BioLiP

>protein
VADPRPDPDELARRAAQVIADRTGIGEHDVAVVLGSGWLPAVAALGSPTTVLPQAELPGFVPPTAAGHAGELLSVPIGAH
RVLVLAGRIHAYEGHDLRYVVHPVRAARAAGAQIMVLTNAAGGLRADLQVGQPVLISDHLNLTARSPLVGGEFVDLTDAY
SPRLRELARQSDPQLAEGVYAGLPGPHYETPAEIRMLQTLGADLVGMSTVHETIAARAAGAEVLGVSLVTNLAAGITGEP
LSHAEVLAAGAASATRMGALLADVIARF

The query sequence (length=268) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7zsq:C	268	268	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	8c25:A, 8c25:B, 1g2o:A, 1g2o:B, 1g2o:C, 1i80:A, 1i80:B, 1i80:C, 3iom:A, 3iom:B, 3ix2:A, 3ix2:B, 3ix2:C, 1n3i:A, 1n3i:B, 1n3i:C, 3scz:A, 3scz:B, 7zsq:A, 7zsq:B, 7zsr:A, 7zsr:B, 7zsr:C
2	1c3x:A	266	265	0.5672	0.5714	0.5736	1.12e-90	1c3x:B, 1c3x:C, 1qe5:A, 1qe5:B, 1qe5:C
3	8swu:A	269	249	0.3731	0.3717	0.4016	1.29e-53	8swu:B, 8swu:C
4	3odg:A	273	266	0.3582	0.3516	0.3609	7.40e-50
5	8swt:A	278	254	0.3321	0.3201	0.3504	1.80e-47	8swt:B
6	3lba:A	260	227	0.3582	0.3692	0.4229	1.97e-46
7	1a9o:A	289	256	0.3694	0.3426	0.3867	8.36e-46	1a9p:A, 1a9q:A, 1a9r:A, 1a9s:A, 1a9t:A, 2ai1:A, 2ai2:A, 2ai3:A, 1b8n:A, 1b8o:A, 3fuc:A, 3fuc:B, 3fuc:C, 1fxu:A, 1lv8:A, 1lv8:B, 1lv8:C, 1lv8:D, 1lv8:E, 1lv8:F, 1lvu:A, 1lvu:B, 1lvu:C, 1lvu:D, 1lvu:E, 1lvu:F, 2qpl:A, 1v48:A, 1vfn:A
8	1yqq:A	273	249	0.3545	0.3480	0.3815	1.95e-45	1yqq:B, 1yqq:C, 1yqu:A, 1yqu:B, 1yqu:C, 1yr3:A, 1yr3:B, 1yr3:C, 1yr3:D, 1yr3:E, 1yr3:F
9	3d1v:A	288	261	0.3806	0.3542	0.3908	2.23e-45	2a0w:A, 2a0x:A, 2a0y:A, 3bgs:A, 4ear:A, 4ear:B, 4ear:C, 4eb8:A, 4eb8:B, 4eb8:C, 5etj:A, 5etj:B, 5etj:C, 5etj:D, 5etj:E, 5etj:F, 3gb9:A, 3gb9:B, 3gb9:C, 3ggs:A, 3ggs:B, 3ggs:C, 4gka:A, 4gka:B, 4gka:C, 4gka:D, 4gka:E, 4gka:F, 3iny:A, 3k8o:E, 3k8o:Q, 3k8o:S, 3k8o:T, 3k8o:U, 3k8o:Y, 3k8q:A, 2oc4:A, 2oc9:A, 2on6:A, 1pf7:E, 3phb:E, 3phb:Q, 3phb:S, 3phb:T, 3phb:U, 3phb:Y, 1pwy:E, 2q7o:E, 1rct:E, 1rfg:E, 1rr6:A, 1rsz:A, 1rt9:A, 5ugf:A, 5ugf:B, 5ugf:C, 5ugf:D, 5ugf:E, 5ugf:F, 1v2h:E, 1v3q:E, 1v41:E, 1v45:E, 1yry:E, 7zsl:A, 7zsl:B, 7zsl:C, 7zsl:D, 7zsl:E, 7zsl:F, 7zsm:A, 7zsn:A, 7zso:A, 7zso:B, 7zso:C, 7zsp:A
10	4nsn:A	273	253	0.3396	0.3333	0.3597	1.49e-43	4ns1:A, 4ns1:B, 4ns1:C, 4ns1:D, 4nsn:B, 4nsn:C
11	4m1e:B	273	272	0.3507	0.3443	0.3456	2.60e-43	4m1e:A, 4m1e:F, 4m1e:E, 4m1e:C, 4m1e:D
12	3e0q:C	285	277	0.3470	0.3263	0.3357	4.51e-43	3djf:A, 3djf:B, 3djf:C, 3e0q:A, 3e0q:B, 3e9r:B, 3e9z:A, 3e9z:C, 3f8w:A, 3f8w:B, 3f8w:C, 3faz:A, 3faz:B, 3faz:C, 3fb1:A, 3fb1:B, 3fb1:C, 3fnq:A, 3fnq:B, 3fnq:C, 3iex:A, 3iex:C, 1tcu:A, 1tcu:B, 1tcu:C, 1tcv:A, 1tcv:B, 1tcv:C, 1td1:A, 1td1:B, 1td1:C
13	5ko6:A	285	258	0.3321	0.3123	0.3450	3.82e-41	6awe:A, 6axa:A, 6b2l:A, 6b37:A, 6b3l:A, 6b4q:A, 6b4t:A, 6b56:A, 6b6k:A, 6b71:A, 6b7i:A, 6bb7:A, 6bfv:A, 6bhb:A, 6bi1:A, 6bi9:A, 6bif:A, 6bj6:A, 6bj7:A, 5ko5:A, 5tbs:A, 5tbt:A, 5tbu:A, 5tbv:A
14	4uc0:A	247	216	0.3284	0.3563	0.4074	9.99e-41
15	4lna:A	269	251	0.3246	0.3234	0.3466	2.12e-40
16	2p4s:A	282	256	0.3209	0.3050	0.3359	6.20e-39	2p4s:B, 2p4s:C
17	8swq:A	302	247	0.3209	0.2848	0.3482	1.02e-37	5ifk:A, 5ifk:B, 5ifk:C, 8swp:A, 8swp:D, 8swp:E, 8swq:D, 8swr:A, 8swr:D, 8sws:A, 8sws:D, 8sws:E
18	3khs:B	270	255	0.3433	0.3407	0.3608	5.31e-37	3khs:A, 3khs:C, 3khs:D
19	8swq:B	278	240	0.3022	0.2914	0.3375	1.68e-31	8swp:B, 8swq:E, 8swr:B, 8sws:B
20	5tc5:A	286	198	0.1828	0.1713	0.2475	1.00e-11	1cb0:A, 1cg6:A, 6dyz:A, 6dz0:A, 6dz2:A, 6dz2:B, 6dz2:C, 6dz3:A, 6dz3:B, 6dz3:C, 5eub:A, 1k27:A, 3ozc:A, 3ozd:A, 3ozd:B, 1sd1:A, 1sd2:A, 5tc5:B, 5tc5:C, 5tc6:A, 5tc7:A, 5tc8:A
21	3t94:A	270	221	0.2090	0.2074	0.2534	7.10e-09	2a8y:A, 2a8y:B, 2a8y:C, 2a8y:D, 2a8y:E, 2a8y:F, 2a8y:G, 2a8y:H, 2a8y:I, 2a8y:J, 2a8y:K, 2a8y:L, 3t94:B, 3t94:C, 3t94:D, 3t94:E, 3t94:F
22	3ozb:A	241	198	0.2164	0.2407	0.2929	2.40e-08	3ozb:B, 3ozb:C, 3ozb:D, 3ozb:E, 3ozb:F
23	9jd2:A	273	194	0.1828	0.1795	0.2526	3.03e-07	9jhv:A, 1wta:A
24	4glj:A	287	217	0.2052	0.1916	0.2535	1.61e-04
25	5f7j:B	291	167	0.1455	0.1340	0.2335	0.001	5f76:A, 5f76:B, 5f76:C, 5f77:A, 5f77:B, 5f77:C, 5f7j:A, 5f7j:D, 5f7j:E, 5f7o:A, 5f7o:B, 5f7x:A, 5f7x:B, 5f7x:C, 5fak:A, 5fak:B, 5fak:D, 5fak:E, 4l5a:A, 4l5a:C, 4l5a:B, 4l5a:D, 4l5a:E, 4l5a:F, 4l5c:A, 4l5c:B, 4l5c:C, 4l5c:D, 4l5c:E, 4l5c:F, 4l6i:A, 4l6i:B, 4l6i:D, 4l6i:E
26	4jdy:A	264	52	0.0672	0.0682	0.3462	1.1	4jdy:B, 4jdy:C
27	2pp1:A	395	50	0.0746	0.0506	0.4000	1.7	2pp1:B, 2pp1:C, 2pp1:D, 2pp1:E, 2pp1:F, 2pp3:A, 2pp3:B, 2pp3:C
28	1ep3:A	311	31	0.0485	0.0418	0.4194	3.2	1ep1:A, 1ep2:A, 5ksw:A, 5ksw:C, 5ue9:A, 5ue9:C
29	1wdl:A	715	66	0.0784	0.0294	0.3182	9.2	2d3t:A, 2d3t:B, 1wdk:A, 1wdk:B, 1wdl:B, 1wdm:A, 1wdm:B

[Back]