Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
TVVPLHTWVLISNFKLSYNILRRADGTFERDLGEYLDRRVPANARPLEGVSSFDHIIDQSVGLEVRIYRAAFLTDAPAAE
PFPVIIFFHGGSFVHSSASSTIYDSLCRRFVKLSKGVVVSVNYRRAPEHRYPCAYDDGWTALKWVMSQPFMRSAQARVFL
SGDSSGGNIAHHVAVRAADEGVKVCGNILLNAMFGGTERTESERRLDGKYFVTLQDRDWYWKAYLPEDADRDHPACNPFG
PNGRRLGGLPFAKSLIIVSGLDLTCDRQLAYADALREDGHHVKVVQCENATVGFYLLPNTVHYHEVMEEISDFLNANL

The query sequence (length=318) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 3ebl:A 323 322 0.9969 0.9814 0.9845 0.0 3ebl:B, 3ebl:C, 3ebl:D, 3ebl:E, 3ebl:F, 3ed1:A, 3ed1:B, 3ed1:C, 3ed1:D, 3ed1:E, 3ed1:F
2 2zsi:A 339 330 0.6509 0.6106 0.6273 1.37e-151 2zsh:A
3 8vcd:A 321 280 0.3113 0.3084 0.3536 8.05e-38
4 2o7r:A 307 245 0.2736 0.2834 0.3551 1.41e-33
5 6rt8:A 314 261 0.2547 0.2580 0.3103 3.57e-26 6rt8:B, 6rt8:C, 6rt8:D, 6rt8:E, 6rt8:F, 6rt8:G, 6rt8:H
6 6i8d:A 315 237 0.2390 0.2413 0.3207 1.04e-25 6i8d:B, 6rb0:A, 6rb0:B, 6rky:A, 6rky:B, 6rky:C, 6rky:D
7 8ea1:A 317 273 0.2327 0.2334 0.2711 1.98e-24
8 1qz3:A 309 263 0.2421 0.2492 0.2928 1.57e-23
9 4v2i:A 315 256 0.2201 0.2222 0.2734 3.78e-23 4v2i:B
10 4ob6:A 319 270 0.2264 0.2257 0.2667 7.25e-19 4ou4:A
11 6iey:A 307 236 0.2044 0.2117 0.2754 3.05e-18
12 7cih:C 311 221 0.2138 0.2186 0.3077 2.96e-16 7ci0:A, 7ci0:B, 7ci0:C, 7ci0:D, 7cih:A, 7cih:B, 7cih:D, 7cip:A, 7cip:B, 7cip:C, 7cip:D, 6keu:A, 6keu:B, 6keu:C, 6keu:D, 6kf1:A, 6kf1:B, 6kf1:C, 6kf1:D, 6kf5:A, 6kf5:B, 6kf5:C, 6kf5:D, 6kf7:A, 6kf7:B, 6kf7:C, 6kf7:D, 7w8n:A, 7w8n:B, 7w8n:C, 7w8n:D
13 8p7e:A 309 229 0.2013 0.2071 0.2795 3.81e-11 8p7e:B, 8p8f:A, 8p8f:B
14 6z69:B 364 294 0.2547 0.2225 0.2755 6.52e-11 6z69:A
15 7auy:B 245 108 0.1038 0.1347 0.3056 7.52e-11
16 7at3:A 295 108 0.1038 0.1119 0.3056 1.07e-10 7at3:B, 7at4:A, 7atd:B, 7atf:A, 7atf:B, 7atq:A, 7auy:A, 7av5:AAA, 7av5:BBB, 7nb5:A
17 8q03:A 318 163 0.1478 0.1478 0.2883 3.44e-09 8q03:B, 8q03:C
18 6zl7:B 319 106 0.1038 0.1034 0.3113 1.37e-06 6zl7:A
19 5mif:C 301 88 0.0786 0.0831 0.2841 8.42e-05 5mif:D
20 1c7i:A 483 125 0.1101 0.0725 0.2800 3.44e-04 1qe3:A
21 7mp4:A 534 154 0.1289 0.0768 0.2662 0.002 7mp4:B, 7mp4:C, 7mp4:D, 7mp4:E, 7mp4:F, 7mp4:G, 7mp4:H
22 5hc2:A 343 115 0.0975 0.0904 0.2696 0.002 5hc0:A, 5hc2:B, 5hc2:C, 5hc2:D, 5hc3:B, 5hc3:D, 5hc4:A
23 8yqp:A 291 121 0.0912 0.0997 0.2397 0.002
24 4bc0:A 542 46 0.0597 0.0351 0.4130 0.003 4a16:A, 4a16:B, 4a16:C, 4a16:D, 4a23:A, 4a23:B, 4ara:A, 4ara:B, 4arb:A, 4arb:B, 4b7z:A, 4b7z:B, 4b80:A, 4b80:B, 4b81:A, 4b81:B, 4b82:A, 4b82:B, 4b83:A, 4b83:B, 4b84:A, 4b84:B, 4b85:A, 4b85:B, 4bc0:B, 4bc0:C, 4bc0:D, 4bc1:A, 4bc1:B, 4bc1:C, 4bc1:D, 4btl:A, 4btl:B, 2c0p:A, 2c0p:B, 2c0q:A, 2c0q:B, 5dtj:A, 5dtj:B, 5ehn:A, 5ehn:B, 5ehq:A, 5ehq:B, 5ehz:A, 5ehz:B, 5eia:A, 5eia:B, 5eie:A, 5eie:B, 5eih:A, 5eih:B, 5fkj:A, 5fkj:D, 5fkj:B, 5fkj:C, 5foq:A, 5foq:B, 5fpp:A, 5fpp:B, 6fsd:A, 6fsd:B, 6fse:A, 6fse:B, 5fum:A, 5fum:B, 2gyu:A, 2gyu:B, 2gyv:A, 2gyv:B, 2gyw:A, 2gyw:B, 2h9y:A, 2h9y:B, 2ha0:A, 2ha0:B, 2ha2:A, 2ha2:B, 2ha3:A, 2ha3:B, 2ha4:A, 2ha4:B, 2ha5:A, 2ha5:B, 2ha6:A, 2ha6:B, 2ha7:A, 2ha7:B, 1j06:A, 1j06:B, 1j07:A, 1j07:B, 2jey:A, 2jey:B, 2jez:A, 2jez:B, 2jf0:A, 2jf0:B, 1maa:A, 1maa:B, 1maa:C, 1maa:D, 1n5m:A, 1n5m:B, 1n5r:A, 8orc:A, 8orc:B, 5ov9:A, 5ov9:B, 1q83:A, 1q83:B, 1q84:A, 1q84:B, 7qak:A, 7qak:B, 7qb4:A, 7qb4:B, 7qyn:A, 7qyn:B, 7r02:A, 7r02:B, 7r0a:A, 7r0a:B, 7r2f:A, 7r2f:B, 7r3c:A, 7r3c:B, 7r4e:A, 7r4e:B, 6td2:A, 6td2:B, 2whp:A, 2whp:B, 2whq:A, 2whq:B, 2whr:A, 2whr:B, 2wls:A, 2wls:B, 2wu3:A, 2wu3:B, 2wu4:A, 2wu4:B, 2xud:A, 2xuf:A, 2xuf:B, 2xug:A, 2xug:B, 2xuh:A, 2xuh:B, 2xui:A, 2xui:B, 2xuj:A, 2xuj:B, 2xuk:A, 2xuk:B, 2xuo:A, 2xuo:B, 2xup:A, 2xup:B, 2xuq:A, 2xuq:B, 3zlu:B, 3zlv:A, 3zlv:B
25 5thm:A 520 105 0.0912 0.0558 0.2762 0.008
26 4bdt:A 563 44 0.0535 0.0302 0.3864 0.012 8aen:B, 8aen:A, 8aev:A, 8aev:B, 6cqt:A, 6cqt:B, 6cqu:A, 6cqu:B, 6cqv:A, 6cqv:B, 6cqw:A, 6cqw:B, 6cqx:A, 6cqx:B, 6cqy:A, 6cqy:B, 6cqz:A, 6cqz:B, 7d9o:A, 7d9o:B, 7d9p:A, 7d9p:B, 7d9q:A, 7d9q:B, 8dt4:A, 8dt4:B, 8dt5:A, 8dt5:B, 8dt7:A, 8dt7:B, 7e3h:A, 7e3h:B, 4ey5:A, 4ey5:B, 4ey6:A, 4ey6:B, 4ey7:A, 4ey7:B, 6f25:A, 6f25:B, 5hf6:B, 5hf6:A, 5hf8:A, 5hf8:B, 5hf9:A, 5hf9:B, 5hfa:A, 5hfa:B, 5hq3:A, 5hq3:B, 4m0e:A, 4m0e:B, 4m0f:A, 4m0f:B, 6nea:A, 6nea:B, 6ntg:A, 6ntg:B, 6nth:A, 6nth:B, 6ntk:A, 6ntk:B, 6ntl:A, 6ntl:B, 6ntm:A, 6ntm:B, 6ntn:A, 6ntn:B, 6nto:A, 6nto:B, 6o4w:A, 6o4w:B, 6o4x:A, 6o4x:B, 6o50:A, 6o50:B, 6o52:A, 6o52:B, 6o5r:A, 6o5r:B, 6o5s:A, 6o5s:B, 6o5v:A, 6o5v:B, 6o66:A, 6o66:B, 7p1n:aa, 7p1n:A, 7p1n:bb, 7p1p:aa, 7p1p:A, 7p1p:bb, 7rb5:A, 7rb6:A, 7rb6:B, 7rb7:A, 7rb7:B, 6u34:A, 6u34:B, 6u37:A, 6u37:B, 6u3p:A, 6wuv:A, 6wuv:B, 6wuy:A, 6wuy:B, 6wuz:A, 6wuz:B, 6wv1:A, 6wv1:B, 6wvc:A, 6wvc:B, 6wvo:A, 6wvo:B, 6wvp:A, 6wvp:B, 6wvq:A, 6wvq:B, 7xn1:A, 7xn1:B, 6zwe:A
27 4n5i:X 311 150 0.1289 0.1318 0.2733 0.012 4ouk:X, 4po3:X
28 7xfz:H 234 126 0.0975 0.1325 0.2460 0.016 7xg0:H, 7xg2:H, 7xg3:H, 7xg4:H
29 7w1i:A 497 83 0.0943 0.0604 0.3614 0.030 7w1j:A, 7w1l:A
30 4qww:A 529 111 0.0849 0.0510 0.2432 0.049 4qww:B
31 6nkf:A 301 117 0.0943 0.0997 0.2564 0.13 6nkf:D
32 2fj0:A 530 111 0.0881 0.0528 0.2523 0.13
33 6i2t:B 562 102 0.0881 0.0498 0.2745 0.18 7aiy:A, 8ai7:F, 7amz:A, 8am1:A, 8am2:A, 4aqd:A, 4aqd:B, 7awg:A, 7awh:A, 7awi:A, 4axb:A, 4b0o:A, 4b0p:A, 4bbz:A, 4bds:A, 7bgc:A, 7bo3:A, 7bo4:A, 8cgo:A, 3djy:A, 3dkk:A, 5dyt:A, 5dyt:B, 5dyw:A, 5dyw:B, 5dyy:A, 5dyy:B, 6ep4:A, 6eqp:A, 6eqq:A, 6esj:A, 6esj:B, 6esy:B, 6esy:A, 6eyf:A, 6f7q:A, 6f7q:B, 6i0b:A, 6i0c:A, 6i2t:A, 6i2t:C, 6i2t:D, 2j4c:A, 5k5e:A, 5k5e:B, 5lkr:A, 5lkr:B, 5nn0:A, 3o9m:A, 3o9m:B, 1p0i:A, 1p0m:A, 1p0p:A, 1p0q:A, 7q1m:A, 7q1n:A, 7q1o:A, 7q1p:A, 6qaa:A, 6qab:A, 6qac:A, 6qad:A, 6qae:A, 7qbq:A, 7qbr:A, 7qhd:A, 7qhe:A, 6r6v:A, 6r6w:A, 6rua:A, 6rua:B, 6sam:A, 6t9p:A, 6t9s:A, 4tpk:A, 4tpk:B, 2wid:A, 2wif:A, 2wig:A, 2wij:A, 2wik:A, 2wil:B, 2wil:A, 2wsl:A, 4xii:A, 4xii:B, 1xlu:A, 1xlv:A, 1xlw:A, 2xmb:A, 2xmc:A, 2xmd:A, 2xmg:A, 2xqf:A, 2xqg:A, 2xqi:A, 2xqj:A, 2xqk:A, 6xta:A, 2y1k:A, 7zpb:A, 6zwi:A
34 4bzw:A 275 110 0.0786 0.0909 0.2273 1.0 4bzw:B, 4bzz:A, 4c01:A, 4c01:E, 4c01:B, 4c01:C, 4c01:F, 4c01:D
35 3k9b:C 453 115 0.1069 0.0751 0.2957 1.8
36 6xyc:A 285 104 0.0818 0.0912 0.2500 2.0
37 1mx9:D 533 115 0.1069 0.0638 0.2957 2.2 2dqy:A, 2dqy:B, 2dqy:C, 2dqz:A, 2dqz:B, 2dqz:C, 2dr0:A, 2dr0:B, 2dr0:C, 2h7c:A, 2h7c:F, 2h7c:B, 2h7c:D, 2h7c:C, 2h7c:E, 2hrq:A, 2hrq:B, 2hrq:C, 2hrq:D, 2hrq:E, 2hrq:F, 2hrr:A, 2hrr:B, 2hrr:C, 1mx1:A, 1mx1:B, 1mx1:C, 1mx1:D, 1mx1:E, 1mx1:F, 1mx5:A, 1mx5:B, 1mx5:C, 1mx5:D, 1mx5:E, 1mx5:F, 1mx9:A, 1mx9:B, 1mx9:C, 1mx9:E, 1mx9:F, 1mx9:G, 1mx9:H, 1mx9:I, 1mx9:J, 1mx9:K, 1mx9:L, 1ya4:A, 1ya4:B, 1ya4:C, 1ya8:A, 1ya8:B, 1ya8:C, 1yah:A, 1yah:B, 1yah:C, 1yaj:A, 1yaj:B, 1yaj:D, 1yaj:E, 1yaj:F, 1yaj:G, 1yaj:H, 1yaj:I, 1yaj:J, 1yaj:K, 1yaj:L
38 6ynx:h 231 55 0.0472 0.0649 0.2727 2.5 6ynx:H, 6yny:h, 6yny:H, 6ynz:h, 6ynz:H, 6ynz:h3, 6ynz:H3
39 3k9b:B 499 115 0.1069 0.0681 0.2957 2.6 3k9b:A
40 4fnm:A 569 168 0.0975 0.0545 0.1845 2.7 5ch5:A, 5ivi:A, 5ivk:A, 4qwm:A, 5tyj:A, 5tyk:A, 5tyl:A, 5tym:A, 5tyn:A, 5tyo:A, 5typ:A, 4ubi:A, 4ubj:A, 4ubk:A, 4ubl:A, 4ubm:A, 4ubn:A, 4ubo:A, 4w1p:A, 4w1q:A, 4w1r:A, 4w1s:A
41 4xho:A 369 43 0.0346 0.0298 0.2558 3.6 4xe8:A, 4xhn:A
42 8axc:B 532 104 0.1038 0.0620 0.3173 3.9 8axc:A, 8axc:C, 8axc:D
43 6ecd:A 245 34 0.0409 0.0531 0.3824 3.9 6ece:B
44 6ecf:D 265 34 0.0409 0.0491 0.3824 4.1 6ece:A, 6ecf:A, 6ecf:B, 6ecf:C, 6ecf:E, 6ecf:F
45 5yp2:A 724 99 0.0755 0.0331 0.2424 4.2 5yp2:B, 5yp3:A, 5yp3:B, 5yp3:C, 5yp3:D, 5yp4:A, 5yp4:B, 5yp4:C, 5yp4:D
46 5ydj:B 538 93 0.0849 0.0502 0.2903 4.2 6ary:A, 6ary:B
47 1k4y:A 501 157 0.1226 0.0778 0.2484 6.1
48 7aaq:A 487 14 0.0252 0.0164 0.5714 6.1 7aar:A, 6h7d:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218