Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
TVYFHEEFKSMEHWTTSKHRDDFGKVEISAGKFYADAEKSKGLRLTEDARFYALSTAFPTPINNEKKSLVVSFSVKHEQD
LKCGGGYIKLLPSMDPEKFHGETKYWLMFGPDRCGSQNRVHIILHYNGENREWSKRIRFPEDKLTHVYTLHIAADNSYEF
FLDGESKAKGQLEEDWSLLLPREIVDGSGIPNPDFVEDSELHKVPEPLTHVGIDVWQVESGSIFKDIVIGDDLKEVLDLV
EKTYGGLKKAEADALKVMEDME

The query sequence (length=262) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 5hcf:B 263 262 1.0000 0.9962 1.0000 0.0 5hcf:F
2 5hca:A 266 239 0.4046 0.3985 0.4435 1.50e-69 5hca:C, 5hca:B, 5hcb:A, 5hcb:B
3 8tzo:C 273 257 0.4237 0.4066 0.4319 1.30e-68 5lk5:A, 5lk5:B, 5lk5:C, 5lk5:D, 5lk5:E, 5lk5:F, 5lk5:G, 5lk5:H, 5lk5:I, 5lk5:J, 3o0v:A, 3o0w:A, 3o0x:A, 3o0x:B, 3pos:A, 3pos:B, 3pos:C, 3pow:A, 8tzr:C
4 3rg0:A 292 279 0.4313 0.3870 0.4050 1.35e-67
5 8xvf:A 251 257 0.4122 0.4303 0.4202 1.73e-58 8xvf:B, 8xvf:C, 8xvf:D, 8xvf:E, 8xvf:F, 8xvf:G, 8xvf:H
6 6eny:G 365 185 0.3473 0.2493 0.4919 7.72e-56 7qpd:C
7 6eny:G 365 62 0.0763 0.0548 0.3226 0.005 7qpd:C
8 1jhn:A 380 217 0.2672 0.1842 0.3226 1.77e-22
9 1jhn:A 380 56 0.0725 0.0500 0.3393 0.001
10 8jh5:A 379 102 0.1031 0.0712 0.2647 0.015 8jh5:B, 7y9u:A, 7y9u:B, 7y9v:A, 7y9v:B
11 7wkw:B 377 101 0.0992 0.0690 0.2574 0.058 7wkw:A, 7xxb:A, 7xxb:B
12 6g9x:B 368 36 0.0496 0.0353 0.3611 0.93 6zgr:B, 6zgs:B, 6zgt:B, 6zgu:B
13 2bmo:A 437 117 0.1145 0.0686 0.2564 0.93 2bmq:A, 2bmr:A
14 6zgs:A 404 36 0.0496 0.0322 0.3611 1.1 6g9x:A, 6zgr:A, 6zgt:A, 6zgu:A
15 6cxs:B 599 60 0.0763 0.0334 0.3333 1.2 6cxs:A
16 5adk:A 416 41 0.0611 0.0385 0.3902 2.2 5adj:A, 5adj:B, 5adk:B, 5adl:A, 5adl:B, 5adm:A, 5adm:B, 5adn:A, 5adn:B, 6av6:A, 6av6:B, 6av6:C, 6av6:D, 6av7:A, 6av7:B, 6av7:C, 6av7:D, 4c3a:A, 4c3a:B, 4car:A, 4car:B, 4cft:A, 4cft:B, 6cie:A, 6cie:B, 6cie:C, 6cie:D, 6cif:A, 6cif:B, 6cif:C, 6cif:D, 4cty:A, 4cty:B, 4ctz:A, 4ctz:B, 4cu0:A, 4cu0:B, 4cu1:A, 4cu1:B, 4cul:A, 4cul:B, 4cum:A, 4cum:B, 4cun:A, 4cun:B, 4cvg:A, 4cvg:B, 4cwv:A, 4cwv:B, 4cww:A, 4cww:B, 4cwx:A, 4cwx:B, 4cwy:A, 4cwy:B, 4cwz:A, 4cwz:B, 4cx0:A, 4cx0:B, 4cx1:A, 4cx1:B, 4cx2:A, 4cx2:B, 1d0c:A, 1d0c:B, 1d0o:A, 1d0o:B, 1d1v:A, 1d1v:B, 1d1w:A, 1d1w:B, 1d1x:A, 1d1x:B, 1d1y:A, 1d1y:B, 4d1o:A, 4d1o:B, 4d1p:A, 4d1p:B, 4d33:A, 4d33:B, 4d34:A, 4d34:B, 4d35:A, 4d35:B, 4d36:A, 4d36:B, 4d37:A, 4d37:B, 4d38:A, 4d38:B, 4d39:A, 4d39:B, 4d3a:A, 4d3a:B, 1dm6:A, 1dm6:B, 1dm7:A, 1dm7:B, 1dm8:A, 1dm8:B, 1dmi:A, 1dmi:B, 1dmj:A, 1dmj:B, 1dmk:A, 1dmk:B, 3dqs:A, 3dqs:B, 3dqt:A, 3dqt:B, 3e7s:A, 3e7s:B, 3eah:A, 3eah:B, 1ed4:A, 1ed4:B, 1ed5:A, 1ed5:B, 1ed6:A, 1ed6:B, 8fgn:A, 8fgn:B, 8fgn:C, 8fgn:D, 8fgo:A, 8fgo:B, 8fgo:C, 8fgo:D, 8fgp:A, 8fgp:B, 8fgp:C, 8fgp:D, 8fgq:A, 8fgq:B, 8fgq:C, 8fgq:D, 8fgr:A, 8fgr:B, 8fgr:C, 8fgr:D, 8fgs:A, 8fgs:B, 8fgs:C, 8fgs:D, 8fgt:A, 8fgt:B, 8fgt:C, 8fgt:D, 8fgu:A, 8fgu:B, 8fgu:C, 8fgu:D, 5fj2:A, 5fj2:B, 5fj3:A, 5fj3:B, 1foi:A, 1foi:B, 1foj:A, 1foj:B, 1fol:A, 1fol:B, 1foo:A, 1foo:B, 1fop:A, 1fop:B, 5fvy:A, 5fvy:B, 5fvz:A, 5fvz:B, 2g6o:A, 2g6o:B, 2hx2:A, 2hx2:B, 1i83:A, 1i83:B, 4imx:A, 4imx:B, 4jsk:A, 4jsk:B, 4jsl:A, 4jsl:B, 4jsm:A, 4jsm:B, 3jww:A, 3jww:B, 3jwx:A, 3jwx:B, 3jwy:A, 3jwy:B, 3jwz:A, 3jwz:B, 4k5h:A, 4k5h:B, 4k5i:A, 4k5i:B, 4k5j:A, 4k5j:B, 4k5k:A, 4k5k:B, 4kcp:A, 4kcp:B, 4kcq:A, 4kcq:B, 4kcr:A, 4kcr:B, 4kcs:A, 4kcs:B, 4luw:A, 4luw:B, 7m56:A, 7m56:B, 1m9j:A, 1m9j:B, 1m9k:A, 1m9k:B, 1m9m:A, 1m9m:B, 1m9q:A, 1m9q:B, 1m9r:A, 1m9r:B, 3n5p:A, 3n5p:B, 3n5q:A, 3n5q:B, 3n5r:A, 3n5r:B, 3n5s:A, 3n5s:B, 3n5t:A, 3n5t:B, 3n67:A, 3n67:B, 3n68:A, 3n68:B, 3n69:A, 3n69:B, 3n6a:A, 3n6a:B, 3n6b:A, 3n6b:B, 3n6c:A, 3n6c:B, 3n6d:A, 3n6d:B, 3n6e:A, 3n6e:B, 3n6f:A, 3n6f:B, 3n6g:A, 3n6g:B, 6nh1:A, 6nh1:B, 6nh1:C, 6nh1:D, 6nh2:A, 6nh2:B, 6nh2:C, 6nh2:D, 6nh3:A, 6nh3:B, 6nh3:C, 6nh3:D, 6nh4:A, 6nh4:B, 6nh4:C, 6nh4:D, 6nh5:A, 6nh5:B, 6nh5:C, 6nh5:D, 6nh6:A, 6nh6:B, 6nh6:C, 6nh6:D, 6nh7:A, 6nh7:B, 6nh8:A, 6nh8:B, 6nh8:C, 6nh8:D, 6nhf:A, 6nhf:B, 6nhf:C, 6nhf:D, 3nld:A, 3nld:B, 3nle:A, 3nle:B, 3nlf:A, 3nlf:B, 3nlg:A, 3nlg:B, 3nlh:A, 3nlh:B, 3nli:A, 3nli:B, 3nlt:A, 3nlt:B, 3nlu:A, 3nlu:B, 3nos:A, 3nos:B, 1nse:A, 1nse:B, 2nse:A, 2nse:B, 3nse:A, 3nse:B, 4nse:A, 4nse:B, 5nse:A, 5nse:B, 6nse:A, 6nse:B, 7nse:A, 7nse:B, 8nse:A, 8nse:B, 9nse:A, 9nse:B, 1p6l:A, 1p6l:B, 1p6m:A, 1p6m:B, 1p6n:A, 1p6n:B, 3pnh:A, 3pnh:B, 6pou:A, 6pou:B, 6pou:C, 6pou:D, 6pou:E, 6pou:F, 6pov:A, 6pov:B, 6pov:C, 6pov:D, 6pow:A, 6pow:B, 6pow:C, 6pow:D, 6pox:A, 6pox:B, 6pox:C, 6pox:D, 6poy:A, 6poy:B, 6poy:C, 6poy:D, 6poz:A, 6poz:B, 6poz:C, 6poz:D, 6pp0:A, 6pp0:B, 6pp0:C, 6pp0:D, 6pp1:A, 6pp1:B, 6pp1:C, 6pp1:D, 6pp2:A, 6pp2:B, 6pp2:C, 6pp2:D, 6pp3:A, 6pp3:B, 6pp3:C, 6pp3:D, 6pp4:A, 6pp4:B, 6pp4:C, 6pp4:D, 1q2o:A, 1q2o:B, 3rqo:A, 3rqo:B, 3rqp:A, 3rqp:B, 1rs8:A, 1rs8:B, 1rs9:A, 1rs9:B, 7tsg:A, 7tsg:B, 7tsg:C, 7tsg:D, 7tsh:A, 7tsh:B, 7tsh:C, 7tsh:D, 7tsi:A, 7tsi:B, 7tsi:C, 7tsi:D, 7tsk:A, 7tsk:B, 7tsk:C, 7tsk:D, 7tsl:A, 7tsl:B, 7tsl:C, 7tsl:D, 7tsm:A, 7tsm:B, 7tsm:C, 7tsm:D, 7tsn:A, 7tsn:B, 7tsn:C, 7tsn:D, 7tso:A, 7tso:B, 7tso:C, 7tso:D, 7tsp:A, 7tsp:B, 7tsp:C, 7tsp:D, 7uao:A, 7uao:B, 7uao:C, 7uao:D, 8ufr:A, 8ufr:B, 8ufr:C, 8ufr:D, 8ufs:A, 8ufs:B, 8ufs:C, 8ufs:D, 8uft:A, 8uft:B, 8uft:C, 8uft:D, 8ufu:A, 8ufu:B, 8ufu:C, 8ufu:D, 4uh7:A, 4uh7:B, 4uh8:A, 4uh8:B, 4uh9:A, 4uh9:B, 4uha:A, 4uha:B, 5uo8:A, 5uo8:B, 5uo8:C, 5uo8:D, 5uo9:A, 5uo9:B, 5uo9:C, 5uo9:D, 5uoa:A, 5uoa:B, 5uob:A, 5uob:B, 5uob:C, 5uob:D, 5uoc:A, 5uoc:B, 5uoc:C, 5uoc:D, 5uod:A, 5uod:B, 4upq:A, 4upq:B, 4upr:A, 4upr:B, 4ups:A, 4ups:B, 4upt:A, 4upt:B, 5vv6:A, 5vv6:B, 5vv7:A, 5vv7:B, 5vv8:A, 5vv8:B, 5vv9:A, 5vv9:B, 5vva:A, 5vva:B, 5vvb:A, 5vvb:B, 5vvb:C, 5vvb:D, 5vvc:A, 5vvc:B, 5vvc:C, 5vvc:D, 5vvd:A, 5vvd:B, 5vvd:C, 5vvd:D, 5vvg:A, 5vvg:B, 5vvn:A, 5vvn:B, 1zzs:A, 1zzs:B, 1zzt:A, 1zzt:B
17 5xbp:A 444 81 0.0916 0.0541 0.2963 3.9 5xbp:D, 5xbp:G
18 2c9e:A 317 41 0.0611 0.0505 0.3902 4.6
19 3w5m:A 1030 43 0.0649 0.0165 0.3953 6.6 3w5n:A
20 2nr9:A 192 58 0.0534 0.0729 0.2414 7.6
21 3mga:B 395 32 0.0458 0.0304 0.3750 8.2
22 3e7g:C 423 68 0.0649 0.0402 0.2500 8.6 4cx7:A, 4cx7:D, 4cx7:B, 4cx7:C, 3e7g:A, 3e7g:B, 3e7g:D, 3ej8:A, 3ej8:B, 3ej8:C, 3ej8:D, 4nos:A, 4nos:B, 4nos:C, 4nos:D, 1nsi:A, 1nsi:B, 1nsi:C, 1nsi:D, 2nsi:A, 2nsi:B, 2nsi:C, 2nsi:D

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218