BioLiP

>protein
VCWIYYPDGGSLVGEVNEDGEMTGEKIAYVYPDERTALYGKFIDGEMIEGKLATLMSTEEGRPHFELMPGNSVYHFDKST
SSCISTNALLPDPYESERVYVAESLISSAGEGLFSKVAVGPNTVMSFYNGVRITHQEVDSRDWALNGNTLSLDEETVIDV
PEPYNHVSKYCASLGHKANHSFTPNCIYDMFVHPRFGPIKCIRTLRAVEADEELTVAYGYDHSPPGKSGPEAPEWYQVEL
KAFQAT

The query sequence (length=246) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1h3i:B	293	227	0.9228	0.7747	1.0000	1.45e-171	5ayf:A, 3cbm:A, 3cbo:A, 3cbp:A, 4e47:A, 4e47:B, 4e47:C, 4e47:D, 5eg2:A, 2f69:A, 4j7f:A, 4j7i:A, 4j83:A, 4j8o:A, 4jds:A, 4jds:B, 4jds:C, 4jds:D, 4jlg:A, 4jlg:B, 3m53:A, 3m54:A, 3m55:A, 3m56:A, 3m57:A, 3m58:A, 3m59:A, 3m5a:A, 1mt6:A, 1n6a:A, 1n6c:A, 1o9s:A, 1o9s:B, 3os5:A, 3vuz:A, 3vv0:A, 1xqh:A, 1xqh:E, 5ylt:A
2	7td5:F	447	210	0.2154	0.1186	0.2524	9.75e-06
3	7td5:A	497	206	0.2114	0.1046	0.2524	1.06e-05
4	7kso:A	395	201	0.2154	0.1342	0.2637	4.87e-05	7ksr:A, 7ktp:A
5	7at8:A	311	126	0.1504	0.1190	0.2937	3.86e-04
6	8t9g:C	536	122	0.1463	0.0672	0.2951	4.70e-04	8fyh:A, 8fyh:G
7	8tas:E	570	122	0.1463	0.0632	0.2951	4.83e-04	8tb9:E
8	5ij7:B	469	122	0.1463	0.0768	0.2951	4.85e-04	6b3w:A, 6b3w:B, 6c23:K, 6c24:K, 5ij7:A, 5ij8:A, 5ij8:B, 4w2r:A, 4w2r:B
9	5hyn:A	581	122	0.1463	0.0620	0.2951	5.41e-04	5hyn:F, 5hyn:K, 5hyn:Q, 5ls6:A, 5ls6:G, 5ls6:J, 5ls6:D
10	6wkr:C	606	122	0.1463	0.0594	0.2951	5.56e-04	4mi0:A, 4mi5:A, 8t9g:I
11	9c8u:A	475	122	0.1463	0.0758	0.2951	5.93e-04
12	5wg6:A	517	122	0.1463	0.0696	0.2951	0.001	5wg6:C
13	7w6l:C	158	134	0.1504	0.2342	0.2761	0.029	5f59:A, 5f6k:C, 5f6k:E, 6kiw:K, 7w6l:E
14	7bre:B	163	135	0.1301	0.1963	0.2370	0.033	7bre:E
15	6nzo:S	233	138	0.1504	0.1588	0.2681	0.11	6px3:S
16	4au7:A	243	41	0.0691	0.0700	0.4146	0.52	4au7:B, 3rq4:A
17	5d6j:A	630	30	0.0488	0.0190	0.4000	2.5	5ey8:A, 5ey8:B, 5ey8:C, 5ey8:D, 5ey8:E, 5ey8:F, 5ey8:G, 5ey8:H, 5icr:A, 5icr:B, 5icr:C, 5icr:D
18	2y2l:B	476	124	0.0976	0.0504	0.1935	2.6	2fff:B, 2jch:A, 2je5:A, 2je5:B, 2xd1:A, 2xd1:B, 2xd5:A, 2xd5:B, 2y2g:A, 2y2g:B, 2y2h:A, 2y2h:B, 2y2i:A, 2y2j:A, 2y2k:A, 2y2l:A, 2y2m:A, 2y2n:A, 2y2o:A, 2y2p:A, 2y2q:A, 2y2q:B, 7zui:AAA, 7zuj:AAA, 7zuk:AAA, 7zul:AAA
19	1cm5:A	759	30	0.0488	0.0158	0.4000	3.4	1cm5:B, 1h16:A, 1h17:A, 1h18:A, 1h18:B, 1mzo:A, 1mzo:B
20	4f3s:A	231	49	0.0691	0.0736	0.3469	3.9	4dz1:A
21	5tfm:A	320	43	0.0569	0.0437	0.3256	5.0	5tfl:A, 5tfl:B
22	8hyk:A	306	47	0.0528	0.0425	0.2766	5.6	7x4p:A
23	5diy:A	463	76	0.0772	0.0410	0.2500	6.0	5diy:B
24	5wfd:B	774	122	0.1220	0.0388	0.2459	9.2	5wfc:B

[Back]