BioLiP

>protein
TTLTVDLSTTYQRIDGFGTSEAFQRAVQMSRLPEEGQRRALDVLFSTTNGAGLSILRNGIGSSPDMSSDHMVSIAPKSPG
SPNNPLIYSWDGSDNKQLWVSQEAVHTYGVKTIYADAWSAPGYMKTNGNDANGGTLCGLSGAQCASGDWRQAYADYLTKY
VEFYQESNVTVTHLGFINAPELTTSYASMRFSASQAAEFIRILYPTIQKSNLTYKPTIACCDAEGWNSQAGMLGALSSVN
SMFGLVTAHAYTSQPGFSMNTPHPVWMTEAADLQGAWTSAWYSYGGAGEGWTWANNVYNAIVNGNASAYLYWIGAQTGNT
NSHMVHIDANAGTVEPSKRLWALGQWSRFVRPGARRVAVSGASGSLRTAAFRNEDGSVAVVVINSGGDAAVNVRLAQPAS
AKAWATDNSRAIEEIQASFADGVATVNVPSRSMTTVVLYPA

The query sequence (length=441) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	8cbc:A	455	448	0.9977	0.9670	0.9821	0.0	8c48:A, 8c48:B, 8cbc:B, 7o0e:A, 7o0e:G, 8p67:A, 8p67:B
2	6krn:A	456	452	0.4535	0.4386	0.4425	4.15e-124
3	6m5z:A	433	443	0.4286	0.4365	0.4266	3.34e-109	6m5z:B
4	8idp:A	446	450	0.3605	0.3565	0.3533	2.25e-75	8idp:C, 8idp:B, 8idp:D, 8idq:A, 8idq:B, 8idq:C, 8idq:D
5	7n6o:A	433	432	0.3152	0.3210	0.3218	5.57e-56	7n6o:B
6	2y24:A	383	455	0.2517	0.2898	0.2440	6.54e-14
7	4qaw:A	537	368	0.2041	0.1676	0.2446	3.79e-10	4qaw:B, 4qaw:C, 4qaw:D, 4qaw:E, 4qaw:F, 4qaw:G, 4qaw:H, 4qb1:A, 4qb2:A, 4qb6:A
8	2wnw:B	445	290	0.1519	0.1506	0.2310	2.94e-08	2wnw:A
9	4uqa:A	391	194	0.1247	0.1407	0.2835	1.32e-06	5a6l:A, 5a6m:A, 4ckq:A, 4uqc:A
10	9fa6:A	501	225	0.1293	0.1138	0.2533	3.11e-06	8awk:AAA, 8awr:AAA, 8ax3:A, 8ax3:B, 9f9z:A, 9fa3:A, 9fad:A, 9fal:A, 9fay:A, 9faz:A, 9fb2:A, 9fdi:A, 3gxf:B, 3gxf:D, 5lvx:C, 5lvx:B, 5lvx:A, 5lvx:D, 6moz:A, 2nsx:A, 2nsx:B, 2nsx:C, 2nsx:D, 2nt0:A, 2nt0:B, 2nt0:C, 2nt0:D, 7nwv:AAA, 7nwv:BBB, 8p3e:B, 8p41:A, 8p41:B, 6q1n:A, 6q1n:B, 6q1p:A, 6q1p:B, 6q6k:A, 6q6k:B, 6q6l:A, 6q6l:B, 6q6n:A, 6q6n:B, 3rik:B, 3rik:D, 3ril:A, 3ril:B, 3ril:C, 3ril:D, 6t13:B, 6t13:C, 6t13:A, 6t13:D, 6tjq:BBB, 6tn1:AAA, 2v3d:A, 2v3d:B, 2v3e:A, 2v3e:B, 2vt0:A, 2vt0:B, 2wcg:A, 2wcg:B, 2xwd:A, 2xwd:B, 2xwe:A, 2xwe:B, 1y7v:A, 1y7v:B, 6ytp:AAA, 6ytp:BBB, 6ytr:AAA, 6ytr:BBB, 6yut:AAA, 6yut:BBB, 6yv3:AAA, 6yv3:BBB, 6z39:AAA, 6z39:BBB, 6z3i:BBB
11	9fa6:A	501	70	0.0476	0.0419	0.3000	0.007	8awk:AAA, 8awr:AAA, 8ax3:A, 8ax3:B, 9f9z:A, 9fa3:A, 9fad:A, 9fal:A, 9fay:A, 9faz:A, 9fb2:A, 9fdi:A, 3gxf:B, 3gxf:D, 5lvx:C, 5lvx:B, 5lvx:A, 5lvx:D, 6moz:A, 2nsx:A, 2nsx:B, 2nsx:C, 2nsx:D, 2nt0:A, 2nt0:B, 2nt0:C, 2nt0:D, 7nwv:AAA, 7nwv:BBB, 8p3e:B, 8p41:A, 8p41:B, 6q1n:A, 6q1n:B, 6q1p:A, 6q1p:B, 6q6k:A, 6q6k:B, 6q6l:A, 6q6l:B, 6q6n:A, 6q6n:B, 3rik:B, 3rik:D, 3ril:A, 3ril:B, 3ril:C, 3ril:D, 6t13:B, 6t13:C, 6t13:A, 6t13:D, 6tjq:BBB, 6tn1:AAA, 2v3d:A, 2v3d:B, 2v3e:A, 2v3e:B, 2vt0:A, 2vt0:B, 2wcg:A, 2wcg:B, 2xwd:A, 2xwd:B, 2xwe:A, 2xwe:B, 1y7v:A, 1y7v:B, 6ytp:AAA, 6ytp:BBB, 6ytr:AAA, 6ytr:BBB, 6yut:AAA, 6yut:BBB, 6yv3:AAA, 6yv3:BBB, 6z39:AAA, 6z39:BBB, 6z3i:BBB
12	3kl0:A	397	367	0.1791	0.1990	0.2153	2.10e-05	3kl3:A, 3kl3:B, 3kl5:A, 3kl5:B, 3kl5:C
13	5ngl:B	454	218	0.1111	0.1079	0.2248	5.14e-04	5ngl:A, 5ngl:C
14	5ngl:B	454	59	0.0408	0.0396	0.3051	0.017	5ngl:A, 5ngl:C
15	6yyi:B	502	124	0.0726	0.0637	0.2581	3.2
16	3iar:A	360	50	0.0454	0.0556	0.4000	3.4	2bgn:E, 2bgn:F, 2bgn:G, 2bgn:H, 2e1w:A, 1krm:A, 1ndv:A, 1ndw:A, 1ndy:A, 1ndz:A, 1o5r:A, 1qxl:A, 7rtg:A, 7rtg:B, 1uml:A, 1v79:A, 1v7a:A, 1vfl:A, 1w1i:E, 1w1i:F, 1w1i:G, 1w1i:H, 1wxy:A, 1wxz:A, 2z7g:A
17	8ayz:A	278	92	0.0544	0.0863	0.2609	9.5	1eah:1, 3epf:1

[Back]