BioLiP

>protein
VASIKVIGIGGAGNNAVNRMIEAGVQGVEFIVANTDAQIISVSKSKNKIVLGKETSKGLGAGADVGRQAAIESAEEIKDA
LKGADMVFVAAGMGGGTGTGAAPIIAKLAREQGALTVGIITTPFSFEGRARNSYAIQGTEELRKHVDSLIIISNDRLLEV
IGGVPLKDSFKEADNILRQGVQTITDLIAVPSLINLDFADIKTVMKNKGNALMGIGIGSGKDKAIEAANKAIISPLLEAS
IRGARDAIINVTGGNTLTLNDANDAVDIVKQAIGGEVNIIFGTAVNEHLDDEMIVTVIATGF

The query sequence (length=302) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7yop:B	304	304	0.9967	0.9901	0.9901	0.0	8grw:A, 8grw:B, 7yop:A, 7ysz:A, 7ysz:B
2	4m8i:A	311	287	0.5530	0.5370	0.5819	6.56e-107	4dxd:A, 5h5g:A, 5h5g:B, 5h5h:A, 5h5i:A, 8htb:A, 6kvp:A, 6kvq:A, 5mn4:A, 5mn5:A, 5mn5:B, 5mn6:A, 5mn6:B, 5mn7:A, 5mn7:B, 5mn8:B, 5mn8:A, 7ohh:A, 7ohk:A, 7ohl:A, 7ohn:A, 7oi2:A, 7oja:A, 7ojb:A, 7ojc:A, 7ojd:A, 7ojz:A, 7on2:A, 7on3:A, 7on4:A, 6rvm:A, 6rvm:B, 6rvm:C, 6rvn:A, 6rvp:A, 6rvq:A, 6si9:A, 3vo8:A, 3vo8:B, 3voa:A, 3vob:A, 3wgj:A, 3wgj:B, 3wgk:A, 3wgk:B, 3wgl:A, 3wgl:B, 3wgm:A, 3wgm:B, 3wgn:A, 3wgn:B, 5xdt:A, 5xdu:A, 5xdv:A, 5xdw:A, 6yd1:A, 6yd5:A, 6yd6:A
3	2rhl:B	315	304	0.6126	0.5873	0.6086	8.45e-107	2rhl:A, 2rho:A, 2rho:B, 4u39:B, 4u39:E, 4u39:F, 4u39:G
4	5zue:A	309	291	0.5099	0.4984	0.5292	9.26e-90	4kwe:A, 4kwe:B, 4kwe:C, 2q1y:A, 1rlu:A, 1rq7:A, 5v68:B, 5v68:E, 6y1u:A, 6y1u:B, 6y1v:A, 6y1v:B, 6ym1:A, 6ym9:A
5	4u39:D	280	286	0.5066	0.5464	0.5350	6.05e-82	4u39:H, 4u39:I
6	1w5f:A	315	306	0.4801	0.4603	0.4739	2.81e-81	1w5f:B
7	2vaw:A	315	292	0.4669	0.4476	0.4829	3.54e-76	1ofu:A, 1ofu:B
8	8h1o:A	314	291	0.4669	0.4490	0.4845	4.41e-76	8gzv:A, 8gzw:A, 8gzw:C, 8gzw:E, 8gzx:A, 8gzy:A, 8gzy:C, 8gzy:E, 8ibn:A, 8ibn:B, 8ibn:C, 8ibn:D, 6ll5:A, 6ll6:A, 6umk:A, 6unx:A
9	1w58:1	337	302	0.4371	0.3917	0.4371	2.60e-70	1fsz:A, 2vap:A, 1w5a:A, 1w5a:B, 1w5b:A, 1w5b:B, 1w5e:A, 1w5e:B, 1w5e:C, 1w5e:D, 1w5e:E, 1w5e:F, 1w5e:G, 1w5e:H, 1w5e:I
10	2r6r:1	323	293	0.4073	0.3808	0.4198	7.32e-67	2r75:1
11	3zid:A	360	216	0.1887	0.1583	0.2639	1.33e-07	3zid:B
12	4b46:A	330	170	0.1689	0.1545	0.3000	0.003
13	4xcq:A	303	61	0.0662	0.0660	0.3279	0.029
14	6mez:B	359	63	0.0563	0.0474	0.2698	0.050	4bcl:A, 3eoj:A, 6mez:A, 3vdi:A
15	8dga:K	182	99	0.0762	0.1264	0.2323	0.39	8dg7:K
16	3zbq:A	315	133	0.1026	0.0984	0.2331	0.66	3zbp:A
17	7uea:U	364	58	0.0497	0.0412	0.2586	1.4	3bsd:A, 3eni:A, 3eni:C, 8gwa:1, 8gwa:2, 8gwa:3, 8gwa:4, 8gwa:5, 8gwa:6, 5h8z:A, 5h8z:C, 6m32:E, 6m32:F, 6m32:G, 7uea:V, 7uea:W, 7ueb:U, 7ueb:V, 7ueb:W, 7ueb:X, 7ueb:Y, 7ueb:Z, 7z6q:E, 7z6q:F, 7z6q:G, 7z6q:H, 7z6q:I, 7z6q:J
18	7bvy:A	333	69	0.0695	0.0631	0.3043	2.0	7bvz:A
19	4om8:A	309	88	0.0662	0.0647	0.2273	2.9	4om8:B
20	7cfe:A	214	63	0.0596	0.0841	0.2857	3.0
21	5ycd:B	193	30	0.0430	0.0674	0.4333	3.7	5x6k:A, 5x6k:B, 5x6l:A, 5x6l:B, 5xru:A, 5xru:B, 5xz2:A, 5xz2:B, 5ycb:A, 5ycb:B, 5ycc:A, 5ycc:B, 5ycd:A, 5ycf:B, 5ycf:A
22	3ukm:A	252	67	0.0662	0.0794	0.2985	8.1	3ukm:B, 3ukm:C, 3ukm:D
23	8tbx:A	458	106	0.0861	0.0568	0.2453	8.9

[Back]