Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
TVLHLGLRAGQVANRIVSVGSLGRAKVLAQLLDEGHFETFESARGFTTYSGKVKGVPVSIVATGMGVPNMDFVVRETRAV
VNGPMTIIRFGTCGAVREEVPPGSVVVNGKGSIMVTRNPDAFFPGASEEDCYRVSRVMPSSSTLSKALVASMEDKLTALR
AEPVIAASSDCDALRVFDGLNATACSFYSSQGRLDSNFDDRNEKLVEDLTTAHPDLYTVEMETFHLLDLAQRSRGSIQAT
AAVLVVANRLSGQIVESEVLEALESFWGGVVLQTIVSTPL

The query sequence (length=280) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 6k8p:A 294 280 1.0000 0.9524 1.0000 0.0 6k5h:A, 6k5h:D, 6k5h:B, 6k5h:C, 6k5k:A, 6k5k:C, 6k5k:B, 6k5k:D, 6k8p:B, 6k8p:C, 6k8p:D
2 3bje:A 327 329 0.3179 0.2722 0.2705 2.20e-18 3bje:B
3 4dae:A 232 105 0.1250 0.1509 0.3333 2.83e-12 4d8v:A, 4d8v:B, 4d9h:A, 4d9h:B, 4da0:A, 4da6:A, 4da7:A, 4da8:A, 4dab:A, 4dan:A, 4dan:B, 4dao:A, 4dao:B, 4dar:A
4 1odi:A 234 105 0.1357 0.1624 0.3619 5.85e-12 1odi:B, 1odi:C, 1odi:D, 1odi:E, 1odi:F, 1odj:A, 1odj:B, 1odj:C, 1odj:D, 1odj:E, 1odj:F, 1odl:A, 1odl:F, 1odl:B, 1odl:C, 1odl:D, 1odl:E
5 1jdv:C 235 105 0.1286 0.1532 0.3429 4.52e-11 1jds:A, 1jds:B, 1jds:C, 1jds:D, 1jds:E, 1jds:F, 1jdt:A, 1jdt:B, 1jdt:C, 1jdv:A, 1jdv:B, 1jdv:D, 1jdv:E, 1jdv:F, 1jdz:A, 1jdz:B, 1jdz:C, 1je0:A, 1je0:B, 1je0:C, 1je1:A, 1je1:B, 1je1:C, 1je1:D, 1je1:E, 1je1:F, 1jp7:A, 1jp7:B, 1jp7:C, 1jpv:A, 1jpv:B, 1jpv:C
6 3uaw:A 233 105 0.1250 0.1502 0.3333 1.87e-10 2ac7:A, 2ac7:B, 3uav:A, 3uax:A, 3uay:A, 3uaz:A
7 4r2w:D 251 201 0.2000 0.2231 0.2786 2.23e-09 7q2w:FFF, 4r2w:A, 4r2w:B, 4r2w:C, 4r2w:E, 4r2w:F, 4r2x:C, 4r2x:D, 4r2x:E, 4r2x:F, 4r2x:A, 4r2x:B, 4yjk:D, 4yjk:F, 4yjk:A
8 3qpb:C 254 121 0.1250 0.1378 0.2893 2.35e-09 3qpb:A, 3qpb:B, 3qpb:D, 3qpb:E, 3qpb:F, 3qpb:G, 3qpb:H, 3qpb:I, 3qpb:J, 3qpb:K, 3qpb:L, 3qpb:M, 3qpb:N, 3qpb:O, 3qpb:P, 3qpb:Q, 3qpb:R
9 2isc:D 238 104 0.1143 0.1345 0.3077 5.96e-09 2i4t:A, 2i4t:B, 2i4t:C, 2isc:A, 2isc:B, 2isc:C, 2isc:E, 2isc:F, 1z34:A, 1z35:A, 1z36:A, 1z37:A, 1z38:A, 1z39:A
10 3u40:D 241 106 0.1286 0.1494 0.3396 2.95e-08 3u40:A, 3u40:B, 3u40:C, 3u40:E, 3u40:F
11 4mch:A 243 104 0.1000 0.1152 0.2692 3.62e-08
12 5efo:B 253 269 0.2429 0.2688 0.2528 5.45e-08 5c80:A, 5c80:B, 5c80:C, 5c80:D, 5c80:E, 5c80:F, 5efo:A, 5efo:C, 5efo:D, 5efo:E, 5efo:F, 5epu:A, 5epu:B, 5epu:C, 5epu:D, 5epu:E, 5epu:F, 4k6o:A, 4k6o:B, 4k6o:C, 4k6o:D, 4k6o:E, 4k6o:F, 5lhv:A, 5lhv:B, 5lhv:C, 5lhv:D, 5lhv:E, 5lhv:F, 5lok:A, 5lok:B, 5lok:C, 5lok:D, 5lok:E, 5lok:F, 5m2t:A, 5m2t:B, 5m2t:C, 5m2t:D, 5m2t:E, 5m2t:F, 5miw:A, 5miw:B, 5miw:C, 5miw:D, 5miw:E, 5miw:F, 4oeh:A, 4oeh:B, 4oeh:E, 4oeh:F, 4ogl:A, 4ogl:B, 4ogl:C, 4ogl:D, 4ogl:E, 4ogl:F, 3pns:B, 3pns:C, 3pns:D, 3pns:E, 3pns:F, 3pns:G, 3pns:H, 3pns:I, 3pns:J, 3pns:K, 3pns:L, 6rca:A, 6rca:B, 6rca:C, 6rca:D, 6rca:E, 6rca:F, 4u2k:B, 4u2k:D, 4u2k:F
13 3occ:F 238 104 0.1179 0.1387 0.3173 1.73e-07 1a69:A, 1a69:B, 1a69:C, 5i3c:A, 5i3c:B, 5i3c:C, 5iu6:A, 5iu6:B, 5iu6:C, 1k9s:A, 1k9s:D, 1k9s:B, 1k9s:E, 1k9s:C, 1k9s:F, 3occ:A, 3occ:B, 3occ:C, 3occ:D, 3occ:E, 3ooe:A, 3ooe:B, 3ooe:C, 3ooe:D, 3ooe:E, 3ooe:F, 3opv:A, 3opv:B, 3opv:C, 3opv:D, 3opv:E, 3opv:F, 3opv:G, 3opv:H, 3opv:I, 3opv:J, 3opv:K, 3opv:L, 1oty:A, 1oty:B, 1oty:C, 1ou4:A, 1ou4:B, 1ou4:C, 1oum:A, 1oum:B, 1oum:C, 1ov6:A, 1ov6:B, 1ov6:C, 1ovg:A, 1ovg:B, 1ovg:C, 1pk7:A, 1pk7:B, 1pk7:C, 1pk9:A, 1pk9:B, 1pk9:C, 1pke:A, 1pke:B, 1pke:C, 1pr0:A, 1pr0:B, 1pr0:C, 1pr1:A, 1pr1:B, 1pr1:C, 1pr2:A, 1pr2:B, 1pr2:C, 1pr4:A, 1pr4:B, 1pr4:C, 1pr5:A, 1pr5:B, 1pr5:C, 1pr6:A, 1pr6:B, 1pr6:C, 1pw7:A, 1pw7:B, 1pw7:C, 4ts3:A, 4ts3:D, 4ts3:B, 4ts3:C, 4ts3:E, 4ts3:F, 4ts9:A, 4ts9:C, 4ts9:B, 4tta:A, 4tta:B, 4tta:C, 4tta:F, 4tta:D, 4tta:E, 4tti:A, 4tti:B, 4tti:C, 4tti:F, 4tti:D, 4tti:E, 4ttj:A, 4ttj:D, 4ttj:B, 3ut6:A, 3ut6:B, 3ut6:C, 6xz2:B, 6xz2:C
14 3of3:A 240 104 0.1143 0.1333 0.3077 1.87e-06 3of3:B, 3of3:C, 3of3:D, 3of3:E, 3of3:F, 3of3:G, 3of3:H, 3of3:I, 3of3:J, 3of3:K, 3of3:L, 1vhw:A, 1vhw:D, 1vhw:B, 1vhw:F, 1vhw:C, 1vhw:E
15 2hn9:A 253 283 0.2464 0.2727 0.2438 1.52e-05 3c74:A, 3c74:F, 3c74:B, 3c74:C, 3c74:D, 3c74:E, 4e1v:A, 4e1v:E, 4e1v:F, 4e1v:D, 4e1v:C, 4e1v:B, 4e1v:H, 4e1v:G, 3fwp:B, 3fwp:D, 3fwp:C, 3fwp:E, 3fwp:A, 3fwp:F, 2hn9:B, 2hn9:D, 2hn9:F, 2hrd:A, 2hrd:B, 2hrd:C, 2hrd:D, 2hrd:E, 2hrd:F, 2hwu:A, 2hwu:B, 2hwu:C, 2hwu:D, 2hwu:E, 2hwu:F, 3kvv:A, 3kvv:B, 3kvv:C, 3kvv:D, 3kvv:E, 3kvv:F, 2oec:B, 2oec:F, 2pga:B, 2pga:D, 2pga:F, 2rj3:A, 2rj3:D, 2rj3:F, 2rj3:E, 2rj3:B, 1rxc:A, 1rxc:B, 1rxc:C, 1rxc:D, 1rxc:E, 1rxc:F, 1rxc:I, 1rxc:J, 1rxc:K, 1rxc:L, 1rxs:A, 1rxs:a, 1rxs:B, 1rxs:b, 1rxs:C, 1rxs:c, 1rxs:D, 1rxs:d, 1rxs:E, 1rxs:e, 1rxs:F, 1rxs:R, 1rxs:G, 1rxs:P, 1rxs:H, 1rxs:h, 1rxs:I, 1rxs:i, 1rxs:J, 1rxs:j, 1rxs:K, 1rxs:k, 1rxs:L, 1rxs:l, 1rxs:M, 1rxs:m, 1rxs:O, 1rxs:N, 1rxs:Q, 1rxs:o, 1rxu:A, 1rxu:B, 1rxu:C, 1rxu:D, 1rxu:E, 1rxu:F, 1rxu:G, 1rxu:H, 1rxu:I, 1rxu:J, 1rxu:K, 1rxu:L, 1rxu:M, 1rxu:N, 1rxu:O, 1rxu:P, 1rxu:Q, 1rxu:R, 1rxy:A, 1rxy:B, 1sj9:B, 1tgv:A, 1tgv:B, 1tgy:A, 1tgy:B, 1u1c:A, 1u1c:B, 1u1c:C, 1u1c:D, 1u1c:E, 1u1c:F, 1u1d:A, 1u1d:B, 1u1d:C, 1u1d:D, 1u1d:E, 1u1d:F, 1u1e:A, 1u1e:B, 1u1e:C, 1u1e:D, 1u1e:E, 1u1e:F, 1u1f:A, 1u1f:B, 1u1f:C, 1u1f:D, 1u1f:E, 1u1f:F, 1u1g:A, 1u1g:B, 1u1g:C, 1u1g:D, 1u1g:E, 1u1g:F, 1y1q:C, 1y1r:D, 1y1r:B, 1y1s:A, 1y1s:D, 1y1s:F, 1y1s:E, 1y1s:B, 1zl2:B, 1zl2:D, 1zl2:F
16 3eue:A 295 207 0.1821 0.1729 0.2464 5.13e-04 3euf:A, 3euf:B, 3euf:C, 3euf:D, 3nbq:A, 3nbq:B, 3nbq:C, 3nbq:D
17 3p0f:A 293 143 0.1357 0.1297 0.2657 5.48e-04 3p0e:A, 3p0e:B, 3p0e:C, 3p0e:D, 3p0e:E, 3p0e:F, 2xrf:A, 2xrf:B, 2xrf:C
18 3ku4:B 293 209 0.1964 0.1877 0.2632 0.001 3ku4:A, 3ku4:C, 3ku4:D, 3kuk:A, 3kuk:B, 3kvr:A, 3kvr:B, 3kvy:A, 3kvy:B
19 3mb8:A 248 94 0.0786 0.0887 0.2340 0.003 3mb8:B
20 6f4w:A 233 104 0.0893 0.1073 0.2404 0.009 6f4w:D, 6f4w:B, 6f4w:E, 6f4w:C, 6f4w:F, 6f4x:A, 6f4x:D, 6f4x:B, 6f4x:E, 6f4x:C, 6f4x:F, 5lu0:A, 5lu0:B, 5lu0:C, 5lu0:E, 5mx4:C, 5mx6:A, 5mx6:B, 5mx6:C, 5mx6:D, 5mx6:F, 5mx8:A, 7ooy:B, 7ooz:B, 7op9:A, 7op9:B, 7op9:C, 7op9:D, 7op9:E, 7op9:F, 7op9:G, 7op9:H, 7op9:I, 7op9:J, 7op9:K, 7op9:L, 7opa:C, 7opa:H
21 6mvu:A 752 66 0.0893 0.0332 0.3788 0.10 6mvs:A, 6mvt:A, 6mvu:B
22 7koe:A 282 116 0.1143 0.1135 0.2759 0.11 7koe:E
23 5tc5:A 286 44 0.0500 0.0490 0.3182 0.32 1cb0:A, 1cg6:A, 6dyz:A, 6dz0:A, 6dz2:A, 6dz2:B, 6dz2:C, 6dz3:A, 6dz3:B, 6dz3:C, 5eub:A, 1k27:A, 3ozc:A, 3ozd:A, 3ozd:B, 1sd1:A, 1sd2:A, 5tc5:B, 5tc5:C, 5tc6:A, 5tc7:A, 5tc8:A
24 7arc:E 235 78 0.0857 0.1021 0.3077 0.37 7ard:E
25 3enz:C 246 97 0.0821 0.0935 0.2371 0.51 6aqs:A, 2bsx:A, 3enz:A, 3enz:B, 3enz:D, 3enz:E, 3enz:F, 3fow:A, 3fow:B, 1nw4:A, 1nw4:B, 1nw4:C, 1nw4:D, 1nw4:E, 1nw4:F, 3phc:A, 3phc:B, 3phc:C, 3phc:D, 3phc:E, 3phc:F, 1q1g:A, 1q1g:B, 1q1g:C, 1q1g:D, 1q1g:E, 1q1g:F, 1sq6:A, 8w7h:A, 5znc:A, 5zni:A
26 1kny:A 253 22 0.0429 0.0474 0.5455 3.2 1kny:B, 6nmk:A, 6nmk:B, 6nml:A, 6nml:B, 6nmm:A, 6nmm:B, 6nmm:C, 6nmm:D, 6nmn:A, 6nmn:B, 6p01:B, 6p04:A, 6p04:B, 6p06:A, 6p06:B, 6p08:A, 6p08:D, 6un8:A, 6un8:B
27 8uk6:A 573 55 0.0536 0.0262 0.2727 3.2
28 7u0r:B 278 29 0.0393 0.0396 0.3793 3.6 8c49:A, 8c49:B, 8dqg:D, 8dqg:A, 8dqh:D, 8dqh:A, 8dqi:D, 8dqi:A, 8dqj:D, 7u0r:A
29 8e73:V2 222 55 0.0607 0.0766 0.3091 4.2 6x89:V2
30 6grd:A 407 39 0.0571 0.0393 0.4103 4.5 5cnq:A, 5co8:C, 5co8:A, 6grb:A, 6grc:A
31 8dqj:A 251 29 0.0393 0.0438 0.3793 5.2
32 7y85:D 652 111 0.0964 0.0414 0.2432 5.7 7xc7:D, 7y83:D
33 8d9g:A 679 111 0.0964 0.0398 0.2432 5.8 7xss:C, 7xt4:C
34 1ez4:B 318 84 0.0750 0.0660 0.2500 8.5 1ez4:A, 1ez4:C, 1ez4:D
35 8a47:C 297 67 0.0643 0.0606 0.2687 9.5

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218