BioLiP

>protein
TVALTVPAAALLPDGALGESIVRGRRYLSDTPAQLPDFVGNGLACRHCHPGRDGEVGTEANAAPFVGVVGRFPQYSARHG
RLITLEQRIGDCFERSLNGRALALDHPALIDMLAYMSWLSQGVPVGAVVAGHGIPTLTLEREPDGVHGEALYQARCLACH
GADGSGTLDADGRYLFPPLWGPRSFNTGAGMNRQATAAGFIKHNMPLSLSDEEAWDVAGFVLTHPRPLF

The query sequence (length=229) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4v2k:A	235	233	0.9956	0.9702	0.9785	2.44e-166	4wq7:A, 4wq8:A, 4wq9:A, 4wqa:A, 4wqb:A, 4wqc:A, 4wqd:A, 4wqe:A
2	5lo9:A	471	238	0.4061	0.1975	0.3908	3.39e-41	5lo9:B
3	2zoo:A	438	149	0.1790	0.0936	0.2752	3.50e-05
4	2c1d:A	264	151	0.1528	0.1326	0.2318	1.13e-04	2c1d:C, 2c1d:G, 2c1d:E
5	6btm:E	161	106	0.1266	0.1801	0.2736	5.57e-04
6	1h31:A	261	127	0.1354	0.1188	0.2441	0.001	1h31:C, 1h31:E, 1h31:G, 1h32:A, 1h33:A, 2oz1:A, 2oz1:C, 2oz1:E, 2oz1:G
7	8yts:A	83	79	0.0873	0.2410	0.2532	0.003	8yts:B
8	2zbo:A	86	84	0.1092	0.2907	0.2976	0.005	2zbo:C, 2zbo:E, 2zbo:G, 2zbo:I, 2zbo:K
9	3oa8:A	229	116	0.1485	0.1485	0.2931	0.011	3oa8:C, 3oa8:E, 3ocd:A, 3ocd:C
10	7w2j:C	418	96	0.1179	0.0646	0.2812	0.017	8jej:C, 8jek:C, 8k6j:C, 8k6k:C, 7w2j:F, 7wsq:C, 7wsq:F, 8xcm:C, 8xcn:C
11	7y5e:GN	84	82	0.1004	0.2738	0.2805	0.059	7y5e:G2, 7y7a:G7, 7y7a:Go
12	1gdv:A	85	84	0.1092	0.2941	0.2976	0.12
13	8q1v:A	79	16	0.0480	0.1392	0.6875	0.33
14	8smr:G	312	100	0.1266	0.0929	0.2900	0.37
15	8smr:G	312	20	0.0393	0.0288	0.4500	7.8
16	8qa8:B	202	63	0.0742	0.0842	0.2698	0.66	8qa8:A, 8qa8:C, 8qa8:D, 8qa8:E, 8qa8:F, 1r71:A, 1r71:B, 1r71:C, 1r71:D
17	7vzg:C	193	41	0.0568	0.0674	0.3171	1.2	7vzr:C
18	1dvh:A	79	18	0.0524	0.1519	0.6667	1.3	2dvh:A, 1dwl:B, 1e08:E
19	1b7v:A	71	21	0.0437	0.1408	0.4762	1.3	1c75:A, 1k3g:A, 1k3h:A, 1n9c:A
20	6rtd:B	466	30	0.0699	0.0343	0.5333	1.4	6rtd:A, 6rte:A, 6rte:B
21	1c53:A	79	18	0.0524	0.1519	0.6667	1.6
22	6y8j:A	343	47	0.0611	0.0408	0.2979	2.1
23	6sa0:A	333	22	0.0480	0.0330	0.5000	2.5	6sa0:D, 6sa1:A, 6sa1:D
24	6ci6:A	581	98	0.1179	0.0465	0.2755	2.6	5dby:A, 5dqf:A, 5id9:A, 5iih:A, 5iiu:A, 5iix:A, 5ij5:A, 5ije:A, 4j2v:A, 7mbl:A, 6mdq:A, 6oci:A, 6ocj:A, 4ot2:A, 7q4x:A, 6u4r:A, 6u4x:A, 6u5a:A, 5v0v:A, 6xk0:A, 4zbq:A, 4zbr:A
25	5xdh:A	86	50	0.0699	0.1860	0.3200	2.6	5xdh:B, 5xdh:C, 5xdh:D
26	8gy2:A	723	90	0.1223	0.0387	0.3111	2.8
27	6h5l:B	220	92	0.0917	0.0955	0.2283	3.2
28	8snh:G	304	20	0.0393	0.0296	0.4500	3.3
29	5txr:A	479	81	0.1135	0.0543	0.3210	4.0	8eim:A, 8eim:B, 5txr:B
30	3dmi:A	87	86	0.1179	0.3103	0.3140	4.0
31	5mxy:A	83	22	0.0437	0.1205	0.4545	4.1	5mxz:A
32	2zzs:A	81	71	0.0873	0.2469	0.2817	4.8	2zzs:B, 2zzs:C, 2zzs:D, 2zzs:E, 2zzs:F, 2zzs:G, 2zzs:H, 2zzs:I, 2zzs:J, 2zzs:K, 2zzs:L, 2zzs:M, 2zzs:N, 2zzs:O, 2zzs:P, 2zzs:Q, 2zzs:R, 2zzs:S, 2zzs:T, 2zzs:U, 2zzs:V, 2zzs:W, 2zzs:X, 2zzs:Y, 2zzs:Z, 2zzs:1, 2zzs:2, 2zzs:3, 2zzs:4, 2zzs:5, 2zzs:6
33	8gy2:B	433	84	0.1092	0.0577	0.2976	5.1
34	7b21:AAA	92	85	0.1048	0.2609	0.2824	5.1
35	3wsw:A	316	74	0.0873	0.0633	0.2703	6.4	3wsw:B, 3wsw:C, 3wsw:D
36	8con:A	379	85	0.1004	0.0607	0.2706	9.3	4rqt:A, 4rqu:A, 4rqu:B

[Back]