Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
TVPGKVTLQKDAQNLIGISIGGGAQYCPCLYIVQVFDNTPAALDGTVAAGDEITGVNGRSIKGKTKVEVAKMIQEVKGEV
TIHYNKL

The query sequence (length=87) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 6ar4:B 87 87 1.0000 1.0000 1.0000 1.93e-59 6ar4:A, 6bjo:A, 6bjo:B, 2pku:A
2 2exg:A 101 84 0.3333 0.2871 0.3452 1.06e-06 2ain:A, 7qcr:B, 7qcr:A
3 2r4h:C 98 69 0.2414 0.2143 0.3043 1.48e-06
4 4e34:A 87 76 0.2644 0.2644 0.3026 7.05e-06 4e34:B, 4e35:A, 4e35:B, 5ic3:A, 5ic3:B, 4joe:A, 4joe:B, 4jof:A, 4jof:B, 4jog:A, 4jog:B, 4joh:A, 4joh:B, 4joj:A, 4joj:B, 4jok:A, 4jok:B, 4jop:A, 4jop:B, 4jor:A, 4jor:B, 7jzo:A, 7jzo:B, 7jzp:A, 7jzp:B, 7jzq:A, 7jzr:A, 7jzr:B, 5k4f:A, 5k4f:B, 4k6y:A, 4k6y:B, 4k72:A, 4k72:B, 4k75:A, 4k76:A, 4k76:B, 4k76:C, 4k76:D, 4k78:A, 2lob:A, 4nmo:A, 4nmo:B, 4nmp:A, 4nmp:B, 4nmq:A, 4nmq:B, 4nmr:A, 4nmr:B, 4nms:A, 4nms:B, 4nmt:A, 4nmt:B, 4nmv:A, 4nmv:B, 6ov7:A, 6ov7:B, 4q6h:A, 4q6s:A, 4q6s:B, 6v84:A, 6v84:B, 6xnj:A
5 2kpl:A 129 69 0.2644 0.1783 0.3333 8.75e-05
6 5n7d:A 423 60 0.2414 0.0496 0.3500 1.13e-04 2i04:A, 2i04:B, 5n7d:B, 5n7f:A, 5n7f:B, 5n7g:A, 7p71:A, 7p71:B, 6twq:B, 6twq:A, 6twu:B, 6twu:A, 6twx:B, 6twx:A, 6twy:B, 6twy:A
7 6nid:B 88 77 0.2414 0.2386 0.2727 1.22e-04 6nid:A, 6nid:C
8 8bp4:A 93 78 0.2759 0.2581 0.3077 4.73e-04 8bp4:C, 8bp4:B
9 7qqn:C 414 77 0.2414 0.0507 0.2727 6.36e-04 7pc7:A, 7pc7:B, 7pc8:A, 7pc8:B, 7qql:C, 7qql:B, 7qqn:A
10 1zub:A 109 78 0.2759 0.2202 0.3077 8.00e-04
11 4xhv:A 94 74 0.2299 0.2128 0.2703 0.001
12 3cyy:B 81 80 0.2299 0.2469 0.2500 0.002 3cyy:A
13 1ihj:B 95 84 0.2644 0.2421 0.2738 0.002 1ihj:A
14 2pdz:A 86 79 0.2529 0.2558 0.2785 0.003
15 7p73:A 420 52 0.2299 0.0476 0.3846 0.003 8ael:A, 7p74:A, 7pc9:A, 7pc9:B, 7r2m:A, 7r2m:D, 7r2t:A
16 3jxt:A 96 80 0.2759 0.2500 0.3000 0.009 3jxt:B
17 2qt5:A 194 82 0.2874 0.1289 0.3049 0.012 2qt5:B
18 2egn:A 83 69 0.2299 0.2410 0.2899 0.015
19 5zys:A 90 60 0.2069 0.2000 0.3000 0.016
20 7qct:A 90 47 0.1609 0.1556 0.2979 0.017 7qct:B
21 6kz1:A 97 76 0.3218 0.2887 0.3684 0.021 6y38:A, 6y38:B, 6y9n:A, 6y9o:A, 6y9p:A, 6y9p:B, 6y9p:I, 6y9p:E, 6y9p:G, 6y9p:K, 6y9q:B
22 7d6f:A 87 49 0.1724 0.1724 0.3061 0.023
23 8bq8:C 93 82 0.2644 0.2473 0.2805 0.024 8bq8:A, 8bq8:B
24 6gbe:A 119 69 0.2414 0.1765 0.3043 0.025
25 4xh7:A 110 52 0.1724 0.1364 0.2885 0.025
26 1u38:A 89 82 0.2299 0.2247 0.2439 0.027
27 7p70:A 407 67 0.2184 0.0467 0.2836 0.033 7pc4:A, 7qql:A
28 1n7f:A 86 71 0.2299 0.2326 0.2817 0.036 1n7f:B
29 4wsi:A 372 50 0.1724 0.0403 0.3000 0.097 7m4r:A, 7ntj:B, 7ntj:A, 7ntk:A, 7ntk:D, 7ntk:B, 7ntk:F, 7qcs:A, 7qcs:B, 4uu5:A, 4wsi:B
30 5heb:A 119 80 0.2414 0.1765 0.2625 0.11 1be9:A, 5d13:B, 5d13:A, 5d13:C, 5d13:D, 5hed:A, 5hey:A, 5hf1:A, 5hfb:A, 5hfc:A, 5hfe:A, 5hff:A, 1tp3:A, 1tp5:A
31 6zbq:A 89 71 0.2184 0.2135 0.2676 0.12 6zc4:A
32 2kqf:A 96 67 0.2414 0.2188 0.3134 0.17 2kyl:A
33 2m0z:A 97 64 0.2414 0.2165 0.3281 0.20 1d5g:A, 3lny:A, 2m10:A, 1vj6:A, 7xty:A, 7xty:B
34 1rzx:A 98 51 0.1839 0.1633 0.3137 0.23 5i7z:A, 1x8s:A
35 1l6o:A 95 73 0.2069 0.1895 0.2466 0.42 2f0a:B, 2f0a:D, 1l6o:B, 1l6o:C, 6zbq:B, 6zbz:A, 6zbz:B, 6zbz:C, 6zbz:D, 6zc3:A, 6zc3:B, 6zc4:B, 6zc6:A, 6zc7:A, 6zc7:B, 6zc8:A, 6zc8:B
36 2kaw:A 90 73 0.2069 0.2000 0.2466 0.47 6lcb:A, 2mx6:A
37 2os6:A 89 70 0.2644 0.2584 0.3286 0.48
38 2ka9:A 189 47 0.1839 0.0847 0.3404 0.52 8cn1:B, 8cn1:A, 8cn1:E, 8cn1:D, 2mho:A, 1rgr:A, 3rl7:A, 3rl7:F, 3rl7:D, 3rl7:C, 3rl7:E, 6spv:A, 6spz:A
39 2ejy:A 85 38 0.1264 0.1294 0.2895 0.55
40 1bpw:A 503 47 0.1609 0.0278 0.2979 0.59 1bpw:B, 1bpw:C, 1bpw:D
41 7pc3:A 405 48 0.1724 0.0370 0.3125 0.66 2awu:B, 2aww:A, 2awx:B, 8cn3:A, 8cn3:B, 2g2l:A, 2g2l:B, 4g69:A, 2i0l:A, 2i0l:B, 2m3m:A, 4oaj:A, 2oqs:A, 3rl8:B
42 2koh:A 111 46 0.1264 0.0991 0.2391 0.66 9imp:A, 9imp:B, 9imp:C, 9imp:D, 9imp:E, 9imp:F, 6jue:L, 2k20:A
43 5ez0:D 95 70 0.2069 0.1895 0.2571 0.82 5eyz:A, 5eyz:B, 5eyz:C, 5eyz:D, 5ez0:A, 5ez0:C, 5ez0:B, 3nfk:A, 3nfk:B, 3nfl:A, 3nfl:B, 3nfl:C, 3nfl:D, 7vze:A, 7vze:B, 7vze:C, 7vze:D
44 2i0i:A 81 55 0.2184 0.2346 0.3455 0.85 2i0i:B, 2i0i:C
45 8blu:B 195 78 0.2644 0.1179 0.2949 0.88 5a2p:A, 5a2p:B, 5a2p:D, 5a2p:C, 8aai:A, 8aai:B, 8aai:C, 8aai:D, 8aak:A, 8aak:B, 8aao:A, 8aao:B, 8aap:A, 8aap:B, 6ak2:A, 6ak2:B, 8blu:C, 8blu:D, 8blv:A, 8blv:B, 7fsg:B, 7fsg:C, 7fsg:D, 7fsh:B, 7fsh:C, 7fsh:D, 7fsi:B, 7fsi:C, 7fsi:D, 7fsj:A, 7fsj:B, 7fsj:C, 7fsj:D, 7fsk:B, 7fsk:C, 7fsk:D, 7fsl:A, 7fsl:B, 7fsl:C, 7fsl:D, 7fsm:A, 7fsm:B, 7fsm:C, 7fsm:D, 7fsn:A, 7fsn:B, 7fsn:C, 7fsn:D, 7fso:B, 7fso:C, 7fso:D, 7fsp:B, 7fsp:C, 7fsp:D, 7fsq:B, 7fsq:A, 7fsq:C, 7fsq:D, 7fsr:B, 7fsr:C, 7fsr:D, 7fss:A, 7fss:B, 7fss:C, 7fss:D, 7fst:B, 7fst:C, 7fst:D, 7fsu:B, 7fsu:C, 7fsu:D, 7fsv:A, 7fsv:B, 7fsv:C, 7fsv:D, 7fsw:A, 7fsw:B, 7fsw:C, 7fsw:D, 7fsx:B, 7fsx:C, 7fsx:D, 7fsy:A, 7fsy:B, 7fsy:C, 7fsy:D, 7fsz:B, 7fsz:C, 7fsz:D, 7ft0:B, 7ft0:C, 7ft0:D, 7ft1:B, 7ft1:C, 7ft1:D, 7ft2:B, 7ft2:C, 7ft2:D, 7ft3:B, 7ft3:A, 7ft3:C, 7ft3:D, 7ft4:A, 7ft4:B, 7ft4:C, 7ft4:D, 7ft5:A, 7ft5:B, 7ft5:C, 7ft5:D, 7ft6:B, 7ft6:C, 7ft6:D, 7ft7:A, 7ft7:B, 7ft7:C, 7ft7:D, 7ft8:B, 7ft8:C, 7ft8:D, 7ft9:B, 7ft9:C, 7ft9:D, 7fta:B, 7fta:C, 7fta:D, 7ftb:B, 7ftb:C, 7ftb:D, 7ftc:B, 7ftc:C, 7ftc:D, 7ftd:A, 7ftd:C, 7ftd:B, 7ftd:D, 5g1d:B, 5g1d:A, 8hck:A, 8hu2:A, 1obx:A, 1oby:A, 1oby:B, 1obz:A, 6r9h:A, 6r9h:C, 6rlc:A, 6rlc:B, 6rlc:C, 6rlc:D, 1v1t:B, 1v1t:A, 1w9e:A, 1w9e:B, 1w9o:B, 1w9o:A, 1w9q:B, 1ybo:A, 1ybo:B, 4z33:A, 4z33:B
46 4wyu:A 201 66 0.2184 0.0945 0.2879 0.93 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
47 2y05:A 328 45 0.1839 0.0488 0.3556 1.7 2y05:B, 2y05:C, 2y05:D
48 3cs0:A 392 31 0.1609 0.0357 0.4516 2.1 8f0a:A, 8f0a:B, 8f0a:C, 8f0u:A, 8f1t:A, 8f1t:B, 8f1t:C, 8f1u:A, 8f1u:B, 8f1u:C, 8f21:A, 8f21:B, 8f21:C, 8f26:A, 6jjk:A, 6jjk:B, 6jjk:C, 6jjk:D, 6jjk:E, 6jjk:F, 6jjl:A, 6jjl:B, 6jjl:C, 6jjl:D, 6jjl:E, 6jjl:F, 6jjo:A, 6jjo:B, 6jjo:C, 6jjo:D, 6jjo:E, 6jjo:F, 3mh5:A, 3mh5:B, 3mh6:A, 3mh7:A, 3otp:A, 3otp:B, 3otp:C, 3otp:D, 3otp:E, 3otp:F, 3ou0:A
49 5gmj:B 224 52 0.1839 0.0714 0.3077 2.4 5gmi:A, 5gmi:B, 5gmj:A, 5h3j:A
50 4c2c:A 433 33 0.1609 0.0323 0.4242 3.0 4c2d:A, 4c2d:B, 4c2d:C, 4c2f:A, 4c2g:A
51 3vqg:A 85 55 0.1379 0.1412 0.2182 3.0
52 6lqs:B1 806 40 0.1609 0.0174 0.3500 3.0 7aju:UA, 7d4i:B1, 7d5t:B1, 7d63:B1, 6lqr:B1, 6lqt:B1, 6lqv:B1, 6zqd:UA, 6zqe:UA, 6zqf:UA
53 7ajt:UA 834 40 0.1609 0.0168 0.3500 3.0 7d5s:B1, 6ke6:B1, 6lqp:B1, 6lqq:B1, 6lqu:B1, 6nd4:O, 7suk:LO, 5wlc:LO, 6zqa:UA, 6zqb:UA, 6zqc:UA
54 5vmt:B 334 48 0.1724 0.0449 0.3125 3.1 5vmt:A, 5vmt:C, 5vmt:D, 5vmt:F, 5vmt:G, 5vmt:H
55 6hks:B 94 70 0.1954 0.1809 0.2429 4.1 8cqy:A, 6hks:A, 6hks:C, 6hks:D, 6hks:E, 6hks:F, 8oep:A, 8oep:C, 6t36:A
56 3nol:A 234 26 0.1264 0.0470 0.4231 4.1 3nom:A, 3nom:B
57 2m0u:A 117 44 0.1724 0.1282 0.3409 4.3
58 6i97:A 763 16 0.1264 0.0144 0.6875 4.5 8b43:A, 6i96:A, 6i97:B, 6i98:A, 6z8a:A
59 4asm:B 357 60 0.2299 0.0560 0.3333 6.0
60 6uwr:A 660 38 0.1609 0.0212 0.3684 6.4 6uwi:A, 6uwi:h, 6uwi:G, 6uwi:n, 6uwi:F, 6uwi:m, 6uwi:E, 6uwi:l, 6uwi:D, 6uwi:k, 6uwi:C, 6uwi:j, 6uwi:B, 6uwi:i, 6uwi:H, 6uwi:a, 6uwi:I, 6uwi:b, 6uwi:J, 6uwi:c, 6uwi:K, 6uwi:d, 6uwi:L, 6uwi:e, 6uwi:M, 6uwi:f, 6uwi:N, 6uwi:g, 6uwr:B, 6uwr:C, 6uwr:D, 6uwr:E, 6uwr:F, 6uwr:G, 6uwr:H, 6uwr:I, 6uwr:J, 6uwr:K, 6uwr:L, 6uwr:M, 6uwr:N, 6uwt:H, 6uwt:I, 6uwt:J, 6uwt:K, 6uwt:L, 6uwt:M, 6uwt:N, 6uwt:A, 6uwt:B, 6uwt:C, 6uwt:D, 6uwt:E, 6uwt:F, 6uwt:G
61 3suc:A 767 55 0.2069 0.0235 0.3273 6.7 3gq7:A, 3gq8:A, 3gqa:A, 3gqk:A
62 8q6z:A 390 11 0.0920 0.0205 0.7273 7.0
63 8u2r:A 664 56 0.1839 0.0241 0.2857 8.0 8sf3:A, 8u2s:A, 8u2s:B, 8u2t:A, 8u2u:A
64 3ppt:A 133 28 0.1609 0.1053 0.5000 9.7 3pp6:A, 3pp6:B, 3pp6:C

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218