BioLiP

>protein
VASGSGEPREEAGALGPAWDESQLRSYSFPTRPIPRLSQSDPRAEELIENEEPVVLTDTNLVYPALKWDLEYLQENIGNG
DFSVYSASTHKFLYYDEKKMANFQNFKPRSNREEMKFHEFVEKLQDIQQRGGEERLYLQQTLNDTVGRKIVMDFLGFNWN
WINKQQGKRGWGQLTSNLLLIGMEGNVTPAHYGEQQNFFAQIKGYKRCILFPPDQFECLYPYPVHHPCDRQSQVDFDNPD
YERFPNFQNVVGYETVVGPGDVLYIPMYWWHHIESLLNGGITITVNFWYKGAPTPKRIEYPLKAHQKVAIMRNIEKMLGE
ALGNPQEVGPLLNTMIKGRYN

The query sequence (length=341) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4b7e:A	349	341	0.9971	0.9742	0.9971	0.0	7a1j:A, 7a1k:A, 7a1l:A, 7a1m:A, 7a1n:A, 7a1o:A, 7a1p:A, 7a1q:A, 7a1s:A, 4ai8:A, 4b7k:A, 4bio:A, 2cgn:A, 2cgo:A, 3d8c:A, 1h2k:A, 1h2l:A, 1h2m:A, 1h2n:A, 6h9j:A, 6ha6:A, 6hc8:A, 6hkp:A, 6hl5:A, 6hl6:A, 8ihz:A, 8ii0:A, 2ilm:A, 4jaa:A, 5jwk:A, 5jwl:A, 5jwp:A, 8k71:A, 8k72:A, 8k73:A, 3kcx:A, 3kcy:A, 1mze:A, 1mzf:A, 4nr1:A, 3od4:A, 5op6:A, 5op8:A, 5opc:A, 3p3n:A, 3p3p:A, 6ruj:A, 2w0x:A, 2wa3:A, 2wa4:A, 2xum:A, 2y0i:A, 1yci:A, 2yc0:A, 2yde:A, 4z1v:A, 4z2w:A
2	6f4n:B	243	264	0.2053	0.2881	0.2652	6.35e-20	4aap:A, 4aap:B, 6avs:A, 6ax3:A, 7dyt:A, 7dyu:A, 7dyv:A, 7dyw:A, 7dyx:A, 6f4n:A, 6f4o:A, 6f4p:A, 6f4q:A, 6f4r:A, 6f4s:A, 6f4t:A, 5fbj:A, 4gjy:A, 4gjz:A, 6i9l:A, 6i9m:A, 6i9n:A, 4qu1:A, 7uq3:A, 3uyj:A, 3uyj:B
3	7yxg:A	313	277	0.2229	0.2428	0.2744	2.85e-14	7yxg:B, 7yxh:A, 7yxh:B, 7yxi:A, 7yxi:B, 7yxj:A, 7yxj:B, 7yxj:C, 7yxj:D, 7yxk:A, 7yxk:B, 7yxl:A, 7yxl:B
4	3al5:B	311	278	0.2053	0.2251	0.2518	7.25e-14	3al5:D, 3al6:B, 3al6:D
5	4qsz:A	686	288	0.1906	0.0948	0.2257	9.72e-10	8j25:A, 8j2p:E, 8j2p:A, 4kyc:A, 4qsz:B, 4qu2:A, 4qu2:B
6	5nfn:B	318	273	0.1906	0.2044	0.2381	1.64e-09	5nfn:A, 5nfn:C, 5nfn:D, 5nfo:A, 5nfo:B
7	2f8j:A	335	198	0.1202	0.1224	0.2071	0.28	2f8j:B, 2f8j:C, 2f8j:D, 1h1c:A, 1h1c:B, 1h1c:C, 1h1c:D, 1uu0:A, 1uu0:B, 1uu0:C, 1uu0:D, 1uu1:A, 1uu1:B, 1uu1:C, 1uu1:D, 1uu2:A, 1uu2:B
8	6mev:A	341	95	0.0792	0.0792	0.2842	0.28	6gdy:A, 6gdy:B, 3ld8:A, 3ldb:A, 6mev:B, 6mev:C, 6mev:D, 6mev:E, 6mev:F, 6mev:G, 6mev:H
9	1vrb:C	298	117	0.0909	0.1040	0.2650	0.67
10	3k5s:A	217	84	0.0645	0.1014	0.2619	1.2	3k5s:B, 3k6i:A
11	5z99:A	485	74	0.0587	0.0412	0.2703	2.3	5yyb:A, 5yyb:B
12	1r0l:B	379	15	0.0293	0.0264	0.6667	2.8	1r0l:A, 1r0l:C, 1r0l:D
13	4bxf:A	425	103	0.0704	0.0565	0.2330	4.2	4bxf:B
14	7zcc:B	326	124	0.0968	0.1012	0.2661	5.2	1vrb:A, 1vrb:B, 1vrb:D, 7zcc:A, 7zcc:C, 7zcc:D
15	6sga:F8	513	33	0.0323	0.0214	0.3333	6.1	6sgb:F8
16	1cxa:A	124	24	0.0381	0.1048	0.5417	6.9	1cxc:A, 2cxb:A, 2cxb:B, 1l9b:C, 1l9j:C, 1l9j:D
17	2b9s:A	426	56	0.0499	0.0399	0.3036	9.2
18	5wvu:A	510	81	0.0674	0.0451	0.2840	9.2	5wvu:B, 5wvu:C

[Back]