	0.4242	1.3	1iwl:A, 7z6x:A
8	5msd:A	636	29	0.2250	0.0142	0.3103	1.5	5msc:A, 5msq:A
9	8d3i:A	439	25	0.2750	0.0251	0.4400	2.4	4bur:D, 8d3e:A, 8d3e:B, 8d3g:A, 8d3g:B, 8d3h:A, 8d3h:B, 8d3i:B, 8d3j:A, 8d3j:B, 8d3k:A, 8d3k:B, 8d3n:A, 8d3n:B, 8d3o:A, 8d3o:B, 3gd4:B, 5kvh:A, 5kvh:B, 8qns:D, 8qns:J
10	5fs9:B	465	25	0.2750	0.0237	0.4400	3.1	4bur:A, 4bur:B, 4bur:C, 4fdc:B, 5fs6:A, 5fs6:B, 5fs7:A, 5fs7:B, 5fs9:A, 3gd3:A, 3gd4:A, 1m6i:A, 5miu:A, 5miu:B, 5miv:A, 5miv:C, 8qns:A, 8qns:G
11	2n7b:A	145	36	0.3500	0.0966	0.3889	3.4	7qui:B, 7qui:A
12	1gv4:A	490	25	0.2750	0.0224	0.4400	3.9	4bv6:A, 5fmh:A, 5fs8:A, 3gd3:B, 3gd3:C, 3gd3:D, 1gv4:B, 5kvi:A, 4lii:A
13	2de3:B	347	29	0.2250	0.0259	0.3103	4.9	2de3:A, 2de4:A, 2de4:B
14	2vk2:A	296	21	0.2000	0.0270	0.3810	6.3
15	4fuv:A	213	22	0.2250	0.0423	0.4091	9.2
16	1pz7:A	188	30	0.2500	0.0532	0.3333	9.6	1pz7:B, 1pz8:A, 1pz8:B, 1pz8:C, 1pz8:D

[Back]