Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
TTPLVHVASVEKGRSYEDFQKVYNAIALKLREDDEYDNYIGYGPVLVRLAWHTSGTWDKHDNTGGSYGGTYRFKKEFNDP
SNAGLQNGFKFLEPIHKEFPWISSGDLFSLGGVTAVQEMQGPKIPWRCGRVDTPEDTTPDNGRLPDADKDADYVRTFFQR
LNMNDREVVALMGAHALGKTHLKNSGYEGPWGAANNVFTNEFYLNLLNEDWKLEKNDANNEQWDSKSGYMMLPTDYSLIQ
DPKYLSIVKEYANDQDKFFKDFSKAFEKLLENGITFPKDAPSPFIFKTLEEQGL

The query sequence (length=294) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 6h08:B 297 291 0.9898 0.9798 1.0000 0.0 1a2f:A, 1a2g:A, 4a6z:A, 4a71:A, 4a78:A, 4a7m:A, 1aa4:A, 1ac4:A, 1ac8:A, 1aeb:A, 1aed:A, 1aee:A, 1aef:A, 1aeg:A, 1aeh:A, 1aej:A, 1aek:A, 1aem:A, 1aen:A, 1aeo:A, 1aeq:A, 1aes:A, 1aet:A, 1aeu:A, 1aev:A, 2anz:A, 2aqd:A, 2as1:A, 2as2:A, 2as3:A, 2as4:A, 2as6:A, 2b0z:A, 2b10:A, 2b10:C, 2b11:A, 2b11:C, 2b12:A, 2bcn:A, 2bcn:C, 1bej:A, 1bek:A, 1bem:A, 1bep:A, 1beq:A, 1bes:A, 7biu:A, 1bj9:A, 1bva:A, 1cca:A, 1ccb:A, 1ccc:A, 1cce:A, 1ccg:A, 1cci:A, 1ccj:A, 1cck:A, 1ccl:A, 1ccp:A, 2ccp:A, 3ccp:A, 3ccx:A, 4ccp:A, 4ccx:A, 5ccp:A, 6ccp:A, 7ccp:A, 2cep:A, 5cib:A, 5cib:C, 5cic:A, 5cic:C, 5cid:A, 5cid:C, 5cie:A, 5cie:C, 5cif:A, 5cif:C, 5cig:A, 5cig:C, 5cih:A, 5cih:C, 1cmp:A, 1cmq:A, 1cmt:A, 1cmu:A, 1cpd:A, 1cpe:A, 1cpf:A, 1cpg:A, 4cvi:A, 4cvj:A, 1cyf:A, 2cyp:A, 5d6m:A, 1dcc:A, 1dj1:A, 1dj5:A, 1ds4:A, 1dse:A, 1dsg:A, 1dso:A, 1dsp:A, 3e2n:A, 3e2o:A, 1ebe:A, 5ejt:A, 5ejx:A, 2eun:A, 2euo:A, 2eup:A, 2euq:A, 2eur:A, 2eus:A, 2eut:A, 2euu:A, 3exb:A, 2gb8:A, 6h08:A, 6h08:C, 2ia8:A, 2icv:A, 4jb4:A, 4jb4:C, 1jci:A, 1jdr:A, 4jm5:A, 4jm6:A, 4jm8:A, 4jm9:A, 4jma:A, 4jmb:A, 4jms:A, 4jmt:A, 4jmv:A, 4jmw:A, 4jmz:A, 4jn0:A, 4jpl:A, 4jpt:A, 4jpu:A, 4jqj:A, 4jqk:A, 4jqm:A, 4jqn:A, 2jti:A, 1kok:A, 1krj:A, 1kxm:A, 1kxn:A, 3m23:A, 3m25:A, 3m26:A, 3m27:A, 3m28:A, 3m29:A, 3m2a:A, 3m2b:A, 3m2c:A, 3m2d:A, 3m2e:A, 3m2f:A, 3m2g:A, 3m2h:A, 3m2i:A, 1mk8:A, 1mkq:A, 1mkr:A, 1ml2:A, 2n18:A, 4nfg:A, 4nva:A, 4nvb:A, 4nvc:A, 4nvd:A, 4nve:A, 4nvf:A, 4nvg:B, 4nvh:B, 4nvi:B, 4nvj:B, 4nvk:B, 4nvl:A, 4nvm:B, 4nvn:B, 4nvo:B, 4oq7:A, 4p4q:A, 4p4q:C, 6p41:A, 6p41:C, 6p42:A, 6p42:C, 6p43:A, 6p43:C, 2pcb:A, 2pcb:C, 2pcc:A, 2pcc:C, 3r98:A, 3r99:A, 2rbt:X, 2rbu:X, 2rbv:X, 2rbw:X, 2rbx:X, 2rby:X, 2rbz:X, 2rc0:X, 2rc1:X, 2rc2:X, 1ryc:A, 1s6v:A, 1s6v:C, 1s73:A, 1sbm:A, 1sdq:A, 1sog:A, 1stq:A, 5u5u:A, 5u5v:A, 5u5w:A, 5u5x:A, 5u5y:A, 5u5z:A, 5u60:A, 5u61:A, 1u74:A, 1u74:C, 1u75:A, 1u75:C, 5ug2:A, 2v23:A, 2v2e:A, 2x07:A, 2x08:A, 2xil:A, 2xj5:A, 2xj8:A, 4xv4:A, 4xv5:A, 4xv6:A, 4xv7:A, 4xv8:A, 4xva:A, 4xva:C, 4xva:E, 4xva:G, 6y1t:A, 6y2y:A, 2y5a:A, 2ycg:A, 1z53:A, 1zby:A, 1zbz:A
2 7oqr:A 274 243 0.3673 0.3942 0.4444 5.07e-64 7opt:A, 7opt:B, 7oqr:B
3 4ged:A 268 263 0.3639 0.3993 0.4068 6.60e-60 5al9:A, 5ala:A, 5ala:B, 5amm:A, 5amm:B, 3riv:A, 3riv:B, 3riw:A, 3riw:B
4 2cl4:X 250 271 0.3401 0.4000 0.3690 1.98e-56 1apx:A, 1apx:B, 1apx:C, 1apx:D, 7bi1:A, 2ggn:X, 2ghc:X, 2ghd:X, 2ghe:X, 2ghh:X, 2ghk:X, 5jpr:A, 5jqr:A, 5l86:A, 5l86:B, 1oaf:A, 1oag:A, 7s10:A, 6tae:A, 1v0h:X, 2vcf:X, 2vcn:A, 2vcs:A, 2vnx:X, 2vnz:X, 2vo2:X, 2wd4:A, 2xi6:A, 2xif:A, 2xih:A, 2xj6:A, 6xv4:A, 2y6a:A, 2y6b:A, 3zcg:A, 3zch:A, 3zcy:A
5 8djr:A 250 268 0.3435 0.4040 0.3769 4.49e-55 8djs:A, 8djt:A, 8dju:A, 8djw:A, 8djx:A, 8ff6:A, 8ff6:B, 8ff6:C, 8ff6:D, 8ff6:E, 8ff6:F, 8ff7:A, 8ff7:B, 8ff7:C, 8ff7:D, 8ff7:E, 8ff7:F
6 1iyn:A 275 244 0.2959 0.3164 0.3566 4.13e-44
7 3vlm:A 663 301 0.2959 0.1312 0.2890 2.65e-24 3vlm:B
8 3vlm:A 663 192 0.1871 0.0830 0.2865 1.05e-05 3vlm:B
9 1itk:B 714 334 0.2993 0.1232 0.2635 3.46e-21 1itk:A, 3uw8:A, 3uw8:B, 3vlh:A, 3vlh:B, 3vli:A, 3vli:B, 3vlj:A, 3vlj:B, 3vlk:A, 3vlk:B, 3vll:A, 3vll:B
10 1itk:B 714 194 0.1871 0.0770 0.2835 2.35e-05 1itk:A, 3uw8:A, 3uw8:B, 3vlh:A, 3vlh:B, 3vli:A, 3vli:B, 3vlj:A, 3vlj:B, 3vlk:A, 3vlk:B, 3vll:A, 3vll:B
11 5kqi:A 714 324 0.2891 0.1190 0.2623 4.08e-20 6b9b:A, 6b9b:B, 6caw:A, 6caw:B, 6cc6:A, 6cc6:B, 6cdq:A, 6cdq:B, 6cek:A, 6cek:B, 6cfq:A, 6cfq:B, 5kq0:A, 5kq0:B, 5kq2:A, 5kq2:B, 5kq3:A, 5kq3:B, 5kq6:A, 5kq6:B, 5kqh:A, 5kqh:B, 5kqi:B, 5kqk:A, 5kqk:B, 5kqn:A, 5kqn:B, 5kqq:A, 5kqq:B, 5ksf:A, 5ksf:B, 5ksg:A, 5ksg:B, 5ksk:A, 5ksk:B, 5ksn:A, 5ksn:B, 5kt8:A, 5kt8:B, 5kt9:A, 5kt9:B, 5l02:A, 5l02:B, 5l05:A, 5l05:B, 6mpy:A, 6mpy:B, 6mq0:A, 6mq0:B, 6mq1:A, 6mq1:B, 5sw4:A, 5sw4:B, 5sw5:A, 5sw5:B, 5sw6:A, 5sw6:B, 5sx0:A, 5sx0:B, 5sx1:A, 5sx1:B, 5sx2:A, 5sx2:B, 5sx3:A, 5sx3:B, 5sx6:A, 5sx6:B, 5sx7:A, 5sx7:B, 5sxq:A, 5sxq:B, 5sxr:A, 5sxr:B, 5sxs:A, 5sxs:B, 5sxt:A, 5sxt:B, 5sxw:A, 5sxw:B, 5sxx:A, 5sxx:B, 5syh:A, 5syh:B, 5syi:A, 5syi:B, 5syj:A, 5syj:B, 5syk:A, 5syk:B, 5syl:A, 5syl:B, 5syu:A, 5syu:B, 5syv:A, 5syv:B, 5syw:A, 5syw:B, 5syx:A, 5syx:B, 5syy:A, 5syy:B, 5txq:A, 5txq:B, 5v4o:A, 5v4o:B, 5v53:A, 5v53:B
12 5kqi:A 714 264 0.2211 0.0910 0.2462 2.26e-07 6b9b:A, 6b9b:B, 6caw:A, 6caw:B, 6cc6:A, 6cc6:B, 6cdq:A, 6cdq:B, 6cek:A, 6cek:B, 6cfq:A, 6cfq:B, 5kq0:A, 5kq0:B, 5kq2:A, 5kq2:B, 5kq3:A, 5kq3:B, 5kq6:A, 5kq6:B, 5kqh:A, 5kqh:B, 5kqi:B, 5kqk:A, 5kqk:B, 5kqn:A, 5kqn:B, 5kqq:A, 5kqq:B, 5ksf:A, 5ksf:B, 5ksg:A, 5ksg:B, 5ksk:A, 5ksk:B, 5ksn:A, 5ksn:B, 5kt8:A, 5kt8:B, 5kt9:A, 5kt9:B, 5l02:A, 5l02:B, 5l05:A, 5l05:B, 6mpy:A, 6mpy:B, 6mq0:A, 6mq0:B, 6mq1:A, 6mq1:B, 5sw4:A, 5sw4:B, 5sw5:A, 5sw5:B, 5sw6:A, 5sw6:B, 5sx0:A, 5sx0:B, 5sx1:A, 5sx1:B, 5sx2:A, 5sx2:B, 5sx3:A, 5sx3:B, 5sx6:A, 5sx6:B, 5sx7:A, 5sx7:B, 5sxq:A, 5sxq:B, 5sxr:A, 5sxr:B, 5sxs:A, 5sxs:B, 5sxt:A, 5sxt:B, 5sxw:A, 5sxw:B, 5sxx:A, 5sxx:B, 5syh:A, 5syh:B, 5syi:A, 5syi:B, 5syj:A, 5syj:B, 5syk:A, 5syk:B, 5syl:A, 5syl:B, 5syu:A, 5syu:B, 5syv:A, 5syv:B, 5syw:A, 5syw:B, 5syx:A, 5syx:B, 5syy:A, 5syy:B, 5txq:A, 5txq:B, 5v4o:A, 5v4o:B, 5v53:A, 5v53:B
13 7a7a:B 667 290 0.2823 0.1244 0.2862 1.68e-18 7a2i:B, 7a7a:A, 7a7c:B
14 7a7a:B 667 263 0.2211 0.0975 0.2471 1.18e-07 7a2i:B, 7a7a:A, 7a7c:B
15 5jhx:A 735 355 0.3027 0.1211 0.2507 1.18e-17 5cjh:A, 5cjh:B, 5jhx:B, 5jhy:A, 5jhy:B, 5jhz:A, 5jhz:B, 3ut2:A, 3ut2:B
16 5jhx:A 735 262 0.2245 0.0898 0.2519 5.44e-06 5cjh:A, 5cjh:B, 5jhx:B, 5jhy:A, 5jhy:B, 5jhz:A, 5jhz:B, 3ut2:A, 3ut2:B
17 3wnu:A 710 326 0.2789 0.1155 0.2515 1.74e-17 4pae:A, 1ub2:A, 3wxo:A, 3x16:A
18 3wnu:A 710 260 0.2075 0.0859 0.2346 0.022 4pae:A, 1ub2:A, 3wxo:A, 3x16:A
19 4c51:A 717 324 0.2925 0.1199 0.2654 1.99e-15 7ag8:A, 7ag8:B, 4c50:A, 4c50:B, 4c51:B, 2cca:A, 2cca:B, 2ccd:A, 2ccd:B, 8czp:A, 8czp:B, 8dwr:A, 8dwr:B, 8dwr:C, 8dwr:D, 1sj2:A, 1sj2:B, 8u3p:A, 8u3p:B, 8u3p:C, 8u3p:D, 6zji:AP1, 6zji:BP1
20 4c51:A 717 263 0.2211 0.0907 0.2471 2.12e-07 7ag8:A, 7ag8:B, 4c50:A, 4c50:B, 4c51:B, 2cca:A, 2cca:B, 2ccd:A, 2ccd:B, 8czp:A, 8czp:B, 8dwr:A, 8dwr:B, 8dwr:C, 8dwr:D, 1sj2:A, 1sj2:B, 8u3p:A, 8u3p:B, 8u3p:C, 8u3p:D, 6zji:AP1, 6zji:BP1
21 7jz6:B 662 290 0.2687 0.1193 0.2724 2.29e-15 7jz6:A, 7jz6:C, 7jz6:D
22 7jz6:B 662 253 0.2177 0.0967 0.2530 2.47e-11 7jz6:A, 7jz6:C, 7jz6:D
23 5whs:A 713 325 0.2925 0.1206 0.2646 1.44e-14 5whq:A, 5whq:B, 5whs:B
24 5whs:A 713 262 0.2279 0.0940 0.2557 1.11e-10 5whq:A, 5whq:B, 5whs:B
25 8qwt:A 331 228 0.1735 0.1541 0.2237 1.94e-09
26 3q3u:A 338 174 0.1361 0.1183 0.2299 6.04e-09
27 3fjw:A 331 228 0.1871 0.1662 0.2412 1.12e-08 5abn:A, 5abo:A, 5abq:A, 4blk:A, 4bll:A, 4bln:A, 4blx:A, 4bly:A, 4blz:A, 4blz:B, 4bm0:A, 2boq:A, 4fcn:A, 4fcs:A, 4fdq:A, 4fef:A, 3fjw:B, 3fkg:A, 3fm1:A, 3fm4:A, 3fm6:A, 3fmu:A, 5fnb:A, 5fnb:B, 5fne:A, 4g05:A, 2vka:A, 2w23:A
28 3m5q:A 357 242 0.1837 0.1513 0.2231 1.13e-08 3m8m:A, 1mn1:A, 1mn2:A, 1mnp:A, 1yyd:A, 1yyg:A, 1yzp:A, 1yzr:A
29 7oo5:A 331 221 0.1803 0.1601 0.2398 3.85e-08
30 3rrw:A 255 92 0.1020 0.1176 0.3261 6.41e-08 3rrw:B
31 7dlh:A 302 301 0.2041 0.1987 0.1993 7.90e-07
32 1b80:A 349 199 0.1361 0.1146 0.2010 2.87e-05 6a6q:A, 1b80:B, 1b82:A, 1b82:B, 1b85:A, 1b85:B, 6iss:A, 6iss:G, 1lga:A, 1lga:B, 1llp:A
33 5aog:A 307 275 0.1837 0.1759 0.1964 6.97e-04
34 1qgj:A 300 231 0.1769 0.1733 0.2251 7.57e-04 1qgj:B
35 5twt:A 291 226 0.1803 0.1821 0.2345 0.001
36 4a5g:A 307 149 0.1224 0.1173 0.2416 0.003 4a5g:B
37 4cuo:A 306 83 0.0816 0.0784 0.2892 0.005
38 1pa2:A 306 258 0.1871 0.1797 0.2132 0.009 1qo4:A
39 1qpa:B 344 174 0.1395 0.1192 0.2356 0.016 1qpa:A
40 1sch:A 294 235 0.1701 0.1701 0.2128 0.21 1sch:B
41 7wx5:A 288 53 0.0612 0.0625 0.3396 0.52 7wx6:A, 7wx7:A
42 6bd4:A 379 53 0.0578 0.0449 0.3208 1.2
43 1fhf:A 304 200 0.1463 0.1414 0.2150 1.6 1fhf:B, 1fhf:C
44 8twj:A 303 33 0.0408 0.0396 0.3636 3.6 2nud:A, 2nud:B, 2nun:A, 8two:A, 8tws:A, 8txf:A
45 6s2p:N 252 66 0.0680 0.0794 0.3030 3.8
46 1bgp:A 309 74 0.0578 0.0550 0.2297 5.0
47 5j92:B 259 54 0.0544 0.0618 0.2963 6.6 5j92:A, 5j92:C, 5j92:D
48 8uo4:A 292 38 0.0442 0.0445 0.3421 6.6 8uo2:A
49 8htg:B 334 30 0.0374 0.0329 0.3667 9.1 8htg:A, 8htg:C, 8htg:D
50 8xuq:A 885 45 0.0646 0.0215 0.4222 9.6 8xuo:A, 8xuo:G, 8xuq:E, 8xuq:F, 8xuq:G, 8xuv:A, 8xuv:B, 8xuv:C, 8xuv:D, 8xuv:E, 8xuv:F, 8xuv:G, 8xuv:H, 8xuv:I, 8xuv:J, 8xuv:K, 8xuv:L

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218